Micrograf\u00eda electr\u00f3nica de transmisi\u00f3n de part\u00edculas del virus SARS-CoV-2, aisladas de un paciente. Imagen capturada y coloreada en el Centro de Investigaci\u00f3n Integrada (IRF) del NIAID en Fort Detrick, Maryland. Cr\u00e9dito: NIAID <\/p>\n
La aparici\u00f3n de variantes del virus SARS-CoV-2 que est\u00e1n agregando giros en la batalla contra el COVID-19 resalta la necesidad de un mejor monitoreo gen\u00f3mico del virus, dice Katia Koelle, profesora asociada de biolog\u00eda en la Universidad de Emory. <\/p>\n
\u00abLa vigilancia gen\u00f3mica mejorada del SARS-CoV-2 en todos los estados realmente nos ayudar\u00eda a comprender mejor c\u00f3mo est\u00e1 evolucionando y propag\u00e1ndose el virus que causa la pandemia en los Estados Unidos\u00bb, dice Koelle. \u00abSe necesitan m\u00e1s fondos federales, junto con est\u00e1ndares centralizados para la recolecci\u00f3n de muestras y la secuenciaci\u00f3n gen\u00e9tica. Los investigadores necesitan acceso a dichos metadatos para rastrear mejor c\u00f3mo se propaga geogr\u00e1ficamente el virus e identificar nuevas variantes que puedan dificultar su control, de modo que los funcionarios de salud pueden responder de manera m\u00e1s r\u00e1pida y efectiva\u00bb.<\/p>\n
Koelle estudia la interacci\u00f3n entre la evoluci\u00f3n viral y la propagaci\u00f3n epidemiol\u00f3gica de enfermedades infecciosas virales. Es autora principal de un art\u00edculo \u00abViewpoint\u00bb reci\u00e9n publicado en la revista Science sobre la importancia de la secuenciaci\u00f3n del SARS-CoV-2 para controlar la pandemia de COVID-19.<\/p>\n
Michael Martin, Ph.D. estudiante del Programa de Poblaci\u00f3n, Biolog\u00eda y Ecolog\u00eda de Emory y miembro del laboratorio de Koelle, es el primer autor del art\u00edculo de Science. David VanInsberghe, becario postdoctoral en el laboratorio de Koelle, es coautor.<\/p>\n
\u00abLa investigaci\u00f3n sobre el SARS-CoV-2 ha ido a la velocidad del rayo\u00bb, dice Martin. \u00abEsta aceleraci\u00f3n nos ha proporcionado uno de los conjuntos de datos m\u00e1s grandes jam\u00e1s recopilados para una enfermedad. Hemos aprendido mucho hasta ahora sobre c\u00f3mo se propaga y se adapta este virus, pero todav\u00eda tenemos muchos puntos ciegos que deben abordarse\u00bb. <\/p>\n
El art\u00edculo resume informaci\u00f3n clave sobre el SARS-CoV-2 que ya se ha obtenido mediante la secuenciaci\u00f3n de su genoma a partir de muestras de pacientes individuales. Tambi\u00e9n cita los desaf\u00edos que quedan, incluida la recopilaci\u00f3n e integraci\u00f3n de metadatos en los an\u00e1lisis gen\u00e9ticos y la necesidad de desarrollar m\u00e9todos computacionales m\u00e1s eficientes y escalables para aplicar a cientos de miles de genomas.<\/p>\n
Un genoma es un material gen\u00e9tico del organismo. Los genomas humanos est\u00e1n formados por ADN de doble cadena, codificado en cuatro letras base de nucle\u00f3tidos diferentes. Un solo genoma humano consta de m\u00e1s de 3 mil millones de pares de bases. Por el contrario, el genoma de los coronavirus, incluido el SARS-CoV-2, est\u00e1 hecho de ARN, que puede tener una estructura m\u00e1s simple que el ADN. El genoma del SARS-CoV-2, por ejemplo, consta de una sola hebra de ARN de solo 30 000 letras. La secuenciaci\u00f3n es una t\u00e9cnica que proporciona una lectura de estas letras.<\/p>\n
Si se encuentra el virus SARS-CoV-2 en una muestra tomada con un hisopo de la nariz o la boca de alguien, se confirma la probabilidad de que la persona tenga el virus, ya sea que tengan s\u00edntomas de COVID-19 o no. El virus de la muestra tambi\u00e9n se puede secuenciar.<\/p>\n
\u00abSecuenciar el virus es como tomarle las huellas dactilares\u00bb, explica Koelle. \u00abY en funci\u00f3n de lo cerca que coincidan las huellas dactilares entre las muestras, es decir, lo cerca que est\u00e9n gen\u00e9ticamente, a veces se puede saber qui\u00e9n est\u00e1 infectando a qui\u00e9n. El an\u00e1lisis de secuencias de muestras tomadas de individuos infectados en una regi\u00f3n determinada a lo largo del tiempo puede proporcionar a\u00fan m\u00e1s informaci\u00f3n\u00bb.<\/p>\n
Los an\u00e1lisis de los datos de secuenciaci\u00f3n del SARS-CoV-2 han permitido a los investigadores estimar el momento del contagio del SARS-CoV-2 a los humanos; identificar algunas de las rutas de transmisi\u00f3n en su difusi\u00f3n global; determinar las tasas de infecci\u00f3n y c\u00f3mo cambian dentro de una regi\u00f3n; e identificar el surgimiento de algunas nuevas variantes de inter\u00e9s.<\/p>\n
Los genomas virales pueden mutar durante la replicaci\u00f3n, cambiando letras a medida que se propagan a nuevas personas. Es probable que la mayor\u00eda de estas mutaciones aleatorias no afecten la transmisibilidad o la virulencia de un virus, pero algunas pueden dificultar a\u00fan m\u00e1s su lucha. La evidencia preliminar, por ejemplo, sugiere que una variante del SARS-CoV-2 que surgi\u00f3 recientemente en el Reino Unido puede transmitirse con mayor facilidad y ser potencialmente m\u00e1s grave. Una variante sudafricana muestra signos de que puede reducir la eficacia de las vacunas existentes, mientras que una variante detectada por primera vez en Brasil tambi\u00e9n contiene mutaciones que los funcionarios de salud temen que puedan hacer que el virus se propague m\u00e1s r\u00e1pidamente.<\/p>\n
\u00abPuede ser dif\u00edcil para identificar qu\u00e9 variantes realmente cambian la forma en que el virus se replica, se propaga y causa enfermedades debido a factores de confusi\u00f3n\u00bb, explica Martin. \u00abSi una variante se propaga m\u00e1s r\u00e1pidamente, por ejemplo, hay que analizar si se debi\u00f3 a que se volvi\u00f3 m\u00e1s transmisible o si alguien que estaba infectado asisti\u00f3 a una gran reuni\u00f3n\u00bb.<\/p>\n
Los mejores investigadores de datos agrega, m\u00e1s r\u00e1pido pueden resolver tales acertijos.<\/p>\n
Los avances tecnol\u00f3gicos durante los \u00faltimos a\u00f1os han hecho que sea m\u00e1s eficiente y menos costoso generar datos de secuenciaci\u00f3n. Apenas un a\u00f1o despu\u00e9s de su aparici\u00f3n, m\u00e1s de 400 000 secuencias del SARS-CoV-2 ya est\u00e1n disponibles en bases de datos p\u00fablicas, como la plataforma GISAID que se lanz\u00f3 en 2008 para compartir informaci\u00f3n entre los Centros Nacionales de Influenza para el Sistema Mundial de Vigilancia y Respuesta a la Influenza de la OMS .<\/p>\n
\u00abUna gran parte de los datos p\u00fablicos de secuenciaci\u00f3n del SARS-CoV-2 provienen del Reino Unido\u00bb, se\u00f1ala Koelle. \u00abEso se debe a que el gobierno brit\u00e1nico tiene una iniciativa para realizar un muestreo de alta densidad del genoma del SARS-CoV-2\u00bb.<\/p>\n
El rico conjunto de datos del Reino Unido ayud\u00f3 a identificar el surgimiento de la variante en Gran Breta\u00f1a que es extendi\u00e9ndose r\u00e1pidamente. \u00abEs posible que surjan otras variantes de preocupaci\u00f3n en otros lugares del mundo adem\u00e1s de las ya identificadas, pero simplemente no lo sabemos porque no tenemos una vigilancia tan buena en esos lugares\u00bb, dice Koelle.<\/p>\n
\u00abSi bien los esfuerzos de Estados Unidos para secuenciar el SARS-CoV-2 a partir de muestras en todo el pa\u00eds han sido lentos, existen varios esfuerzos excelentes de secuenciaci\u00f3n viral y an\u00e1lisis filogen\u00e9ticos, principalmente impulsados por investigadores acad\u00e9micos, que han ayudado a comprender el SARS- transmisi\u00f3n de CoV-2 m\u00e1s localmente\u00bb, dice Koelle. \u00abTenemos la experiencia en los EE. UU., pero el esfuerzo es m\u00e1s fragmentario\u00bb.<\/p>\n
\u00abNecesitamos un programa coordinado y estandarizado a nivel nacional para hacer una secuenciaci\u00f3n generalizada del SARS-CoV-2 en los Estados Unidos\u00bb, Martin dice. \u00abMuchos de los datos recopilados ahora solo tienen un identificador estatal, pero necesitamos una mayor resoluci\u00f3n y, al mismo tiempo, proteger la privacidad del paciente. M\u00e1s identificadores a nivel de condado, por ejemplo, ser\u00edan una forma de mejorar en gran medida la calidad y la profundidad de los datos\u00bb.<\/p>\n
Una vez que la pandemia de COVID-19 disminuya, es importante continuar construyendo la infraestructura y los sistemas nacionales para la vigilancia de enfermedades infecciosas, incluida la secuenciaci\u00f3n viral, y mantenerlos en su lugar, enfatizan ambos investigadores.<\/p>\n
\u00bb habr\u00e1 m\u00e1s pandemias de enfermedades infecciosas, y debemos estar mejor preparados\u00bb, dice Martin. <\/p>\n
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Siga las \u00faltimas noticias sobre el brote de coronavirus (COVID-19) M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> MA Martin el al., \u00abPerspectivas de las secuencias del SARS-CoV-2\u00bb, Science (2020). science.sciencemag.org\/cgi\/doi … 1126\/science.abf3995 Informaci\u00f3n de la revista:<\/strong> Science <\/p>\n Proporcionado por la Universidad de Emory Cita<\/strong>: La secuenciaci\u00f3n viral puede revelar c\u00f3mo se propaga y evoluciona el SARS-CoV-2 (2021, enero 28) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https:\/\/medicalxpress.com\/news\/2021-01-viral-sequencing-reveal-sars-cov-evolves.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Micrograf\u00eda electr\u00f3nica de transmisi\u00f3n de part\u00edculas del virus SARS-CoV-2, aisladas de un paciente. Imagen capturada y coloreada en el Centro de Investigaci\u00f3n Integrada (IRF) del NIAID en Fort Detrick, Maryland. Cr\u00e9dito: NIAID La aparici\u00f3n de variantes del virus SARS-CoV-2 que est\u00e1n agregando giros en la batalla contra el COVID-19 resalta la necesidad de un mejor … Continuar leyendo \u00abLa secuenciaci\u00f3n viral puede revelar c\u00f3mo se propaga y evoluciona el SARS-CoV-2\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-12462","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/12462","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=12462"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/12462\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=12462"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=12462"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=12462"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}