{"id":35504,"date":"2022-09-01T05:37:50","date_gmt":"2022-09-01T10:37:50","guid":{"rendered":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/la-transferencia-horizontal-de-genes-es-un-sello-distintivo-de-los-genomas-animales\/"},"modified":"2022-09-01T05:37:50","modified_gmt":"2022-09-01T10:37:50","slug":"la-transferencia-horizontal-de-genes-es-un-sello-distintivo-de-los-genomas-animales","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/la-transferencia-horizontal-de-genes-es-un-sello-distintivo-de-los-genomas-animales\/","title":{"rendered":"\u00bfLa transferencia horizontal de genes es un sello distintivo de los genomas animales?"},"content":{"rendered":"

NHGRIMuchos genomas animales incluyen genes bacterianos y f\u00fangicos adquiridos mediante la transferencia horizontal de genes (HGT) durante la evoluci\u00f3n, seg\u00fan un estudio publicado hoy (12 de marzo) en Genome Biology <\/em>. Escaneando los genomas de moscas de la fruta, nematodos, primates y humanos, entre otros animales, los investigadores encontraron evidencia que sugiere que algunos de estos genes adquiridos horizontalmente pueden incluso ser funcionales.<\/p>\n

Cuando se public\u00f3 por primera vez el genoma humano, la sugerencia de que conten\u00eda genes bacterianos fue controvertida. Estudios posteriores cuestionaron la posibilidad de HGT y ofrecieron explicaciones alternativas para la presencia de genes que se parec\u00edan a las secuencias bacterianas, como la p\u00e9rdida de genes o la evoluci\u00f3n convergente o divergente.<\/p>\n

“Hab\u00eda problemas metodol\u00f3gicos en ambos lados del asunto. argumento, y el principal problema era que simplemente no ten\u00edamos los datos que tenemos ahora”. dijo Alastair Crisp de la Universidad de Cambridge, autor del nuevo estudio.<\/p>\n

M\u00e1s recientemente, varios investigadores han…<\/p>\n

Pero este \u00faltimo estudio es el primero en abarcar un amplitud de especies y tipos de genes. El estudio presenta un caso convincente que presenta m\u00e1s evidencia de transferencia lateral de genes de bacterias a eucariotas, dijo la microbi\u00f3loga Julie Hotopp de la Universidad de Maryland, quien no particip\u00f3 en el trabajo. Ha sido necesario rehacer este tipo de an\u00e1lisis durante bastante tiempo. La gente sigue citando los art\u00edculos de 2000 y 2001 como ejemplos de que no hay transferencia lateral de genes, especialmente en humanos.<\/p>\n

Para volver a evaluar el alcance de la transferencia de genes bacterianos a los animales, Crisp y sus colegas analizaron 40 genomas animales, incluidos 10 primates, 12 especies de Drosophila<\/em> y cuatro genomas de Caenorhabditis<\/em>. Los investigadores calcularon una puntuaci\u00f3n para cuantificar qu\u00e9 tan cerca se alineaba un gen con una secuencia no metazoaria en comparaci\u00f3n con una secuencia metazoaria o animal. Con base en esta puntuaci\u00f3n, consideraron que los genes que se parec\u00edan mucho a las secuencias no animales se transfirieron horizontalmente. Seg\u00fan los puntajes, entre el 55 y el 88 por ciento de las secuencias analizadas se parec\u00edan mucho a las secuencias procari\u00f3ticas, lo que sugiere que se hab\u00edan introducido en los genomas animales mediante transferencia lateral.<\/p>\n

Ten\u00edamos la idea de que la HGT era mucho m\u00e1s amplia que la de las personas. hab\u00eda sospechado previamente, dijo Crisp. Lo que nos sorprendi\u00f3 particularmente fue que parec\u00eda haber una cantidad muy similar tanto en vertebrados como en invertebrados.<\/p>\n

Los resultados respaldaron los an\u00e1lisis de estudios previos que suger\u00edan genes humanos como FTO<\/em>, la grasa el gen asociado a la masa y la obesidad puede haberse adquirido horizontalmente. Las comparaciones filogen\u00e9ticas tambi\u00e9n encontraron que algunos genes, como la hialuronano sintasa (HAS) en el genoma humano, que originalmente se pens\u00f3 que se transfirieron horizontalmente de las bacterias pero luego se rechazaron, en realidad pueden ser de origen f\u00fangico.<\/p>\n

A una gran proporci\u00f3n de los genes for\u00e1neos analizados se encontraron en los mismos andamios gen\u00f3micos que los genes animales nativos. El fuerte v\u00ednculo sugiri\u00f3 a Crisp y sus colegas que era poco probable que la contaminaci\u00f3n de las muestras secuenciadas fuera la fuente de estos genes no nativos.<\/p>\n

Sin embargo, la validez de estos resultados depende de la calidad de los genomas ensamblados que fueron analizados. Algunos genomas, como C. elegans<\/em>, D. melanogaster<\/em> y el genoma humano est\u00e1n muy bien combinados. Pero en otros, los ensamblajes pueden no ser tan buenos, y los ensamblajes deficientes dar\u00e1n como resultado algo parecido a la transferencia de genes, dijo Hotopp. Simplemente significa que en algunos organismos pueden haberlo sobreestimado.<\/p>\n

El equipo de Crisps descubri\u00f3 que varios de los genes extra\u00f1os en los genomas de los metazoos codificaban enzimas y probablemente ten\u00edan funciones bioqu\u00edmicas activas. En tres nematodos y en todos los genomas de primates analizados, los investigadores encontraron que el 95 por ciento de los genes extra\u00f1os conten\u00edan intrones, lo que sugiere que estos genes se han domesticado con el tiempo.<\/p>\n

Dado que los eventos HGT no son incre\u00edblemente comunes, parece probable que los mecanismos [que operan] son muy similares a los que insertar\u00edan intrones en cualquier gen, dijo Crisp. Observar los eventos HGT recientes puede decirnos c\u00f3mo se insertaron los intrones en otros genes eucariotas, o c\u00f3mo evoluciona la regulaci\u00f3n transcripcional de nuevos genes.<\/p>\n

El proceso de transferencia lateral de genes parece ser antiguo y activo en la actualidad. En los genomas humanos y de otros primates, los genes extra\u00f1os parecen haber entrado en el genoma solo en sus \u00faltimos ancestros comunes. Pero en algunas especies y nematodos de Drosophila<\/em>, el proceso parece haber ocurrido mucho m\u00e1s recientemente.<\/p>\n

Los resultados sugieren que si usamos el mismo criterio para medir una variedad de organismos modelo, es posible decir que los genomas de los mam\u00edferos tambi\u00e9n han estado sujetos a niveles bajos de HGT, aunque esto sucedi\u00f3 solo en muy raras ocasiones en las primeras etapas de la evoluci\u00f3n, dijo la genetista molecular Irina Arkhipova del Laboratorio de Biolog\u00eda Marina en Woods Hole, Massachusetts, quien no estaba involucrados con el estudio. Algunas especies son m\u00e1s susceptibles que otras. Pero definitivamente puede suceder y ha sucedido durante la evoluci\u00f3n, y ha desempe\u00f1ado un papel en la configuraci\u00f3n de la diversidad funcional del repertorio de genes en los metazoos.<\/p>\n

Microbi\u00f3logo Jonathan Eisen de la Universidad de California, Davis, que tampoco particip\u00f3 en el trabajo, se\u00f1al\u00f3 que los resultados de los estudios no excluyen de manera concluyente la p\u00e9rdida de genes como una explicaci\u00f3n alternativa de sus datos.<\/p>\n

Esto es bastante t\u00edpico de las afirmaciones de HGT, dijo Eisen El cient\u00edfico <\/em>en un correo electr\u00f3nico. Muchos investigadores muestran evidencia que es consistente con la ocurrencia de HGT (lo que hicieron aqu\u00ed), pero pocos prueban expl\u00edcitamente hip\u00f3tesis alternativas como p\u00e9rdida de genes, malas alineaciones, convergencia, divergencia, contaminaci\u00f3n, ruido aleatorio y m\u00e1s. <\/p <\/p>\n

Sospecho que [estos resultados] no ser\u00e1n universalmente aceptados, dijo Crisp. Pero creo que se necesita una buena oportunidad para resolver la controversia.<\/p>\n

A. Crisp et al., La expresi\u00f3n de m\u00faltiples genes adquiridos horizontalmente es un sello distintivo de los genomas de vertebrados e invertebrados, doi:10.1186\/s13059-015-0607-3, Genome Biology<\/em>, 2015.<\/strong><\/p>\n

Aclaraci\u00f3n (12 de marzo): este art\u00edculo se actualiz\u00f3 de una versi\u00f3n anterior para se\u00f1alar que las hialuronano sintasas que se encuentran en el genoma humano pueden tener un origen f\u00fangico.<\/em><\/p>\n

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