ISTOCK, TLFURRER Si pensamos en nuestros cuerpos como ecosistemas que caminan y hablan, es l\u00f3gico pensar que las colecciones microbianas pueden cambiar en respuesta a los alimentos que comemos y los lugares en los que vivimos. De manera similar, se espera que los cambios relacionados con enfermedades en el entorno humano influyan en nuestros microbios residentes, incluso si esos microbios mismos no causan los cambios.<\/p>\n
Los investigadores e inversores conf\u00edan cada vez m\u00e1s en la posibilidad de que los microbios encuentren El puerto en los h\u00e1bitats humanos puede ser \u00fatil para detectar enfermedades, desde infecciones agudas hasta afecciones inflamatorias cr\u00f3nicas.<\/p>\n
“Tiene sentido que el microbioma pueda ser un indicador de muchas cosas diferentes que suceden en el cuerpo” ; dijo Jonathan Eisen, investigador de evoluci\u00f3n y ecolog\u00eda de la Universidad de California, Davis, cuyo laboratorio estudia las contribuciones microbianas a la salud del ecosistema. “La comunidad de microbios es una lectura bastante buena de la disponibilidad de carbono y nitr\u00f3geno y la activaci\u00f3n del sistema inmunol\u00f3gico y los niveles de ox\u00edgeno y humedad…<\/p>\n
Desde ese punto de vista, no es tan importante saltar a pensar que el seguimiento de los miembros de la comunidad microbiana, los genes o los resultados, ya sean prote\u00ednas o metabolitos, podr\u00eda ofrecer m\u00e9todos para medir el estado de la enfermedad o tal vez predecir las respuestas individuales a tratamientos espec\u00edficos. Varias empresas est\u00e1n trabajando en el desarrollo de herramientas para hacer precisamente eso.<\/p>\n
WIKIMEDIA, FOTO DE ERIC ERBE, COLORIZACI\u00d3N DIGITAL DE CHRISTOPHER POOLEY, AMBOS DEL USDA, ARS, EMUUn enfoque intenso en el uso de microbios intestinales en el diagn\u00f3stico es para realizar un seguimiento de las enfermedades inflamatorias del intestino (EII) como la enfermedad de Crohn o la colitis ulcerosa, porque la inflamaci\u00f3n que marca esas afecciones puede alterar dr\u00e1sticamente los tipos de microbios que sobreviven y prosperan en el intestino grueso.<\/p>\n
Estudios anteriores han revelado algunos de las caracter\u00edsticas m\u00e1s reveladoras del microbioma intestinal en la EII y van mucho m\u00e1s all\u00e1 de la presencia o ausencia de microbios espec\u00edficos en el intestino. Las personas con estas y otras enfermedades a menudo tienen una diversidad de microbios intestinales m\u00e1s baja de lo normal y tambi\u00e9n niveles reducidos de microbios inofensivos o comensales, lo que brinda la posibilidad de explorar m\u00faltiples resultados de pruebas.<\/p>\n
Con sede en San Francisco uBiome, por ejemplo, ofrece una prueba SmartGut que implica la secuenciaci\u00f3n dirigida de un gen de c\u00f3digo de barras bacteriano de ARN ribosomal 16S para medir la composici\u00f3n microbiana. Esa prueba se realiza en un laboratorio certificado por CLIA y acreditado por el Colegio de Pat\u00f3logos Estadounidenses e informa sobre patrones microbianos que se han relacionado con afecciones que van desde la EII hasta la diabetes tipo 2 y la obesidad. (Eisen renunci\u00f3 recientemente a la junta asesora cient\u00edfica de la empresa para evitar posibles conflictos con otro proyecto que est\u00e1 realizando).<\/p>\n
El sitio web de la empresa sugiere que el enfoque tiene una alta precisi\u00f3n cuando se trata de perfilar los microbios intestinales a los que se dirige, con una sensibilidad del 99 por ciento. para recogerlos, en promedio, y 100 por ciento de especificidad para los errores espec\u00edficos. Donde se vuelve m\u00e1s complicado es traducir dichos patrones en pistas cl\u00ednicas.<\/p>\n
Con ese fin, los investigadores de uBiome publicaron un estudio reciente de PLOS ONE<\/em> destinado a definir la variabilidad normal en el microbioma intestinal. Utilizando una estrategia de secuenciaci\u00f3n de ARNr 16S similar a la que subyace en la prueba SmartGut, analizaron muestras de heces de casi 900 individuos sanos para rastrear los niveles intestinales de 28 especies o g\u00e9neros microbianos intestinales, incluidos cinco pat\u00f3genos, 20 organismos comensales y tres especies que se cree que ser beneficioso Tambi\u00e9n describieron las asociaciones documentadas entre estos microbios y 13 tipos de enfermedades.<\/p>\n Un m\u00e9dico puede usar la informaci\u00f3n combinatoria de qu\u00e9 organismos est\u00e1n fuera del rango saludable para aumentar un plan de tratamiento, escribieron, se\u00f1alando que el panel de prueba considerado en el art\u00edculo de PLOS ONE<\/em> informa sobre algunos microorganismos que generalmente no se interrogan en la cl\u00ednica, pero brindan informaci\u00f3n adicional sobre la salud intestinal general de un paciente en un entorno cl\u00ednico.<\/p>\n WIKIMEDIA, DEPARTAMENTO DE AGRICULTURA DE LOS ESTADOS UNIDOS Al igual que otras empresas con enfoque cl\u00ednico, uBiome comercializa su prueba SmartGut como una herramienta de detecci\u00f3n en lugar de un diagn\u00f3stico definitivo, que brinda resultados que generalmente est\u00e1n m\u00e1s cerca de una nube de pistas microbianas que un \u00fanico punto de datos que representa la presencia de un solo pat\u00f3geno. Map My Gut, con sede en el Reino Unido, tambi\u00e9n utiliza la secuenciaci\u00f3n 16S para sus pruebas, que se ordenan a trav\u00e9s de profesionales de la salud registrados en el Servicio Nacional de Salud para personas con problemas de salud, como afecciones gastrointestinales u obesidad, as\u00ed como para personas sanas que sienten curiosidad por su intestino. microbioma y dieta. Nuevamente, los patrones de microbioma son el resultado predominante y el sitio de la empresa enfatiza que estas pruebas no son herramientas de diagn\u00f3stico m\u00e9dico.<\/p>\n Otra empresa est\u00e1 buscando evidencia cl\u00ednica a\u00fan m\u00e1s firme de su prueba de diagn\u00f3stico propuesta. Metabiomics, una subsidiaria de BioSpherex, acaba de concluir un ensayo cl\u00ednico destinado a comprender si su m\u00e9todo de secuenciaci\u00f3n de c\u00f3digo de barras de ADN bacteriano puede predecir el c\u00e1ncer de colon a partir de muestras de heces y\/o mucosa col\u00f3nica. Los investigadores inscribieron a 260 personas de entre 45 y 80 a\u00f1os de edad, a quienes tambi\u00e9n se les hab\u00eda realizado una colonoscopia, para el ensayo. El estudio concluy\u00f3 en marzo y los resultados a\u00fan no se han publicado.<\/p>\n Otras empresas, como Second Genome, est\u00e1n m\u00e1s centradas en la extracci\u00f3n de datos del microbioma para desarrollar nuevos tratamientos para enfermedades metab\u00f3licas o afecciones como la EII. , aunque se pueden usar las pruebas de diagn\u00f3stico correspondientes para dirigir dichos tratamientos a las personas con m\u00e1s probabilidades de beneficiarse de ellos, explic\u00f3 el cofundador de Second Genome y director s\u00e9nior de bioinform\u00e1tica, Todd DeSantis.<\/p>\n Si bien existe un enorme potencial en los tratamientos basados en microbiomas, diagn\u00f3stico, dijo Eamonn Quigley, m\u00e9dico e investigador del Hospital Metodista de Houston, debemos actuar con cuidado al interpretar los datos del microbioma y evitar pistas confusas al tratar de usar estos datos para hacer diagn\u00f3sticos.<\/p>\n Quigley escribi\u00f3 un art\u00edculo de perspectivas publicado en Nature Reviews: Gastroenterology & Hepatolog\u00eda<\/em> en mayo que describe una serie de consideraciones, desde la din\u00e1mica del microbioma hasta la dieta, los h\u00e1bitos de ejercicio, la edad, el estado de salud y m\u00e1s de un individuo, que pueden afectar la interpretaci\u00f3n de las pruebas microbianas. Preside el consejo asesor de una empresa irlandesa llamada Alimentary Health, que aprovecha los datos microbianos para obtener informaci\u00f3n sobre el tratamiento de enfermedades inflamatorias e infecciosas.<\/p>\n En este momento, las pruebas de detecci\u00f3n basadas en microbiomas establecidas son una pieza en la cl\u00ednica de un paciente. rompecabezas, en lugar de un m\u00e9todo para llegar a un diagn\u00f3stico firme. Sin embargo, las pruebas se est\u00e1n aplicando agresivamente en el \u00e1mbito del diagn\u00f3stico porque podr\u00edan obviar formas m\u00e1s invasivas de pruebas de diagn\u00f3stico.<\/p>\n En un estudio reciente de Metabolismo celular<\/em>, por ejemplo, los investigadores documentaron diferencias en comunidades microbianas intestinales entre individuos con enfermedad del h\u00edgado graso no alcoh\u00f3lico (NAFLD) que ten\u00edan fibrosis hep\u00e1tica leve a moderada o avanzada. El equipo vislumbr\u00f3 estos microbios intestinales utilizando ADN bacteriano extra\u00eddo y secuenciado de las heces de los sujetos, un tipo de muestra que es mucho m\u00e1s f\u00e1cil de obtener que las biopsias de h\u00edgado que se usan normalmente para confirmar el estado de NAFLD en los 86 participantes del estudio.<\/p>\n Mediante la secuenciaci\u00f3n metagen\u00f3mica, los investigadores observaron niveles de Escherichia coli<\/em> m\u00e1s altos de lo habitual en los microbiomas intestinales de los 14 pacientes con EHGNA con fibrosis avanzada, junto con diferencias en la representaci\u00f3n de otras tres docenas de especies microbianas. <\/p>\n Al combinar informaci\u00f3n sobre estos microbios asociados con la fibrosis avanzada con pistas sobre la diversidad microbiana intestinal, la edad y el \u00edndice de masa corporal de las personas, el equipo ide\u00f3 un modelo para predecir la fibrosis avanzada en personas con NAFLD. Estos resultados, junto con las pruebas preliminares de validaci\u00f3n en otras personas con cirrosis o fibrosis avanzada, sugieren que eventualmente no se necesitar\u00e1 m\u00e1s que excremento y experiencia para encontrar una enfermedad hep\u00e1tica avanzada.<\/p>\n Este es un campo relativamente joven, por lo que siempre debe estar Tenga cuidado con las posibilidades de traducir estos hallazgos, dijo el investigador de microbiomas de la Escuela de Medicina Icahn de Mount Sinai, Jos\u00e9 Clemente, cuyo laboratorio est\u00e1 en conversaciones con varias compa\u00f1\u00edas interesadas en usar microbios para tratar la EII. \u00c9l cree que puede no ser suficiente considerar solo los microbios intestinales, sino tambi\u00e9n las interacciones con sus anfitriones, que pueden estar impulsadas por la gen\u00e9tica de los individuos y la susceptibilidad a ciertas condiciones.<\/p>\n Con solo observar cualquiera de los factores [en aislamiento], no creo que vayas a tener herramientas de diagn\u00f3stico muy precisas, explic\u00f3 Clemente. Obtendr\u00e1 una precisi\u00f3n y diagn\u00f3sticos mucho mejores cuando combine los factores.<\/p>\n Reciba acceso completo a m\u00e1s de 35 a\u00f1os de archivos<\/strong>, as\u00ed como a TS Digest<\/em><\/strong>, ediciones digitales de El cient\u00edfico<\/em><\/strong>, art\u00edculos<\/strong>, \u00a1y mucho m\u00e1s!\u00danase gratis hoy \u00bfYa es miembro?Inicie sesi\u00f3n aqu\u00ed<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" ISTOCK, TLFURRER Si pensamos en nuestros cuerpos como ecosistemas que caminan y hablan, es l\u00f3gico pensar que las colecciones microbianas pueden cambiar en respuesta a los alimentos que comemos y los lugares en los que vivimos. 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