Cr\u00e9dito: Pixabay\/CC0 Dominio p\u00fablico <\/p>\n
Un grupo mundial de investigadores pide una mejor integraci\u00f3n de la gen\u00e9tica viral, la bioinform\u00e1tica y la salud p\u00fablica para permitir una mejor respuesta a la pandemia ahora y una mejor pandemia preparaci\u00f3n en el futuro. En un art\u00edculo de comentario en la revista Nature, una colaboraci\u00f3n internacional de especialistas en an\u00e1lisis viral y gen\u00e9tico, dirigida por la cient\u00edfica suiza Dra. Emma Hodcroft de la Universidad de Berna y el Prof. Christophe Dessimoz de la Universidad de Lausana, ambos del SIB Swiss Institute of Bioinformatics, junto con el Dr. Nick Goldman en EMBL-EBI en el Reino Unido, exponen los \u00abcuellos de botella bioinform\u00e1ticos\u00bb que est\u00e1n obstaculizando la respuesta a la pandemia de SARS-CoV-2 y proponen formas de \u00ablimpiar el camino\u00bb para mejores herramientas y enfoques. Estos son los mensajes clave para llevar a casa y la perspectiva desde el punto de vista suizo. <\/p>\n
\u00abLo que los cient\u00edficos han logrado en un a\u00f1o desde el descubrimiento de un nuevo virus es verdaderamente notable\u00bb, dice Emma Hodcroft del Instituto de Medicina Social y Preventiva (ISPM) de la Universidad de Berna, primera autora del art\u00edculo. , \u00abpero las herramientas que los cient\u00edficos est\u00e1n usando para estudiar c\u00f3mo se transmite y cambia el SARS-CoV-2 nunca se dise\u00f1aron para las presiones \u00fanicas o los vol\u00famenes de datos de esta pandemia\u00bb.<\/p>\n
El SARS-CoV-2 es ahora uno de los pat\u00f3genos m\u00e1s secuenciados de todos los tiempos, con m\u00e1s de 600\u00a0000 secuencias de genoma completo generadas desde que comenz\u00f3 la pandemia, y m\u00e1s de 5000 nuevas secuencias provenientes de todo el mundo todos los d\u00edas. Sin embargo, las herramientas de an\u00e1lisis y visualizaci\u00f3n que se utilizan hoy en d\u00eda (incluida Nextstrain, desarrollada conjuntamente por el grupo del Prof. Richard Neher en el SIB y la Universidad de Basilea) nunca se dise\u00f1aron para manejar el volumen y la velocidad de las secuencias que se generan hoy en d\u00eda, o la escala de la participaci\u00f3n en la respuesta de salud p\u00fablica. \u00abEn todo el mundo, la vigilancia gen\u00f3mica se basa en la iniciativa de investigadores acad\u00e9micos para encontrar respuestas esenciales. La toma de decisiones de salud p\u00fablica se beneficiar\u00eda de un marco de colaboraci\u00f3n m\u00e1s sostenible\u00bb, dice Christophe Dessimoz en SIB y la Universidad de Lausana.<\/p>\n
Lo que permitir\u00eda una secuenciaci\u00f3n mejorada<\/p>\n
Las secuencias gen\u00e9ticas del SARS-CoV-2 contienen informaci\u00f3n valiosa para implementar pol\u00edticas pand\u00e9micas efectivas y mantenerse a la vanguardia del virus. Comparar cu\u00e1ntas mutaciones comparten diferentes muestras, por ejemplo, permite a los cient\u00edficos rastrear la transmisi\u00f3n del virus, lo que ayuda a identificar eventos de superpropagaci\u00f3n y propagaci\u00f3n internacional. Pero por el momento puede ser dif\u00edcil combinar esta informaci\u00f3n gen\u00e9tica con otras variables clave, como qui\u00e9n asisti\u00f3 a un evento y cu\u00e1ndo aparecieron los s\u00edntomas, lo que podr\u00eda ayudar a que estos m\u00e9todos sean a\u00fan m\u00e1s informativos.<\/p>\n
El ‘n\u00famero R’ se ha ido. de un concepto cient\u00edfico a una palabra familiar en el \u00faltimo a\u00f1o, mide el n\u00famero promedio de personas a las que transmitir\u00e1 una persona infectada. Aqu\u00ed, las secuencias tambi\u00e9n pueden ayudar, al ayudar a separar los casos importados de la transmisi\u00f3n local. Esto permite una estimaci\u00f3n m\u00e1s precisa de Re, pero requiere altos niveles de secuenciaci\u00f3n y an\u00e1lisis complejos, que actualmente no se implementan ampliamente.<\/p>\n
Finalmente, la secuenciaci\u00f3n es la \u00fanica forma de identificar y rastrear las numerosas mutaciones que surgen. en el SARS-CoV-2. Si bien las mutaciones son una parte normal de la vida del virus, los cient\u00edficos necesitan saber cu\u00e1les son variaciones inofensivas y cu\u00e1les podr\u00edan cambiar la transmisibilidad o el resultado cl\u00ednico del virus. La combinaci\u00f3n de secuencias, trabajo de laboratorio y predicciones computacionales podr\u00eda permitir una mejor comprensi\u00f3n de los impactos mutacionales, pero hay poco marco para ayudar a que estas diferentes especialidades trabajen juntas. \u00abLas secuencias de datos virales y los metadatos asociados deben determinarse, recopilarse y armonizarse gracias a infraestructuras estables compatibles con los principios de Open Data para facilitar la revisi\u00f3n por pares de la comunidad y su reutilizaci\u00f3n\u00bb, dice Christophe Dessimoz en SIB y la Universidad de Lausana, el pasado autor del comentario.<\/p>\n
Beneficios para Suiza<\/p>\n
\u00abEn Suiza, la poblaci\u00f3n podr\u00eda beneficiarse de una secuenciaci\u00f3n m\u00e1s sistem\u00e1tica y representativa, por ejemplo, a trav\u00e9s de un mejor rastreo de contratos, aislamiento espec\u00edfico y cuarentena de peque\u00f1os regiones, y orientar el cierre y la apertura de escuelas en funci\u00f3n de la presencia de determinadas variantes\u00bb, explica Emma Hodcroft. La armonizaci\u00f3n de las pr\u00e1cticas de datos de salud tambi\u00e9n es un tema cr\u00edtico. Suiza ya est\u00e1 poniendo mucho esfuerzo a nivel nacional a trav\u00e9s de la Red de Salud Personalizada de Suiza (SPHN).<\/p>\n
Los investigadores est\u00e1n convencidos de que el potencial de Suiza en t\u00e9rminos de experiencia e infraestructura est\u00e1 a la espera de ser aprovechado, para el beneficio de la salud p\u00fablica. \u00abLas herramientas para permitir la investigaci\u00f3n est\u00e1n ah\u00ed, y los investigadores se han autoorganizado y han dado el primer paso: para ampliar y sostener estos esfuerzos para acercar la investigaci\u00f3n y la salud p\u00fablica, dependemos de una financiaci\u00f3n p\u00fablica sostenible\u00bb, dice Christophe Dessimoz. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
En el seguimiento de las mutaciones del virus, la mayor\u00eda de los pa\u00edses vuelan a ciegas. M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Emma B. Hodcroft et al, \u00bfQuiere realizar un seguimiento m\u00e1s r\u00e1pido de las variantes pand\u00e9micas? Solucionar el cuello de botella de la bioinform\u00e1tica, Nature (2021). DOI: 10.1038\/d41586-021-00525-x Informaci\u00f3n del diario:<\/strong> Nature <\/p>\n Proporcionado por la Universidad de Berna Cita<\/strong>: C\u00f3mo rastrear las variantes de la pandemia m\u00e1s r\u00e1pido ( 2021, 3 de marzo) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https:\/\/medicalxpress.com\/news\/2021-03-track-variants-pandemic-faster.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Cr\u00e9dito: Pixabay\/CC0 Dominio p\u00fablico Un grupo mundial de investigadores pide una mejor integraci\u00f3n de la gen\u00e9tica viral, la bioinform\u00e1tica y la salud p\u00fablica para permitir una mejor respuesta a la pandemia ahora y una mejor pandemia preparaci\u00f3n en el futuro. En un art\u00edculo de comentario en la revista Nature, una colaboraci\u00f3n internacional de especialistas en … Continuar leyendo \u00abC\u00f3mo rastrear las variantes de la pandemia m\u00e1s r\u00e1pido\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-19058","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/19058","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=19058"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/19058\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=19058"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=19058"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=19058"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}