CENTRO DE CIENCIAS DEL JUEGO, DEPARTAMENTO DE INGENIER\u00cdA E INFORM\u00c1TICA, UNIV. OF WASHINGTON<\/p>\n
Un peque\u00f1o grupo de diversos individuos que viven en al menos tres continentes, que se hacen llamar The Contenders, han resuelto la estructura de una prote\u00edna que ha dejado perplejos a los cient\u00edficos durante m\u00e1s de 10 a\u00f1os. Y lo hicieron desde la comodidad de sus propios hogares, jugando en el juego de plegamiento de prote\u00ednas en l\u00ednea llamado Foldit.<\/p>\n
The Contenders’ La soluci\u00f3n y su validaci\u00f3n se publicaron hoy (18 de septiembre) en Nature Structural and Molecular Biology<\/em>.<\/p>\n “Este es el verdadero negocio” dijo el biof\u00edsico Rhiju Das de la Universidad de Stanford, que no particip\u00f3 en el trabajo. \u00abCreo que este documento realmente muestra c\u00f3mo esta es una nueva forma de hacer ciencia que es m\u00e1s poderosa que lo que podr\u00eda hacer un pu\u00f1ado de expertos\u00bb.<\/p>\n La prote\u00edna en cuesti\u00f3n era una proteasa retroviral de Mason -Virus del mono Pfizer, que causa una enfermedad similar al SIDA en los monos. M\u00e1s…<\/p>\n As\u00ed que un cient\u00edfico frustrado, Mariusz Jaskolski de la Universidad A. Mickiewicz en Polonia y la Academia de Ciencias de Polonia, recurri\u00f3 a un juego en l\u00ednea llamado Foldit. El programa es una extensi\u00f3n del programa Rosetta@home, dise\u00f1ado por el bi\u00f3logo inform\u00e1tico <\/strong>David Baker de la Universidad de Washington para usar computadoras dom\u00e9sticas en todo el mundo para realizar c\u00e1lculos complejos sobre estructuras de prote\u00ednas. Mientras se ejecutaba el programa, los usuarios ve\u00edan un protector de pantalla de los c\u00e1lculos, dijo Baker, y en poco tiempo, comenz\u00f3 a recibir algunos correos electr\u00f3nicos sobre c\u00f3mo el programa no siempre era preciso. La prote\u00edna, cuando est\u00e1 plegando su h\u00e9lice, va hacia la izquierda cuando deber\u00eda ir hacia la derecha, informaron los usuarios.<\/p>\n Foldit permite a los usuarios alterar el curso de los c\u00e1lculos de Rosetta e intentar resolver las estructuras de prote\u00ednas por s\u00ed mismos. El objetivo: plegar la prote\u00edna para que tenga la energ\u00eda m\u00e1s baja, tal como lo hacen las mol\u00e9culas en la vida real.<\/p>\n Una captura de pantalla de Foldit de un rompecabezas de prote\u00ednas planteado a los jugadores de Foldit. CENTRO DE CIENCIAS DEL JUEGO, DEPARTAMENTO DE INGENIER\u00cdA E INFORM\u00c1TICA, UNIV. DE WASHINGTON <\/p>\n En el \u00faltimo a\u00f1o y medio, los usuarios del programa hab\u00edan demostrado su potencial para resolver problemas reales de plegamiento de prote\u00ednas, dijo Baker, por lo que cuando Jaskolski acudi\u00f3 a \u00e9l con esta enigm\u00e1tica proteasa viral, decidieron poner a los jugadores a la prueba Baker plante\u00f3 el problema a los jugadores de Foldit y observ\u00f3 c\u00f3mo llegaban las respuestas.<\/p>\n Unos 600 jugadores de 41 equipos enviaron m\u00e1s de 1,25 millones de soluciones. Reduci\u00e9ndolos a 5000, Jaskolski y sus colegas los sometieron a una t\u00e9cnica computacional llamada reemplazo molecular (MR), que prueba los modelos contra datos de cristalograf\u00eda de rayos X. Para que MR funcione, la estructura propuesta tiene que ser muy precisa, en cuyo caso los c\u00e1lculos de MR pueden ayudar a perfeccionar los detalles. Pero los intentos anteriores de MR para esta prote\u00edna hab\u00edan fallado porque los modelos de prote\u00edna estaban demasiado lejos de la realidad.<\/p>\n Pero la estructura de prote\u00edna propuesta por The Contenders result\u00f3 ganadora. Cuando tomamos [su] modelo, se ajustaba perfectamente a los datos de rayos X, as\u00ed que sab\u00edamos que [ellos] lo hab\u00edan resuelto, dijo Baker. Est\u00e1bamos totalmente impresionados. Esta es la primera vez que un problema cient\u00edfico de larga data ha sido resuelto por los jugadores de Foldit o, que yo sepa, por los participantes de juegos cient\u00edficos.<\/p>\n El avance final provino de la usuaria de Foldit, mimi, miembro de The Contenders. y un t\u00e9cnico cient\u00edfico en una escuela secundaria cerca de Manchester, Reino Unido, que ha estado jugando Foldit durante unos 3 a\u00f1os. Meti\u00f3 un colgajo de la prote\u00edna que sobresal\u00eda, explica, para hacer que la prote\u00edna fuera m\u00e1s globular. Pero ella enfatiza que el logro fue en gran medida un esfuerzo de grupo, y se\u00f1ala que no le fue posible colocar el colgajo hasta que otros en el grupo hubieran hecho los ajustes clave en la estructura de las prote\u00ednas.<\/p>\n Es una especie de un caso sin precedentes de uso de no especialistas en computaci\u00f3n para resolver un problema cient\u00edfico de larga data, dijo Alexander Wlodawer, jefe del Laboratorio de Cristalograf\u00eda Macromolecular del Instituto Nacional del C\u00e1ncer.<\/p>\n El pr\u00f3ximo paso podr\u00eda ser proporcionar a los usuarios de Foldit validaci\u00f3n mientras juegan, dijo Das, ex postdoctorado en el laboratorio de Bakers. En este caso, los jugadores simplemente siguieron modificando la estructura hasta que produjo una puntuaci\u00f3n de energ\u00eda baja, pero no obtuvieron una respuesta experimental hasta el final.<\/p>\n \u00bfQu\u00e9 pasa si los jugadores tienen acceso a datos experimentales? Das se pregunt\u00f3. \u00bfPueden interpretarlo de la misma manera que lo hacen los cient\u00edficos? \u00bfPodemos convertir a 10.000 o 100.000 cient\u00edficos ciudadanos en cient\u00edficos reales que est\u00e9n desarrollando hip\u00f3tesis y luego haciendo experimentos y luego refinando sus hip\u00f3tesis? Si es as\u00ed, los usuarios de Foldit no solo podr\u00e1n resolver estructuras de prote\u00ednas, sino tambi\u00e9n refinar las reglas del juego en s\u00ed, agreg\u00f3 Das, y ayudar a los cient\u00edficos a alcanzar el objetivo final de comprender la estructura directamente a partir de una secuencia de amino\u00e1cidos de prote\u00ednas.<\/p>\n Predecir el plegamiento de prote\u00ednas simplemente sobre la base de la secuencia de la prote\u00edna es uno de esos problemas cient\u00edficos sin resolver, dijo Wlodawer. Pero estos nuevos m\u00e9todos que est\u00e1 introduciendo el Dr. Baker, y algunos otros, ahora est\u00e1n cambiando todo esto.<\/p>\n F. Khatib et al., Estructura cristalina de una proteasa retroviral monom\u00e9rica resuelta por jugadores de juegos de plegamiento de prote\u00ednas, Nature Structural & Molecular Biology, doi:10.1038\/nsmb.2119, 2011.<\/strong><\/p>\n Correcci\u00f3n: esta historia se ha actualizado desde su versi\u00f3n original para aclarar que David Baker no dise\u00f1\u00f3 Foldit. De hecho, el programa fue dise\u00f1ado por cient\u00edficos inform\u00e1ticos del Center for Game Science de la Universidad de Washington<\/em>. El cient\u00edfico lamenta el error.<\/em><\/p>\n Reciba acceso completo a m\u00e1s de 35 a\u00f1os de archivos<\/strong>, as\u00ed como TS Digest<\/em><\/strong>, ediciones digitales de The Scientist<\/em><\/strong>, art\u00edculos destacados<\/strong>, \u00a1y mucho m\u00e1s!\u00danase gratis hoy \u00bfYa es miembro?Inicie sesi\u00f3n aqu\u00ed<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" CENTRO DE CIENCIAS DEL JUEGO, DEPARTAMENTO DE INGENIER\u00cdA E INFORM\u00c1TICA, UNIV. OF WASHINGTON Un peque\u00f1o grupo de diversos individuos que viven en al menos tres continentes, que se hacen llamar The Contenders, han resuelto la estructura de una prote\u00edna que ha dejado perplejos a los cient\u00edficos durante m\u00e1s de 10 a\u00f1os. Y lo hicieron desde … Continuar leyendo \u00abP\u00fablico Resuelve Estructura Proteica\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-34094","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/34094","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=34094"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/34094\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=34094"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=34094"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=34094"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}\u00bfLe interesa leer m\u00e1s?<\/h2>\n
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