Cr\u00e9dito: Pixabay\/CC0 Dominio p\u00fablico <\/p>\n
Todos los humanos portan variaciones gen\u00e9ticas en su ADN, llamadas polimorfismos de nucle\u00f3tido \u00fanico (SNP) que pueden ser la base de la susceptibilidad a enfermedades como diabetes y c\u00e1ncer. Para la enfermedad inflamatoria intestinal (EII), se han identificado muchos SNP asociados con la enfermedad, pero explotarlos cl\u00ednicamente ha demostrado ser un desaf\u00edo, principalmente debido a los efectos desconocidos de los SNP. <\/p>\n
Un grupo multidisciplinario de bi\u00f3logos de sistemas, cl\u00ednicos, inmun\u00f3logos y microbi\u00f3logos ha desarrollado y probado un flujo de trabajo de medicina de sistemas que identifica las conexiones gen\u00e9ticas ocultas que forman patrones espec\u00edficos del paciente, lo que podr\u00eda guiar mejores selecciones de terapia. El trabajo se public\u00f3 hoy en Nature Communications.<\/p>\n
Investigadores y m\u00e9dicos del Instituto Quadram, el Instituto Earlham, el Hospital Universitario de Norfolk y Norwich y la Universidad de East Anglia con colaboradores en Cambridge, Londres y Lovaina (B\u00e9lgica) han descubierto que los pacientes con enfermedad inflamatoria intestinal (EII) desarrollan la afecci\u00f3n debido a mecanismos distintos y diferentes, determinados por su gen\u00e9tica.<\/p>\n
Usando un enfoque de gen\u00f3mica de sistemas novedoso y poderoso que identifica cu\u00e1l de varias v\u00edas posibles hacia la enfermedad El paciente conducir\u00e1 a diagn\u00f3sticos y tratamientos m\u00e1s efectivos y proporcionar\u00e1 una comprensi\u00f3n mucho mejor de esta afecci\u00f3n complicada, que tambi\u00e9n se puede aplicar a otros estudios de enfermedades desconcertantes para ayudar a m\u00e1s pacientes.<\/p>\n
\u00abLa capacidad del flujo de trabajo para identificar cohortes de mutaciones y v\u00edas asociadas a la enfermedad no se limita a la EII; tiene el potencial de uso en otras enfermedades complejas, incluidas la salud mental, la enfermedad card\u00edaca y la enfermedad autoinmune. condiciones\u00bb, dijo el coautor principal del estudio, el Dr. Tamas Korcsmaros, del Instituto Earlham y el Instituto Quadram. \u00abEl desarrollo de terapias de precisi\u00f3n basadas en la gen\u00e9tica espec\u00edfica del paciente abre la posibilidad de enfoques de medicina personalizada muy necesarios para abordar estas afecciones complejas y poco comprendidas\u00bb.<\/p>\n
La enfermedad inflamatoria intestinal afecta a unas 500\u00a0000 personas en el Reino Unido y provoca gama de s\u00edntomas dolorosos y debilitantes relacionados con la inflamaci\u00f3n del intestino. Las causas de la EII no se comprenden, pero est\u00e1n relacionadas con la disfunci\u00f3n del sistema inmunitario y c\u00f3mo reacciona a los alimentos y al microbioma intestinal. Tambi\u00e9n existe un fuerte v\u00ednculo gen\u00e9tico con la susceptibilidad a la EII.<\/p>\n
Para descubrir c\u00f3mo interact\u00faan estos factores complejos en el desarrollo de la EII, gastroenter\u00f3logos del Hospital Universitario de Norfolk y Norwich y el Hospital Addenbrooke en Cambridge, microbi\u00f3logos e inmun\u00f3logos de el Instituto Quadram, bi\u00f3logos del genoma y cient\u00edficos de la red del Instituto Earlham y quimioinform\u00e1tico de la Universidad de Cambridge se unieron para vincular el componente gen\u00e9tico de la susceptibilidad de la EII a sus efectos en los pacientes.<\/p>\n
Estudios anteriores han relacionado la enfermedad con enfermedades espec\u00edficas alteraciones en el c\u00f3digo gen\u00e9tico, encontrando cambios menores de una sola letra en el c\u00f3digo gen\u00e9tico que se asocian con la EII. Estos llamados \u00abpolimorfismos de nucle\u00f3tido \u00fanico\u00bb o SNP se pueden mapear en el genoma humano.<\/p>\n
Si un SNP vinculado a la EII se mapea en un gen, identifica ese gen y su c\u00f3digo gen\u00e9tico como importantes en la enfermedad. Para algunas afecciones, esto ha llevado a terapias mejoradas.<\/p>\n
Sin embargo, para la EII, menos del 10 % de los SNP identificados estaban en los genes. En cambio, m\u00e1s del 90 % de los SNP se encontraban en regiones no codificantes del genoma. Esto no es sorprendente, ya que la mayor parte del genoma humano se compone de este ADN no codificante, con genes que comprenden solo el 1%. Alguna vez se pens\u00f3 que el otro 99 % era solo ADN basura, pero ahora sabemos que tiene funciones importantes en el control y la regulaci\u00f3n de la actividad de los genes.<\/p>\n
Adem\u00e1s, algunos SNP pueden tener solo efectos muy sutiles, pero en combinaci\u00f3n conducen a la progresi\u00f3n de la enfermedad. Dada la naturaleza compleja de la EII, era muy probable que este fuera el caso de esta afecci\u00f3n. El sistema inmunitario funciona tomando una amplia gama de entradas diferentes que activan diferentes redes de se\u00f1alizaci\u00f3n dentro de la c\u00e9lula, integr\u00e1ndolas para producir una respuesta adecuada y equilibrada.<\/p>\n
Comprender c\u00f3mo todos los SNP asociados de la EII en los SNP no codificantes regiones del genoma se combinan para influir en estas se\u00f1ales intrincadamente interrelacionadas en el desarrollo de la EII, lo que llenar\u00eda importantes lagunas en nuestro conocimiento.<\/p>\n
Abordar esto se convirti\u00f3 en el objetivo de la Dra. Johanne Brooks-Warburton, una gastroenter\u00f3loga que cambi\u00f3 el pabellones del Hospital Universitario de Norfolk y Norwich para los laboratorios del Instituto Quadram mientras realizaba una beca de capacitaci\u00f3n cl\u00ednica Wellcome Trust trabajando con los grupos del profesor Simon Carding y el Dr. Tams Korcsmros. El proyecto fue financiado por el Consejo de Investigaci\u00f3n de Biotecnolog\u00eda y Ciencias Biol\u00f3gicas, parte de UKRI (Investigaci\u00f3n e Innovaci\u00f3n del Reino Unido), el Consejo Europeo de Investigaci\u00f3n y el Fondo Traslacional del Parque de Investigaci\u00f3n de Norwich.<\/p>\n
Su enfoque fue construir una simulaci\u00f3n por computadora de interacciones entre el genoma humano y las rutas y redes de se\u00f1alizaci\u00f3n celular en las que influyen los productos de estos genes, usando bases de datos de interacciones conocidas y predichas entre prote\u00ednas en la red.<\/p>\n
\u00abEn la era posgen\u00f3mica, identificar los cambios gen\u00e9ticos para pacientes individuales se han convertido en una realidad. Sin embargo, para traducir esta informaci\u00f3n en una mejora cl\u00ednica real, necesit\u00e1bamos una herramienta que conectara los puntos y proporcionara una visi\u00f3n sist\u00e9mica de lo que est\u00e1 sucediendo en la condici\u00f3n de la enfermedad\u00bb, dijo el Dr. Brooks-Warburton.<\/p>\n
Dr. Dezs Modos trabaj\u00f3 en el proyecto con el Prof. Andreas Bender en la Universidad de Cambridge, luego se traslad\u00f3 al Instituto Quadram para ampliar su alcance.<\/p>\n
\u00c9l coment\u00f3: \u00abEl poder de este enfoque es que puede encontrar previamente conexiones y prote\u00ednas \u00abocultas\u00bb no identificadas en las redes de se\u00f1alizaci\u00f3n afectadas por SNP en las regiones no codificantes, en lugar de solo aquellas que alteraron directamente los genes. Identifica cambios en los mecanismos reguladores que los enfoques anteriores pasar\u00edan por alto, ya que se originan en el regiones codificantes del genoma\u00bb.<\/p>\n
Tambi\u00e9n identifica cambios en las redes de se\u00f1alizaci\u00f3n provocados por el efecto acumulativo de muchos SNP diferentes, ya que observa la red completa, en lugar de centrarse en una v\u00eda o paso en particular. A partir de esto, se seleccionaron v\u00edas clave que conducen a la colitis ulcerosa, un tipo de EII.<\/p>\n
Con el flujo de trabajo establecido, el equipo trabaj\u00f3 con el Consorcio Gen\u00e9tico de IBD del Reino Unido para comparar 377 pacientes con colitis ulcerosa con ver c\u00f3mo sus genomas individuales afectaron a la red. Descubrieron que los pacientes se agruparon en cuatro grupos distintos, seg\u00fan su \u00abhuella de red\u00bb.<\/p>\n
Este hallazgo significa que, aunque sus s\u00edntomas pueden ser los mismos, los factores subyacentes de la colitis ulcerosa pueden variar. Se necesita m\u00e1s trabajo con grupos m\u00e1s grandes de pacientes para validar las v\u00edas identificadas aqu\u00ed, pero si tiene \u00e9xito, podr\u00eda conducir a un enfoque m\u00e1s estratificado o incluso personalizado para el tratamiento de la afecci\u00f3n, basado en la gen\u00f3mica de los pacientes.<\/p>\n
El flujo de trabajo de la gen\u00f3mica de sistemas, denominado Integrated SNP Network Pipeline (iSNP), se ha publicado ahora en la revista Nature Communications y es objeto de una solicitud de patente.<\/p>\n
\u00abPara enfermedades complejas, como c\u00e1ncer, EII y otras enfermedades autoinmunes, siempre hay m\u00faltiples respuestas\u00bb, dijo el profesor Simon Carding del Instituto Quadram y la Universidad de East Anglia\u00bb.<\/p>\n
\u00abHasta ahora, solo hab\u00eda unas pocas herramientas que pod\u00edan llevar realizar un an\u00e1lisis complejo de forma espec\u00edfica para cada paciente y proporcionar varios mapas moleculares de una misma enfermedad. Con iSNP, ahora es una realidad evaluar grandes cohortes, comprender mejor las historias de patog\u00e9nesis individuales y encontrar el mejor tratamiento para el paciente adecuado\u00bb. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
Descifrando la ‘charla’ del microbioma intestinal para combatir la EII M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Johanne Brooks-Warburton et al, Un enfoque de gen\u00f3mica de sistemas para descubrir v\u00edas y prote\u00ednas patog\u00e9nicas espec\u00edficas del paciente en la colitis ulcerosa, Nature Communications (2022).DOI: 10.1038\/s41467-022-29998-8 Informaci\u00f3n de la revista:<\/strong> Nature Communications <\/p>\n Proporcionado por Quadram Institute Cita<\/strong>: Nueva herramienta de medicina de precisi\u00f3n descubre conexiones gen\u00e9ticas ocultas que podr\u00edan mejorar la medicina personalizada (28 de abril de 2022) consultado el 29 Agosto de 2022 de https:\/\/medicalxpress.com\/news\/2022-04-precision-medicine-tool-hidden-genetic.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Adem\u00e1s de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, no parte puede ser reproducida sin el permiso escrito sion El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Cr\u00e9dito: Pixabay\/CC0 Dominio p\u00fablico Todos los humanos portan variaciones gen\u00e9ticas en su ADN, llamadas polimorfismos de nucle\u00f3tido \u00fanico (SNP) que pueden ser la base de la susceptibilidad a enfermedades como diabetes y c\u00e1ncer. Para la enfermedad inflamatoria intestinal (EII), se han identificado muchos SNP asociados con la enfermedad, pero explotarlos cl\u00ednicamente ha demostrado ser un … Continuar leyendo \u00abNueva herramienta de medicina de precisi\u00f3n descubre conexiones gen\u00e9ticas ocultas que podr\u00edan mejorar la medicina personalizada\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-11441","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11441","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=11441"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11441\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=11441"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=11441"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=11441"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}