La herramienta EcoTyper ha permitido a los investigadores de Stanford comprender mejor c\u00f3mo se comportan las c\u00e9lulas, como estas c\u00e9lulas de c\u00e1ncer de pulm\u00f3n, en diferentes entornos. Cr\u00e9dito: David A. Litman\/Shutterstock.com <\/p>\n
Investigadores del Instituto Stanford de Biolog\u00eda de C\u00e9lulas Madre y Medicina Regenerativa han ideado una herramienta para examinar c\u00f3mo las c\u00e9lulas se comportan e interact\u00faan en diversos entornos del cuerpo. Lo han usado para comprender mejor c\u00f3mo se desarrolla el c\u00e1ncer y c\u00f3mo se puede tratar. <\/p>\n
\u00abAhora podemos ver los componentes b\u00e1sicos del tejido, la forma en que se estructura todo el ecosistema celular, en lugar de solo mirar los tipos de c\u00e9lulas presentes\u00bb, dijo Aaron Newman, Ph.D., profesor asistente de ciencia de datos biom\u00e9dicos y un miembro del instituto. \u00abEs una forma mucho m\u00e1s poderosa de ver la organizaci\u00f3n de los tejidos\u00bb.<\/p>\n
La herramienta, llamada EcoTyper, combina nuevos algoritmos inform\u00e1ticos con los desarrollados previamente por los investigadores para analizar los tipos de c\u00e9lulas, c\u00f3mo se organizan en relaci\u00f3n con entre s\u00ed, y qu\u00e9 tipo de mensajes de ARN est\u00e1n creando las c\u00e9lulas. Los investigadores pudieron analizar las interacciones de las c\u00e9lulas en grandes cantidades de tejido a granel, utilizando an\u00e1lisis inform\u00e1ticos para determinar d\u00f3nde viven ciertos subtipos de c\u00e9lulas en el tejido y c\u00f3mo interact\u00faan con sus vecinas.<\/p>\n
\u00abEcoTyper es \u00fanico en su capacidad de decodificar la arquitectura celular de los tejidos en alta definici\u00f3n y escala masiva de manera rentable\u00bb, dijo Newman. \u00abEsto incluye poder analizar los tipos de muestras de tejido almacenados despu\u00e9s de biopsias o ensayos cl\u00ednicos, que de otro modo ser\u00edan dif\u00edciles y costosos de analizar de esta manera\u00bb.<\/p>\n
Otra ventaja de EcoTyper es que los investigadores pueden usar una gran cantidad de reservas de tejidos almacenados y bases de datos p\u00fablicas para ejecutar ensayos cl\u00ednicos virtuales, lo que han hecho para analizar miles de casos de c\u00e1ncer de una manera altamente rentable, dijo Newman.<\/p>\n
Se public\u00f3 un art\u00edculo que describe la herramienta en septiembre. 30 en la revista Cell. Newman, junto con el profesor asistente de ciencia de datos biom\u00e9dicos Andrew Gentles, Ph.D., son coautores principales del art\u00edculo, que muestra las capacidades de EcoTyper con un an\u00e1lisis de la arquitectura del tejido en diferentes tipos de tumores cancerosos s\u00f3lidos. Los autores principales son los acad\u00e9micos posdoctorales Bogdan Luca, Ph.D., y Chlo Steen, Ph.D.<\/p>\n
Un art\u00edculo complementario, publicado el 30 de septiembre en la revista Cancer Cell, describe c\u00f3mo se us\u00f3 EcoTyper para identificar subtipos de c\u00e9lulas de linfoma. Newman y Ash Alizadeh, MD, Ph.D., profesor de oncolog\u00eda, son los autores principales de ese art\u00edculo. Los autores principales son Chlo Steen, Ph.D., y Bogdan Luca, Ph.D.<\/p>\n
C\u00e9lulas cancerosas ‘EcoTyping’ y sus vecinas<\/p>\n
Si bien el c\u00e1ncer de pulm\u00f3n puede verse muy diferente de c\u00e1ncer de vejiga u otros tipos de tumores cancerosos bajo el microscopio, EcoTyper permiti\u00f3 a los investigadores encontrar 10 comunidades multicelulares distintas, denominadas \u00abecotipos\u00bb, que existen en m\u00e1s de una docena de tipos de tumores diferentes. Tambi\u00e9n encontraron que la presencia o ausencia de ciertos ecotipos en un tumor era altamente predictiva de los resultados y, a menudo, indicaba qu\u00e9 tipos de tratamiento funcionar\u00edan mejor, incluso para diferentes tipos de c\u00e1ncer, dicen los investigadores.<\/p>\n
\u00abNosotros encontr\u00f3 un ecotipo que era predictivo de una buena respuesta a una inmunoterapia en particular\u00bb, dijo Luca. \u00abDe hecho, fue incluso mejor predictor que otros biomarcadores candidatos que probamos, incluso aquellos que se buscaban espec\u00edficamente para predecir la respuesta\u00bb. Adem\u00e1s, con EcoTyper, los investigadores pudieron predecir si una lesi\u00f3n premaligna, un crecimiento anormal que puede volverse canceroso en los pulmones, regresar\u00eda espont\u00e1neamente o se convertir\u00eda en c\u00e1ncer de pulm\u00f3n.<\/p>\n
\u00abEcoTyper puede proporcionar una plataforma para futuros terapias, porque tiene una mejor idea de las c\u00e9lulas malas en un tumor que quiere atacar\u00bb, dijo Gentles. Este enfoque en las poblaciones de c\u00e9lulas que interact\u00faan en un tumor es diferente de los enfoques actuales, que generalmente se enfocan en \u00abmutaciones impulsoras\u00bb o genes a lo largo de una ruta determinada. \u00abMuchas terapias contra el c\u00e1ncer se enfocan en un tipo de c\u00e9lula o gen determinado, pero siempre hay otras c\u00e9lulas que contribuyen al c\u00e1ncer o c\u00e9lulas que no tienen esa mutaci\u00f3n gen\u00e9tica\u00bb, y esos son objetivos de tratamiento igualmente valiosos, agreg\u00f3.<\/p>\n
Pasando al c\u00e1ncer de la sangre m\u00e1s com\u00fan<\/p>\n
Los investigadores cuyo art\u00edculo se public\u00f3 en Cancer Cell buscaban discernir si existen dos subtipos diferentes de cierto tipo de linfoma, como se ha aceptado generalmente en el campo. Usando EcoTyper, analizaron el microambiente que se encuentra entre y alrededor de las c\u00e9lulas de linfoma de c\u00e9lulas B grandes difusas. Al observar c\u00f3mo las c\u00e9lulas cancerosas y no cancerosas se organizaron e interactuaron, pudieron diferenciar no solo dos subtipos, sino nueve subtipos diferentes de este linfoma.<\/p>\n
Debido a que los investigadores estaban trabajando en muestras de tejido de casos de linfoma, tambi\u00e9n ten\u00edan un registro de c\u00f3mo les iba a los pacientes. \u00abDescubrimos que no solo hab\u00eda muchos m\u00e1s subtipos de este linfoma de c\u00e9lulas B que los reconocidos anteriormente, sino que tambi\u00e9n pudimos demostrar que saber qu\u00e9 subtipo ten\u00edan las personas nos dio una mejor capacidad para hacer predicciones sobre c\u00f3mo probablemente progresar\u00eda el c\u00e1ncer, \u00ab, dijo Steen.<\/p>\n
Los investigadores pudieron encontrar resultados positivos de un ensayo cl\u00ednico de un medicamento para el linfoma que parec\u00eda fallar. De hecho, los investigadores volvieron a realizar el ensayo cl\u00ednico, esta vez empleando EcoTyper e incluyendo su nueva comprensi\u00f3n de cu\u00e1ntos tipos m\u00e1s de este linfoma de c\u00e9lulas B hab\u00eda.<\/p>\n
\u00abLo que vimos fue que, de hecho, hab\u00eda un subtipo de linfoma espec\u00edfico que respondi\u00f3 a la terapia\u00bb, dijo Alizadeh. \u00abPero en el ensayo original, no pudieron identificar estos otros subtipos, por lo que esta prometedora se\u00f1al de eficacia se perdi\u00f3 entre los resultados negativos para todos los dem\u00e1s subtipos de linfoma\u00bb.<\/p>\n
\u00abSer capaz de encontrar el elaborar tratamientos contra el c\u00e1ncer efectivos basados en los subtipos particulares de c\u00e1ncer es el ep\u00edtome de la salud de precisi\u00f3n y la medicina personalizada\u00bb, a\u00f1adi\u00f3 Alizadeh. \u00abEcoTyper nos ayuda a hacer eso\u00bb. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
Los ‘ecotipos’ del c\u00e1ncer de mama presentan un nuevo camino hacia el tratamiento personalizado M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Bogdan A. Luca et al, Atlas of Clinically Distinte Cell States and Ecotypes Through Human Solid Tumores, C\u00e9lula (2021). DOI: 10.1016\/j.cell.2021.09.014 <\/p>\n Chlo B. Steen et al, El panorama de los estados y ecosistemas de las c\u00e9lulas tumorales en el linfoma difuso de c\u00e9lulas B grandes, Cancer Cell (2021). DOI: 10.1016\/j.ccell.2021.08.011 Informaci\u00f3n de la revista:<\/strong> Cancer Cell , Cell <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" La herramienta EcoTyper ha permitido a los investigadores de Stanford comprender mejor c\u00f3mo se comportan las c\u00e9lulas, como estas c\u00e9lulas de c\u00e1ncer de pulm\u00f3n, en diferentes entornos. Cr\u00e9dito: David A. Litman\/Shutterstock.com Investigadores del Instituto Stanford de Biolog\u00eda de C\u00e9lulas Madre y Medicina Regenerativa han ideado una herramienta para examinar c\u00f3mo las c\u00e9lulas se comportan e … Continuar leyendo \u00abLa herramienta puede revelar subtipos de c\u00e1ncer por comunidades celulares en las que se encuentran\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-3539","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/3539","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=3539"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/3539\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=3539"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=3539"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=3539"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}