El crecimiento en el n\u00famero de estudios GWAS que descubrieron los loci de riesgo es mucho mayor que el de los estudios que investigan los mecanismos y funciones de los loci de riesgo. Cr\u00e9dito: Michael D. Gallagher et al. <\/p>\n
Se ha encontrado que muchas variantes gen\u00e9ticas tienen un v\u00ednculo con enfermedades gen\u00e9ticas, pero la comprensi\u00f3n de sus roles funcionales en la causa de enfermedades a\u00fan es limitada. Un equipo de investigaci\u00f3n internacional, que incluye a un cient\u00edfico biom\u00e9dico de la Universidad de la Ciudad de Hong Kong (CityU), desarroll\u00f3 una t\u00e9cnica de ensayo biol\u00f3gico de alto rendimiento que les permiti\u00f3 realizar un an\u00e1lisis sistem\u00e1tico sobre el impacto de casi 100 000 variantes gen\u00e9ticas en la uni\u00f3n de los factores de transcripci\u00f3n. con ADN Sus hallazgos proporcionaron datos valiosos para encontrar biomarcadores clave de la diabetes tipo 2 para diagn\u00f3sticos y tratamientos. Y creen que la nueva t\u00e9cnica se puede aplicar a estudios de variantes asociadas a otras enfermedades gen\u00e9ticas. <\/p>\n
El estudio fue codirigido por el Dr. Yan Jian, profesor asistente en el Departamento de Ciencias Biom\u00e9dicas de CityU, el profesor Bing Ren de la Universidad de California en San Diego y el profesor Jussi Taipale de la Universidad de Cambridge. Sus hallazgos fueron publicados en la prestigiosa revista cient\u00edfica Nature, titulados \u00abAn\u00e1lisis sistem\u00e1tico de la uni\u00f3n de factores de transcripci\u00f3n a variantes no codificantes\u00bb. <\/p>\n
\u00abBas\u00e1ndonos en nuestros hallazgos, creemos que nuestro m\u00e9todo experimental de alto rendimiento se puede aplicar en el estudio de diferentes enfermedades gen\u00e9ticas, incluido el c\u00e1ncer colorrectal y el c\u00e1ncer de pr\u00f3stata. Puede ayudar a diseccionar el mecanismo de la herencia gen\u00e9tica. de la enfermedad y encontrar los biomarcadores para el diagn\u00f3stico cl\u00ednico\u00bb, dijo el Dr. Yan.<\/p>\n
Revelaci\u00f3n de las funciones de las variantes no codificantes en enfermedades<\/p>\n
Estudios de asociaci\u00f3n del genoma completo (GWAS, por sus siglas en ingl\u00e9s), que investigan el genoma completo, ha sido la estrategia m\u00e1s importante para encontrar los genes asociados con enfermedades gen\u00e9ticas complejas. Los investigadores han encontrado cientos de miles de variantes gen\u00e9ticas asociadas con enfermedades y rasgos humanos. Pero los estudios sobre las funciones de estas variantes a\u00fan son limitados.<\/p>\n
\u00abComprender las funciones moleculares de las variantes no codificantes nos ayudar\u00e1 a descubrir por qu\u00e9 las personas que portan estas mutaciones son m\u00e1s susceptibles a las enfermedades gen\u00e9ticas. Esto nos ayudar\u00e1 a desarrollar m\u00e9todos o estrategias para prevenir, detectar o curar las enfermedades de manera temprana\u00bb, explic\u00f3 el Dr. Yan. <\/p>\n
Una de las funciones de las variantes es afectar la uni\u00f3n de los factores transcripcionales con el ADN. Los factores transcripcionales luego controlar\u00e1n la expresi\u00f3n g\u00e9nica en las c\u00e9lulas, activando y desactivando genes espec\u00edficos, modulando las funciones celulares. <\/p>\n
Para caracterizar sistem\u00e1ticamente los efectos de las variantes gen\u00e9ticas en la uni\u00f3n con factores transcripcionales, el equipo modific\u00f3 su m\u00e9todo experimental previamente desarrollado en un ensayo de uni\u00f3n de prote\u00edna-ADN multiplex de ultra alto rendimiento, denominado \u00abpolimorfismo de un solo nucle\u00f3tido\u00bb. evaluaci\u00f3n por evoluci\u00f3n sistem\u00e1tica de ligandos por enriquecimiento exponencial\u00bb (SNP-SELEX). Luego eligieron las variantes gen\u00e9ticas de las ubicaciones de genes en el genoma (llamadas \u00abloci de genes\u00bb) que se sabe que est\u00e1n asociadas con el riesgo de diabetes tipo 2 como objeto de an\u00e1lisis.<\/p>\n
Utilizando el SNP- SELEX, analizaron con \u00e9xito el impacto de 95\u00a0886 variantes gen\u00e9ticas en la uni\u00f3n de 270 factores de transcripci\u00f3n humanos distintos al ADN. Demostraron que la variante gen\u00e9tica no codificante SNP rs7118999 que aumenta el riesgo de diabetes tipo 2 puede afectar la uni\u00f3n del ADN con uno de los factores de transcripci\u00f3n, y el mecanismo molecular resultante regula el nivel de l\u00edpidos en sangre. <\/p>\n
\u00abEste es un claro ejemplo de la aplicaci\u00f3n de los datos generados por SNP-SELEX que puede ayudar a identificar las variantes gen\u00e9ticas que juegan un papel clave en la herencia de la diabetes tipo 2. Esto ayudar\u00eda a la investigaci\u00f3n posterior a encontrar biomarcadores de diagn\u00f3stico y dianas terap\u00e9uticas\u00bb, dijo el Dr. Yan. <\/p>\n
Aceleraci\u00f3n significativa del an\u00e1lisis<\/p>\n
Adem\u00e1s, los estudios previos solo pod\u00edan se\u00f1alar una o algunas variantes para descubrir su mecanismo molecular. Cada estudio tom\u00f3 alrededor de 2-3 a\u00f1os. \u00abAs\u00ed que era imposible comprender completamente las enfermedades gen\u00e9ticas complejas como la diabetes tipo 2, que est\u00e1n asociadas con cientos de variantes gen\u00e9ticas en un per\u00edodo corto. Pero con SNP-SELEX, pudimos analizar sistem\u00e1ticamente aproximadamente 100 000 variantes en un per\u00edodo de tiempo mucho m\u00e1s corto\u00bb. dijo el Dr. Yan. <\/p>\n
\u00abEn este estudio, solo cubrimos una porci\u00f3n relativamente peque\u00f1a de variantes y factores de transcripci\u00f3n. Por lo tanto, ampliaremos nuestro estudio. Al utilizar SNP-SELEX, esperamos que nos ayude a descubrir los mecanismos subyacentes de m\u00e1s y m\u00e1s de estas variantes no codificantes muy pronto\u00bb, dijo el profesor Ren. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
Uso de datos de secuenciaci\u00f3n de ADN con registros de salud electr\u00f3nicos para encontrar variantes raras detr\u00e1s de enfermedades hereditarias M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Jian Yan et al. An\u00e1lisis sistem\u00e1tico de la uni\u00f3n de factores de transcripci\u00f3n a variantes no codificantes, Nature (2021). DOI: 10.1038\/s41586-021-03211-0 <\/p>\n Michael D. Gallagher et al. La era posterior a GWAS: de la asociaci\u00f3n a la funci\u00f3n, The American Journal of Human Genetics (2018). DOI: 10.1016\/j.ajhg.2018.04.002 Informaci\u00f3n de la revista:<\/strong> Nature , American Journal of Human Genetics <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" El crecimiento en el n\u00famero de estudios GWAS que descubrieron los loci de riesgo es mucho mayor que el de los estudios que investigan los mecanismos y funciones de los loci de riesgo. Cr\u00e9dito: Michael D. Gallagher et al. Se ha encontrado que muchas variantes gen\u00e9ticas tienen un v\u00ednculo con enfermedades gen\u00e9ticas, pero la comprensi\u00f3n … Continuar leyendo \u00abEl an\u00e1lisis gen\u00e9tico sistem\u00e1tico y eficiente ayuda a diseccionar la herencia de la enfermedad\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-14684","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/14684","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=14684"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/14684\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=14684"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=14684"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=14684"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}