Cr\u00e9dito: CC0 Dominio p\u00fablico <\/p>\n
Commons de datos gen\u00f3micos (GDC) del Instituto Nacional del C\u00e1ncer, lanzado en 2016 por el entonces vicepresidente Joseph Biden y alojado en la Universidad de Chicago, se ha convertido en uno de los recursos m\u00e1s grandes y m\u00e1s utilizados en gen\u00f3mica del c\u00e1ncer, con m\u00e1s de 3,3 petabytes de datos de m\u00e1s de 65 proyectos y m\u00e1s de 84\u00a0000 casos de pacientes an\u00f3nimos, que atienden a m\u00e1s de 50\u00a0000 usuarios \u00fanicos cada mes. <\/p>\n
En nuevos art\u00edculos publicados el 22 de febrero en Nature Communications y Nature Genetics, el equipo de investigaci\u00f3n con sede en UChicago comparte nuevos detalles sobre el GDC, que est\u00e1 financiado por el Instituto Nacional del C\u00e1ncer (NCI), a trav\u00e9s de un subcontrato con el Laboratorio Nacional de Frederick para Cancer Research, actualmente operado por Leidos Biomedical Research, Inc. Uno de los documentos describe el dise\u00f1o y el funcionamiento del GDC. El otro describe las canalizaciones utilizadas por la GDC para la armonizaci\u00f3n de los datos enviados a la GDC y la generaci\u00f3n de conjuntos de datos utilizados por la comunidad de investigaci\u00f3n de la GDC.<\/p>\n
El objetivo de la GDC es proporcionar a la comunidad de investigaci\u00f3n del c\u00e1ncer un dep\u00f3sito de datos de datos cl\u00ednicos asociados y gen\u00f3micos procesados de manera uniforme que permite el intercambio de datos y el an\u00e1lisis colaborativo en apoyo de la medicina de precisi\u00f3n.<\/p>\n
La producci\u00f3n de datos para lo que se convertir\u00eda en el GDC comenz\u00f3 en junio de 2015 utilizando una nube privada. Despu\u00e9s de solo un a\u00f1o, el GDC hab\u00eda analizado m\u00e1s de 50,000 entradas de datos de secuenciaci\u00f3n sin procesar. La GDC incluye datos gen\u00f3micos, transcript\u00f3micos, epigen\u00f3micos, prote\u00f3micos, cl\u00ednicos y de im\u00e1genes. Los canales de procesamiento descritos en el art\u00edculo de Nature han producido m\u00e1s de 1660 TB de datos sobre m\u00e1s de dos docenas de tipos de c\u00e1nceres primarios. Estos datos se almacenan en el Portal de datos de GDC, donde est\u00e1n disponibles para su visualizaci\u00f3n y descarga.<\/p>\n
Junto con el portal de datos, el GDC tambi\u00e9n ofrece recursos adicionales para el usuario, incluido el An\u00e1lisis, visualizaci\u00f3n y exploraci\u00f3n de datos de GDC (DAVE) Herramientas para la exploraci\u00f3n interactiva de datos por variante gen\u00f3mica o alteraci\u00f3n espec\u00edfica; el Portal de env\u00edo de datos de GDC para enviar datos; la herramienta de transferencia de datos (DTT) de GDC para descargar grandes conjuntos de datos gen\u00f3micos; y el sistema de armonizaci\u00f3n de datos de GDC, que permite a los usuarios ejecutar los datos enviados a GDC a trav\u00e9s de las canalizaciones de procesamiento de armonizaci\u00f3n.<\/p>\n
\u00abEstos datos tienen un papel fundamental que desempe\u00f1ar\u00bb, dijo Robert Grossman, Ph.D., investigador principal de GDC y director del Center for Translational Data Science en UChicago. \u00abA medida que se acumulan los datos, ser\u00e1 m\u00e1s f\u00e1cil identificar nuevas se\u00f1ales como objetivos importantes para comprender la biolog\u00eda del c\u00e1ncer. Adem\u00e1s, la infraestructura de intercambio de datos puede servir para informar los estudios de investigaci\u00f3n, brindando nuevos conocimientos sobre la variaci\u00f3n gen\u00e9tica entre individuos y c\u00f3mo puede afectar a los pacientes con c\u00e1ncer. resultados.\u00bb <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
Genomic Data Commons de la Universidad de Chicago lanza una nueva era de intercambio de datos sobre el c\u00e1ncer M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Zhenyu Zhang et al, An\u00e1lisis uniforme de datos gen\u00f3micos en NCI Genomic Data Commons, Nature Comunicaciones (2021). DOI: 10.1038\/s41467-021-21254-9 <\/p>\n Allison P. Heath et al. Los comunes de datos gen\u00f3micos del NCI, Nature Genetics (2021). DOI: 10.1038\/s41588-021-00791-5 Informaci\u00f3n de la revista:<\/strong> Nature Communications , Nature Genetics <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Cr\u00e9dito: CC0 Dominio p\u00fablico Commons de datos gen\u00f3micos (GDC) del Instituto Nacional del C\u00e1ncer, lanzado en 2016 por el entonces vicepresidente Joseph Biden y alojado en la Universidad de Chicago, se ha convertido en uno de los recursos m\u00e1s grandes y m\u00e1s utilizados en gen\u00f3mica del c\u00e1ncer, con m\u00e1s de 3,3 petabytes de datos de … Continuar leyendo \u00abCommons de datos gen\u00f3micos proporciona un recurso de datos sobre el c\u00e1ncer sin precedentes\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-14524","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/14524","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=14524"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/14524\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=14524"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=14524"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=14524"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}