Mina de oro HomestakeWIKIPEDIA, RACHEL HARRISEl \u00e1rbol de la vida est\u00e1 dominado por microbios, pero muchas ramas grandes siguen sin cartografiarse porque los cient\u00edficos se han limitado hist\u00f3ricamente a estudiar la peque\u00f1a fracci\u00f3n de especies que crecer\u00e1n en un laboratorio. Un equipo internacional de cient\u00edficos ha comenzado ahora a corregir este sesgo, secuenciando genomas completos de c\u00e9lulas individuales para traer a la \u00abmayor\u00eda no cultivada\u00bb a la vista.<\/p>\n
En total, el equipo identific\u00f3 m\u00e1s de 200 nuevas especies microbianas pertenecientes a 29 linajes subrepresentados o desconocidos. Y los resultados, publicados hoy (14 de julio) en Nature<\/em>, estaban llenos de nuevas habilidades metab\u00f3licas y sorpresas gen\u00e9ticas.<\/p>\n “[Ha habido un] fuerte imperativo para completar el \u00e1rbol microbiano de la vida” dijo Philip Hugenholtz de la Universidad de Queensland, uno de los l\u00edderes del estudio. \u00abSi tienes una visi\u00f3n incompleta de la evoluci\u00f3n, muy incompleta en el caso de los microorganismos, tienes una comprensi\u00f3n muy incompleta de la biolog\u00eda\u00bb.<\/p>\n Por…<\/p>\n Para completar estos vac\u00edos, el equipo recolect\u00f3 muestras de nueve h\u00e1bitats diversos, incluidos reactores industriales, aguas termales y una mina de oro. Los investigadores gravitaron hacia lugares con bajo contenido de ox\u00edgeno, ya que estos tienden a albergar una mayor y m\u00e1s interesante propagaci\u00f3n de microbios que los sitios familiares como nuestros cuerpos.<\/p>\n A partir de estas muestras, Tanja Woyke del Departamento de El Instituto Conjunto del Genoma de Energys en California aisl\u00f3 9.600 c\u00e9lulas individuales y amplific\u00f3 los genomas de alrededor de un tercio de ellas. Si alguno de estos genomas parec\u00eda provenir de nuevos linajes, el equipo los secuenciaba por completo.<\/p>\n Terminaron con 201 genomas completos que representaban 21 linajes bacterianos y 8 arqueales. Algunos de estos eran filos candidatos conocidos solo por c\u00f3digos abstractos, pero el equipo ahora les ha dado nombres descriptivos basados en la biolog\u00eda de sus miembros. Por ejemplo, EM19 ahora es Calescamantes (amantes del calor) porque provienen de un ambiente extremadamente c\u00e1lido, y OD1 ahora es Parcubacteria (bacteria ahorrativa) por su metabolismo optimizado. <\/p>\n Jack Gilbert, del Laboratorio Nacional de Argonne, llama al estudio un hito, aunque no abre nuevos caminos t\u00e9cnicos. Su escala e impacto son exactamente para lo que Nature<\/em> est\u00e1 ah\u00ed, dijo. Los datos nos permiten confirmar algunas relaciones conocidas, pero tambi\u00e9n descubrieron algunas nuevas e impresionantes.<\/p>\n Por ejemplo, el equipo descubri\u00f3 que tres de los filos candidatos est\u00e1n estrechamente relacionados y forman un superfilo llamado Patescibacteria, de el lat\u00edn para bacterias desnudas. Tienen genomas diminutos para organismos de vida libre, dijo Hugenholtz, y sus capacidades metab\u00f3licas probablemente sean limitadas en comparaci\u00f3n con la mayor\u00eda de las bacterias conocidas. Otros microbios tienen genomas aerodin\u00e1micos similares, dijo Hugenholtz, pero nuestros hallazgos sugieren que esta elecci\u00f3n de estilo de vida podr\u00eda ser m\u00e1s com\u00fan de lo que se cre\u00eda anteriormente. Podr\u00eda ser el m\u00e1s<\/em> com\u00fan.<\/p>\n Entre los nuevos genomas, el equipo tambi\u00e9n encontr\u00f3 muchos genes de arqueas que hab\u00edan terminado en bacterias, y viceversa, una se\u00f1al de que estos dos dominios regularmente intercambian ADN.<\/p>\n Por ejemplo, las patescibacterias fabrican dos de las bases de su ADN usando una enzima PurP prestada de una arquea muy temprana, y carecen de la enzima PurH1 que todas las dem\u00e1s bacterias usan para la misma tarea. Mientras tanto, dos de las especies de arqueas reci\u00e9n descritas transcriben su ADN usando factores sigma, prote\u00ednas que se pensaba que eran exclusivas de las bacterias. Y en el primer intercambio conocido de este tipo, un archaeon incluso parece haber tomado prestado un gen de un moho mucilaginoso eucari\u00f3tico.<\/p>\n El trabajo de los equipos tambi\u00e9n facilita el an\u00e1lisis de los datos de estudios metagen\u00f3micos anteriores, que colectivamente secuenciar el ADN de todos los microbios en un sitio espec\u00edfico. El resultado de esta estrategia es una monta\u00f1a de fragmentos de ADN an\u00f3nimos, que pueden anclarse a un \u00e1rbol filogen\u00e9tico compar\u00e1ndolos con genomas existentes. Al completar muchas ramas nuevas, el nuevo trabajo deber\u00eda permitir a otros cient\u00edficos anclar estos fragmentos con mayor precisi\u00f3n.<\/p>\n Al buscar espec\u00edficamente nuevas ramas en el \u00e1rbol de la vida, el equipo ha ampliado la diversidad de genomas microbianos conocidos. en un 11 por ciento. A\u00fan as\u00ed, hay un largo camino por recorrer. Calculan que para cubrir la mitad de la diversidad total de microbios, necesitar\u00edamos secuenciar al menos 16\u00a0000 genomas m\u00e1s, 80 veces m\u00e1s de lo que lograron en este estudio.<\/p>\n Sin duda, es un objetivo desalentador, pero estamos entusiasmados y lo haremos constantemente. trabajar hacia este objetivo, dijo Woyke, cuyo equipo est\u00e1 desarrollando nuevas tecnolog\u00edas para acelerar y ampliar su trabajo. Hugenholtz agreg\u00f3: Hace diez a\u00f1os, habr\u00eda dicho que nos llevar\u00eda cien a\u00f1os llegar a donde estamos hoy. No me sorprender\u00eda en absoluto si alcanzamos esta marca en la pr\u00f3xima d\u00e9cada.<\/p>\n C. Rinke et al., Informaci\u00f3n sobre la filogenia y el potencial de codificaci\u00f3n de la materia oscura microbiana<\/strong>, Nature<\/em>, doi:10.1038\/nature12352, 2013. <\/strong><\/p>\n Reciba acceso completo a m\u00e1s de 35 a\u00f1os de archivos<\/strong>, as\u00ed como TS Digest<\/em><\/strong>, ediciones digitales de The Scientist<\/em><\/strong>, historias destacadas<\/strong>, \u00a1y mucho m\u00e1s!\u00danase gratis hoy \u00bfYa es miembro?Inicie sesi\u00f3n aqu\u00ed<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Mina de oro HomestakeWIKIPEDIA, RACHEL HARRISEl \u00e1rbol de la vida est\u00e1 dominado por microbios, pero muchas ramas grandes siguen sin cartografiarse porque los cient\u00edficos se han limitado hist\u00f3ricamente a estudiar la peque\u00f1a fracci\u00f3n de especies que crecer\u00e1n en un laboratorio. 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