{"id":34952,"date":"2022-09-01T04:53:26","date_gmt":"2022-09-01T09:53:26","guid":{"rendered":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/opinion-demasiados-articulos-sobre-el-genoma-mitocondrial\/"},"modified":"2022-09-01T04:53:26","modified_gmt":"2022-09-01T09:53:26","slug":"opinion-demasiados-articulos-sobre-el-genoma-mitocondrial","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/opinion-demasiados-articulos-sobre-el-genoma-mitocondrial\/","title":{"rendered":"Opini\u00f3n: Demasiados art\u00edculos sobre el genoma mitocondrial"},"content":{"rendered":"

El protista Euglena <\/em>sp. (barra de escala 25 µm)WIKIMEDIA, ROGELIO MORENOAcabo de terminar de revisar otro art\u00edculo sobre el genoma mitocondrial. En estos d\u00edas, las solicitudes de revisi\u00f3n del genoma mitocondrial llegan m\u00e1s r\u00e1pido de lo que puedo responder. De hecho, solo en 2014, m\u00e1s de mil nuevas secuencias del genoma mitocondrial se depositaron en GenBank, un aumento de casi el 15 % con respecto al a\u00f1o anterior.<\/p>\n

Pocos cuestionar\u00edan la utilidad del ADN mitocondrial (ADNmt) como un marcador. Pero est\u00e1 cada vez m\u00e1s claro que la secuenciaci\u00f3n del mtDNA se ha convertido en una ruta f\u00e1cil hacia las publicaciones revisadas por pares; a veces, la b\u00fasqueda de estas publicaciones es una carga para los editores de revistas, los \u00e1rbitros y la infraestructura de investigaci\u00f3n en su conjunto. \u00bfEs la publicaci\u00f3n de art\u00edculos sobre genomas mitocondriales una reliquia del “publicar o perecer” panorama acad\u00e9mico? \u00bfDeber\u00edan las secuencias de mtDNA ir directamente a GenBank? \u00bfSeguimos obteniendo informaci\u00f3n nueva y significativa de los datos del genoma mitocondrial?<\/p>\n

Importancia del mtDNA<\/strong><\/p>\n

El primer genoma no viral en ser…<\/p>\n

A medida que mejoraron las t\u00e9cnicas de secuenciaci\u00f3n de Sanger, se volvi\u00f3 m\u00e1s asequible y eficiente secuenciar ADNmt completos, lo que result\u00f3 en una avalancha de genomas mitocondriales animales que, dadas sus peque\u00f1as estructuras circulares, se encuentran entre los cromosomas m\u00e1s f\u00e1ciles de secuenciar. Sin embargo, el mayor cambio de juego en la gen\u00f3mica mitocondrial fue la introducci\u00f3n de tecnolog\u00edas de secuenciaci\u00f3n masivamente paralelas. Una sola ejecuci\u00f3n de ADN gen\u00f3mico completo en una plataforma de secuenciaci\u00f3n de pr\u00f3xima generaci\u00f3n generalmente produce suficientes lecturas derivadas de ADNmt para ensamblar, con alta cobertura, el genoma mitocondrial completo o, en el caso del ADNc, el transcriptoma mitocondrial completo.<\/p>\n

Hoy en d\u00eda, los genomas mitocondriales se encuentran entre los marcadores gen\u00e9ticos m\u00e1s utilizados, y algunos han argumentado que el gen mitocondrial cox1 <\/em>deber\u00eda ser el c\u00f3digo de barras gen\u00e9tico universal para los an\u00e1lisis de biodiversidad eucari\u00f3tica. Los arque\u00f3logos y los cient\u00edficos forenses dependen del mtDNA para su trabajo, en parte debido a su modo de herencia uniparental, alto n\u00famero de copias y menor tasa de descomposici\u00f3n en relaci\u00f3n con el ADN nuclear. Los investigadores m\u00e9dicos utilizan el mtDNA para estudiar, diagnosticar y tratar enfermedades mitocondriales, que son algunos de los tipos m\u00e1s comunes de trastornos gen\u00e9ticos. La gen\u00e9tica mitocondrial incluso se est\u00e1 convirtiendo en una parte integral de las tecnolog\u00edas reproductivas humanas.<\/p>\n

M\u00e1s que nada, quiz\u00e1s, las mitocondrias han proporcionado una reserva interminable de genomas no convencionales, desde los enormes ADNmt multicromos\u00f3micos de varias flores hasta los desconcertantes ADNmt similares a cotas de malla. de cinetoplastos. Es dif\u00edcil imaginar el campo de la evoluci\u00f3n molecular tal como es hoy en d\u00eda sin las contribuciones de los estudios mitocondriales.<\/p>\n

Un alcance limitado<\/strong><\/p>\n

Con el estado de la m\u00e9todos de \u00faltima generaci\u00f3n para generar secuencias completas de mtDNA hubo una avalancha de publicaciones que describ\u00edan estas secuencias. La literatura cient\u00edfica est\u00e1 saturada de art\u00edculos sobre el genoma mitocondrial. Algunos de estos art\u00edculos abordan preguntas fundamentales, pero otros, desafortunadamente, agregan poco en t\u00e9rminos de nuevos conocimientos y reflejan m\u00e1s el deseo de algunos investigadores de acumular art\u00edculos revisados por pares en lugar de lograr progreso cient\u00edfico. Muchas revistas se han convertido en vertederos de art\u00edculos sobre ADNmt de diversa calidad. Todo esto est\u00e1 ocupando a los editores, revisores y a los propios autores, y potencialmente distray\u00e9ndolos de tareas m\u00e1s valiosas.<\/p>\n

Con papel o sin papel, <\/em>el 90 % de todos los ADNmt secuenciados son metazoos, y solo alrededor del 3 por ciento son de protistas. Esta distribuci\u00f3n de datos no refleja la biodiversidad eucari\u00f3tica, que es en gran parte microbiana y para la cual los animales representan solo una proporci\u00f3n modesta. La escasez de datos mitocondriales microbianos refleja no solo la priorizaci\u00f3n de los animales sobre otros organismos, sino tambi\u00e9n el hecho de que muchos eucariotas microbianos son dif\u00edciles de cultivar y tienen ADNmt complicados, lo que dificulta la secuenciaci\u00f3n de sus genomas mitocondriales. Pero esto puede estar cambiando pronto.<\/p>\n

Recientemente, ha habido importantes iniciativas de colaboraci\u00f3n para estudiar la gen\u00f3mica de los protistas. El Proyecto de secuenciaci\u00f3n del transcriptoma eucariota microbiano marino, en el que particip\u00e9, puso a disposici\u00f3n del p\u00fablico los transcriptomas de cientos de protistas marinos. Los datos de secuenciaci\u00f3n sin procesar de estos transcriptomas que se encuentran en GenBanks Sequence Read Archive permitir\u00e1n a otros grupos examinar la transcripci\u00f3n mitocondrial en algunos de los organismos menos estudiados pero ecol\u00f3gicamente importantes de la Tierra.<\/p>\n

La metagen\u00f3mica tambi\u00e9n est\u00e1 ayudando a la investigaci\u00f3n mitocondrial microbiana. Los proyectos masivos de secuenciaci\u00f3n de \u00e1cidos nucleicos ambientales pueden capturar la informaci\u00f3n gen\u00e9tica de las comunidades virales, procari\u00f3ticas y protistas de las que se toman las muestras. Los datos del genoma mitocondrial proliferan en los proyectos de secuenciaci\u00f3n ambiental y los nuevos algoritmos inform\u00e1ticos est\u00e1n facilitando el ensamblaje de mtDNA a partir de muestras de secuenciaci\u00f3n mixta. Ahora existen conjuntos de datos metagen\u00f3micos para ecosistemas extremos e inexplorados, y las secuencias mitocondriales dentro de estos proyectos est\u00e1n ayudando a descubrir linajes microbianos previamente desconocidos.<\/p>\n

En el futuro, muchas especies eucariotas requerir\u00e1n investigaciones m\u00e1s detalladas de sus arquitecturas gen\u00f3micas mitocondriales. En mi opini\u00f3n, existe la necesidad de estudios que combinen las t\u00e9cnicas tradicionales de biolog\u00eda molecular con la secuenciaci\u00f3n del genoma mitocondrial completo. La investigaci\u00f3n sobre la estructura cromos\u00f3mica, los modos de reparaci\u00f3n, replicaci\u00f3n y expresi\u00f3n, y el proteoma subyacente de los sistemas mitocondriales son excelentes v\u00edas para futuras investigaciones. Un \u00e9nfasis en cualquiera de estas diferentes v\u00edas de investigaci\u00f3n complementar\u00e1 muy bien la gran cantidad de datos del genoma mitocondrial que ya est\u00e1n disponibles y que crecen cada vez m\u00e1s. Puede que sea tarde para la gen\u00f3mica mitocondrial, pero el sol a\u00fan no se ha puesto.<\/p>\n

Este art\u00edculo es una adaptaci\u00f3n de una revisi\u00f3n publicada en <\/em>Briefings in Functional Genomics. <\/em><\/p>\n

David Roy Smith<\/em><\/strong> es profesor asistente de biolog\u00eda en la Universidad de Western Ontario. <\/em><\/strong><\/p>\n

\u00bfLe interesa leer m\u00e1s?<\/h2>\n

El cient\u00edfico <\/em>ARCHIVOS<\/h4>\n

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