La secuenciaci\u00f3n del c\u00f3digo gen\u00e9tico de muestras de virus tomadas de pacientes con COVID-19 revela c\u00f3mo el SARS-CoV-2 se est\u00e1 propagando y cambiando. Cr\u00e9dito: Nate Langer\/UPMC, CC BY-ND <\/p>\n
\u00abNo puedes arreglar lo que no mides\u00bb es una m\u00e1xima en el mundo de los negocios. Y tambi\u00e9n es cierto en el mundo de la salud p\u00fablica. <\/p>\n
Al principio de la pandemia, Estados Unidos tuvo dificultades para satisfacer la demanda de pruebas de detecci\u00f3n del SARS-CoV-2 en las personas. Esa falla signific\u00f3 que los funcionarios no sab\u00edan la cantidad real de personas que ten\u00edan COVID-19. Se les dej\u00f3 responder a la pandemia sin saber qu\u00e9 tan r\u00e1pido se propagaba y qu\u00e9 intervenciones minimizaban los riesgos.<\/p>\n
Ahora EE. UU. enfrenta un problema similar con un tipo diferente de prueba: la secuenciaci\u00f3n gen\u00e9tica. A diferencia de una prueba de COVID-19 que diagnostica una infecci\u00f3n, la secuenciaci\u00f3n gen\u00e9tica decodifica el genoma del virus SARS-CoV-2 en muestras de pacientes. Conocer la secuencia del genoma ayuda a los investigadores a comprender dos cosas importantes: c\u00f3mo el virus est\u00e1 mutando en variantes y c\u00f3mo viaja de persona a persona.<\/p>\n
Antes de la pandemia de COVID-19, este tipo de vigilancia gen\u00f3mica se reservaba principalmente para realizar peque\u00f1os estudios de bacterias resistentes a los antibi\u00f3ticos, investigando brotes y monitoreando cepas de influenza. Como epidemi\u00f3logos gen\u00f3micos y expertos en enfermedades infecciosas, realizamos este tipo de pruebas todos los d\u00edas en nuestros laboratorios, trabajando para descifrar c\u00f3mo evoluciona el coronavirus y c\u00f3mo se mueve entre la poblaci\u00f3n.<\/p>\n
Especialmente ahora, como nuevas variantes de coronavirus de siguen surgiendo preocupaciones, la vigilancia gen\u00f3mica tiene un papel importante que desempe\u00f1ar para ayudar a controlar la pandemia.<\/p>\n
Rastrear los viajes y cambios del virus<\/p>\n
La secuenciaci\u00f3n del genoma implica descifrar el orden de las mol\u00e9culas de nucle\u00f3tidos que explican el c\u00f3digo gen\u00e9tico de un virus en particular. Para el coronavirus, ese genoma contiene una cadena de alrededor de 30.000 nucle\u00f3tidos. Cada vez que el virus se replica, se cometen errores. Estos errores en el c\u00f3digo gen\u00e9tico se denominan mutaciones.<\/p>\n
Los cient\u00edficos cargan muestras de pacientes en un manipulador de l\u00edquidos rob\u00f3tico para prepararlas para la secuenciaci\u00f3n. Cr\u00e9dito: Nate Langer\/UPMC, CC BY-ND <\/p>\n
La mayor\u00eda de las mutaciones no cambian significativamente la funci\u00f3n del virus. Otros pueden ser importantes, particularmente cuando codifican elementos vitales, como la prote\u00edna de punta del coronavirus que act\u00faa como una llave para ingresar a las c\u00e9lulas humanas y causar infecci\u00f3n. Las mutaciones en pico pueden influir en la infecciosidad del virus, la gravedad de la infecci\u00f3n y la eficacia de la protecci\u00f3n de las vacunas actuales.<\/p>\n
Los investigadores est\u00e1n especialmente atentos a cualquier mutaci\u00f3n que distinga a las muestras de virus de otras o que coincida con ellas. variantes conocidas.<\/p>\n
Los cient\u00edficos pueden usar las secuencias gen\u00e9ticas para rastrear c\u00f3mo se transmite el virus en la comunidad y en los centros de atenci\u00f3n m\u00e9dica. Por ejemplo, si dos personas tienen secuencias virales con cero o muy pocas diferencias entre ellas, sugiere que el virus se transmiti\u00f3 de una a otra o de una fuente com\u00fan. Por otro lado, si hay muchas diferencias entre las secuencias, estos dos individuos no se contagiaron el virus uno del otro.<\/p>\n
Este tipo de informaci\u00f3n permite a los funcionarios de salud p\u00fablica adaptar las intervenciones y recomendaciones para el p\u00fablico. . La vigilancia gen\u00f3mica tambi\u00e9n puede ser importante en entornos de atenci\u00f3n m\u00e9dica. Nuestro hospital, por ejemplo, utiliza la vigilancia gen\u00f3mica para detectar brotes que, de otro modo, los m\u00e9todos tradicionales pasar\u00edan por alto.<\/p>\n
La vigilancia puede proporcionar una advertencia<\/p>\n
Pero, \u00bfc\u00f3mo saben los investigadores si est\u00e1n surgiendo variantes y si la gente deber\u00eda preocuparse?<\/p>\n
Tomemos como ejemplo la variante B.1.1.7, detectada por primera vez en el Reino Unido, que cuenta con una s\u00f3lida vigilancia gen\u00f3mica. Los investigadores de salud p\u00fablica descubrieron que una determinada secuencia con m\u00faltiples cambios, incluida la prote\u00edna espiga, estaba aumentando en el Reino Unido Incluso en medio de un cierre nacional, esta versi\u00f3n del virus se estaba propagando r\u00e1pidamente, m\u00e1s que sus predecesores.<\/p>\n
Investigadores puede construir lo que son esencialmente \u00e1rboles geneal\u00f3gicos para el SARS-CoV-2, llamados \u00e1rboles filogen\u00e9ticos, que trazan un mapa de cu\u00e1n estrechamente relacionadas est\u00e1n varias muestras de virus. Los puntos rojos aqu\u00ed indican pacientes que son parte de un solo brote, mientras que los otros son pacientes con COVID-19 con cepas no relacionadas. Cr\u00e9dito: Lee Harrison, CC BY-ND <\/p>\n
Los cient\u00edficos estudiaron m\u00e1s a fondo el genoma de esta variante para determinar c\u00f3mo superaba las recomendaciones de distanciamiento y otras intervenciones de salud p\u00fablica. Encontraron mutaciones particulares en la prote\u00edna espiga con nombres como 69-70 y N501Y que facilitaron que el virus infectara las c\u00e9lulas humanas. La investigaci\u00f3n preliminar sugiere que estas mutaciones se tradujeron en una mayor tasa de transmisi\u00f3n, lo que significa que se propagan mucho m\u00e1s f\u00e1cilmente de persona a persona que las cepas anteriores.<\/p>\n
Los desarrolladores de vacunas y otros cient\u00edficos luego usaron esta informaci\u00f3n gen\u00e9tica para probar si la nueva las variantes cambian qu\u00e9 tan bien funcionan las vacunas. Afortunadamente, la investigaci\u00f3n preliminar que a\u00fan no ha sido revisada por pares encontr\u00f3 que la variante B.1.1.7 sigue siendo susceptible a las vacunas actuales. M\u00e1s preocupantes son otras variantes como la P.1. y B.1.351, descubiertos por primera vez en Brasil y Sud\u00e1frica, respectivamente, que pueden evadir algunos anticuerpos producidos por las vacunas. <\/p>\n
Establecer un sistema de vigilancia gen\u00f3mica<\/p>\n
Detectar variantes de preocupaci\u00f3n y desarrollar una respuesta de salud p\u00fablica a ellas requiere un programa s\u00f3lido de vigilancia gen\u00f3mica. Eso se traduce en que los cient\u00edficos secuencian muestras de virus de aproximadamente el 5% del n\u00famero total de pacientes con COVID-19, seleccionados para ser representativos de las poblaciones con mayor riesgo de contraer la enfermedad. Sin esta informaci\u00f3n gen\u00f3mica, las nuevas variantes pueden propagarse desenfrenadamente y sin ser detectadas por todo el pa\u00eds y el mundo.<\/p>\n
Entonces, \u00bfc\u00f3mo se est\u00e1 desempe\u00f1ando EE. UU. en el \u00e1rea de la vigilancia gen\u00f3mica? No muy bien, y muy por detr\u00e1s de otros pa\u00edses desarrollados, ocupando el puesto 34 en la cantidad de genomas de SARS-CoV-2 secuenciados por n\u00famero de casos. Incluso dentro de los EE. UU., existe una gran variaci\u00f3n entre los estados para los genomas secuenciados por n\u00famero de casos, desde Tennessee con un 0,09 % hasta Wyoming con un 5,82 %.<\/p>\n
Pero esto est\u00e1 a punto de cambiar. Los Centros para el Control y la Prevenci\u00f3n de Enfermedades, junto con otras agencias del gobierno federal, se est\u00e1n asociando con laboratorios privados, laboratorios de salud p\u00fablica estatales y locales, instituciones acad\u00e9micas y otros para aumentar la capacidad de vigilancia gen\u00f3mica en los EE. UU.<\/p>\n
Alcanzando Sin embargo, la nueva meta nacional del 5% establecida por la Casa Blanca no es tan simple como pagar una fuerte factura para que un laboratorio realice las pruebas. Los laboratorios deben recolectar las muestras, a menudo de diferentes fuentes: laboratorios de salud p\u00fablica, hospitales, cl\u00ednicas, laboratorios de pruebas privados. Una vez que se realiza la prueba de secuenciaci\u00f3n, los bioinform\u00e1ticos utilizan programas avanzados para identificar mutaciones importantes. Luego, los profesionales de la salud p\u00fablica fusionan los datos gen\u00f3micos con los datos epidemiol\u00f3gicos para determinar c\u00f3mo se propaga el virus. Todo esto requiere invertir en capacitar a las personas para que realicen estas tareas en equipo.<\/p>\n
En \u00faltima instancia, para ser \u00fatil, un programa de vigilancia gen\u00f3mica exitoso debe ser r\u00e1pido y los datos deben estar disponibles p\u00fablicamente de inmediato para informar -tiempo de toma de decisiones por parte de los funcionarios de salud p\u00fablica y los fabricantes de vacunas. Dicho programa es una de las herramientas de salud p\u00fablica que ayudar\u00e1 a controlar la pandemia actual y preparar\u00e1 a los EE. UU. para que pueda responder a futuras pandemias. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
El experto analiza las ‘variantes preocupantes’ del coronavirus Proporcionado por The Conversation <\/p>\n
Este art\u00edculo se vuelve a publicar de The Conversation bajo una licencia Creative Commons. Lea el art\u00edculo original. <\/p>\n
Cita<\/strong>: Por qu\u00e9 necesitamos m\u00e1s vigilancia gen\u00f3mica para rastrear el coronavirus y ayudar a poner fin a la pandemia de COVID-19 (31 de marzo de 2021) consultado el 30 de agosto de 2022 en https:\/\/medicalxpress.com\/ news\/2021-03-genomic-surveillance-track-coronavirus-covid-.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" La secuenciaci\u00f3n del c\u00f3digo gen\u00e9tico de muestras de virus tomadas de pacientes con COVID-19 revela c\u00f3mo el SARS-CoV-2 se est\u00e1 propagando y cambiando. Cr\u00e9dito: Nate Langer\/UPMC, CC BY-ND \u00abNo puedes arreglar lo que no mides\u00bb es una m\u00e1xima en el mundo de los negocios. Y tambi\u00e9n es cierto en el mundo de la salud p\u00fablica. … Continuar leyendo \u00abPor qu\u00e9 necesitamos m\u00e1s vigilancia gen\u00f3mica para rastrear el coronavirus y ayudar a terminar con la pandemia de COVID-19\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-16791","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/16791","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=16791"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/16791\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=16791"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=16791"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=16791"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}