Una imagen de una historia de Minerva sobre el c\u00e1ncer de pulm\u00f3n. Cr\u00e9dito: Minerva <\/p>\n
Para muchos de nosotros, Google Maps se ha convertido en una herramienta diaria indispensable: abrimos un navegador web y accedemos instant\u00e1neamente a un poderoso mapa donde podemos obtener direcciones, acercar y desplazarse, superponer caracter\u00edsticas como el tr\u00e1fico y el terreno, y buscar puntos de referencia espec\u00edficos. Pero, \u00bfy si hubiera una herramienta con una funcionalidad similar para explorar un tipo de mapa completamente diferente? \u00bfQu\u00e9 pasar\u00eda si tuvi\u00e9ramos la habilidad de Magic School Bus para profundizar en los detalles de los tejidos que componen el cuerpo humano? <\/p>\n
Esta es precisamente la idea detr\u00e1s de Minerva, una herramienta de software desarrollada por investigadores de la Escuela de Medicina de Harvard en el Laboratorio de Farmacolog\u00eda de Sistemas en el Departamento de Biolog\u00eda de Sistemas en el Instituto Blavatnik en HMS.<\/p>\n
Minerva, disponible en l\u00ednea para nadie, lleva el nombre de la diosa romana de la sabidur\u00eda. Permite a los usuarios acceder a mapas detallados de muestras de tejido recopiladas durante la investigaci\u00f3n, que van desde tumores cancerosos hasta m\u00fasculo card\u00edaco en peligro. En cada mapa, los usuarios pueden hacer zoom y desplazarse, superponer funciones como c\u00e9lulas inmunitarias y explorar \u00e1reas destacadas. Los mapas tambi\u00e9n incorporan la experiencia de cient\u00edficos y m\u00e9dicos que pueden crear narrativas para guiar a los usuarios a trav\u00e9s de las muestras. <\/p>\n
Los investigadores esperan que a medida que crezca la biblioteca de muestras de tejido de Minerva, la herramienta sea utilizada por otros cient\u00edficos, revistas cient\u00edficas, m\u00e9dicos, pasantes, estudiantes de medicina o cualquier persona que simplemente tenga curiosidad, lo que permitir\u00e1 obtener informaci\u00f3n cient\u00edfica y experiencia para ser compartida de manera m\u00e1s amplia.<\/p>\n
\u00abRecopilamos una gran cantidad de datos de investigaci\u00f3n, pero todav\u00eda no muchos de ellos son muy accesibles, por lo que la pregunta es c\u00f3mo movilizar datos complejos para que las personas puedan acceder a ellos en una manera \u00fatil\u00bb, dijo Peter Sorger, profesor de Farmacolog\u00eda de Sistemas de HMS Otto Krayer, quien codirige el proyecto con Sandro Santagata, profesor asociado de patolog\u00eda de HMS en el Brigham and Women’s Hospital. \u00abDe eso se trata realmente Minerva\u00bb.<\/p>\n
Ahogarse en datos<\/p>\n
A medida que avanza la tecnolog\u00eda de im\u00e1genes, tambi\u00e9n lo hace la capacidad de los cient\u00edficos para recopilar datos de resoluci\u00f3n extremadamente alta sobre tejidos en el ser humano. cuerpo. Con t\u00e9cnicas de im\u00e1genes multiplexadas, los investigadores pueden recopilar tales detalles a nivel de una sola c\u00e9lula y esos datos pueden contener 50 o 60 capas de informaci\u00f3n sobre marcadores de prote\u00ednas y otras caracter\u00edsticas. Hace varios a\u00f1os, Sorger, Santagata y su equipo desarrollaron su propia t\u00e9cnica de im\u00e1genes multiplexadas, inmunofluorescencia c\u00edclica o CyCIF, que est\u00e1 disponible gratuitamente y utiliza instrumentos y productos qu\u00edmicos que se encuentran en la mayor\u00eda de los laboratorios.<\/p>\n
Como los cient\u00edficos utilizaron CyCIF en su propia investigaci\u00f3n, se sintieron frustrados por el hecho de que terabytes de datos de im\u00e1genes complejos y de alta resoluci\u00f3n se destilaban rutinariamente en unas pocas im\u00e1genes peque\u00f1as y est\u00e1ticas cuando publicaban art\u00edculos en revistas cient\u00edficas.<\/p>\n
\u00abLo que usted publicar es un sello postal, una peque\u00f1a figura JPEG diminuta, de 600 p\u00edxeles de ancho, mientras que la imagen real tiene m\u00e1s de unos pocos miles de millones de p\u00edxeles, pero est\u00e1 atascada en la computadora de alguien\u00bb, dijo Sorger.<\/p>\n
En los \u00faltimos a\u00f1os, la comunidad de investigaci\u00f3n ha enfatizado cada vez m\u00e1s la importancia de un intercambio de datos m\u00e1s completo, o lo que se ha denominado datos \u00abFAIR\u00bb: localizables, accesibles, interoperables y reproducibles. En enero de 2023, entrar\u00e1 en vigor una nueva pol\u00edtica de los Institutos Nacionales de la Salud sobre la gesti\u00f3n y el intercambio de datos, que requerir\u00e1 que todos los cient\u00edficos que reciben fondos de los NIH presenten un plan que describa c\u00f3mo se gestionar\u00e1n y compartir\u00e1n sus datos.<\/p>\n
Una imagen de un Historia de Minerva sobre el c\u00e1ncer de mama. La leyenda en la esquina superior derecha identifica diferentes capas de informaci\u00f3n molecular en la muestra de tejido y el panel de narraci\u00f3n en el lado izquierdo describe la imagen en detalle. Cr\u00e9dito: Minerva <\/p>\n
Sin embargo, a pesar de estos esfuerzos, \u00abnuestro trabajo nos ha demostrado que no hay suficiente inversi\u00f3n en lo que realmente se necesita para acceder a cualquiera de estos datos\u00bb, dijo Sorger. \u00abSeguimos recopilando m\u00e1s y m\u00e1s datos, y seguimos aspirando a hacerlos m\u00e1s accesibles y compartibles, pero no estamos creando las herramientas de software necesarias para hacer esto\u00bb.<\/p>\n
Esto est\u00e1 en en parte porque los datos cient\u00edficos a menudo son grandes, torpes y dif\u00edciles de entender incluso para los expertos sin una gu\u00eda (como Google Maps sin etiquetas), por lo que dise\u00f1ar herramientas que respalden el intercambio de informaci\u00f3n de una manera \u00fatil es m\u00e1s f\u00e1cil decirlo que hacerlo. <\/p>\n
\u00abPodr\u00edas descargar una de nuestras im\u00e1genes y luego estar\u00eda en tu computadora ocupando tu disco duro\u00bb, explic\u00f3 Sorger. \u00abSin un software especializado, gran parte del cual todav\u00eda est\u00e1 en desarrollo, no podr\u00edas mirarlo. No podr\u00edas interactuar con \u00e9l. Y aunque pudieras, no necesariamente sabr\u00edas de qu\u00e9 se trata\u00bb.<\/p>\n
Ah\u00ed es donde entra en juego Minerva.<\/p>\n
D\u00e1ndole sentido a las cosas<\/p>\n
Basada en la nube, Minerva est\u00e1 organizada en historias, cada una de las cuales se centra en una sola muestra de tejido o en un conjunto. de muestras relacionadas. A medida que los usuarios interact\u00faan con una imagen, pueden moverse de un lugar a otro y acercar o alejar para explorar. Tambi\u00e9n pueden activar y desactivar diferentes capas de informaci\u00f3n, incluidas las c\u00e9lulas inmunitarias, otros tipos de c\u00e9lulas o marcadores de prote\u00ednas, o la arquitectura f\u00edsica del tejido, entre otras cosas.<\/p>\n
Las historias de Minerva tambi\u00e9n incluyen un \u00abdocente digital ,\u00bb un elemento de narraci\u00f3n que consiste en un panel de texto que aparece junto a cada imagen. La idea se inspir\u00f3 en los recorridos del museo, tanto los recorridos de audio para ver en persona como los recorridos en l\u00ednea desarrollados durante la pandemia de COVID-19, que gu\u00edan a los visitantes a trav\u00e9s de una exhibici\u00f3n al ofrecer una introducci\u00f3n narrativa a diferentes obras de arte. El panel de narraci\u00f3n de las historias de Minerva gu\u00eda a los usuarios a trav\u00e9s de las funciones clave de una muestra y proporciona informaci\u00f3n adicional sobre cada funci\u00f3n a lo largo del camino. Los usuarios pueden detenerse para explorar libremente la muestra en cualquier momento y volver a la narraci\u00f3n m\u00e1s tarde. <\/p>\n
Los usuarios tambi\u00e9n pueden crear sus propias historias de Minerva con narraci\u00f3n.<\/p>\n
Sorger y Santagata describieron Minerva y la idea de gu\u00edas narrativas en l\u00ednea para muestras de tejido en una perspectiva reciente en Nature Biomedical Engineering.<\/p>\n
Hasta ahora, muchas historias de Minerva se centran en el c\u00e1ncer, incluido el melanoma, el c\u00e1ncer de pulm\u00f3n y el c\u00e1ncer colorrectal. El c\u00e1ncer proporciona un punto de partida obvio, dijo Sorger, porque se diagnostica en gran medida en base a muestras de tejido en 85 a 90 por ciento de los casos, seg\u00fan su estimaci\u00f3n. Sin embargo, las historias de Minerva se pueden crear para cualquier afecci\u00f3n que aparezca o deje sus marcas en un tejido, incluidas enfermedades card\u00edacas, tuberculosis, neurodegeneraci\u00f3n y COVID-19.<\/p>\n
Una imagen de una historia de Minerva sobre el c\u00e1ncer colorrectal. Las flechas en el medio se\u00f1alan una caracter\u00edstica clave en la muestra de tejido, la leyenda en la esquina superior derecha identifica diferentes capas de informaci\u00f3n molecular y el panel de narraci\u00f3n en el lado izquierdo proporciona una descripci\u00f3n detallada de la imagen. Cr\u00e9dito: Minerva <\/p>\n
Sorger y Santagata han estado creando historias de Minerva a partir de im\u00e1genes asociadas con art\u00edculos que publican en revistas cient\u00edficas, as\u00ed como im\u00e1genes de investigaciones no publicadas, lo que ha dado como resultado unas doscientas historias hasta el momento. \u00abEstas son esencialmente mini publicaciones\u00bb que permiten a los cient\u00edficos acceder a mucha m\u00e1s informaci\u00f3n de la que est\u00e1 disponible en un art\u00edculo, explic\u00f3 Sorger.<\/p>\n
Por ejemplo, los investigadores crearon una historia de Minerva sobre el melanoma para un art\u00edculo reciente en Cancer Discovery en el que crearon mapas espaciales a escala fina que muestran c\u00f3mo interact\u00faan las c\u00e9lulas individuales a medida que avanza el c\u00e1ncer. En el futuro, los investigadores prev\u00e9n que cada peque\u00f1a imagen est\u00e1tica en un art\u00edculo cient\u00edfico se convierta en un punto de entrada a una historia completa de Minerva. \u00abVemos que complementa una figura convencional al proporcionar m\u00e1s contenido y contexto\u00bb, dijo Sorger.<\/p>\n
Las im\u00e1genes en los libros de texto m\u00e9dicos podr\u00edan convertirse de manera similar en historias de Minerva. Por ejemplo, en lugar de que un libro de texto brinde una instant\u00e1nea del tejido con un infarto de miocardio, un estudiante podr\u00eda hacer clic en la imagen y usar Minerva para explorar libremente la representaci\u00f3n m\u00e1s din\u00e1mica visualmente y mucho m\u00e1s detallada de esa muestra. \u00abOfrece un compromiso participativo con im\u00e1genes que esperamos mejoren la educaci\u00f3n m\u00e9dica\u00bb, dijo Santagata.<\/p>\n
Minerva tambi\u00e9n puede ser \u00fatil para los pat\u00f3logos en formaci\u00f3n que est\u00e1n aprendiendo a analizar muestras de tejido. Actualmente, los estudiantes de patolog\u00eda se sientan frente a un microscopio de m\u00faltiples cabezales y miran un portaobjetos de tejido mientras un instructor los gu\u00eda a trav\u00e9s del caso y les se\u00f1ala las caracter\u00edsticas cr\u00edticas para hacer un diagn\u00f3stico. Las historias de Minerva contienen gran parte de esta informaci\u00f3n, con la ventaja de que se puede acceder a ellas bajo demanda y desde cualquier lugar. \u00abCon Minerva, podemos capturar la experiencia de una amplia gama de personas y difundirla ampliamente\u00bb, dijo Santagata. \u00abRealmente ampl\u00eda nuestro alcance y tambi\u00e9n proporciona m\u00e1s tipos de datos que podemos usar para educar a las personas\u00bb.<\/p>\n
Sorger y Santagata creen que Minerva tambi\u00e9n podr\u00eda respaldar un impulso m\u00e1s amplio para digitalizar la patolog\u00eda. Actualmente, la patolog\u00eda todav\u00eda se basa en gran medida en muestras de tejido f\u00edsico, que deben enviarse por correo siempre que los colegas de diferentes instituciones quieran consultarse entre s\u00ed. De hecho, Santagata estima que alrededor de un mill\u00f3n de portaobjetos de alrededor de 100.000 casos pasan por el departamento de patolog\u00eda de Brigham and Women’s cada a\u00f1o. Con Minerva, los pat\u00f3logos pod\u00edan compartir f\u00e1cilmente versiones digitales de muestras de tejido, junto con la informaci\u00f3n esencial necesaria para interpretarlas.<\/p>\n
De acuerdo con su objetivo de hacer que Minerva est\u00e9 ampliamente disponible, Sorger y Santagata han creado la herramienta y todos su c\u00f3digo de acceso abierto. Estiman que 10 grupos de investigaci\u00f3n de diferentes universidades han construido sus propias historias de Minerva, y alrededor de 25 laboratorios est\u00e1n usando activamente Minerva, incluidos varios laboratorios conectados a la Red Atlas de Tumores Humanos del Instituto Nacional del C\u00e1ncer. Los investigadores est\u00e1n trabajando actualmente en la integraci\u00f3n de Minerva en las herramientas existentes, incluido cBioPortal, una herramienta de acceso abierto para explorar conjuntos de datos de gen\u00f3mica del c\u00e1ncer, un paso que esperan que ampl\u00ede en gran medida el uso de Minerva. Tambi\u00e9n creen que Minerva puede atraer a personas no cient\u00edficas interesadas en aprender m\u00e1s sobre una afecci\u00f3n en particular, incluidos los defensores de los pacientes con c\u00e1ncer o el p\u00fablico lego cient\u00edficamente curioso.<\/p>\n
\u00abNuestra misi\u00f3n es crear bienes p\u00fablicos. Somos sobre educaci\u00f3n e investigaci\u00f3n, y son de dominio p\u00fablico\u00bb, dijo Sorger. \u00abSi queremos crear algo que sea \u00fatil en una clase o en una investigaci\u00f3n, no queremos poner barreras a su uso\u00bb.<\/p>\n
M\u00e1s all\u00e1 de hacer que los datos cient\u00edficos sean m\u00e1s accesibles, los investigadores esperan que Minerva inspirar un mayor inter\u00e9s en la ciencia y la investigaci\u00f3n cient\u00edfica.<\/p>\n
\u00abEs extraordinario poder tomar lo que una vez fue b\u00e1sicamente una imagen est\u00e1tica y darle vida. Hay cierta maravilla y magia que es parte de la experiencia de participar e interactuar con los datos de esta manera\u00bb, dijo Santagata. \u00abEsperamos que Minerva haga que la ciencia sea m\u00e1s emocionante y comprensible para otros cient\u00edficos, para el p\u00fablico en general e incluso para nosotros mismos\u00bb. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
Explorando mapas de c\u00e1ncer M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Rumana Rashid et al, Gu\u00edas narrativas en l\u00ednea para la interpretaci\u00f3n de im\u00e1genes de patolog\u00eda digital y datos de atlas de tejidos, Nature Biomedical Engineering (2021) . DOI: 10.1038\/s41551-021-00789-8<\/p>\n Ajit J. Nirmal et al, El panorama espacial de la progresi\u00f3n y la inmunoedici\u00f3n en el melanoma primario con resoluci\u00f3n unicelular, Cancer Discovery (2022). DOI: 10.1158\/2159-8290.CD-21-1357 Informaci\u00f3n de la revista:<\/strong> Cancer Discovery , Nature Biomedical Engineering <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Una imagen de una historia de Minerva sobre el c\u00e1ncer de pulm\u00f3n. Cr\u00e9dito: Minerva Para muchos de nosotros, Google Maps se ha convertido en una herramienta diaria indispensable: abrimos un navegador web y accedemos instant\u00e1neamente a un poderoso mapa donde podemos obtener direcciones, acercar y desplazarse, superponer caracter\u00edsticas como el tr\u00e1fico y el terreno, y … Continuar leyendo \u00abUna nueva herramienta hace que los datos de im\u00e1genes de alta resoluci\u00f3n sobre tejidos humanos sean m\u00e1s f\u00e1ciles de entender y usar\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-11890","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11890","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=11890"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11890\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=11890"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=11890"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=11890"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}