Resultados de PKS de personas hospitalizadas con COVID-19. Se utiliz\u00f3 un total de 23 v\u00edas KEGG para examinar un patr\u00f3n de presencia\/ausencia de v\u00edas metab\u00f3licas KEGG para B. vulgatus y la presencia o ausencia de cada v\u00eda KEGG se observ\u00f3 comparando la muestra del \u00faltimo d\u00eda de cada paciente con cada par posible de los mismos pacientes muestras Todas las muestras de pacientes fueron recolectadas previamente por Zuo et al. 17. El resultado PKS compartido por paciente se agrup\u00f3 en cuadros de diferentes colores. Cada columna de la tabla indica el ID individual, una muestra utilizada para cada comparaci\u00f3n por pares y los d\u00edas. Cr\u00e9dito: Informes cient\u00edficos (2022). DOI: 10.1038\/s41598-022-10472-w <\/p>\n
Casey D. Morrow, Ph.D., y sus colegas de la Universidad de Alabama en Birmingham desarrollaron previamente un m\u00e9todo de \u00abhuella digital\u00bb de microbioma llamado WSS que identifica cepas individuales de intestino particular bacterias, a trav\u00e9s del an\u00e1lisis de datos metagen\u00f3micos de muestras fecales. Han demostrado que cepas particulares en adultos tienden a permanecer estables con el tiempo, a menos que sean perturbadas por eventos como antibi\u00f3ticos o cirug\u00eda para la obesidad. Tambi\u00e9n vieron que una cepa de trasplante fecal de donante administrada para tratar infecciones por Clostridium difficile resistente a los medicamentos persisti\u00f3 en el receptor hasta dos a\u00f1os despu\u00e9s del trasplante. <\/p>\n
Morrow y Hyunmin Koo, Ph.D., refinaron el m\u00e9todo de huellas dactilares para incluir la b\u00fasqueda de variantes de un solo nucle\u00f3tido en las v\u00edas metab\u00f3licas de KEGG de una cepa en particular. Estas variantes pueden identificar subcepas de una sola cepa identificada por WSS. Para observar las subcepas de una cepa de Bacteroides vulgatus, por ejemplo, Morrow y Koo examinaron 23 v\u00edas metab\u00f3licas KEGG diferentes presentes en esa bacteria.<\/p>\n
Ahora han aplicado este an\u00e1lisis ampliado para monitorear los cambios en las subcepas durante per\u00edodos de tiempo m\u00e1s cortos, d\u00edas o semanas, en dos bacterias intestinales claveB. vulgatus y Bacteroides uniformis. Al comparar un peque\u00f1o n\u00famero de personas sanas y pacientes hospitalizados con COVID-19, ven una diferencia en la din\u00e1mica de la subtensi\u00f3n que, seg\u00fan dicen, presagia una desaceleraci\u00f3n de las tasas intr\u00ednsecas de variaci\u00f3n de la tensi\u00f3n en los pacientes enfermos. Esta ralentizaci\u00f3n podr\u00eda conducir eventualmente a una disbiosis en la comunidad de cepas microbianas que podr\u00eda presagiar un cambio en las cepas dominantes del microbioma intestinal.<\/p>\n
Ambas especies de Bacteroides se encuentran en gran abundancia en la flora intestinal, y pueden ser especies clave, organismos que ayudan a definir un ecosistema completo.<\/p>\n
El estudio de Koo y Morrow, \u00abIndicadores tempranos de disbiosis de cepa microbiana en la comunidad microbiana gastrointestinal humana de ciertos humanos sanos y pacientes hospitalizados con COVID19\u00bb, es publicado en la revista Scientific Reports.<\/p>\n
Koo y Morrow primero analizaron datos metagen\u00f3micos publicados previamente de 41 individuos muestreados con un a\u00f1o de diferencia y 11 individuos muestreados con 90 d\u00edas de diferencia. Examinaron una sola cepa dominante de B. vulgatus en cada individuo en los dos momentos para ver si hab\u00edan mostrado diferentes patrones de subcepas metab\u00f3licas de KEGG, como se detect\u00f3 a partir del an\u00e1lisis de variantes de un solo nucle\u00f3tido en las v\u00edas metab\u00f3licas de KEGG, o PKS. En general, la mayor\u00eda mostr\u00f3 un patr\u00f3n PKS de subcepa diferente entre los dos puntos temporales de cada individuo.<\/p>\n
Luego, los investigadores de la UAB analizaron datos metagen\u00f3micos publicados previamente de seis individuos sanos muestreados cada pocos d\u00edas durante tres a 10 semanas. , nuevamente analizando subcepas por variantes de un solo nucle\u00f3tido en 23 v\u00edas metab\u00f3licas KEGG. Tres individuos mostraron una subcepa diferente en cada punto de tiempo, mientras que tres subcepas mostraron patrones de PKS que aparec\u00edan, desaparec\u00edan y reaparec\u00edan en diferentes puntos de tiempo.<\/p>\n
Tambi\u00e9n se observaron patrones de PKS compartidos en dos de tres pacientes hospitalizados con COVID-19 que fueron muestreados varias veces.<\/p>\n
\u00abSugerimos que las comunidades microbianas intestinales bajo estr\u00e9s, como las que se encuentran en pacientes hospitalizados con COVID-19, podr\u00edan estar en un estado que indica el cambio potencial en el que la cepa dominante ser\u00eda superada por una cepa menor\u00bb, dijo Koo. \u00abLas alteraciones de la comunidad microbiana intestinal resultantes de una variaci\u00f3n de cepa podr\u00edan, a su vez, alterar la estructura de la comunidad e impactar las funciones en el metabolismo y la resistencia a la colonizaci\u00f3n\u00bb.<\/p>\n
\u00abUna de las caracter\u00edsticas de un sistema biol\u00f3gico complejo es que, a medida que se acerca a una transici\u00f3n cr\u00edtica, hay una desaceleraci\u00f3n de las tasas de cambio intr\u00ednsecas\u00bb, dijo Morrow. \u00abEl sistema entra en una condici\u00f3n relacionada con la autocorrelaci\u00f3n, donde los patrones se repetir\u00edan entre puntos de tiempo. Es posible que los grupos de v\u00edas metab\u00f3licas KEGG compartidos representen un estado de autocorrelaci\u00f3n en la comunidad de cepas microbianas intestinales que presagia un cambio de cepa\u00bb. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
Las cepas microbianas muestran patrones individualizados de estabilidad en el intestino del beb\u00e9 en desarrollo M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Hyunmin Koo et al, Indicadores tempranos de disbiosis de cepas microbianas en la comunidad microbiana gastrointestinal humana de ciertos humanos sanos y pacientes hospitalizados con COVID-19, Scientific Reports (2022). DOI: 10.1038\/s41598-022-10472-w Informaci\u00f3n de la revista:<\/strong> Scientific Reports <\/p>\n Proporcionado por la Universidad de Alabama en Birmingham Cita<\/strong>: Un m\u00e9todo de ‘huella digital’ de microbioma refinado rastrea variantes de una sola cepa de microbio intestinal (27 de abril de 2022) recuperado el 29 de agosto de 2022 de https:\/\/medicalxpress.com\/news\/2022-04-refined-microbiome-fingerprint-method-tracks.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor . Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Resultados de PKS de personas hospitalizadas con COVID-19. Se utiliz\u00f3 un total de 23 v\u00edas KEGG para examinar un patr\u00f3n de presencia\/ausencia de v\u00edas metab\u00f3licas KEGG para B. vulgatus y la presencia o ausencia de cada v\u00eda KEGG se observ\u00f3 comparando la muestra del \u00faltimo d\u00eda de cada paciente con cada par posible de los … Continuar leyendo \u00abUn m\u00e9todo refinado de ‘huella digital’ de microbioma rastrea variantes de una sola cepa de microbio intestinal\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-11522","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11522","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=11522"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11522\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=11522"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=11522"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=11522"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}