Alessia Ranciaro, cient\u00edfica investigadora s\u00e9nior en el laboratorio Tishkoff de la Universidad de Pensilvania, recopila una lectura de reflectancia de la piel de un participante en un estudio gen\u00e9tico de una poblaci\u00f3n nilo-sahariana. TISHKOFF LAB<\/p>\n
No hace mucho tiempo, una pareja fue a ver a Neil Risch, un genetista humano de la Universidad de California en San Francisco, con la esperanza de que pudiera identificar variantes gen\u00e9ticas raras en su hijo, que ten\u00eda una enfermedad no diagnosticada. No hay problema, pens\u00f3 Risch. Secuenciar\u00eda los exomas de los padres y el ni\u00f1o y pasar\u00eda los datos a trav\u00e9s de una base de datos de variantes raras para identificar los genes defectuosos que subyacen a la enfermedad del ni\u00f1o. Sin embargo, el caso no era tan sencillo. Los padres no ten\u00edan ascendencia europea, pero eran descendientes de una poblaci\u00f3n que no estaba bien representada en la base de datos.<\/p>\n
“Para las personas con antecedentes gen\u00e9ticos no representados en [la base de datos], puede haber desaf\u00edos adicionales en la identificaci\u00f3n adecuada de las variantes gen\u00e9ticas que causan la…<\/p>\n
El caso, dice Risch, no es poco com\u00fan en el entorno cl\u00ednico, donde la mayor\u00eda de los datos representan a individuos con ascendencia europea. Lo mismo ocurre con los datos que, hasta el momento, han recopilado los Institutos Nacionales de Salud (NIH) y empresas como 23andMe. De hecho, un comentario de Nature<\/em> publicado en 2016 estim\u00f3 que alrededor del 80 % de las personas en los estudios gen\u00e9ticos eran de ascendencia europea. Y a partir de 2018, las proporciones de individuos incluidos en los estudios de asociaci\u00f3n del genoma completo (GWAS) son 78 % europeos, 10 % asi\u00e1ticos, 2 % africanos, 1 % hispanos y todas las dem\u00e1s etnias representan menos del 1 %, humanos de la Universidad de Pensilvania. la genetista Sarah Tishkoff y sus colegas escriben hoy (21 de marzo) en un comentario de Cell<\/em>. Eso es problem\u00e1tico, escriben, porque la falta de diversidad \u00e9tnica en los estudios gen\u00f3micos humanos significa que nuestra capacidad para traducir la investigaci\u00f3n gen\u00e9tica en la pr\u00e1ctica cl\u00ednica o en las pol\u00edticas de salud p\u00fablica puede ser peligrosamente incompleta o, lo que es peor, err\u00f3nea.<\/p>\n En un nivel muy b\u00e1sico, si realmente quieres entender la biolog\u00eda humana, tiene sentido estudiar toda la diversidad cultural y biol\u00f3gica humana, dice Joanna Mountain, antrop\u00f3loga y directora s\u00e9nior de investigaci\u00f3n de 23andMe a The Scientist<\/em>. Si podemos comprender c\u00f3mo [las personas han evolucionado cultural y biol\u00f3gicamente en su entorno] en todo el mundo, podremos comprender la salud y la enfermedad en un nivel m\u00e1s amplio. Esa es una raz\u00f3n muy, muy importante para diversificar nuestra base de datos gen\u00e9tica.<\/p>\n Otros est\u00e1n haciendo lo mismo, incluidos cient\u00edficos como Tishkoff, investigadores cl\u00ednicos como Risch y los NIH.<\/p>\n Esta figura muestra la distribuci\u00f3n de la ascendencia de los individuos en estudios de asociaci\u00f3n de todo el genoma hasta enero de 2019. Sirugo et al. 2019<\/p>\n Cuando se trata de enfermedades mendelianas, donde una variante gen\u00e9tica generalmente causa una enfermedad, la variante pat\u00f3gena en una poblaci\u00f3n deber\u00eda ser pat\u00f3gena en otras poblaciones. Pero, ese no es siempre el caso. En la fibrosis qu\u00edstica (FQ), por ejemplo, la variante gen\u00e9tica que con mayor frecuencia causa FQ en los europeos es F508 en el gen CFTR<\/em>. Esta mutaci\u00f3n representa m\u00e1s del 70 por ciento de la FQ en los europeos, pero solo el 29 por ciento de los casos en personas de la di\u00e1spora africana. Otra mutaci\u00f3n, 3120+1GA, explica entre el 15 y el 65 por ciento de la FQ en pacientes sudafricanos con ascendencia africana, explican Tishkoff y sus colegas. Cada una de estas variantes conduce a formas algo diferentes de la enfermedad y, en funci\u00f3n de las diferencias de poblaci\u00f3n, los tratamientos podr\u00edan ser diferentes para cada grupo, un hecho que se hace evidente solo cuando la diversidad gen\u00e9tica se incluye en los conjuntos de datos de investigaci\u00f3n.<\/p>\n Otra raz\u00f3n para priorizar la diversidad en los estudios gen\u00e9ticos, dice Tishkoff a The Scientist<\/em>, es que puede conducir a una nueva comprensi\u00f3n de los genes que subyacen a las enfermedades o nuevas terapias que pueden no ser detectables en poblaciones que ya est\u00e1n bien estudiadas. . En 2017, por ejemplo, Tishkoff y sus colegas publicaron un estudio en Science<\/em> que revel\u00f3 variantes gen\u00e9ticas novedosas y un gen novedoso asociado con la pigmentaci\u00f3n de la piel en una muestra de 1600 individuos de diversas poblaciones africanas. El nuevo gen MFSD12 <\/em>desempe\u00f1a un papel fundamental en el desarrollo de melanocitos y la producci\u00f3n de pigmentos, y un estudio reciente indica que juega un papel en el c\u00e1ncer de piel, dice Tishkoff. Pero antes del estudio de su equipo, no se sab\u00eda nada sobre este gen.<\/p>\n Otro ejemplo es el desarrollo de los inhibidores de PCSK9, nuevos f\u00e1rmacos que reducen el colesterol. Un estudio de genes relacionados con el colesterol revel\u00f3 que ciertas mutaciones en los genes PCSK9<\/em> en algunas personas afrodescendientes las llevaron a tener colesterol LDL bajo. Estas mutaciones, sin embargo, son extremadamente raras en los estadounidenses con ascendencia europea, por lo que sin estudiar a las personas de ascendencia africana, es posible que no se hayan desarrollado los nuevos medicamentos para controlar el colesterol.<\/p>\n Esto no sugiere que una etnia dada es homog\u00e9neo, y la diversidad dentro de los grupos es una consideraci\u00f3n cr\u00edtica. Tomemos, por ejemplo, la deficiencia de G6PD, que puede conducir a la destrucci\u00f3n de gl\u00f3bulos rojos en respuesta a la toma de medicamentos antipal\u00fadicos. En \u00c1frica subsahariana, la deficiencia de G6PD puede alcanzar una frecuencia del 25 por ciento, particularmente cuando se administran tratamientos para la malaria. Debido a que la enfermedad se vio exacerbada por una combinaci\u00f3n eficaz de medicamentos antipal\u00fadicos, llamada clorproguanil-dapsona, se suspendi\u00f3 su uso, a pesar de que podr\u00eda haberse usado de manera segura en pacientes infectados con malaria sin deficiencia enzim\u00e1tica de G6PD, se\u00f1alan Tishkoff y sus colegas. <\/p>\n Muchas poblaciones tienen su propio perfil gen\u00e9tico, dice Risch, y hay algunas que claramente nos faltan.<\/p>\n 23andMe reconoce que su diversidad gen\u00e9tica es limitada y ha estado reclutando participantes que viven en los EE. UU. y que tienen cuatro abuelos nacidos en cualquiera de los 61 pa\u00edses, incluidos Angola, Uzbekist\u00e1n, Sierra Leona y Tailandia, para ampliar su alcance. La empresa tambi\u00e9n se est\u00e1 asociando, a trav\u00e9s de subvenciones otorgadas por la empresa, con investigadores que trabajan en esos pa\u00edses para recopilar datos de las personas que viven all\u00ed. <\/p>\n Las personas en estos diferentes pa\u00edses est\u00e1n dispuestas a contribuir con sus datos, pero quieren diferentes beneficios a cambio de su participaci\u00f3n, se\u00f1ala Anjali Shastri, gerente de proyectos de investigaci\u00f3n de la empresa. En Ruanda, mejorar la salud podr\u00eda impulsar la participaci\u00f3n, mientras que en Angola, las personas sienten mucha curiosidad por sus or\u00edgenes. Los cient\u00edficos trabajan muy de cerca con cada poblaci\u00f3n para desarrollar incentivos para la participaci\u00f3n a fin de garantizar que todos se beneficien de la investigaci\u00f3n, dice ella.<\/p>\n En 2018, el NIH lanz\u00f3 un programa llamado All of Us, con el objetivo de crear una base de datos de 1 mill\u00f3n de registros de salud de participantes diversos, desde su gen\u00e9tica hasta sus registros de salud electr\u00f3nicos. Hasta el momento, dice Katie Baca-Motes, directora del Centro de Participantes del Programa de Investigaci\u00f3n All of Us, casi 100 000 personas han completado el proceso de consentimiento informado, proporcionado muestras de sangre y orina y vinculado sus registros de salud electr\u00f3nicos, si pueden. De ellos, el 50 por ciento representa poblaciones que tradicionalmente est\u00e1n subrepresentadas. <\/p>\n El programa realmente est\u00e1 destinado a todos, dice ella, y se\u00f1ala que incluso antes de que comenzara la inscripci\u00f3n, los directores del programa estaban trabajando con l\u00edderes comunitarios y otras personas influyentes. para disipar cualquier desconfianza sobre lo que se har\u00eda con los datos de los participantes. En el pasado, ha habido desconfianza en el establecimiento m\u00e9dico y el gobierno, dice, explicando que es un desaf\u00edo que el programa contin\u00faa trabajando para superar.<\/p>\n Ciertamente para el NIH, creo que es un paso en el camino correcto. direcci\u00f3n, dice Tishkoff. Una de las cosas que realmente me impresion\u00f3 sobre el estudio de All of Us es que se est\u00e1n alejando de la raza, lo cual es realmente bueno. No es como, \u00bfEres negro, blanco, hispano? . . . Entran en detalles sobre la ascendencia, \u00bfDe d\u00f3nde vienen tus padres? \u00bfDe d\u00f3nde vienen tus abuelos? \u00bfDonde naciste? \u00bfD\u00f3nde vives ahora? Hacen preguntas sobre factores socioecon\u00f3micos, \u00bfEn qu\u00e9 c\u00f3digo postal vives? Porque sabemos que eso est\u00e1 relacionado con la salud.<\/p>\n En su propia investigaci\u00f3n, Tishkoff ha estado trabajando en la expansi\u00f3n de conjuntos de datos gen\u00e9ticos, espec\u00edficamente en \u00c1frica oriental, meridional y occidental. Trabaja con juntas de revisi\u00f3n \u00e9tica gubernamentales e institucionales en pa\u00edses africanos, luego con genetistas locales, quienes interact\u00faan con las poblaciones y comparten con ellos lo que los cient\u00edficos quer\u00edan aprender sobre la salud humana utilizando datos de tribus como San y Hadza. <\/p>\n M\u00e1s recientemente, ella y sus colegas analizaron los microbiomas intestinales de los individuos de las tribus San y Hadza, junto con varios otros grupos de Botswana y Tanzania, y los compararon con datos similares de un grupo de individuos en Filadelfia. Los microbiomas de Botswana eran m\u00e1s similares a los de Filadelfia que a los de Tanzania, pero hab\u00eda grandes diferencias, especialmente en las v\u00edas gen\u00e9ticas asociadas con la degradaci\u00f3n de compuestos industriales. En los microbiomas intestinales de individuos de EE. UU., ciertas v\u00edas para descomponer compuestos industriales, como el bisfenol, estaban m\u00e1s enriquecidas que en los microbiomas de Botswana y Tanzania, lo que sugiere una selecci\u00f3n en la cohorte de EE. UU. de bacterias que pueden degradar estos compuestos. Los microbiomas de Botswana estaban m\u00e1s orientados a descomponer el DDT, especialmente en comparaci\u00f3n con los de Tanzania, informaron Tishkoff y sus colegas el 22 de enero en Genome Biology<\/em>.<\/p>\n Sabemos que la composici\u00f3n del microbioma puede influir tanto en la salud como en la salud. y enfermedades, dice Tishkoff, y los resultados, se\u00f1ala, plantean otra cuesti\u00f3n sobre la diversidad y la comprensi\u00f3n de la salud humana. No es solo gen\u00f3mica. . . . Tambi\u00e9n observamos la variaci\u00f3n en la expresi\u00f3n g\u00e9nica y la epigen\u00e9tica, explica. El medio ambiente es importante, y tampoco podemos ignorarlo, as\u00ed que creo que es importante obtener la mayor cantidad de informaci\u00f3n sobre la gen\u00e9tica y el medio ambiente en poblaciones \u00e9tnicamente diversas en los EE. UU. y en todo el mundo.<\/p>\n Recibe acceso completo a m\u00e1s de 35 a\u00f1os de archivos<\/strong>, como as\u00ed como TS Digest<\/em><\/strong>, ediciones digitales de The Scientist<\/em><\/strong>, art\u00edculos destacados<\/strong> y \u00a1mucho m\u00e1s!\u00danase gratis hoy \u00bfYa es miembro?Inicie sesi\u00f3n aqu\u00ed<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Alessia Ranciaro, cient\u00edfica investigadora s\u00e9nior en el laboratorio Tishkoff de la Universidad de Pensilvania, recopila una lectura de reflectancia de la piel de un participante en un estudio gen\u00e9tico de una poblaci\u00f3n nilo-sahariana. 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