WIKIMEDIA COMMONS, VOSSMAN<\/p>\n
Aunque el trabajo anterior identific\u00f3 ejemplos aislados de formas circulares de ARN, un nuevo estudio en PLoS ONE<\/em> muestra que la mol\u00e9cula asume esta forma mucho m\u00e1s de lo que se pensaba anteriormente. Al examinar el complemento completo de ARN de varios tipos de c\u00e9lulas humanas en busca de variantes de empalme alternativas, los investigadores de la Universidad de Stanford identificaron que una parte significativa de estas no son lineales, sino circulares.<\/p>\n “Es el enfoque global” eso es tan novedoso, dijo Jørgen Kjems, un bioqu\u00edmico de ARN de la Universidad de Aarhus en Dinamarca, que no particip\u00f3 en el estudio. El propio trabajo de Kjems sobre el ARN identific\u00f3 una transcripci\u00f3n circular de ARN antisentido de un gen neuronal, dirigida por microARN e involucrada en la supresi\u00f3n de prote\u00ednas.<\/p>\n En lugar de examinar variantes de empalme para genes espec\u00edficos, los investigadores de Stanford estaban usando ARN para escanee el genoma en busca de fragmentos \u00abcodificados\u00bb exones, donde las secuencias de \u00e1cido nucleico en los transcritos de ARN estaban desordenadas en comparaci\u00f3n con su secuencia en el cromosoma. El…<\/p>\n Para hacer esto, los investigadores extrajeron el ARN ribos\u00f3mico de las c\u00e9lulas tumorales, luego fragmentaron el ARN restante antes de crear una biblioteca de ADNc para escanear. Esto cre\u00f3 una gran variedad de secuencias, un rompecabezas de ARN, que Salzman y sus colegas ensamblaron compar\u00e1ndolas con bases de datos de transcripciones conocidas. Por lo tanto, los cient\u00edficos pudieron identificar los exones que se unieron fuera de la secuencia, dijo Salzman.<\/p>\n En lugar de descubrir algunas translocaciones, el equipo identific\u00f3 cientos de secuencias codificadas, explic\u00f3 el coautor y onc\u00f3logo pedi\u00e1trico de la Universidad de Stanford, Charles Gawad, lo que suger\u00eda que estaban encontrando ARN empalmado alternativamente. Cuando Gawad y Salzman intentaron volver a ensamblar la biblioteca de fragmentos de secuencias, descubrieron que muchas secuencias no parec\u00edan encajar, a menos que los cient\u00edficos modelaran las secuencias como c\u00edrculos.<\/p>\n Pensando que se hab\u00edan topado con una caracter\u00edstica de las c\u00e9lulas cancerosas, Salzman y Gawad realizaron los mismos experimentos en c\u00e9lulas humanas normales y encontraron un porcentaje similarmente alto de transcripciones codificadas que parec\u00edan ser circulares. Para confirmar esto, los investigadores sometieron el ARN a un tratamiento con RNase R, que solo digiere transcripciones lineales. La mayor\u00eda de las transcripciones circulares pronosticadas resistieron la digesti\u00f3n con RNasa R.<\/p>\n Una de las razones por las que los investigadores de Stanford pudieron identificar tantos ARN circulares cuando otros no lo hicieron fue su enfoque imparcial, dijo el experto en bioinform\u00e1tica Alexei Fedorov de la Universidad de Ohio. , que no particip\u00f3 en la investigaci\u00f3n. En lugar de extraer y examinar el ARN poliadenilado, que generalmente es lineal, su m\u00e9todo retuvo los ARN sin colas poli-A, de las que carecen la mayor\u00eda de los ARN circulares.<\/p>\n Es un hallazgo importante, pero la importancia no est\u00e1 probada. , dijo Alberto Kornblihtt, bi\u00f3logo molecular de la Universidad de Buenos Aires y del Consejo Nacional de Investigaciones (CONICET) de Argentina. Kornblihtt, que estudia el empalme alternativo del ARN pero no particip\u00f3 en la investigaci\u00f3n, se\u00f1ala que aunque hay ejemplos de ARN circular funcional, las reacciones enzim\u00e1ticas no son perfectas y queda por ver cu\u00e1ntos de los transcritos circulares son funcionales y c\u00f3mo. muchos son ruido evolutivo.<\/p>\n Salzman estuvo de acuerdo en que es demasiado pronto para predecir cu\u00e1n funcionalmente relevante es el ARN circular, pero dijo que es cautelosamente optimista y se\u00f1al\u00f3 que los ARN circulares se han identificado en una variedad de especies.<\/p>\n Gawad se\u00f1al\u00f3 la ubicaci\u00f3n de los ARN circulares en el citoplasma como un indicio de que algunos pueden realizar alguna funci\u00f3n. Uno podr\u00eda esperar que los subproductos de empalme no funcionales permanezcan en el n\u00facleo o se degraden r\u00e1pidamente.<\/p>\n Por ahora, los investigadores est\u00e1n investigando c\u00f3mo se forman los ARN circulares, con la esperanza de obtener informaci\u00f3n sobre los factores necesarios. M\u00e1s tarde, podr\u00edan intentar derribar la forma circular de un ARN espec\u00edfico, para ver si se puede inferir alguna funci\u00f3n. La funci\u00f3n es la gran pregunta y realmente desafiante, dijo Fedorov. Tomar\u00e1 muchos a\u00f1os y muchos laboratorios.<\/p>\n J. Salzman et al., <\/em>\u00abLos ARN circulares son la isoforma de transcripci\u00f3n predominante de cientos de genes humanos en diversos tipos de c\u00e9lulas\u00bb, PLoS ONE<\/em>, doi:10.1371\/journal.pone.0030733 , 2012.<\/strong><\/p>\n Reciba acceso completo a m\u00e1s de 35 a\u00f1os de archivos<\/strong>, as\u00ed como TS Digest<\/em><\/strong>, ediciones digitales de The Scientist<\/em><\/strong>, art\u00edculos destacados<\/strong>, \u00a1y mucho m\u00e1s!\u00danase gratis hoy \u00bfYa es miembro?Inicie sesi\u00f3n aqu\u00ed<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" WIKIMEDIA COMMONS, VOSSMAN Aunque el trabajo anterior identific\u00f3 ejemplos aislados de formas circulares de ARN, un nuevo estudio en PLoS ONE muestra que la mol\u00e9cula asume esta forma mucho m\u00e1s de lo que se pensaba anteriormente. 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