Fig. 1. Identificaci\u00f3n basada en MS de subtipos de proteoma de NSCLC. a, Gr\u00e1ficos de barras que muestran la histolog\u00eda y la distribuci\u00f3n por etapas en la cohorte de pacientes. b, Descripci\u00f3n general de la configuraci\u00f3n experimental para perfiles de proteoma basados en MS, resultados de an\u00e1lisis y niveles de datos de apoyo. c, \u00c1rbol jer\u00e1rquico que muestra los resultados del agrupamiento de consenso utilizado para identificar los subtipos de proteoma de NSCLC. Las barras de anotaciones a continuaci\u00f3n indican la informaci\u00f3n cl\u00ednica de las muestras, los subtipos de ARNm, las firmas de infiltraci\u00f3n, las mutaciones comunes y los niveles de prote\u00edna de los marcadores seleccionados. d, an\u00e1lisis de red de subtipos de proteoma de NSCLC con gr\u00e1fico UMAP coloreado por m\u00f3dulos (izquierda), mapa de calor de m\u00f3dulos versus subtipos (centro) y salida de an\u00e1lisis de enriquecimiento de tipos de c\u00e9lulas\/v\u00edas de se\u00f1alizaci\u00f3n para los diez m\u00f3dulos (derecha). e, Diagrama de caja que indica el n\u00famero de oncogenes sobreexpresados por muestra por subtipo de proteoma de NSCLC (n = 141 muestras). L\u00ednea media, mediana; bordes de caja, percentiles 25 y 75; bigotes, puntos m\u00e1s extremos que no superan 1,5 rango intercuart\u00edlico (RIC). El valor de P se calcul\u00f3 mediante la prueba de Kruskal Wallis y el n\u00famero de muestras por subtipo se indica en rojo. f, Diagrama de burbujas que indica CDRP com\u00fanmente sobreexpresados en la cohorte de NSCLC. OG, oncog\u00e9n; TSG, gen supresor de tumores; quant, cuantificaciones. g, Diagrama de dispersi\u00f3n que indica la correlaci\u00f3n de Pearsons de ARNm a prote\u00edna (corr) de CDRP. El gr\u00e1fico de densidad de correlaci\u00f3n correspondiente se muestra en la parte superior. h, Diagrama de dispersi\u00f3n que muestra la metilaci\u00f3n del promotor a la correlaci\u00f3n de ARNm frente a la correlaci\u00f3n de ARNm a prote\u00edna para CDRP. Se indican (arriba y a la derecha) los diagramas de densidad correspondientes para la superposici\u00f3n completa de genes (9018 genes). Las pruebas de comparaci\u00f3n m\u00faltiple de Dunns con el ajuste de BenjaminiHochberg para diagrama de caja (e) est\u00e1n disponibles en la Tabla complementaria 3. Cr\u00e9dito: DOI: 10.1038\/s43018-021-00259-9 <\/p>\n
Analizar todas las prote\u00ednas que existen en un tipo de tejido (el -llamado proteoma) puede proporcionar informaci\u00f3n vital sobre las causas de las enfermedades y la mejor manera de tratarlas. Hablamos con Janne Lehti, profesora del Departamento de Oncolog\u00eda-Patolog\u00eda, sobre la medicina basada en el proteoma y lo que puede aportar a la terapia personalizada contra el c\u00e1ncer. <\/p>\n
\u00bfQu\u00e9 es la medicina basada en proteoma?<\/p>\n
El proteoma es una instant\u00e1nea de todas las prote\u00ednas que existen en una c\u00e9lula o un tejido en particular. La medicina basada en proteomas se trata de medirlos y usar la informaci\u00f3n para aprender sobre una enfermedad y, por ejemplo, guiar la elecci\u00f3n del tratamiento, dice Janne Lehti, profesora del Departamento de Oncolog\u00eda-Patolog\u00eda del Karolinska Institutet. <\/p>\n
\u00bfEn qu\u00e9 se diferencia de la medicina basada en el genoma?<\/p>\n
La medicina basada en el genoma se trata de usar informaci\u00f3n sobre el ADN del genoma en una c\u00e9lula con el fin de diagnosticar o elegir una terapia. Pero son las prote\u00ednas las que realizan las funciones en las c\u00e9lulas, y las prote\u00ednas son los objetivos de casi todos los f\u00e1rmacos. Es por eso que necesitamos informaci\u00f3n sobre las prote\u00ednas para comprender los mecanismos detr\u00e1s de la salud y la enfermedad.<\/p>\n
\u00bfQu\u00e9 puede aprender de los datos del proteoma?<\/p>\n
Muchas enfermedades complejas, como la diabetes y el c\u00e1ncer , son causados no por uno sino por m\u00faltiples cambios en el genoma. Debido a esto, es dif\u00edcil averiguar c\u00f3mo causan colectivamente la enfermedad. Pero a nivel de prote\u00edna, el efecto de los m\u00faltiples cambios gen\u00f3micos es m\u00e1s evidente, lo que nos brinda la oportunidad de comprender c\u00f3mo se puede tratar mejor la enfermedad.<\/p>\n
Trabajo con proteogen\u00f3mica, que implica combinar informaci\u00f3n de ambos el genoma y el proteoma. Por ejemplo, puede responder preguntas sobre c\u00f3mo una mutaci\u00f3n afecta a todas las prote\u00ednas de la c\u00e9lula o la actividad de las prote\u00ednas diana de m\u00faltiples f\u00e1rmacos.<\/p>\n
\u00bfHasta d\u00f3nde ha llegado la investigaci\u00f3n sobre la medicina basada en el proteoma?<\/p>\n
T\u00e9cnicas para la medici\u00f3n simult\u00e1nea de un gran n\u00famero de prote\u00ednas se han desarrollado en los \u00faltimos cinco a\u00f1os, por lo que ahora podemos medir el proteoma en muestras cl\u00ednicas. Sabemos que el proteoma brinda informaci\u00f3n interesante y estamos comenzando a ver algunos art\u00edculos interesantes que muestran exactamente esto para diferentes formas de c\u00e1ncer, entre otras enfermedades. Hasta la fecha, la investigaci\u00f3n se ha centrado principalmente en analizar material tumoral ya recolectado. Ahora tenemos que empezar a analizar muestras de pacientes en el punto de decisi\u00f3n de la terapia para analizar c\u00f3mo la informaci\u00f3n puede afectar la toma de decisiones cl\u00ednicas en relaci\u00f3n con los otros datos utilizados para ello.<\/p>\n
\u00bfC\u00f3mo podr\u00eda afectar esto a la atenci\u00f3n de \u00bfpacientes con c\u00e1ncer?<\/p>\n
Al final del d\u00eda, puede significar ser capaz de elegir la mejor terapia para el paciente y evitar tratamientos que sospecha que son ineficaces, utilizando lo que sabemos sobre el proteoma de este paciente. Tambi\u00e9n creo que la medicina basada en el proteoma y la proteogen\u00f3mica ser\u00e1n cruciales si queremos aprender c\u00f3mo combinar mejor los medicamentos contra el c\u00e1ncer en un c\u00f3ctel efectivo.<\/p>\n
Usted y sus colegas publicaron un art\u00edculo en Nature Cancer en el que ha estudiado el proteoma y el genoma en muestras de tumores de pulm\u00f3n. \u00bfQu\u00e9 muestran sus resultados?<\/p>\n
Descubrimos que podemos usar el proteoma para dividir los tumores en nuevos subgrupos, que difieren entre s\u00ed de una manera interesante. Los tumores utilizan una variedad de mecanismos para esconderse del sistema inmunitario, y estos mecanismos difieren de un grupo a otro. Esta es informaci\u00f3n valiosa ya que determina si ciertas inmunoterapias, que son importantes medicamentos modernos contra el c\u00e1ncer, ayudar\u00e1n o no al paciente.<\/p>\n
\u00bfQu\u00e9 sigue para su investigaci\u00f3n?<\/p>\n
Comenzaremos para hacer an\u00e1lisis de proteoma para pacientes con c\u00e1ncer de pulm\u00f3n ingresados en el Hospital Universitario Karolinska. Nuestro trabajo formar\u00e1 parte del piloto de c\u00e1ncer de pulm\u00f3n que se iniciar\u00e1 bajo el grupo de trabajo de medicina de precisi\u00f3n del Karolinska Institutet.<\/p>\n
Para empezar, recopilaremos datos de proteoma en paralelo con otros tipos de datos. Veremos c\u00f3mo responde la paciente a los tratamientos que recibe y si podr\u00edamos haber predicho esta respuesta con mayor precisi\u00f3n a partir de los resultados de nuestra investigaci\u00f3n sobre el proteoma. Esto podr\u00eda ir seguido de un estudio en el que los datos del proteoma del paciente decidan qu\u00e9 tratamientos se administran para ver si esto da mejores resultados de respuesta que los medios actuales para elegir una terapia. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
Los cient\u00edficos mapean el proteoma humano M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Janne Lehti et al, Proteogenomics of non-small cell pulmon cancer revela subtipos moleculares asociados con dianas terap\u00e9uticas espec\u00edficas y mecanismos de evasi\u00f3n inmunitaria , Naturaleza C\u00e1ncer (2021). DOI: 10.1038\/s43018-021-00259-9 Informaci\u00f3n de la revista:<\/strong> Nature Cancer <\/p>\n Proporcionado por Karolinska Institutet Cita<\/strong>: El an\u00e1lisis de las prote\u00ednas en los tejidos puede mejorar el c\u00e1ncer therapy (2021, 23 de noviembre) recuperado el 29 de agosto de 2022 de https:\/\/medicalxpress.com\/news\/2021-11-analysis-proteins-tissue-cancer-therapy.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Fig. 1. Identificaci\u00f3n basada en MS de subtipos de proteoma de NSCLC. a, Gr\u00e1ficos de barras que muestran la histolog\u00eda y la distribuci\u00f3n por etapas en la cohorte de pacientes. b, Descripci\u00f3n general de la configuraci\u00f3n experimental para perfiles de proteoma basados en MS, resultados de an\u00e1lisis y niveles de datos de apoyo. c, \u00c1rbol … Continuar leyendo \u00abEl an\u00e1lisis de las prote\u00ednas en los tejidos puede conducir a una mejor terapia contra el c\u00e1ncer\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-1980","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1980","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1980"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1980\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1980"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=1980"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=1980"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}