Cr\u00e9dito: Pixabay\/CC0 Dominio p\u00fablico <\/p>\n
Las nuevas variantes de COVID-19 podr\u00edan poner en peligro gran parte del trabajo que se ha hecho hasta ahora para contener la pandemia. Sonia Gonalves explica c\u00f3mo la vigilancia gen\u00f3mica puede ayudarnos a rastrearlos y contenerlos. <\/p>\n
Antes de la pandemia, Sonia Gonalves dirig\u00eda la vigilancia gen\u00f3mica de la Red de Epidemiolog\u00eda Gen\u00f3mica de la Malaria. Desde la primavera de 2020, su equipo en el Instituto Wellcome Sanger se ha ampliado para apoyar el trabajo de COVID-19, y ahora est\u00e1 buscando ver d\u00f3nde aparecen nuevas variantes a medida que muta el virus. <\/p>\n
1. \u00bfC\u00f3mo se rastrean las nuevas mutaciones del coronavirus?<\/p>\n
Lo hacemos analizando continuamente muchas muestras de virus, observando c\u00f3mo est\u00e1 cambiando el c\u00f3digo gen\u00e9tico del virus y qu\u00e9 mutaciones se est\u00e1n adquiriendo. <\/p>\n
La tecnolog\u00eda que nos permite obtener la informaci\u00f3n gen\u00e9tica de una determinada muestra se denomina secuenciaci\u00f3n del genoma. <\/p>\n
La vigilancia gen\u00f3mica es c\u00f3mo traducimos esos datos en conocimiento sobre lo que est\u00e1 sucediendo y d\u00f3nde. Combinamos los datos gen\u00f3micos generados a trav\u00e9s de la secuenciaci\u00f3n con datos epidemiol\u00f3gicos (sobre c\u00f3mo se propaga el virus en las comunidades). Y eso proporciona informaci\u00f3n sobre c\u00f3mo est\u00e1n cambiando las poblaciones de virus y c\u00f3mo est\u00e1 evolucionando el virus. <\/p>\n
2. \u00bfPor qu\u00e9 es importante la vigilancia gen\u00f3mica?<\/p>\n
La vigilancia gen\u00f3mica es importante porque nos ayuda a comprender lo que sucede en la poblaci\u00f3n de un virus.<\/p>\n
Por ejemplo, en la pandemia de COVID-19 podemos ver casos subiendo, o casos bajando. Pero no sabemos qu\u00e9 est\u00e1 causando ese aumento o disminuci\u00f3n. Con la vigilancia gen\u00f3mica, podemos entender qu\u00e9 est\u00e1 pasando con el virus, c\u00f3mo se est\u00e1 propagando y si est\u00e1 cambiando de manera significativa.<\/p>\n
Como ejemplo, fue la vigilancia gen\u00f3mica la que detect\u00f3 un r\u00e1pido aumento de la frecuencia de una nueva variante (B.1.1.7) en el sureste de Inglaterra, donde Public Health England estaba investigando la causa del aumento de la infecci\u00f3n, que estaba ocurriendo a pesar de las restricciones.<\/p>\n
Entonces, la vigilancia gen\u00f3mica es una herramienta que puede ayudar agencias de salud p\u00fablica en c\u00f3mo controlan la pandemia. Por eso es importante que trabajemos en estrecha colaboraci\u00f3n con las agencias de salud p\u00fablica para proporcionarles los datos gen\u00f3micos que luego se pueden integrar con los datos epidemiol\u00f3gicos. <\/p>\n
Esa informaci\u00f3n es crucial para que las agencias de salud p\u00fablica respalden la toma de decisiones sobre qu\u00e9 intervenciones utilizar sobre el terreno.<\/p>\n
3. \u00bfC\u00f3mo funciona la vigilancia gen\u00f3mica en la pr\u00e1ctica?<\/p>\n
En Sanger recibimos cientos de miles de muestras cada semana, dependiendo de la etapa de la pandemia; en el pico, recib\u00edamos alrededor de 400.000 a 500.000 muestras por semana. Estas son muestras tanto positivas como negativas que llegan de laboratorios de pruebas de coronavirus de todo el Reino Unido.<\/p>\n
Hay mucha actividad coordinando la recepci\u00f3n de todas esas muestras, para asegurarnos de que estamos recibiendo las muestras y todo lo dem\u00e1s. los datos asociados necesarios para el procesamiento y en el momento adecuado del d\u00eda, de modo que el tiempo de respuesta para recuperar los datos sea lo m\u00e1s r\u00e1pido posible. <\/p>\n
Primero, las muestras positivas se seleccionan autom\u00e1ticamente, luego se procesan en el laboratorio y se secuencian. El proceso de secuenciaci\u00f3n dura alrededor de 24 horas. Los datos de secuenciaci\u00f3n generados luego se combinan, analizan e informan diariamente a las agencias de salud p\u00fablica y al Departamento de Salud y Atenci\u00f3n Social del Reino Unido.<\/p>\n
Por lo tanto, nuestras actividades diarias se centran en asegurarnos de obtener todas las muestras. fluyendo a trav\u00e9s de las tuber\u00edas, y que estamos produciendo los datos y comparti\u00e9ndolos diariamente.<\/p>\n
Es una operaci\u00f3n masiva, con una gran cantidad de equipos involucrados. Hasta la fecha, el Instituto Sanger ha generado una cantidad masiva de datos alrededor de una cuarta parte de todos los datos gen\u00f3micos sobre el SARS-CoV-2 en el mundo. Nuestro trabajo es parte del COVID-19 Genomics UK Consortium (COG-UK) que ha generado casi la mitad de todos los datos gen\u00f3micos sobre el SARS-CoV-2 en el mundo.<\/p>\n
4. \u00bfQu\u00e9 sucede con todos los datos gen\u00f3micos que produce? <\/p>\n
Tan pronto como se completa la secuenciaci\u00f3n y se analizan los datos, los datos gen\u00f3micos se comparten inmediatamente a nivel nacional e internacional, y se vuelven accesibles para personas de todo el mundo. Lo compartimos a trav\u00e9s de diferentes bases de datos, como GISAID, una base de datos internacional donde se encuentran actualmente todos los datos del COVID-19. <\/p>\n
Compartir los datos es fundamental para gestionar la pandemia. Solo podemos controlar la pandemia si es un esfuerzo global, porque si una variante de preocupaci\u00f3n aparece en una parte del mundo, afecta a todo el mundo.<\/p>\n
Podemos tener un programa muy bueno a nivel nacional, pero si hay una variante nueva en otro pa\u00eds y no la estamos detectando, o no sabemos de ella, puede poner en peligro todo el trabajo que se est\u00e1 haciendo.<\/p>\n
5. \u00bfC\u00f3mo se usan los datos de vigilancia gen\u00f3mica en la pandemia de COVID-19?<\/p>\n
Existen diferentes maneras en las que usamos los datos de vigilancia gen\u00f3mica durante una pandemia.<\/p>\n
Al comienzo de COVID-19, est\u00e1bamos viendo c\u00f3mo se estaba introduciendo el virus en el pa\u00eds y c\u00f3mo se estaba propagando dentro del Reino Unido.<\/p>\n
Tambi\u00e9n est\u00e1bamos usando datos gen\u00f3micos para controlar los brotes. Mirando los datos, pudimos ver si un aumento de casos en un lugar fue causado por una variante o por diferentes. Entonces sab\u00edamos si era un brote causado por una variante espec\u00edfica que se estaba transmitiendo muy r\u00e1pido, o si hab\u00eda diferentes variantes en el entorno que estaban causando el aumento de casos. <\/p>\n
M\u00e1s recientemente, el enfoque se ha desplazado hacia el uso de datos gen\u00f3micos para identificar y rastrear ‘variantes de inter\u00e9s’. El virus ha desarrollado nuevas mutaciones y hay varias variantes preocupantes que circulan en la poblaci\u00f3n. Algunos de ellos est\u00e1n asociados con una alta transmisibilidad, lo que en s\u00ed mismo es una preocupaci\u00f3n, ya que provocar\u00e1 un aumento de los casos. <\/p>\n
Tambi\u00e9n existe la preocupaci\u00f3n de que algunas de esas variantes puedan afectar la eficacia de algunas vacunas. Es muy importante que, tan pronto como se identifique una nueva variante, los datos se compartan p\u00fablicamente. Y que los programas de vacunas y los investigadores que trabajan en el desarrollo de vacunas puedan usar inmediatamente esos datos: en primer lugar, para evaluar si esas variantes tienen alg\u00fan impacto en las vacunas; y si ese es el caso, hacer cambios r\u00e1pidamente para adaptar las vacunas.<\/p>\n
6. \u00bfC\u00f3mo se identifican las ‘variantes de preocupaci\u00f3n’?<\/p>\n
El virus siempre est\u00e1 evolucionando. Este es un proceso natural a medida que el virus se replica, se producen mutaciones. Los virus con nuevas mutaciones se denominan variantes.<\/p>\n
Una ‘variante en investigaci\u00f3n’ puede tener una o una serie de mutaciones, y generalmente est\u00e1 asociada con un contexto epidemiol\u00f3gico. Por ejemplo, si vemos una variante espec\u00edfica o un grupo espec\u00edfico de mutaciones, pero tambi\u00e9n estamos viendo que el n\u00famero de casos de esa variante espec\u00edfica est\u00e1 aumentando, eso podr\u00eda declararse una ‘variante bajo investigaci\u00f3n’.<\/p>\n
Se convierte en una ‘variante preocupante’ cuando una mutaci\u00f3n espec\u00edfica, o un grupo espec\u00edfico de mutaciones, tambi\u00e9n se asocia con una diferencia en el comportamiento del virus; por ejemplo, esa variante espec\u00edfica tiene una mayor transmisibilidad o un impacto en la respuesta inmune.<\/p>\n
La variante de preocupaci\u00f3n es declarada por las agencias de salud p\u00fablica. Trabajamos con ellos para proporcionar los datos gen\u00f3micos de apoyo. Cuando se detecta una variante preocupante, es muy importante monitorear c\u00f3mo se est\u00e1 propagando esa variante y c\u00f3mo se est\u00e1 introduciendo esa variante en el pa\u00eds.<\/p>\n
Desde el punto de vista de la vigilancia gen\u00f3mica, tan pronto como una variante se detecta un problema, nos enfocamos en identificar todas las muestras que pasan por el proceso de secuenciaci\u00f3n, cu\u00e1les son variantes de inter\u00e9s o variantes bajo investigaci\u00f3n.<\/p>\n
Nuestros canales de an\u00e1lisis de datos actualmente est\u00e1n analizando cuatro variantes de inter\u00e9s y seis variantes de investigaci\u00f3n, pero esto est\u00e1 en constante revisi\u00f3n para agregar nuevas. Estos datos luego se proporcionan a las agencias de salud p\u00fablica, que usan esa informaci\u00f3n para contener la propagaci\u00f3n de esas variantes. <\/p>\n
7. \u00bfC\u00f3mo pueden ayudar los datos gen\u00f3micos a contener la pandemia?<\/p>\n
El mejor ejemplo es a trav\u00e9s de la detecci\u00f3n de variantes preocupantes. Ah\u00ed es donde est\u00e1 el mayor valor de la vigilancia gen\u00f3mica, en esta fase de la pandemia.<\/p>\n
La existencia de estas variantes es preocupante porque pueden poner en peligro todo el trabajo que se ha hecho hasta ahora con los programas de vacunas. Por lo tanto, tener la capacidad de saber qu\u00e9 est\u00e1 sucediendo, d\u00f3nde se est\u00e1n propagando estas variantes y c\u00f3mo contenerlas, es muy importante, y los datos gen\u00f3micos deben estar all\u00ed para respaldar esas actividades.<\/p>\n
Y no hay absolutamente ninguna duda de que m\u00e1s vendr\u00e1n variantes, el virus est\u00e1 en continua evoluci\u00f3n. Y el problema es que los n\u00fameros son tan altos a nivel mundial, que hay muchas oportunidades para que el virus evolucione y desarrolle nuevas mutaciones. As\u00ed que tendremos nuevas variantes. Y debemos mantener esa capacidad para detectarlos tan pronto como aparezcan.<\/p>\n
Es muy importante que todos los pa\u00edses aumenten sus esfuerzos de vigilancia gen\u00f3mica porque saber qu\u00e9 est\u00e1 sucediendo y c\u00f3mo est\u00e1 evolucionando el virus es absolutamente fundamental para contener la pandemia.<\/p>\n
E incluso despu\u00e9s de que la pandemia est\u00e9 controlada, es muy importante continuar con la vigilancia gen\u00f3mica como una actividad de base, porque a\u00fan nos proporcionar\u00e1 informaci\u00f3n sobre c\u00f3mo el virus est\u00e1 cambiando o no.<\/p>\n
8. \u00bfCu\u00e1l es el papel de la vigilancia gen\u00f3mica en el futuro? <\/p>\n
El trabajo que hemos estado haciendo durante el COVID-19 ha demostrado el valor que la vigilancia gen\u00f3mica puede aportar para controlar una pandemia y lo importante que es trabajar en estrecha colaboraci\u00f3n con las agencias de salud p\u00fablica. Este trabajo ha proporcionado los recursos, los m\u00e9todos anal\u00edticos y las bases sobre c\u00f3mo podemos responder mejor a futuras pandemias. <\/p>\n
Ha sido una experiencia de aprendizaje incre\u00edble. Y todav\u00eda estamos aprendiendo sobre la marcha. Y seguiremos aprendiendo incluso despu\u00e9s de que termine la pandemia. Pero realmente creo que estaremos mejor preparados para responder a futuras pandemias. <\/p>\n
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Siga las \u00faltimas noticias sobre el brote de coronavirus (COVID-19) Proporcionado por Wellcome Trust Cita<\/strong>: Experto explica c\u00f3mo rastrear variantes de coronavirus (2021, 19 de abril) recuperado 30 Agosto de 2022 de https:\/\/medicalxpress.com\/news\/2021-04-expert-track-coronavirus-variants.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Cr\u00e9dito: Pixabay\/CC0 Dominio p\u00fablico Las nuevas variantes de COVID-19 podr\u00edan poner en peligro gran parte del trabajo que se ha hecho hasta ahora para contener la pandemia. Sonia Gonalves explica c\u00f3mo la vigilancia gen\u00f3mica puede ayudarnos a rastrearlos y contenerlos. Antes de la pandemia, Sonia Gonalves dirig\u00eda la vigilancia gen\u00f3mica de la Red de Epidemiolog\u00eda … Continuar leyendo \u00abExperto explica c\u00f3mo rastrear variantes de coronavirus\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-20296","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/20296","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=20296"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/20296\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=20296"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=20296"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=20296"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}