Cr\u00e9dito: Unsplash\/CC0 Dominio p\u00fablico <\/p>\n
Los cient\u00edficos han encontrado una nueva causa de c\u00e1ncer cerebral pedi\u00e1trico agresivo. El estudio del St. Jude Children’s Research Hospital es el primero en documentar c\u00f3mo un transpos\u00f3n, una pieza de ADN que \u00absalta\u00bb alrededor del genoma, puede donar su promotor para impulsar la expresi\u00f3n de un oncog\u00e9n. El trabajo fue publicado recientemente en Acta Neuropathologica. <\/p>\n
Los transposones son secuencias m\u00f3viles repetitivas dispersas por todo el genoma que constituyen aproximadamente el 17 % del genoma humano. Long Interspersed Element-1 (LINE-1 o L1) es el \u00fanico transpos\u00f3n activo de forma aut\u00f3noma en humanos. Un genoma humano promedio contiene aproximadamente 80-100 L1 activas con la capacidad de \u00absaltar\u00bb (retrotransponer). Como la mayor\u00eda de los genes humanos, las L1 tienen segmentos de ADN que regulan la expresi\u00f3n de los genes necesarios para la retrotransposici\u00f3n. Uno de esos elementos reguladores se llama promotor, que inicia la expresi\u00f3n g\u00e9nica en un sitio particular. En este estudio, los cient\u00edficos encontraron que la retrotransposici\u00f3n de L1 proporcion\u00f3 un promotor activo para un oncog\u00e9n, FOXR2. Esto condujo a la sobreexpresi\u00f3n de FOXR2 y, en \u00faltima instancia, al c\u00e1ncer.<\/p>\n
\u00abEl mecanismo de ‘donaci\u00f3n’ del promotor L1 es completamente novedoso\u00bb, dijo el coautor correspondiente Jinghui Zhang, Ph.D., presidente de St. Jude Computational Biolog\u00eda. \u00abNuestro estudio abre la puerta para que las personas investiguen este mecanismo en el inicio del c\u00e1ncer y otras enfermedades. Esto puede requerir el desarrollo o la mejora de m\u00e9todos computacionales para detectar tales eventos\u00bb.<\/p>\n
Una clasificaci\u00f3n de c\u00e1ncer desconcertante<\/p>\n
La investigaci\u00f3n comenz\u00f3 cuando un paciente de c\u00e1ncer pedi\u00e1trico lleg\u00f3 a la cl\u00ednica con un glioma de alto grado. Los m\u00e9dicos y cient\u00edficos quieren encontrar la causa subyacente de los gliomas de alto grado porque son c\u00e1nceres cerebrales agresivos que a menudo son resistentes al tratamiento.<\/p>\n
Normalmente, los pat\u00f3logos observan un tipo particular de modificaci\u00f3n qu\u00edmica del ADN, llamada metilaci\u00f3n. , como el est\u00e1ndar de oro para clasificar los tumores cerebrales, y compararlo con la histopatolog\u00eda para clasificar el c\u00e1ncer. Esta clasificaci\u00f3n ayuda a guiar los tratamientos. En este caso, el patr\u00f3n de metilaci\u00f3n y la histopatolog\u00eda no coincid\u00edan, por lo que el tumor no se clasific\u00f3.<\/p>\n
\u00abDesde una perspectiva cl\u00ednico patol\u00f3gica, el tumor parec\u00eda un glioma de alto grado, pero muestra el perfil de metilaci\u00f3n de un tumor embrionario del sistema nervioso central con activaci\u00f3n de FOXR2, que es muy raro\u00bb, dijo el coautor correspondiente Jason Chiang, MD, Ph.D., Departamento de Patolog\u00eda de St. Jude. \u00abEso nos llev\u00f3 a estudiar este tumor porque sugiere que la alta expresi\u00f3n de FOXR2 es el evento impulsor\u00bb.<\/p>\n
Los investigadores estaban intrigados por la falta de coincidencia que presentaba la muestra, especialmente la expresi\u00f3n de FOXR2. FOXR2 es un tipo de prote\u00edna llamada factor de transcripci\u00f3n, que se une al ADN y altera la expresi\u00f3n de otros genes. Por lo tanto, parec\u00eda probable que FOXR2 estuviera impulsando el c\u00e1ncer. Pero los investigadores necesitaban averiguar por qu\u00e9 se sobreexpresaba.<\/p>\n
El grupo de Zhang no pudo identificar por qu\u00e9 se activ\u00f3 usando los algoritmos computacionales disponibles. Por lo tanto, los investigadores observaron de cerca los datos de secuencia sin procesar.<\/p>\n
La basura de un algoritmo es el tesoro de un cient\u00edfico<\/p>\n
Los L1 se han informado anteriormente como impulsores del c\u00e1ncer cuando su retrotransposici\u00f3n interrumpe la funci\u00f3n normal del gen, por ejemplo, la correcta expresi\u00f3n de supresores de tumores. Sin embargo, antes de este trabajo, no hab\u00eda informes cient\u00edficos sobre los eventos de donaci\u00f3n del promotor L1 que impulsan la expresi\u00f3n del oncog\u00e9n, ya que normalmente la regi\u00f3n promotora se pierde durante la retrotransposici\u00f3n a una nueva regi\u00f3n de ADN.<\/p>\n
Dentro de algunos de los datos que un algoritmo de mapeo est\u00e1ndar normalmente se recorta, Zhang y el becario postdoctoral Xiaolong Chen, Ph.D., reconocieron que el patr\u00f3n recortado en el ADN parec\u00eda un L1 dentro del gen FOXR2. En un momento de casualidad, Diane Flasch, Ph.D., becaria postdoctoral que trabaj\u00f3 anteriormente con L1, reconoci\u00f3 los signos de un elemento regulador de L1. Los investigadores realizaron una t\u00e9cnica especial que secuencia regiones m\u00e1s largas de ADN para decodificar la estructura de este L1 retrotranspuesto en FOXR2.<\/p>\n
Los cient\u00edficos utilizaron muestras obtenidas a lo largo del tiempo para saber cu\u00e1ndo se produjo la retrotransposici\u00f3n durante el desarrollo del tumor. La donaci\u00f3n del promotor de L1 ocurri\u00f3 antes que otras mutaciones asociadas con el c\u00e1ncer, por lo que probablemente fue el evento impulsor que caus\u00f3 el c\u00e1ncer.<\/p>\n
Dado que nunca se sospech\u00f3 que los elementos reguladores de L1 insertados estuvieran involucrados en la tumorig\u00e9nesis, los algoritmos computacionales existentes fueron no est\u00e1 dise\u00f1ado para detectar tal evento. Se necesit\u00f3 una mente humana para ver y comprender el patr\u00f3n por primera vez. <\/p>\n
\u00abLos cient\u00edficos deben estar atentos a todas las posibilidades\u00bb, dijo Chiang. \u00abNo filtre informaci\u00f3n que crea que es basura. A veces, el oro est\u00e1 en la basura\u00bb. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
El estudio epigen\u00e9tico proporciona nuevos conocimientos sobre los or\u00edgenes del glioma M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Diane A. Flasch et al, La adquisici\u00f3n del promotor som\u00e1tico LINE-1 impulsa la activaci\u00f3n oncog\u00e9nica de FOXR2 en un tumor cerebral pedi\u00e1trico , Acta neuropatol\u00f3gica (2022). DOI: 10.1007\/s00401-022-02420-9 Proporcionado por St. Jude Childrens Research Hospital 29 de agosto de 2022 de https:\/\/medicalxpress.com\/news\/2022-04-junk-dna-childhood-brain-cancer.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Cr\u00e9dito: Unsplash\/CC0 Dominio p\u00fablico Los cient\u00edficos han encontrado una nueva causa de c\u00e1ncer cerebral pedi\u00e1trico agresivo. El estudio del St. Jude Children’s Research Hospital es el primero en documentar c\u00f3mo un transpos\u00f3n, una pieza de ADN que \u00absalta\u00bb alrededor del genoma, puede donar su promotor para impulsar la expresi\u00f3n de un oncog\u00e9n. El trabajo fue … Continuar leyendo \u00abUn estudio encuentra que el ADN ‘basura’ saltante es una nueva causa de c\u00e1ncer cerebral infantil\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-11827","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11827","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=11827"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11827\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=11827"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=11827"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=11827"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}