Modelo estructural de infecci\u00f3n por SARS-CoV-2. Este modelo estructural fue construido con UCSF Chimera usando computadoras de alto rendimiento (Bridges Large y Frontera). El modelo muestra 16 virus, con las prote\u00ednas de punta en verde (PDB ID: 6VSB) y una membrana de bicapa lip\u00eddica real, con d\u00edmeros de ACE2 en magenta. Todas estas estructuras est\u00e1n en resoluci\u00f3n at\u00f3mica. La longitud de la membrana es de aproximadamente 1 micr\u00f3metro. Cr\u00e9dito: Victor Padilla-Sanchez, Universidad Cat\u00f3lica de Am\u00e9rica <\/p>\n
Con millones de casos de COVID-19 informados en todo el mundo, las personas recurren a pruebas de anticuerpos para averiguar si han estado expuestas al coronavirus que causa la enfermedad. Pero, \u00bfqu\u00e9 son los anticuerpos? \u00bfPor qu\u00e9 son importantes? Si los tenemos, \u00bfsomos inmunes al COVID-19? Y si no, \u00bfP\u00f3rque no? <\/p>\n
Las pruebas de anticuerpos buscan la presencia de anticuerpos, que son prote\u00ednas espec\u00edficas producidas en respuesta a infecciones. Los anticuerpos son espec\u00edficos de la enfermedad. Por ejemplo, los anticuerpos contra el sarampi\u00f3n lo proteger\u00e1n de contraer sarampi\u00f3n si se vuelve a exponer, pero no lo proteger\u00e1n de contraer paperas si se expone a las paperas.<\/p>\n
\u00abLos anticuerpos son importantes porque previenen infecci\u00f3n y curar a los pacientes afectados por enfermedades\u00bb, dijo V\u00edctor Padilla-S\u00e1nchez, investigador de la Universidad Cat\u00f3lica de Am\u00e9rica en Washington DC \u00abSi tenemos anticuerpos, somos inmunes a la enfermedad, mientras est\u00e9n en su sistema, usted est\u00e1 protegido . Si no tiene anticuerpos, la infecci\u00f3n contin\u00faa y la pandemia contin\u00faa\u00bb.<\/p>\n
Esta forma de protecci\u00f3n basada en anticuerpos extra\u00f1os se denomina inmunidad pasivainmunidad a corto plazo que se brinda cuando a una persona se le administran anticuerpos contra un enfermedad en lugar de producir estos anticuerpos a trav\u00e9s de su propio sistema inmunitario.<\/p>\n
\u00abEstamos en los pasos iniciales de esto ahora, y aqu\u00ed es donde espero que mi trabajo pueda ayudar\u00bb, dijo Padilla-S\u00e1nchez. Padilla-Sanchez se especializa en virus. Espec\u00edficamente, utiliza modelos inform\u00e1ticos para comprender la estructura de los virus a nivel molecular y utiliza esta informaci\u00f3n para tratar de averiguar c\u00f3mo funciona el virus.<\/p>\n
El s\u00edndrome respiratorio agudo severo (SARS) fue la primera nueva enfermedad infecciosa identificado en el siglo XXI. Esta enfermedad respiratoria se origin\u00f3 en la provincia china de Guangdong en noviembre de 2002. La Organizaci\u00f3n Mundial de la Salud identific\u00f3 este nuevo coronavirus (SARS-CoV) como el agente que provoc\u00f3 el brote.<\/p>\n
Ahora estamos en medio de otro nuevo coronavirus (SARS-CoV-2), que surgi\u00f3 en Wuhan, China en 2019. COVID-19, la enfermedad causada por el SARS-CoV-2, se ha convertido en una pandemia de r\u00e1pida propagaci\u00f3n que ha llegado a la mayor\u00eda de los pa\u00edses del mundo. Hasta julio de 2020, COVID-19 ha infectado a m\u00e1s de 15,5 millones de personas en todo el mundo con m\u00e1s de 630\u00a0000 muertes.<\/p>\n
An\u00e1lisis estructural de la glicoprote\u00edna de punta del SARS-CoV. En A, la prote\u00edna de punta del SARS-CoV (PDB ID: 6ACG) se muestra unida a ACE2 (marr\u00f3n) y al anticuerpo 80R (cian), superpuestos en el mismo sitio de uni\u00f3n. En B, la prote\u00edna de pico se muestra unida solo al anticuerpo 80R (ID de PDB: 2GHW), con el modelo estructural del RBD de la prote\u00edna de pico de SARS-CoV-2 (magenta) que contiene los bucles que faltan. Este modelo de homolog\u00eda sirvi\u00f3 como base para los experimentos de acoplamiento. En C se muestra una espiga coloreada por subunidades y mostrando los glicanos. Solo hay dos glicanos posibles en la regi\u00f3n RBD en 331 y 343 y ninguno de estos sitios afecta la uni\u00f3n de 80R. Cr\u00e9dito: Victor Padilla-Sanchez, Investigador, Universidad Cat\u00f3lica de Am\u00e9rica <\/p>\n
Hasta la fecha, no hay vacunas ni terapias para combatir la enfermedad.<\/p>\n
Dado que ambas enfermedades (SARS-CoV y SARS-CoV -2) comparten la misma prote\u00edna espiga, la clave de entrada que permite que el virus entre en las c\u00e9lulas humanas, la idea de Padilla-S\u00e1nchez era tomar los anticuerpos encontrados en el primer brote en 200280R y m396 y redise\u00f1arlos para que se adaptaran al virus COVID-19 actual. <\/p>\n
Un estudio de junio de 2020 en la revista en l\u00ednea Research Ideas and Outcomes describe los esfuerzos de Padilla-Sanchez para resolver este problema mediante simulaci\u00f3n por computadora. Descubri\u00f3 que las diferencias de secuencia evitan que 80R y m396 se unan a la COVID-19.<\/p>\n
\u00abComprender por qu\u00e9 80R y m396 no se unieron a la prote\u00edna espiga del SARS-CoV-2 podr\u00eda allanar el camino para dise\u00f1ar nuevos anticuerpos que son efectivos\u00bb, dijo Padilla-S\u00e1nchez. \u00abLas versiones mutadas de los anticuerpos 80r y m396 se pueden producir y administrar como terapia para combatir la enfermedad y prevenir la infecci\u00f3n\u00bb.<\/p>\n
Sus experimentos de acoplamiento mostraron que las sustituciones de amino\u00e1cidos en 80R y m396 deber\u00edan aumentar las interacciones de uni\u00f3n entre los anticuerpos y el SARS-CoV-2, proporcionando nuevos anticuerpos para neutralizar el virus.<\/p>\n
\u00abAhora, necesito probarlo en el laboratorio\u00bb, dijo.<\/p>\n
Para su investigaci\u00f3n , Padilla-S\u00e1nchez se bas\u00f3 en los recursos de supercomputaci\u00f3n asignados a trav\u00e9s del Extreme Science and Engineering Discovery Environment (XSEDE). XSEDE es un sistema virtual \u00fanico financiado por la Fundaci\u00f3n Nacional de Ciencias que utilizan los cient\u00edficos para compartir de forma interactiva recursos inform\u00e1ticos, datos y experiencia.<\/p>\n
Interfaz de acoplamiento entre el anticuerpo 80R modificado y el RBD de la prote\u00edna espiga del SARS-CoV-2. El modelo muestra la interfaz estructural con el anticuerpo 80R arriba y el RBD debajo. Las siete sustituciones en 80R se muestran en magenta y los residuos de RBD se muestran en cian. Observe c\u00f3mo las sustituciones en 80R permiten nuevas interacciones arom\u00e1tico-arom\u00e1ticas que mejoran la uni\u00f3n al RBD y no est\u00e1n presentes en el 80R de tipo salvaje. E484 se muestra apuntando hacia la hebra beta de 80R y, por lo tanto, se introdujo una sustituci\u00f3n de glicina para evitar choques. Cr\u00e9dito: Victor Padilla-Sanchez, investigador, Universidad Cat\u00f3lica de Am\u00e9rica <\/p>\n
Los sistemas Stampede2 y Bridges asignados por XSEDE en el Centro de Computaci\u00f3n Avanzada de Texas (TACC) y el Centro de Supercomputadoras de Pittsburgh respaldaron los experimentos de acoplamiento, ensamblajes macromoleculares y an\u00e1lisis y visualizaci\u00f3n.<\/p>\n
\u00abLos recursos de XSEDE fueron esenciales para esta investigaci\u00f3n\u00bb, dijo Padilla-S\u00e1nchez.<\/p>\n
Realiz\u00f3 los experimentos de acoplamiento en Stampede2 utilizando el paquete de software Rosetta, que incluye algoritmos para modelado computacional y an\u00e1lisis de estructuras de prote\u00ednas. El software une virtualmente las prote\u00ednas y luego proporciona una puntuaci\u00f3n para cada experimento de uni\u00f3n. \u00abSi encuentra una buena posici\u00f3n de acoplamiento, entonces puede recomendar que este nuevo anticuerpo mutado entre en producci\u00f3n\u00bb.<\/p>\n
La supercomputadora Frontera de TACC, la octava supercomputadora m\u00e1s poderosa del mundo y la supercomputadora m\u00e1s r\u00e1pida en un campus universitario, tambi\u00e9n brind\u00f3 una ayuda vital a Padilla-S\u00e1nchez. Us\u00f3 el software Chimera en Frontera para generar visualizaciones de resoluci\u00f3n extremadamente alta. A partir de ah\u00ed, transfiri\u00f3 el trabajo a Bridges debido a sus grandes nodos de memoria.<\/p>\n
\u00abFrontera tiene un gran rendimiento al importar una gran cantidad de grandes datos. Por lo general, solo podemos observar las interacciones de prote\u00ednas, pero con Frontera y Bridges, pudimos estudiar procesos de infecci\u00f3n completos en la computadora\u00bb, dijo. Los hallazgos de Padilla-S\u00e1nchez se probar\u00e1n en un laboratorio h\u00famedo. Una vez completada con \u00e9xito esa etapa, su trabajo puede pasar a ensayos en humanos.<\/p>\n
Actualmente, varios laboratorios de todo el mundo ya est\u00e1n probando vacunas.<\/p>\n
\u00abSi no encontramos una vacuna a corto plazo todav\u00eda tenemos inmunidad pasiva, que puede prevenir la infecci\u00f3n durante varios meses siempre que tenga los anticuerpos\u00bb, dijo Padilla-S\u00e1nchez. \u00abPor supuesto, una vacuna es el mejor resultado. Sin embargo, la inmunidad pasiva puede ser una v\u00eda r\u00e1pida para brindar alivio a la pandemia\u00bb. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
\u00bfSoy inmune al COVID-19 si tengo anticuerpos? M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> V\u00edctor Padilla-Sanchez, An\u00e1lisis in silico de la glicoprote\u00edna de punta del SARS-CoV-2 e informaci\u00f3n sobre la uni\u00f3n de anticuerpos, Ideas y resultados de investigaci\u00f3n (2020). DOI: 10.3897\/rio.6.e55281 Proporcionado por la Universidad de Texas en Austin Cita<\/strong>: Reingenier\u00eda de anticuerpos para COVID-19 (2020, 30 de julio) recuperado el 31 de agosto de 2022 de https:\/\/medicalxpress. com\/news\/2020-07-re-engineering-antibodies-covid-.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Modelo estructural de infecci\u00f3n por SARS-CoV-2. Este modelo estructural fue construido con UCSF Chimera usando computadoras de alto rendimiento (Bridges Large y Frontera). El modelo muestra 16 virus, con las prote\u00ednas de punta en verde (PDB ID: 6VSB) y una membrana de bicapa lip\u00eddica real, con d\u00edmeros de ACE2 en magenta. Todas estas estructuras est\u00e1n … Continuar leyendo \u00abReingenier\u00eda de anticuerpos para COVID-19\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-30964","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/30964","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=30964"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/30964\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=30964"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=30964"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=30964"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}