Los investigadores utilizan la secuenciación del ARN como alternativa a la inmunohistoquímica en el diagnóstico del cáncer
ARN. Crédito: Daria Sokol/MIPT
Por primera vez, investigadores del Instituto de Física y Tecnología de Moscú y sus colegas lograron utilizar la secuenciación de ARN como alternativa a la inmunohistoquímica para el diagnóstico del cáncer. Su estudio fue publicado en Biomedicines.
El método utilizado convencionalmente para el diagnóstico del cáncer se basa en la tinción inmunohistoquímica de secciones de tejido tumoral. Permite detectar la presencia y medir la concentración de proteínas marcadoras que caracterizan los crecimientos malignos. El procedimiento consiste en sumergir una muestra de tumor en parafina caliente. Una vez enfriado, un bloque de tejido parafinado se corta en secciones delgadas, que luego se tiñen y se estudian con un microscopio. Las imágenes resultantes indican si el tumor es maligno y cuál es su tipo molecular. Esta información es crucial para seleccionar la terapia adecuada.
Otro método, la secuenciación del ARN, consiste en determinar la secuencia y el número de moléculas de cada ARN presente en la célula. Los datos resultantes, denominados transcriptomas, reflejan la actividad de todos los genes en la célula. Para analizar una gran variedad de datos, los bioinformáticos emplean algoritmos especializados y compilan bases de datos de transcriptomas para diferentes células y tejidos humanos.
Los autores del reciente artículo en Biomedicines han propuesto que la secuenciación de ARN se utilice como técnica alternativa y complementaria a la tinción inmunohistoquímica convencional. Bajo este enfoque, los mismos fragmentos de tumor parafinados pueden usarse en el análisis. Esto significa que no se requiere una biopsia adicional y las dos técnicas serán bastante fáciles de combinar.
«Hemos demostrado por primera vez que los hallazgos de ambos métodos están en perfecto acuerdo para el conjunto seleccionado de biomarcadores. Es solo que la inmunohistoquímica requiere una cantidad mucho mayor de experimentos, uno para cada biomarcador considerado, lo que significa que mucho más se necesita biomaterial. A su vez, la secuenciación del ARN nos permite caracterizar cuantitativamente el trabajo de todos los genes que codifican proteínas, ¡y hay alrededor de 20,000 de ellos! dijo el investigador principal Anton Buzdin, quien dirige el Laboratorio de Bioinformática Genómica Traslacional en MIPT y dirige el Departamento de Investigación en Oncobox.
En su estudio, los investigadores demostraron una clara correlación entre los niveles de expresión de cuatro genes marcadores tumorales medidos mediante secuenciación de ARN y los resultados de la tinción inmunohistoquímica.
«Estamos convencidos de que la secuenciación del ARN tiene un gran futuro en el diagnóstico médico. Esperamos que nuestro último estudio haya acercado un poco más ese futuro», añadió Buzdin.
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