Una micrograf\u00eda electr\u00f3nica de barrido coloreada del virus SARS-CoV-2. Cr\u00e9dito: NIAID <\/p>\n
La secuenciaci\u00f3n del genoma viral de las aguas residuales puede detectar nuevas variantes del SARS-CoV-2 antes de que sean detectadas por la secuenciaci\u00f3n cl\u00ednica local, seg\u00fan un nuevo estudio publicado en mBio, una revista de acceso abierto de la Sociedad Estadounidense de Microbiolog\u00eda. La capacidad de rastrear las mutaciones del SARS-CoV-2 en las aguas residuales podr\u00eda ser particularmente \u00fatil para rastrear nuevas variantes, como la cepa B.1.17 que ahora est\u00e1 muy extendida en el Reino Unido y ya se introdujo en los EE. UU. <\/p>\n
\u00abSARS CoV-2 El virus es excretado por personas infectadas por COVID-19 y los desechos fecales terminan en los sistemas de aguas residuales. Al tomar muestras de aguas residuales, podemos obtener informaci\u00f3n sobre las infecciones de toda una poblaci\u00f3n. Algunos sistemas de aguas residuales sirven a varios miles de personas. Algunos sirven a cientos de miles. de personas\u00bb, dijo la investigadora principal del estudio, Kara Nelson, Ph.D., profesora de ingenier\u00eda civil y ambiental en la Facultad de Ingenier\u00eda de la Universidad de California-Berkeley. \u00abEl muestreo de aguas residuales es una forma muy eficiente de obtener informaci\u00f3n. Tambi\u00e9n es una fuente de informaci\u00f3n menos sesgada, porque podemos obtener informaci\u00f3n de todas las personas en la cuenca del alcantarillado, ya sea que se les haga la prueba en una cl\u00ednica o no. Sabemos que hay individuos que tienen infecciones asintom\u00e1ticas que tal vez nunca se hagan la prueba\u00bb.<\/p>\n
En el nuevo estudio, los investigadores desarrollaron y usaron un m\u00e9todo novedoso para tomar muestras de aguas residuales. Cuando los investigadores secuencian el ARN concentrado y extra\u00eddo de muestras de aguas residuales, puede haber muchas cepas diferentes presentes porque hay muchos individuos que contribuyen a la muestra. Sin embargo, es un desaf\u00edo distinguir la se\u00f1al gen\u00e9tica del SARS-CoV-2 de los miles de millones de bacterias y virus que las personas excretan todos los d\u00edas. Los investigadores deben identificar el SARS CoV-2 en medio de una sopa completa de otro material gen\u00f3mico.<\/p>\n
\u00abLa forma en que necesitamos procesar la informaci\u00f3n de la secuencia es compleja. Una contribuci\u00f3n de este documento es la capacidad de preparar muestras para la secuenciaci\u00f3n. de aguas residuales En lugar de secuenciar directamente todo lo presente, utilizamos un enfoque de enriquecimiento en el que primero intenta enriquecer el ARN que le interesa \u00ab, dijo el Dr. Nelson. \u00abLuego, desarrollamos un enfoque de an\u00e1lisis bioinform\u00e1tico novedoso que era lo suficientemente sensible como para detectar una sola diferencia de nucle\u00f3tidos. No se puede ser m\u00e1s sensible que eso\u00bb.<\/p>\n
Los investigadores secuenciaron el ARN directamente de las aguas residuales recolectadas por la empresa de servicios p\u00fablicos municipales. distritos en el \u00c1rea de la Bah\u00eda de San Francisco para generar genomas completos y casi completos de SARS-CoV-2. Los investigadores encontraron que los principales genotipos de SARS-CoV-2 de consenso detectados en las aguas residuales eran id\u00e9nticos a los genomas cl\u00ednicos de la regi\u00f3n. Si bien las variantes de aguas residuales observadas eran m\u00e1s similares a los genotipos locales derivados de pacientes de California que a los de otras regiones, tambi\u00e9n detectaron variantes de un solo nucle\u00f3tido que solo se hab\u00edan informado en otros lugares de los Estados Unidos o en todo el mundo. Por lo tanto, los investigadores encontraron que la secuenciaci\u00f3n de aguas residuales puede proporcionar evidencia de introducciones recientes de linajes virales antes de que sean detectados por la secuenciaci\u00f3n cl\u00ednica local. Al comprender qu\u00e9 cepas de SARS-CoV-2 est\u00e1n presentes en las poblaciones a lo largo del tiempo, los investigadores pueden obtener informaci\u00f3n sobre c\u00f3mo se produce la transmisi\u00f3n y si nuevas variantes, como B.1.1.7, dominan la transmisi\u00f3n.<\/p>\n
\u00bb De todos los que se someten a pruebas, solo una fracci\u00f3n de esas muestras se secuencian. Cuando toma muestras de aguas residuales, obtiene datos m\u00e1s completos y menos sesgados sobre su poblaci\u00f3n \u00ab, dijo el Dr. Nelson. \u00abParece que podr\u00edamos obtener una se\u00f1al m\u00e1s temprana en las aguas residuales si aparece una nueva variante en comparaci\u00f3n con solo confiar en la secuenciaci\u00f3n de muestras cl\u00ednicas. El primer paso es saber que el SARS-CoV-2 est\u00e1 presente en una poblaci\u00f3n\u00bb. en proporcionar informaci\u00f3n para ayudar a controlar la propagaci\u00f3n del virus, pero saber qu\u00e9 variantes est\u00e1n presentes proporciona informaci\u00f3n adicional pero muy \u00fatil\u00bb. <\/p>\n
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Siga las \u00faltimas noticias sobre el brote de coronavirus (COVID-19) Informaci\u00f3n de la revista:<\/strong> mBio <\/p>\n Proporcionado por la Sociedad Estadounidense de Microbiolog\u00eda Cita<\/strong>: Secuenciaci\u00f3n de aguas residuales \u00fatiles para el control de SARS-CoV-2 (2021, 19 de enero) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https:\/\/medicalxpress.com\/news\/2021-01-sequencing-wastewater-sars-cov-.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Una micrograf\u00eda electr\u00f3nica de barrido coloreada del virus SARS-CoV-2. Cr\u00e9dito: NIAID La secuenciaci\u00f3n del genoma viral de las aguas residuales puede detectar nuevas variantes del SARS-CoV-2 antes de que sean detectadas por la secuenciaci\u00f3n cl\u00ednica local, seg\u00fan un nuevo estudio publicado en mBio, una revista de acceso abierto de la Sociedad Estadounidense de Microbiolog\u00eda. La … Continuar leyendo \u00abSecuenciaci\u00f3n de aguas residuales \u00fatil para el control del SARS-CoV-2\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-13188","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/13188","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=13188"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/13188\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=13188"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=13188"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=13188"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}