El flujo de trabajo MicrobioLink. Cr\u00e9dito: Celdas 2020, 9(5), 1278; https:\/\/doi.org\/10.3390\/cells9051278 <\/p>\n
Una nueva herramienta desarrollada por cient\u00edficos del Instituto Quadram y el Instituto Earlham est\u00e1 ayudando a traducir la compleja comunicaci\u00f3n entre el microbioma y el cuerpo. La herramienta ser\u00e1 valiosa para los investigadores que intentan comprender la influencia de los microbios en la salud, los cambios que conducen a la enfermedad y apuntan a posibles objetivos farmacol\u00f3gicos. <\/p>\n
El microbioma intestinal humano tiene funciones importantes para mantenernos saludables. Es vital para obtener los nutrientes de los alimentos, y cada vez es m\u00e1s evidente que desempe\u00f1a un papel en diferentes enfermedades cr\u00f3nicas, terminales y relacionadas con el estilo de vida. Los cambios en la composici\u00f3n del microbioma se han asociado con la diabetes tipo 2, la obesidad y la enfermedad inflamatoria intestinal (EII), pero no est\u00e1 claro c\u00f3mo esos cambios provocan la aparici\u00f3n de diferentes afecciones o si, en cambio, son un s\u00edntoma.<\/p>\n
Para comenzar a desentra\u00f1ar los mecanismos, los investigadores se han centrado en la comunicaci\u00f3n entre los microbios y sus organismos anfitriones, incluidos los humanos. Los microbios liberan una variedad de metabolitos, prote\u00ednas y mol\u00e9culas de ARN que les permiten comunicarse con otras prote\u00ednas del organismo hu\u00e9sped. Esto puede provocar una respuesta de las redes del hu\u00e9sped que active o desactive los genes del hu\u00e9sped que modulan varios procesos.<\/p>\n
Traducir estas comunicaciones entre reinos entre las prote\u00ednas microbianas y del hu\u00e9sped es vital si queremos comprender los procesos que afectan tanto a la salud como a la enfermedad. Estos estudios de comunicaci\u00f3n entre reinos se han realizado para algunas bacterias, principalmente especies pat\u00f3genas que desencadenan enfermedades espec\u00edficas. Pero el microbioma puede contener miles de especies diferentes, todas potencialmente comunic\u00e1ndose con una serie de diferentes prote\u00ednas del hu\u00e9sped, vinculadas a muchas v\u00edas de se\u00f1alizaci\u00f3n y procesos fisiol\u00f3gicos diferentes.<\/p>\n
Para controlar estas comunicaciones complejas, el Dr. Tamas Korcsmaros y el Dr. Padhmanand Sudhakar del Instituto Quadram y el Instituto Earlham y sus colegas desarrollaron una tuber\u00eda computacional integrada llamada MicrobioLink. Publicado en la revista Cells, MicrobioLink conecta las prote\u00ednas microbianas con las prote\u00ednas del hu\u00e9sped con las que es probable que interact\u00faen y luego infiere c\u00f3mo estas interacciones influyen en los procesos celulares del hu\u00e9sped.<\/p>\n
Los investigadores pueden usar Microbiolink para probar un conjunto de prote\u00ednas , que por ejemplo podr\u00edan ser las prote\u00ednas secretadas por toda una comunidad microbiana, frente a una lista relevante de prote\u00ednas hu\u00e9sped de datos experimentales o bases de datos existentes. Luego, la tuber\u00eda predice las interacciones entre las prote\u00ednas microbianas y del hu\u00e9sped en funci\u00f3n de sus respectivas caracter\u00edsticas moleculares, como dominios y motivos. Las interacciones prote\u00edna-prote\u00edna representan canales de comunicaci\u00f3n potencialmente interesantes entre las bacterias y el hu\u00e9sped.<\/p>\n
El poder de Microbiolink viene en el siguiente paso que utiliza un principio, denominado difusi\u00f3n, en la ciencia de redes para rastrear los efectos de las interacciones entre las prote\u00ednas microbianas y del hu\u00e9sped en otros procesos del hu\u00e9sped aguas abajo. Esto utiliza bases de datos existentes de interacciones moleculares validadas para seguir las se\u00f1ales de las prote\u00ednas del hu\u00e9sped (que se prev\u00e9 que se unir\u00e1n y, por lo tanto, se modificar\u00e1n por las prote\u00ednas microbianas) a trav\u00e9s de otros genes o prote\u00ednas objetivo en el hu\u00e9sped. Con el filtrado apropiado, esto puede identificar nodos clave en redes y genes o prote\u00ednas espec\u00edficos en el hu\u00e9sped que se ven afectados por la comunicaci\u00f3n original entre los microbios y el hu\u00e9sped.<\/p>\n
Para probar la tuber\u00eda, el equipo de investigaci\u00f3n llev\u00f3 a cabo un estudio de caso utilizando un compendio de prote\u00ednas bacterianas que se encuentran solo en pacientes con enfermedad de Crohn y otro conjunto de prote\u00ednas que se encuentran solo en personas sanas. Usaron MicrobioLink para comparar c\u00f3mo los diferentes conjuntos de prote\u00ednas afectaban la autofagia, que es un proceso celular importante que se sabe que est\u00e1 desregulado en la enfermedad de Crohn. Esto revel\u00f3 una red con rutas de se\u00f1alizaci\u00f3n claramente separadas exclusivas de la enfermedad y los contextos saludables y, en \u00faltima instancia, que influyen en la expresi\u00f3n de los genes de autofagia.<\/p>\n
Estos hallazgos deber\u00edan confirmarse experimentalmente, pero apuntan hacia un mecanismo potencial que vincula el microbioma y la enfermedad de Crohn. El estudio de caso tambi\u00e9n demuestra el potencial de esta tuber\u00eda computacional integrada para traducir las comunicaciones entre los microbios y el hu\u00e9sped para que podamos comenzar a comprender sus efectos en el cuerpo y sus implicaciones en la salud y la enfermedad.<\/p>\n
Adem\u00e1s de estudiar la influencia del microbioma en otras enfermedades, MicrobioLink tambi\u00e9n podr\u00eda usarse para descubrir los efectos beneficiosos en el hu\u00e9sped de bacterias probi\u00f3ticas o comunidades de bacterias, y no solo en humanos.<\/p>\n
M\u00e1s inmediatamente, el equipo est\u00e1 buscando aplicar MicrobioLink para comprender los efectos del virus SARS-CoV-2 detr\u00e1s de la pandemia de COVID-19. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
El nuevo m\u00e9todo captura las primeras interacciones virales-prote\u00ednas del hu\u00e9sped M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Tahila Andrighetti et al. MicrobioLink: una canalizaci\u00f3n computacional integrada para inferir los efectos funcionales de las interacciones MicrobiomeHost, Cells (2020). DOI: 10.3390\/cells9051278 Proporcionado por Quadram Institute Cita<\/strong>: Nueva herramienta para traducir las comunicaciones entre el microbioma y el cuerpo (22 de mayo de 2020) consultado el 31 de agosto de 2022 en https:\/\/medicalxpress.com\/news\/ 2020-05-tool-microbiome-body.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" El flujo de trabajo MicrobioLink. Cr\u00e9dito: Celdas 2020, 9(5), 1278; https:\/\/doi.org\/10.3390\/cells9051278 Una nueva herramienta desarrollada por cient\u00edficos del Instituto Quadram y el Instituto Earlham est\u00e1 ayudando a traducir la compleja comunicaci\u00f3n entre el microbioma y el cuerpo. La herramienta ser\u00e1 valiosa para los investigadores que intentan comprender la influencia de los microbios en la salud, … Continuar leyendo \u00abNueva herramienta para traducir las comunicaciones entre el microbioma y el cuerpo\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-26277","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/26277","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=26277"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/26277\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=26277"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=26277"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=26277"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}