Cr\u00e9dito: Susanna M. Hamilton, Broad Communications <\/p>\n
Las l\u00edneas de c\u00e9lulas cancerosas, cultivadas a partir de c\u00e9lulas tumorales y cultivadas en condiciones de laboratorio, son un pilar de la investigaci\u00f3n del c\u00e1ncer. Proporcionan informaci\u00f3n valiosa sobre la gen\u00f3mica y la biolog\u00eda del c\u00e1ncer, pero por varias razones, los cient\u00edficos a menudo tienen dificultades para comparar los datos de los experimentos basados en l\u00edneas celulares con los de sus tumores complementarios, o seleccionar las mejores l\u00edneas celulares para modelar tipos de tumores particulares. <\/p>\n
Para ayudar a orientar esas elecciones, Allison Warren, Aviad Tsherniak, James McFarland y otros miembros del equipo del Mapa de Dependencia del C\u00e1ncer (DepMap) de Broad han desarrollado Celligner, una herramienta computacional que ayuda a emparejar tumores y l\u00edneas celulares en funci\u00f3n de la expresi\u00f3n g\u00e9nica. datos de perfil <\/p>\n
Debido a que las l\u00edneas celulares se cultivan en laboratorios, a menudo durante d\u00e9cadas, no reflejan completamente los tumores que se supone que deben modelar. Por ejemplo, las l\u00edneas pueden expresar genes o contener mutaciones que no se ven en los tumores de los pacientes, lo que puede alterar la forma en que responden a los medicamentos contra el c\u00e1ncer. Mientras tanto, los tumores son mezclas complejas que comprenden muchos tipos de c\u00e9lulas, mientras que las l\u00edneas celulares generalmente constan de solo uno.<\/p>\n
Cellinger corrige estas diferencias comparando y alineando los datos de secuenciaci\u00f3n de ARN del tumor del paciente y de la l\u00ednea celular (lo que revela qu\u00e9 genes est\u00e1n activos en una c\u00e9lula en un momento dado). Mediante el uso de Celligner para comparar datos de m\u00e1s de 12 000 tumores de pacientes con m\u00e1s de 1200 l\u00edneas celulares recopiladas por Cancer Cell Line Encyclopedia, The Cancer Genome Atlas, TARGET y otros proyectos, el equipo pudo:<\/p>\n
Sus resultados completos se publican en Nature Communications.<\/p>\n
\u00abUn objetivo para el campo es poseer una colecci\u00f3n de modelos de c\u00e1ncer que reflejen todos los tumores humanos\u00bb, dijo Jesse. Boehm, cient\u00edfico del instituto en el Programa de C\u00e1ncer de Broad y director cient\u00edfico del equipo de DepMap. \u00abAhora, con Celligner, podemos comenzar a medir nuestro progreso y enfocar nuevos esfuerzos para cerrar las brechas y mejorar nuestra interpretaci\u00f3n de las predicciones moleculares para beneficiar a pacientes reales\u00bb. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
Nueva vulnerabilidad gen\u00e9tica encontrada en m\u00e1s de un tercio de todos los c\u00e1nceres M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Allison Warren et al. Alineaci\u00f3n computacional global de perfiles transcripcionales de l\u00edneas celulares y tumores, Nature Communications (2021). DOI: 10.1038\/s41467-020-20294-x Informaci\u00f3n de la revista:<\/strong> Nature Communications <\/p>\n Proporcionado por Broad Institute of MIT y Harvard Cita<\/strong>: Uso de datos de expresi\u00f3n g\u00e9nica para comparar modelos de c\u00e1ncer de laboratorio a tumores reales (5 de enero de 2021) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https:\/\/medicalxpress.com\/news\/2021-01-gene-laboratory-cancer-real-tumors.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Cr\u00e9dito: Susanna M. Hamilton, Broad Communications Las l\u00edneas de c\u00e9lulas cancerosas, cultivadas a partir de c\u00e9lulas tumorales y cultivadas en condiciones de laboratorio, son un pilar de la investigaci\u00f3n del c\u00e1ncer. Proporcionan informaci\u00f3n valiosa sobre la gen\u00f3mica y la biolog\u00eda del c\u00e1ncer, pero por varias razones, los cient\u00edficos a menudo tienen dificultades para comparar los … Continuar leyendo \u00abUso de datos de expresi\u00f3n g\u00e9nica para comparar modelos de c\u00e1ncer de laboratorio con tumores reales\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-14270","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/14270","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=14270"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/14270\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=14270"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=14270"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=14270"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}