{"id":35340,"date":"2022-09-01T05:24:41","date_gmt":"2022-09-01T10:24:41","guid":{"rendered":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/un-nuevo-recurso-clasifica-a-las-sondas-quimicas-para-proteinas-humanas\/"},"modified":"2022-09-01T05:24:41","modified_gmt":"2022-09-01T10:24:41","slug":"un-nuevo-recurso-clasifica-a-las-sondas-quimicas-para-proteinas-humanas","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/un-nuevo-recurso-clasifica-a-las-sondas-quimicas-para-proteinas-humanas\/","title":{"rendered":"Un nuevo recurso clasifica a las sondas qu\u00edmicas para prote\u00ednas humanas"},"content":{"rendered":"

ISTOCK, SHUNYUFAN Las sondas qu\u00edmicas (peque\u00f1as mol\u00e9culas utilizadas para manipular la funci\u00f3n de las prote\u00ednas) a menudo no son tan selectivas o efectivas como podr\u00edan esperar los investigadores que las utilizan. Ahora, un recurso llamado Probe Miner tiene como objetivo avisar a los cient\u00edficos si su elecci\u00f3n no es buena y ofrecer mejores opciones. En un estudio publicado hoy (14 de diciembre) en Cell Chemical Biology<\/em>, investigadores del Instituto de Investigaci\u00f3n del C\u00e1ncer (ICR) en Londres describen la herramienta, que eval\u00faa millones de sondas qu\u00edmicas basadas en datos y resultados disponibles p\u00fablicamente. una lista que clasifica las sondas en orden de efectividad contra un objetivo.<\/p>\n

“Reunir todos los datos es una tarea monumental, pero ahora est\u00e1 en una forma visual muy simple” dice Michael Walters, un qu\u00edmico m\u00e9dico de la Universidad de Minnesota que no particip\u00f3 en el estudio. “Este portal deber\u00eda permitir que las personas sean m\u00e1s eficientes y efectivas en sus investigaciones porque realmente…<\/p>\n

Los reactivos deficientes son un factor importante en los 28\u00a0000 millones de d\u00f3lares gastados cada a\u00f1o en EE. UU. en investigaciones que no pueden ser replicado. Existe un mal uso generalizado de las herramientas qu\u00edmicas, dice el coautor Paul Workman, que trabaja en el descubrimiento de f\u00e1rmacos en el ICR. Los bi\u00f3logos a menudo usan compuestos de mala calidad o seleccionan una sonda qu\u00edmica que interact\u00faa con muchas prote\u00ednas de cierto tipo, como una quinasa, en lugar de solo el objetivo de inter\u00e9s, agrega.<\/p>\n

Y estos malos h\u00e1bitos son autosuficientes. -reforzando, el coautor y cient\u00edfico de datos de ICR Bissan Al-Lazikani le dice a The Scientist<\/em>. Las personas seleccionar\u00e1n una sonda porque realizan una b\u00fasqueda en PubMed y es la m\u00e1s citada. Y publican, y se convierte en una contaminaci\u00f3n exponencial, dice ella.<\/p>\n

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Podemos cubrir 10 veces m\u00e1s objetivos que los expertos porque es basado en datos, autom\u00e1tico y objetivo. Bissan Al-Lazikani, Instituto de Investigaci\u00f3n del C\u00e1ncer<\/p>\n<\/blockquote>\n

Al-Lazikani, Workman y sus colegas comenzaron con los datos subyacentes dentro de un recurso que crearon previamente llamado canSAR, que selecciona informaci\u00f3n sobre lo que se sabe sobre la presencia de prote\u00ednas, las interacciones y actividad en estados de enfermedad y tipos de c\u00e9lulas de la literatura cient\u00edfica y bases de datos p\u00fablicas para ayudar al descubrimiento de f\u00e1rmacos para el c\u00e1ncer. Desarrollaron un algoritmo inform\u00e1tico que utiliza los datos de canSAR para evaluar la idoneidad de casi 2 millones de compuestos como sondas qu\u00edmicas para objetivos de prote\u00ednas humanas.<\/p>\n

Basado en los niveles m\u00ednimos establecidos que los compuestos deb\u00edan alcanzar en t\u00e9rminos de su capacidad. para ingresar a las c\u00e9lulas, su selectividad contra los objetivos predichos y su potencia, los autores encontraron que las sondas qu\u00edmicas que cumplen con todos los criterios est\u00e1n disponibles solo para alrededor del 1 por ciento de las prote\u00ednas humanas, cuando los investigadores han predicho que entre el 20 y el 40 por ciento de las prote\u00ednas debe ser drogable.<\/p>\n

El grupo Al-Lazikanis incorpor\u00f3 los datos y el algoritmo en el recurso Probe Miner, donde cualquiera puede recibir una lista clasificada de sondas sugeridas para un objetivo en particular.<\/p>\n

Probe Miner es una gran idea, y el mundo necesita mucha m\u00e1s gente pensando en esto, dice el bioqu\u00edmico de la Universidad de Toronto, Aled Edwards, que no particip\u00f3 en el trabajo. Advierte que las listas de datos de Probe Miners pueden ser dif\u00edciles de interpretar a menos que se complementen con la opini\u00f3n de expertos.<\/p>\n

De hecho, los autores recomiendan que los investigadores utilicen Probe Miner junto con Chemical Probes Portal, una organizaci\u00f3n sin fines de lucro basada en la web. recurso curado por expertos en biolog\u00eda qu\u00edmica voluntarios, donde los investigadores pueden buscar una sonda qu\u00edmica adecuada para su objetivo previsto. Edwards y Workman forman parte de la junta directiva del Portal.<\/p>\n

El Portal de sondas qu\u00edmicas es absolutamente brillante porque los diferentes expertos le brindan sus propias reservas sobre una sonda en particular, pero el rendimiento es limitado. dice Al-Lazikani. Con Probe Miner, podemos cubrir 10 veces m\u00e1s objetivos que los expertos porque se basa en datos, es autom\u00e1tico y objetivo, agrega. Para combinar los beneficios de ambos recursos, los investigadores integraron enlaces al portal de sondas qu\u00edmicas dentro de Probe Miner.<\/p>\n

Al-Lazikani, Workman y sus colegas ya tienen actualizaciones planificadas para Probe Miner, como la integraci\u00f3n de la versi\u00f3n m\u00e1s reciente. del recurso canSAR en las pr\u00f3ximas semanas. Pero ahora, lo que m\u00e1s les preocupa es asegurarse de que las personas adecuadas sepan que la herramienta est\u00e1 disponible en l\u00ednea para que cualquiera pueda usarla.<\/p>\n

Lo que hemos tratado de hacer es capacitar a los bi\u00f3logos para que tomen buenas decisiones en \u00e1reas que no son naturalmente \u00fatiles. c\u00f3modo, dice Workman. Lograr que los bi\u00f3logos utilicen [Probe Miner] es probablemente incluso m\u00e1s importante en este momento que mejorarlo a\u00fan m\u00e1s, lo que de todos modos suceder\u00e1.<\/p>\n

AA Antolin et al., Evaluaci\u00f3n objetiva, cuantitativa y basada en datos de sondas qu\u00edmicas, <\/strong>Biolog\u00eda qu\u00edmica celular<\/em><\/strong>,<\/em> doi:10.1016\/j.chembiol.2017.11.004, 2017. <\/strong><\/p>\n

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ISTOCK, SHUNYUFAN Las sondas qu\u00edmicas (peque\u00f1as mol\u00e9culas utilizadas para manipular la funci\u00f3n de las prote\u00ednas) a menudo no son tan selectivas o efectivas como podr\u00edan esperar los investigadores que las utilizan. Ahora, un recurso llamado Probe Miner tiene como objetivo avisar a los cient\u00edficos si su elecci\u00f3n no es buena y ofrecer mejores opciones. En … Continuar leyendo \u00abUn nuevo recurso clasifica a las sondas qu\u00edmicas para prote\u00ednas humanas\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-35340","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/35340","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=35340"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/35340\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=35340"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=35340"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=35340"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}