Ratones de fantas\u00eda, Mus musculus domesticusWIKIMEDIA COMMONS<\/p>\n
Investigadores han creado mapas gen\u00e9ticos de alta resoluci\u00f3n de todo el genoma de 100 cepas de ratones endog\u00e1micos. En comparaci\u00f3n con las cepas de origen silvestre, la mayor\u00eda de las cepas de laboratorio cl\u00e1sicas actuales tienen una diversidad gen\u00e9tica limitada y se originan abrumadoramente a partir de una sola especie de rat\u00f3n dom\u00e9stico, informan los investigadores.<\/p>\n
Or\u00edgenes y composici\u00f3n de ratones de laboratorio. El art\u00edculo, publicado en l\u00ednea esta semana en Nature Genetics<\/em>, tambi\u00e9n presenta una herramienta en l\u00ednea con la que los cient\u00edficos pueden visualizar datos gen\u00e9ticos detallados y \u00e1rboles de filogenia de cepas de ratones consangu\u00edneas y silvestres para decidir qu\u00e9 cepas es probable que sean m\u00e1s \u00fatil en un experimento.<\/p>\n "Es un papel muy bueno. Resuelve la controversia sobre cu\u00e1l es realmente el origen de estos animales" dijo Elizabeth Fisher, neurocient\u00edfica del University College London que no particip\u00f3 en la investigaci\u00f3n. En cuanto a la herramienta en l\u00ednea, agrega: "Estoy segura de que todos estaremos…<\/p>\n \u201cEstos son ratones con los que la gente ha estado trabajando durante m\u00e1s o menos 100 a\u00f1os. \u201d, dijo el autor principal Gary Churchill, genetista de ratones en el Laboratorio Jackson en Bar Harbor, Maine. \u00abEs vergonzoso tener un organismo modelo tan utilizado y no entender realmente cu\u00e1l es su relaci\u00f3n con la naturaleza\u00bb.<\/p>\n En 2007, dos grupos de investigaci\u00f3n llegaron a diferentes conclusiones sobre los or\u00edgenes de las cepas de ratones endog\u00e1micos cl\u00e1sicos. Un grupo descubri\u00f3 que las cepas est\u00e1n compuestas en un 68 por ciento por Mus musculus domesticus<\/em> (ratones domesticados \u00abelegantes\u00bb derivados de criadores de ratones de Europa occidental), un 19 por ciento de otras cepas conocidas y un 13 por ciento de origen desconocido. Usando los mismos datos p\u00fablicos, un segundo grupo, dirigido por Churchill, concluy\u00f3 que las cepas endog\u00e1micas son mucho menos diversas: el 92 por ciento de su composici\u00f3n gen\u00e9tica se deriva de M. metro. domesticus,<\/em> con el 7 por ciento restante procedente de otras dos especies conocidas.<\/p>\n Durante los pr\u00f3ximos tres a\u00f1os, Churchill, con su colaborador Fernando Pardo-Manuel de Villena en la Universidad de Carolina del Norte en Chapel Hill , dise\u00f1\u00f3 una matriz de genotipado de alta densidad y un software para genotipar cientos de cepas de ratones a alta resoluci\u00f3n. Una vez que la tecnolog\u00eda estuvo lista, el equipo recolect\u00f3 36 cepas de ratones de origen silvestre. \u00abHab\u00eda gente literalmente saliendo a los arbustos y atrapando ratones\u00bb, dijo Churchill, y analiz\u00f3 sus datos gen\u00e9ticos para determinar qu\u00e9 especie portaba qu\u00e9 nucle\u00f3tido \u00fanico. polimorfismos (SNP): variaciones de una sola letra en el ADN. Estos datos se utilizaron luego para identificar los or\u00edgenes de 100 cepas de ratones de laboratorio endog\u00e1micos cl\u00e1sicos.<\/p>\n Descubrieron que los genomas de las cepas de laboratorio endog\u00e1micas son abrumadoramente M. metro. domesticus<\/em> en origen, 90 por ciento o m\u00e1s en todos los casos, y el porcentaje restante se debe casi exclusivamente a una especie japonesa de ratones. \u00abRecapitulamos lo que dijimos en 2007, por lo que fue bueno ser reivindicado\u00bb, dijo Churchill. Y las cepas de laboratorio endog\u00e1micas ten\u00edan una diversidad gen\u00e9tica significativamente menor en comparaci\u00f3n con las cepas de origen silvestre: las cepas de laboratorio est\u00e1ndar contienen alrededor de 12 millones de SNP, mientras que la descendencia de ratones endog\u00e1micos y cepas de origen silvestre (parte de un proyecto de 2004 lanzado por Churchill y Pardo-Manuel de Villena llamado Collaborative Cross) tienen 45 millones de SNP.<\/p>\n Hay incluso regiones de los genomas de ratones de laboratorio que son gen\u00e9ticamente \u00abciegas\u00bb, dijo Churchill, donde no hay variaci\u00f3n gen\u00e9tica en absoluto. Sin variaci\u00f3n, no hay forma de que los investigadores prueben los efectos de diferentes variantes. Por ejemplo, fragmentos del cromosoma 10, donde se han identificado genes implicados en la vida \u00fatil, son id\u00e9nticos en las cepas de laboratorio. Dichas regiones pueden alentar a los investigadores a incorporar m\u00e1s cepas de origen silvestre en su trabajo, para la diversidad al\u00e9lica en esos lugares, dijo Churchill. \u00abNunca se puede tener demasiada diversidad\u00bb.<\/p>\n Adem\u00e1s, el equipo recopil\u00f3 datos de 162 cepas de ratones para crear una herramienta en l\u00ednea disponible p\u00fablicamente llamada Mouse Phylogeny Viewer. En el sitio, los investigadores pueden elegir cualquier conjunto de cepas, comparar c\u00f3mo se relacionan, ver sus or\u00edgenes e incluso observar regiones espec\u00edficas del genoma del rat\u00f3n para ver c\u00f3mo se comparan las cepas en los alelos individuales.<\/p>\n El nuevo los datos y la herramienta en l\u00ednea deber\u00edan ayudar a los investigadores a incorporar cepas de ratones nuevas y m\u00e1s diversas en su investigaci\u00f3n, dijo Fisher. Con la nueva herramienta, los ratones de origen salvaje \u00abno son un desconocido tan aterrador\u00bb, dijo. \u00abEs algo maravilloso que surge de este documento, que probablemente habr\u00e1 una adopci\u00f3n de cepas m\u00e1s diversas\u00bb.<\/p>\n H. Yang, et al., \u00abOrigen subespec\u00edfico y diversidad de haplotipos en ratones de laboratorio\u00bb, Nat Genet, doi:10.1038\/ng.84, 2011.<\/strong><\/p>\n Reciba acceso completo a m\u00e1s de 35 a\u00f1os de archivos<\/strong>, as\u00ed como a TS Digest<\/em><\/strong>, \u00a1Ediciones digitales de El cient\u00edfico<\/em><\/strong>, art\u00edculos destacados<\/strong> y mucho m\u00e1s!\u00danase gratis hoy \u00bfYa es miembro?Inicie sesi\u00f3n aqu\u00ed<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Ratones de fantas\u00eda, Mus musculus domesticusWIKIMEDIA COMMONS Investigadores han creado mapas gen\u00e9ticos de alta resoluci\u00f3n de todo el genoma de 100 cepas de ratones endog\u00e1micos. 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