{"id":35238,"date":"2022-09-01T05:16:34","date_gmt":"2022-09-01T10:16:34","guid":{"rendered":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/pantalla-crispr-detecta-regulacion-genetica-funcional\/"},"modified":"2022-09-01T05:16:34","modified_gmt":"2022-09-01T10:16:34","slug":"pantalla-crispr-detecta-regulacion-genetica-funcional","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/pantalla-crispr-detecta-regulacion-genetica-funcional\/","title":{"rendered":"Pantalla CRISPR detecta regulaci\u00f3n gen\u00e9tica funcional"},"content":{"rendered":"

© BRYAN SATALINOLa mayor parte del ADN no codifica prote\u00ednas. Y descubrir c\u00f3mo, cu\u00e1ndo y d\u00f3nde esta \u00abmateria oscura\u00bb gen\u00f3mica; juega un papel en la regulaci\u00f3n de genes es una empresa enorme. Ahora, los cient\u00edficos han desarrollado una herramienta que podr\u00eda ayudar. En un art\u00edculo publicado hoy (3 de abril) en Nature Biotechnology<\/em>,<\/em> un equipo de la Universidad de Duke en Durham, Carolina del Norte, describe una t\u00e9cnica de detecci\u00f3n de alto rendimiento que utiliza CRISPR-Cas9 edici\u00f3n del epigenoma para identificar elementos reguladores en los genomas de las c\u00e9lulas humanas.<\/p>\n

“Resulta que la mayor parte de la variaci\u00f3n gen\u00e9tica que es responsable de enfermedades complejas m\u00e1s comunes, como enfermedades cardiovasculares, diabetes y trastornos neurol\u00f3gicos&mdash ;realmente ocurre en esta regi\u00f3n entre genes” dijo el coautor Charles Gersbach de Duke. \u00abLo emocionante es tener m\u00e9todos disponibles para anotar la funci\u00f3n del genoma no codificante\u00bb. agreg\u00f3.<\/p>\n

“El genoma no codificante es enorme, y puede ser un desaf\u00edo identificar qu\u00e9 regiones son importantes para modular…<\/p>\n

Gersbach y sus colegas crearon bibliotecas lentivirales de ARN gu\u00eda para apuntar a elementos reguladores probables en varias megabases de ADN que rodean dos loci de inter\u00e9s: -globina y HER2. Luego generaron l\u00edneas celulares con una prote\u00edna fluorescente integrada para informar sobre la activaci\u00f3n del gen diana.<\/p>\n

Los autores transdujeron sus l\u00edneas celulares con una de las dos versiones de la prote\u00edna Cas9 con actividad de nucleasa desactivada, denominada dCas9. La forma represora de dCas9 recluta prote\u00ednas que metilan la lisina 9 en la histona H3, lo que conduce a la formaci\u00f3n de heterocromatina y la represi\u00f3n g\u00e9nica en las secuencias diana. La forma activadora de dCas9 se une a los potenciadores o promotores de ADN espec\u00edficos y facilita la acetilaci\u00f3n de la lisina 27 en la histona H3, lo que da como resultado la activaci\u00f3n del gen.<\/p>\n

A continuaci\u00f3n, los investigadores transdujeron sus l\u00edneas celulares con las bibliotecas de ARN gu\u00eda. en niveles bajos para asegurar que un \u00fanico ARN gu\u00eda estar\u00eda presente en cada c\u00e9lula. A continuaci\u00f3n, clasificaron las c\u00e9lulas en funci\u00f3n de la fluorescencia y secuenciaron el ARN gu\u00eda presente en c\u00e9lulas con una expresi\u00f3n g\u00e9nica diana especialmente alta y baja.<\/p>\n

La identificaci\u00f3n de secuencias confirm\u00f3 los elementos reguladores conocidos y revel\u00f3 nuevas funciones para otras secuencias de ADN. Muchas, aunque no todas, de estas secuencias aparec\u00edan tanto en las pantallas de activaci\u00f3n como de represi\u00f3n. Y algunas secuencias parec\u00edan desempe\u00f1ar un papel regulador para un gen en un tipo de c\u00e9lula, pero no para el mismo gen en otro tipo de c\u00e9lula. Aunque los cambios observados en la expresi\u00f3n g\u00e9nica fueron sutiles, los autores validaron el papel regulador de las secuencias de ADN individuales.<\/p>\n

Sabemos que hay varios aspectos del epigenoma que se correlacionan muy fuertemente con los cambios en la regulaci\u00f3n g\u00e9nica, y su Siempre ha sido una lucha convertir esas observaciones en una comprensi\u00f3n real de c\u00f3mo se regulan realmente los genes, dijo el coautor Tim Reddy de Duke a The Scientist<\/em><\/p>\n

Todav\u00eda no sabemos si la epigen\u00e9tica particular modificaci\u00f3n que observamos es la causal, dijo Reddy. Pero ahora sabemos por esto, y por otros trabajos de nuestros laboratorios y otros, que la modificaci\u00f3n del epigenoma s\u00ed tiene un papel en la regulaci\u00f3n de algunos de estos genes diana.<\/p>\n

Richard Sherwood del Brigham and Womens Hospital en Boston, que no particip\u00f3 en el estudio, dijo que esta t\u00e9cnica de detecci\u00f3n podr\u00eda ayudar a los investigadores a interpretar las grandes cantidades de datos gen\u00f3micos que se han generado como parte de proyectos como ENCODE. Es emocionante: cuantas m\u00e1s herramientas tenemos en la caja de herramientas, m\u00e1s preguntas diferentes podemos abordar, dijo Sherwood.<\/p>\n

Reddy, Gersbach y sus colegas est\u00e1n trabajando para ampliar la t\u00e9cnica de detecci\u00f3n, a fin de examinar elementos reguladores candidatos en todo el genoma a trav\u00e9s de diferentes tipos de c\u00e9lulas y tejidos. Tambi\u00e9n planean aprovechar la t\u00e9cnica en un esfuerzo por comprender mejor ciertas enfermedades.<\/p>\n

Hay tantos lugares donde sabemos que la regulaci\u00f3n gen\u00e9tica contribuye a la enfermedad, dijo Reddy. Ahora podemos comenzar a obtener nuevos conocimientos realmente claros sobre los mecanismos que causan esas enfermedades, y esos mecanismos en s\u00ed mismos podr\u00edan ser una v\u00eda para la terapia. Esos mecanismos podr\u00edan ayudar a guiar mejores diagn\u00f3sticos, podr\u00edan ayudar a diferenciar a los pacientes que responden o no a la terapia, [y] eso puede informar mejores tratamientos para los pacientes.<\/p>\n

TS Klann et al., CRISPR- La edici\u00f3n del epigenoma Cas9 permite la detecci\u00f3n de alto rendimiento de elementos reguladores funcionales en el genoma humano, Nature Biotechnol., <\/em>doi:10.1038\/nbt.3853, 2017.<\/strong><\/p>\n

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