Fig. 1. Muestra de agrupaci\u00f3n de hisopos con replicaci\u00f3n basada en transposici\u00f3n. Cr\u00e9dito: Escuela Superior de Econom\u00eda de la Universidad Nacional de Investigaci\u00f3n <\/p>\n
Los investigadores Mario Guarracino del Laboratorio HSE de Algoritmos y Tecnolog\u00edas para el An\u00e1lisis de Redes en Nizhny Novgorod y Julius ilinskas y Algirdas Laninskas de la Universidad de Vilnius, han propuesto un nuevo m\u00e9todo de prueba para COVID-19. Este m\u00e9todo grupal permite obtener resultados 13 veces m\u00e1s r\u00e1pido en comparaci\u00f3n con las pruebas individuales de cada muestra. El trabajo de investigaci\u00f3n fue publicado en la revista Scientific Reports. <\/p>\n
La pandemia de COVID-19 ya ha afectado a millones de personas de m\u00e1s de 200 pa\u00edses. La r\u00e1pida expansi\u00f3n del virus demostr\u00f3 cu\u00e1n r\u00e1pido pueden propagarse tales infecciones en el mundo globalizado de hoy. Al comienzo de la pandemia, cuando se sab\u00eda poco sobre el virus y a\u00fan no se hab\u00edan desarrollado vacunas, solo era posible frenar su propagaci\u00f3n limitando la movilidad de la poblaci\u00f3n. Casi todos en todo el mundo pasaron por varios bloqueos y per\u00edodos de aislamiento. Si se pueden realizar pruebas r\u00e1pidamente a grandes grupos de personas, las restricciones pueden ser menos estrictas y m\u00e1s efectivas al mismo tiempo, creen los autores del art\u00edculo \u00abPruebas agrupadas con replicaci\u00f3n como estrategia de pruebas masivas para las pandemias de COVID-19\u00bb.<\/p>\n
Las soluciones de prueba de COVID-19 actuales se basan en la extracci\u00f3n de ARN de pacientes que usan hisopos orofar\u00edngeos y nasofar\u00edngeos, y luego prueban con PCR en tiempo real para detectar la presencia de filamentos de ARN espec\u00edficos que identifican el virus. La velocidad de este enfoque est\u00e1 limitada por la disponibilidad de reactivos, t\u00e9cnicos capacitados y laboratorios.<\/p>\n
Una forma de acelerar los procedimientos de prueba es la prueba grupal, donde se agrupan y analizan los hisopos de varios pacientes. Los hisopos de los grupos que arrojan un resultado positivo luego se analizan individualmente para detectar pacientes positivos de COVID-19 espec\u00edficos. Este enfoque ayuda a reducir el n\u00famero de pruebas al doble o m\u00e1s (dependiendo de la propagaci\u00f3n de la enfermedad) en comparaci\u00f3n con las pruebas individuales de cada hisopo.<\/p>\n
Fig. 2. Muestra de agrupaci\u00f3n de hisopos con el m\u00e9todo OptReplica. Cr\u00e9dito: Escuela Superior de Econom\u00eda de la Universidad Nacional de Investigaci\u00f3n. <\/p>\n
Por ejemplo, suponga que se deben analizar 96 muestras y que son posibles grupos de hasta 12 muestras. En las pruebas individuales son necesarias 96 pruebas. En las pruebas de grupo, se toman 8 grupos de 12 muestras y se realizan las pruebas. Si el resultado de un grupo es positivo, se necesitan 12 pruebas individuales adicionales. Si dos o tres grupos arrojan un resultado positivo, se requieren 24 o 36 pruebas adicionales que, junto con las primeras ocho pruebas, supondr\u00e1n una disminuci\u00f3n en el n\u00famero de pruebas de dos a cinco veces en comparaci\u00f3n con las pruebas individuales.<\/p>\n
Los investigadores creen que la cantidad de pruebas se puede reducir optimizando el tama\u00f1o de los grupos que tiene en cuenta la cantidad total de hisopos y la cantidad prevista de personas infectadas. A medida que aumenta el n\u00famero de personas infectadas, la posibilidad de guardar hisopos disminuye pero sigue siendo del orden del 40 % en caso de una incidencia de 100 muestras positivas por 1000, y del 18 % para una incidencia de 200 por 1000.<\/p>\n
Hay formas de optimizar las pruebas grupales, como elegir el tama\u00f1o \u00f3ptimo del grupo seg\u00fan la cantidad total de hisopos y el nivel proyectado de propagaci\u00f3n de la enfermedad. Otro es el m\u00e9todo de divisi\u00f3n binaria, en el que un grupo positivo se divide en dos mitades y se analiza nuevamente, hasta que se detectan hisopos positivos individuales. Sin embargo, el segundo m\u00e9todo requiere mucho tiempo, lo que disminuye su atractivo durante una pandemia.<\/p>\n
Adem\u00e1s, para optimizar las pruebas grupales, se utiliza la replicaci\u00f3n basada en la transposici\u00f3n: despu\u00e9s de agrupar los hisopos, los investigadores forman grupos de control de los mismos hisopos y probarlos junto con los grupos principales. Esto ayuda a reducir a\u00fan m\u00e1s la cantidad de pruebas y, si los niveles de la enfermedad son bajos, tambi\u00e9n ayuda a detectar hisopos positivos en un solo paso, lo que acelera considerablemente la prueba.<\/p>\n
Fig. 3. Disminuci\u00f3n de la cantidad de pruebas con el uso de replicaci\u00f3n basada en transposici\u00f3n (l\u00ednea punteada) y OptReplica (l\u00ednea continua) con un tama\u00f1o de grupo \u00f3ptimo, seg\u00fan la incidencia de la enfermedad, analizando una muestra de 96 hisopos (azul) y 384 hisopos (rojo). Cr\u00e9dito: Escuela Superior de Econom\u00eda de la Universidad Nacional de Investigaci\u00f3n <\/p>\n
Sin embargo, este m\u00e9todo no permite experimentar con tama\u00f1os de grupo para detectar el tama\u00f1o \u00f3ptimo de grupo en condiciones espec\u00edficas. Investigadores de la Universidad HSE y la Universidad de Vilnius sugirieron la tecnolog\u00eda OptReplica, que utiliza un algoritmo m\u00e1s complicado de agrupaci\u00f3n de hisopos en grupos clave y de control y ayuda a disminuir la cantidad de grupos de control. Adem\u00e1s, el algoritmo ayuda a calcular el tama\u00f1o de grupo \u00f3ptimo para el n\u00famero actual de hisopos y el nivel previsto de propagaci\u00f3n de la enfermedad.<\/p>\n
Los autores realizaron una investigaci\u00f3n experimental en muestras de 96 y 384 hisopos, realizando 100 pruebas aleatorias. para cada tama\u00f1o de muestra, y compar\u00f3 la efectividad de la replicaci\u00f3n basada en la transposici\u00f3n y el m\u00e9todo OptReplica para diferentes niveles de incidencia de la enfermedad. Los estudios han demostrado que si se elige el tama\u00f1o \u00f3ptimo de los grupos, OptReplica es m\u00e1s eficaz que la replicaci\u00f3n basada en transposici\u00f3n. En casos con baja incidencia, el uso de OptReplica, se puede lograr una reducci\u00f3n promedio de 13 veces de las pruebas en comparaci\u00f3n con las pruebas individuales sin demora de tiempo.<\/p>\n
\u00abNuestras simulaciones est\u00e1n demostrando que usar esta estrategia de replicaci\u00f3n de optimizaci\u00f3n siempre es ventajoso e, incluso en caso de alta propagaci\u00f3n de la enfermedad (10% o 20% de positivos en la poblaci\u00f3n), seguimos siendo competitivos con la estrategia de pruebas individuales\u201d, explic\u00f3 Mario Guarracino, Chief Research Fellow del Laboratorio de Algoritmos y Tecnolog\u00edas para Redes. An\u00e1lisis.<\/p>\n
Los autores de la nueva tecnolog\u00eda sugieren usarla para poblaciones asintom\u00e1ticas con una incidencia aparentemente baja de casos de coronavirus, donde ayudar\u00e1 a detectar a los individuos infectados a la m\u00e1xima velocidad con un n\u00famero m\u00ednimo de pruebas y a tiempo. aplicar las medidas de cuarentena para evitar la propagaci\u00f3n de la enfermedad. En regiones con incidentes de enfermedades de m\u00e1s de 50 casos por cada 1000 pruebas, los autores sugieren utilizar otros m\u00e9todos de replicaci\u00f3n grupal o pruebas sin replicaci\u00f3n. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
Siga las \u00faltimas noticias sobre el brote de coronavirus (COVID-19) M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Julius ilinskas et al, Pruebas agrupadas con replicaci\u00f3n como estrategia de prueba masiva para el COVID- 19 pandemias, Informes cient\u00edficos (2021). DOI: 10.1038\/s41598-021-83104-4 Informaci\u00f3n de la revista:<\/strong> Scientific Reports <\/p>\n Proporcionado por la Escuela Superior de Econom\u00eda de la Universidad Nacional de Investigaci\u00f3n Cita<\/strong>: M\u00e9todo de prueba grupal desarrollado para COVID-19 (2021, 24 de marzo) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https:\/\/medicalxpress.com\/news\/2021-03-group-method-covid-.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Fig. 1. Muestra de agrupaci\u00f3n de hisopos con replicaci\u00f3n basada en transposici\u00f3n. Cr\u00e9dito: Escuela Superior de Econom\u00eda de la Universidad Nacional de Investigaci\u00f3n Los investigadores Mario Guarracino del Laboratorio HSE de Algoritmos y Tecnolog\u00edas para el An\u00e1lisis de Redes en Nizhny Novgorod y Julius ilinskas y Algirdas Laninskas de la Universidad de Vilnius, han propuesto … Continuar leyendo \u00abM\u00e9todo de prueba grupal desarrollado para COVID-19\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-17400","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/17400","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=17400"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/17400\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=17400"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=17400"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=17400"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}