Cr\u00e9dito: CC0 Dominio p\u00fablico <\/p>\n
Un nuevo estudio de Penn State y Cornell describe un esfuerzo por producir el mapa m\u00e1s completo y de alta resoluci\u00f3n hasta la fecha de la arquitectura cromos\u00f3mica y la regulaci\u00f3n g\u00e9nica en la levadura, un paso importante hacia la mejora de la comprensi\u00f3n del desarrollo, la evoluci\u00f3n y las respuestas ambientales en los organismos superiores. <\/p>\n
Espec\u00edficamente, el estudio mape\u00f3 sitios de uni\u00f3n precisos de m\u00e1s de 400 prote\u00ednas cromos\u00f3micas diferentes en el genoma de la levadura, la mayor\u00eda de las cuales regulan la expresi\u00f3n de genes.<\/p>\n
Las c\u00e9lulas de levadura proporcionan un sistema modelo simple con 6000 genes, la mayor\u00eda de los cuales se encuentran en otros organismos, incluidos los humanos, lo que los convierte en excelentes candidatos para estudiar la gen\u00e9tica fundamental y las v\u00edas biol\u00f3gicas complejas.<\/p>\n
El art\u00edculo, \u00abUna arquitectura proteica de alta resoluci\u00f3n del genoma de la levadura en ciernes\u00bb, publicado 10 de marzo en la revista Nature.<\/p>\n
\u00abEs una propuesta mucho m\u00e1s compleja, pero como la secuenciaci\u00f3n del genoma de la levadura precedi\u00f3 a la secuenciaci\u00f3n del humano, estoy seguro de que podremos ver la arquitectura regulatoria del genoma humano\u00bb, dijo el autor principal B. Franklin Pugh ’83, profesor de biolog\u00eda molecular y gen\u00e9tica en la Facultad de Artes y Ciencias y ex profesor de la Universidad Estatal de Pensilvania, donde comenz\u00f3 este trabajo. Matthew Rossi, profesor asistente de investigaci\u00f3n en Penn State, es el primer autor del art\u00edculo.<\/p>\n
El equipo us\u00f3 una t\u00e9cnica llamada ChIP-exo para mapear las ubicaciones de uni\u00f3n de unas 400 prote\u00ednas diferentes que interact\u00faan con el genoma de la levadura. algunos en algunas ubicaciones y otros en miles de ubicaciones.<\/p>\n
El equipo realiz\u00f3 m\u00e1s de 1200 experimentos ChIP-exo individuales, produciendo miles de millones de puntos de datos individuales. El an\u00e1lisis de tantos datos requiri\u00f3 el uso de grupos de supercomputaci\u00f3n de Penn State y el desarrollo de varias herramientas bioinform\u00e1ticas novedosas para identificar patrones y revelar la organizaci\u00f3n de prote\u00ednas reguladoras en el genoma de la levadura. El an\u00e1lisis revel\u00f3 una cantidad sorprendentemente peque\u00f1a de ensamblajes de prote\u00ednas \u00fanicos que se usan repetidamente en el genoma de la levadura.<\/p>\n
El estudio revel\u00f3 dos arquitecturas reguladoras de genes distintas, ampliando el modelo tradicional de regulaci\u00f3n de genes. Los llamados genes constitutivos, aquellos que realizan funciones b\u00e1sicas de \u00abmantenimiento\u00bb y casi siempre est\u00e1n activos a niveles bajos, solo requer\u00edan un conjunto b\u00e1sico de controles regulatorios, mientras que los activados por se\u00f1ales ambientales, conocidos como genes inducibles, ten\u00edan una arquitectura m\u00e1s especializada.<\/p>\n
El modelo tradicional de regulaci\u00f3n g\u00e9nica involucra prote\u00ednas llamadas \u00abfactores de transcripci\u00f3n\u00bb, que se unen a secuencias de ADN espec\u00edficas para controlar la expresi\u00f3n de un gen cercano. Sin embargo, los investigadores encontraron que los genes de \u00ablimpieza\u00bb, que comprenden la mayor\u00eda de los genes en la levadura, carec\u00edan de una arquitectura prote\u00edna-ADN que permitir\u00eda la uni\u00f3n de factores de transcripci\u00f3n espec\u00edficos, un sello distintivo de los genes inducibles.<\/p>\n
\u00abLa resoluci\u00f3n y la integridad de los datos nos permitieron identificar 21 ensamblajes de prote\u00ednas y tambi\u00e9n identificar la ausencia de se\u00f1ales de control regulatorias espec\u00edficas en los genes dom\u00e9sticos\u00bb, dijo el coautor Shaun Mahony, profesor asistente de bioqu\u00edmica y biolog\u00eda molecular en Penn State. \u00abLos m\u00e9todos computacionales que hemos desarrollado para analizar estos datos podr\u00edan servir como punto de partida para un mayor desarrollo de estudios de regulaci\u00f3n de genes en organismos m\u00e1s complejos\u00bb. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
Un nuevo mapa de ubicaciones de uni\u00f3n a prote\u00ednas en la levadura avanza en la comprensi\u00f3n de la regulaci\u00f3n g\u00e9nica M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Una arquitectura proteica de alta resoluci\u00f3n del genoma de la levadura en ciernes, Nature (2021). DOI: 10.1038\/s41586-021-03314-8 , dx.doi.org\/10.1038\/s41586-021-03314-8 Informaci\u00f3n del diario:<\/strong> Nature <\/p>\n Proporcionado por la Universidad de Cornell Cita <\/strong>: El mapa del epigenoma de la levadura revela detalles de la regulaci\u00f3n g\u00e9nica (12 de marzo de 2021) consultado el 30 de agosto de 2022 en https:\/\/medicalxpress.com\/news\/2021-03-yeast-epigenome-reveals-gene.html Este documento es sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Cr\u00e9dito: CC0 Dominio p\u00fablico Un nuevo estudio de Penn State y Cornell describe un esfuerzo por producir el mapa m\u00e1s completo y de alta resoluci\u00f3n hasta la fecha de la arquitectura cromos\u00f3mica y la regulaci\u00f3n g\u00e9nica en la levadura, un paso importante hacia la mejora de la comprensi\u00f3n del desarrollo, la evoluci\u00f3n y las respuestas … Continuar leyendo \u00abEl mapa del epigenoma de la levadura revela detalles de la regulaci\u00f3n g\u00e9nica\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-18289","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/18289","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=18289"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/18289\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=18289"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=18289"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=18289"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}