Impresi\u00f3n 3D de una prote\u00edna espiga de SARS-CoV-2, el virus que causa el COVID-19 frente a una impresi\u00f3n 3D de una part\u00edcula del virus SARS-CoV-2 . La prote\u00edna espiga (en primer plano) permite que el virus ingrese e infecte las c\u00e9lulas humanas. En el modelo de virus, la superficie del virus (azul) est\u00e1 cubierta con prote\u00ednas de pico (rojo) que permiten que el virus ingrese e infecte las c\u00e9lulas humanas. Cr\u00e9dito: NIH <\/p>\n
La masa de datos crecientes y en constante cambio resultantes de m\u00faltiples disciplinas representa uno de los mayores desaf\u00edos que los investigadores y los funcionarios de salud p\u00fablica deben enfrentar al tratar de manejar la pandemia de COVID-19 en curso. <\/p>\n
Sin embargo, varios centros en todo el pa\u00eds, incluido el Centro Nacional de Investigaci\u00f3n Ontol\u00f3gica (NCOR) de la Universidad de Buffalo, est\u00e1n trabajando para desarrollar ontolog\u00edas que ayuden en los esfuerzos para controlar el brote actual, acelerar el descubrimiento de datos en futuras pandemias y promover la reproducci\u00f3n investigaci\u00f3n de enfermedades infecciosas, seg\u00fan Barry Smith, Profesor Distinguido de Filosof\u00eda de SUNY y director de NCOR.<\/p>\n
Smith es uno de los coautores de un nuevo art\u00edculo que analiza c\u00f3mo las ontolog\u00edas pueden ayudar en la lucha contra COVID-19. <\/p>\n
Para darse cuenta del alcance del desaf\u00edo al que se enfrentan los cient\u00edficos frente al COVID-19, considere las disciplinas involucradas en la lucha, desde la inmunoqu\u00edmica hasta el modelado del comportamiento de la poblaci\u00f3n.<\/p>\n
Todos los datos recopilados por bi\u00f3logos, pat\u00f3logos, soci\u00f3logos, ge\u00f3grafos, m\u00e9dicos y epidemi\u00f3logos requieren integraci\u00f3n, pero la informaci\u00f3n relevante se captura utilizando t\u00e9rminos espec\u00edficos de la disciplina y, a menudo, se almacena de manera que solo son accesibles para aquellos que trabajan en los campos en los que se originaron.<\/p>\n
\u00abLa ontolog\u00eda se dise\u00f1\u00f3 para abordar ese problema mediante la creaci\u00f3n de vocabularios controlados comunes para descripciones de datos que todos pueden usar\u00bb, dice Smith, quien fue nombrado uno de los 50 m\u00e1s fil\u00f3sofos vivos influyentes en 2016 por TheBestSchools.org.<\/p>\n
\u00abEs casi imposible, a menos que sea un experto en m\u00faltiples disciplinas separadas, unir datos derivados de m\u00faltiples fuentes diferentes. Este problema es especialmente agudo frente a un nuevo pat\u00f3geno como el SARS-CoV-2, donde nadie puede anticipar qu\u00e9 combinaciones de factores resultar\u00e1n cruciales para comprender c\u00f3mo afecta a sus hu\u00e9spedes humanos\u00bb.<\/p>\n
Acceso e integrar cantidades masivas de informaci\u00f3n de m\u00faltiples fuentes de datos en ausencia de ontolog\u00edas es como tratar de encontrar informaci\u00f3n en los libros de la biblioteca usando solo fichas de cat\u00e1logo antiguas como nuestra gu\u00eda, cuando las propias fichas se han tirado al suelo.<\/p>\n
Las ontolog\u00edas son herramientas para compartir datos que brindan interoperabilidad a trav\u00e9s de un l\u00e9xico computarizado con una taxonom\u00eda y un conjunto de t\u00e9rminos y relaciones con definiciones estructuradas l\u00f3gicamente.<\/p>\n
Smith ha estado trabajando durante unos 15 a\u00f1os con bi\u00f3logos y especialistas en bioinform\u00e1tica para crear un conjunto de ontolog\u00edas para cubrir todas las ciencias de la vida.<\/p>\n
El art\u00edculo con Shane Babcock (Universidad de Ni\u00e1gara), John Beverley (Universidad de Northwestern) y Lindsay G. Cowell (Universidad de Texas Southwest Medical Schoo l) a\u00fan no ha sido aceptado para su publicaci\u00f3n. Sin embargo, a la luz de la urgencia de la pandemia, ya aparece en el repositorio de preprints de Open Science Foundation.<\/p>\n
Presenta, primero, un N\u00facleo de Ontolog\u00eda de Enfermedades Infecciosas (IDO), que contiene t\u00e9rminos relacionados con enfermedades infecciosas en general antes de describir c\u00f3mo este IDO Core se ha ampliado en una serie de ontolog\u00edas relacionadas con enfermedades infecciosas espec\u00edficas, como la malaria, el estafilococo y la gripe. El documento concluye con un tratamiento de las ontolog\u00edas IDO para enfermedades infecciosas virales en general, para enfermedades infecciosas por coronavirus y para COVID-19, espec\u00edficamente.<\/p>\n
Estas ontolog\u00edas ayudan a satisfacer la necesidad de terminolog\u00eda estandarizada para describir datos de coronavirus. e informaci\u00f3n, y debido a que todos est\u00e1n construidos de la misma manera, facilitan la comparaci\u00f3n de los datos de COVID-19 con los datos relacionados con otras enfermedades por coronavirus, como el SARS, el MERS y las nuevas enfermedades por coronavirus del futuro.<\/p>\n
\u00abUna ontolog\u00eda de enfermedades infecciosas tambi\u00e9n puede contribuir a resolver el problema de la reproducibilidad\u00bb, dice Smith.<\/p>\n
La reproducci\u00f3n de los resultados de los experimentos como parte del proceso de investigaci\u00f3n requiere una descripci\u00f3n precisa no solo de los resultados obtenidos. sino tambi\u00e9n de los protocolos, estad\u00edsticas, equipos, muestras y pruebas utilizadas.<\/p>\n
\u00abCreemos que, cuando se usa en combinaci\u00f3n con otras ontolog\u00edas de ciencias de la vida como la Ontolog\u00eda para Investigaciones Biom\u00e9dicas, el marco IDO pro ofrece una estrategia prometedora para la creaci\u00f3n de metadatos de procedencia comparables, integrables y detectables para los datos generados en la investigaci\u00f3n de enfermedades infecciosas\u00bb, dice Smith. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
Siga las \u00faltimas noticias sobre el brote de coronavirus (COVID-19) M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Shane Babcock et al. La ontolog\u00eda de las enfermedades infecciosas en la era de la COVID-19, (2020). DOI: 10.31219\/osf.io\/az6u5 Proporcionado por la Universidad de Buffalo Cita<\/strong>: Apalancamiento de un arma poderosa en la lucha contra la ontolog\u00eda COVID-19 (2020, 11 de junio) recuperado el 31 de agosto de 2022 de https:\/\/medicalxpress .com\/news\/2020-06-leveraging-powerful-weapon-covid-19ontology.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Impresi\u00f3n 3D de una prote\u00edna espiga de SARS-CoV-2, el virus que causa el COVID-19 frente a una impresi\u00f3n 3D de una part\u00edcula del virus SARS-CoV-2 . La prote\u00edna espiga (en primer plano) permite que el virus ingrese e infecte las c\u00e9lulas humanas. En el modelo de virus, la superficie del virus (azul) est\u00e1 cubierta con … Continuar leyendo \u00abAprovechando un arma poderosa en la lucha contra el COVID-19\u2014ontolog\u00eda\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-29799","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/29799","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=29799"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/29799\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=29799"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=29799"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=29799"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}