Cr\u00e9dito: Pixabay\/CC0 Dominio p\u00fablico <\/p>\n
El proyecto Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE) es un esfuerzo mundial para comprender c\u00f3mo funciona el genoma humano. Con la finalizaci\u00f3n de su \u00faltima fase, el Proyecto ENCODE ha agregado millones de \u00abinterruptores\u00bb de ADN candidatos de los genomas humano y de rat\u00f3n que parecen regular cu\u00e1ndo y d\u00f3nde se activan los genes, y un nuevo registro que asigna una parte de estos interruptores de ADN. a categor\u00edas biol\u00f3gicas \u00fatiles. El proyecto tambi\u00e9n ofrece nuevas herramientas de visualizaci\u00f3n para ayudar en el uso de grandes conjuntos de datos de ENCODE. <\/p>\n
Los resultados m\u00e1s recientes del proyecto se publicaron en Nature, junto con otros 13 estudios en profundidad publicados en otras revistas importantes. ENCODE est\u00e1 financiado por el Instituto Nacional de Investigaci\u00f3n del Genoma Humano, parte de los Institutos Nacionales de Salud.<\/p>\n
\u00abUna de las principales prioridades de ENCODE 3 fue desarrollar medios para compartir datos de los miles de experimentos ENCODE con la investigaci\u00f3n m\u00e1s amplia comunidad para ayudar a expandir nuestra comprensi\u00f3n de la funci\u00f3n del genoma\u00bb, dijo el director del NHGRI, Eric Green, MD, Ph.D. \u00abLas herramientas de b\u00fasqueda y visualizaci\u00f3n de ENCODE 3 hacen que estos datos sean accesibles, lo que impulsa los esfuerzos en la ciencia abierta\u00bb.<\/p>\n
Para evaluar las funciones potenciales de las diferentes regiones del ADN, los investigadores de ENCODE estudiaron los procesos bioqu\u00edmicos que normalmente se asocian con los interruptores que regular los genes. Este enfoque bioqu\u00edmico es una forma eficiente de explorar todo el genoma de forma r\u00e1pida y completa. Este m\u00e9todo ayuda a localizar regiones en el ADN que son \u00abelementos funcionales candidatos\u00bb regiones de ADN que se prev\u00e9 que sean elementos funcionales en funci\u00f3n de estas propiedades bioqu\u00edmicas. Luego, los candidatos pueden probarse en experimentos adicionales para identificar y caracterizar sus roles funcionales en la regulaci\u00f3n de genes.<\/p>\n
\u00abUn desaf\u00edo clave en ENCODE es que diferentes genes y regiones funcionales est\u00e1n activos en diferentes tipos de c\u00e9lulas\u00bb, dijo Elise Feingold. , Ph.D., asesor cient\u00edfico para la implementaci\u00f3n estrat\u00e9gica en la Divisi\u00f3n de Ciencias del Genoma en NHGRI y l\u00edder en ENCODE para el instituto. \u00abEsto significa que necesitamos analizar un n\u00famero grande y diverso de muestras biol\u00f3gicas para trabajar en un cat\u00e1logo de elementos funcionales candidatos en el genoma\u00bb.<\/p>\n
Se ha logrado un progreso significativo en la caracterizaci\u00f3n de los genes que codifican prote\u00ednas, que comprenden menos del 2% del genoma humano. Los investigadores saben mucho menos sobre el 98% restante del genoma, incluido cu\u00e1nto y qu\u00e9 partes realizan otras funciones. ENCODE est\u00e1 ayudando a llenar este importante vac\u00edo de conocimiento.<\/p>\n
El cuerpo humano est\u00e1 compuesto por billones de c\u00e9lulas, con miles de tipos de c\u00e9lulas. Si bien todas estas c\u00e9lulas comparten un conjunto com\u00fan de instrucciones de ADN, los diversos tipos de c\u00e9lulas (p. ej., coraz\u00f3n, pulm\u00f3n y cerebro) llevan a cabo funciones distintas al usar la informaci\u00f3n codificada en el ADN de manera diferente. Las regiones de ADN que act\u00faan como interruptores para activar o desactivar los genes, o sintonizar los niveles exactos de actividad de los genes, ayudan a impulsar la formaci\u00f3n de distintos tipos de c\u00e9lulas en el cuerpo y gobiernan su funcionamiento en la salud y la enfermedad.<\/p>\n
Durante la tercera fase de ENCODE recientemente completada, los investigadores realizaron casi 6000 experimentos4834 en humanos y 1158 en ratones para aclarar los detalles de los genes y sus reguladores potenciales en sus respectivos genomas.<\/p>\n
3 investigadores de ENCODE estudiaron el desarrollo de embriones de rat\u00f3n tejidos para comprender la l\u00ednea de tiempo de varios cambios gen\u00f3micos y bioqu\u00edmicos que ocurren durante el desarrollo del rat\u00f3n. Los ratones, debido a su similitud gen\u00f3mica y biol\u00f3gica con los humanos, pueden ayudar a informar nuestra comprensi\u00f3n de la biolog\u00eda y las enfermedades humanas.<\/p>\n
Estos experimentos en humanos y ratones se llevaron a cabo en varios contextos biol\u00f3gicos. Los investigadores analizaron c\u00f3mo las modificaciones qu\u00edmicas del ADN, las prote\u00ednas que se unen al ADN y el ARN (una mol\u00e9cula hermana del ADN) interact\u00faan para regular los genes. Los resultados de ENCODE 3 tambi\u00e9n ayudan a explicar c\u00f3mo las variaciones en las secuencias de ADN fuera de las regiones codificantes de prote\u00ednas pueden influir en la expresi\u00f3n de genes, incluso genes ubicados lejos de una variante espec\u00edfica.<\/p>\n
\u00abLos datos generados en ENCODE 3 aumentar dr\u00e1sticamente nuestra comprensi\u00f3n del genoma humano\u00bb, dijo Brenton Graveley, Ph.D., profesor y presidente del Departamento de Gen\u00e9tica y Ciencias del Genoma de UCONN Health. \u00abEl proyecto ha agregado una gran resoluci\u00f3n y claridad para los tipos de datos anteriores, como las prote\u00ednas de uni\u00f3n al ADN y las marcas de cromatina, y nuevos tipos de datos, como las interacciones de ADN de largo alcance y las interacciones prote\u00edna-ARN\u00bb.<\/p>\n
Como novedad, los investigadores de ENCODE 3 crearon un recurso que detalla diferentes tipos de regiones de ADN y sus funciones candidatas correspondientes. Una herramienta basada en la web llamada SCREEN permite a los usuarios visualizar los datos que respaldan estas interpretaciones.<\/p>\n
El Proyecto ENCODE comenz\u00f3 en 2003 y es un extenso esfuerzo de investigaci\u00f3n colaborativa que involucra a grupos en los EE. UU. e internacionalmente, que comprende a m\u00e1s de 500 cient\u00edficos con experiencia diversa. Se ha beneficiado y se ha basado en d\u00e9cadas de investigaci\u00f3n sobre la regulaci\u00f3n g\u00e9nica realizada por investigadores independientes de todo el mundo. Los investigadores de ENCODE han creado un recurso comunitario, asegurando que los datos del proyecto sean accesibles para cualquier investigador para sus estudios. Estos esfuerzos en ciencia abierta han dado como resultado m\u00e1s de 2000 publicaciones de investigadores ajenos a ENCODE que utilizaron datos generados por el Proyecto ENCODE.<\/p>\n
\u00abEsto demuestra que la enciclopedia se usa ampliamente, que es lo que siempre hab\u00edamos buscado \u00ab, dijo el Dr. Feingold. \u00abMuchas de estas publicaciones est\u00e1n relacionadas con enfermedades humanas, lo que demuestra el valor del recurso para relacionar el conocimiento biol\u00f3gico b\u00e1sico con la investigaci\u00f3n en salud\u00bb. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
ENCODE3: Interpretaci\u00f3n de los genomas humano y de rat\u00f3n M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Perspectivas sobre ENCODE, Naturaleza (2020). DOI: 10.1038\/s41586-020-2449-8 , www.nature.com\/articles\/s41586-020-2449-8 Informaci\u00f3n de la revista:<\/strong> Nature <\/p>\n Proporcionada por NIH\/National Human Genome Research Cita<\/strong> del Instituto: El proyecto ENCODE 3 detalla el funcionamiento interno del genoma humano y del rat\u00f3n (29 de julio de 2020) consultado el 31 de agosto de 2022 en https:\/\/medicalxpress.com\/news\/2020-07-encode- human-mouse-genome.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Cr\u00e9dito: Pixabay\/CC0 Dominio p\u00fablico El proyecto Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE) es un esfuerzo mundial para comprender c\u00f3mo funciona el genoma humano. Con la finalizaci\u00f3n de su \u00faltima fase, el Proyecto ENCODE ha agregado millones de \u00abinterruptores\u00bb de ADN candidatos de los genomas humano y de rat\u00f3n que parecen regular cu\u00e1ndo y d\u00f3nde se activan … Continuar leyendo \u00abEl proyecto ENCODE 3 detalla el funcionamiento interno del genoma humano y del rat\u00f3n\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-31044","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/31044","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=31044"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/31044\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=31044"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=31044"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=31044"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}