Programa informático reduce candidatos a fármacos para tratar el COVID-19
Crédito: PubChem
Si bien la vacunación y la educación pública sobre la transmisión del coronavirus que causa el COVID-19 han estado a la vanguardia de nuestra respuesta a la pandemia, sigue existiendo una necesidad urgente necesidad de intervenciones farmacéuticas en los casos en que se produce infección y conduce a una morbilidad grave con un riesgo significativo de muerte. Un nuevo trabajo en el International Journal of Computational Biology and Drug Design se ha centrado en tres objetivos de proteínas en el cuerpo que se cree que son fundamentales para la propagación del virus en el cuerpo después de la infección y provocan síntomas.
Según Srija Mukherjee y Santanu Paul del Laboratorio de Biología Celular y Molecular de la Universidad de Calcuta, India, el receptor de la enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE-2) representa un objetivo prometedor para los productos farmacéuticos de molécula pequeña. El SARS-CoV2 ingresa a las células humanas a través del receptor ACE-2 ubicado en la membrana de los pulmones, las arterias, los riñones y el intestino. Como tal, una pequeña molécula que se dirige selectivamente a esta proteína podría usarse para reducir la interacción del virus con esas proteínas y así impedir su ciclo de infección a replicación.
El equipo ha recurrido a un programa informático que tiene un modelo de la proteína diana. Luego, las estructuras moleculares de los candidatos a fármacos se comparan con el sitio de acoplamiento en el modelo de proteína para determinar qué tan bien podrían encajar en el sitio y qué tan bien se unen a él. Este tipo de detección in silico de moléculas de fármacos permite al equipo determinar rápidamente cuál de diez candidatos podría valer la pena seguir en experimentos que se llevarían a cabo en el laboratorio in vitro y luego cualquiera que resulte útil en esas pruebas se trasladaría a un animal. modelo para la evaluación in vivo.
El principal beneficio de las pruebas in silico es que cualquier candidato que parece muy poco probable que se acople bien a la proteína objetivo puede descartarse y no se desperdicia tiempo ni recursos en pruebas in vitro e in vivo. experimentos que muy probablemente llegarían a un callejón sin salida.
Como tal, el equipo ha probado diez candidatos a fármacos contra los modelos de proteína diana in silico. Estos medicamentos son hidralazina, fostemsavir, trandolapril, triamtereno, isuprel, albuterol, benadryl, Ro 28-2653, teofilina y mesilato de osimertinib. Determinaron que una molécula conocida como Ro 28-2653 tiene la mayor promesa en el tratamiento de COVID-19. Este compuesto, que tiene el nombre químico de 5-bifenil-4-il-5-[4-(-nitro-fenil)-piperazin-1-il]-pirimidina-2,4,6-triona, ya se conoce como molécula de fármaco y se ha probado como inhibidor de un tipo de proteína involucrada en el crecimiento de vasos sanguíneos en tumores cancerosos.
«Nuestro estudio muestra que Ro 28-2653 puede ser un potente inhibidor contra COVID-19 ”, escribe el equipo. Señalan que el fármaco es poco soluble en agua y, por lo tanto, necesitaría un vehículo, como la ciclodextrina, una molécula de «almidón» en forma de anillo, para permitir que se tome por vía oral. Sin embargo, el fármaco tiene la ventaja importante de que tiene una vida media larga en el cuerpo una vez absorbido y, por lo tanto, se espera que permanezca activo contra el virus durante un período de tiempo significativo. De hecho, debido a que se dirige a una proteína en el cuerpo, debería ser activo contra cualquier cepa actual o nueva del coronavirus.
El próximo paso será llevar los experimentos in silico al nivel in vitro para ver si el fármaco funciona en el laboratorio contra la proteína diana.
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Los investigadores desarrollan una molécula prometedora en busca de crear un fármaco para tratar la COVID-19 Más información: Srija Mukherjee, Santanu Paul, el estudio in silico identifica a RO 28-2653 como una novela fármaco contra cepas mutantes de SARS-CoV2, International Journal of Computational Biology and Drug Design (2022). DOI: 10.1504/IJCBDD.2021.121622 Proporcionado por Inderscience Cita: El programa informático reduce los candidatos a fármacos para tratar la COVID-19 (24 de marzo de 2022) consultado el 29 de agosto de 2022 en https://medicalxpress.com/news/ 2022-03-narrows-drug-candidates-covid-.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.