ARRIBA: ISTOCK.COM, DEFUN<\/p>\n
La secuenciaci\u00f3n r\u00e1pida del genoma del SARS-CoV-2 y La distribuci\u00f3n de los datos al principio del brote de COVID-19 ha permitido el desarrollo de una variedad de ensayos para diagnosticar pacientes basados en fragmentos del c\u00f3digo gen\u00e9tico del virus. Pero a medida que aumenta la cantidad de casos potenciales y aumentan las preocupaciones sobre la posibilidad de una pandemia mundial, aumenta la presi\u00f3n para permitir pruebas a\u00fan m\u00e1s r\u00e1pidas y accesibles.<\/p>\n
Los m\u00e9todos de prueba actuales se consideran precisos, pero los gobiernos han restringido las pruebas a las agencias centrales de salud o a unos pocos laboratorios acreditados, lo que limita la capacidad de diagnosticar r\u00e1pidamente nuevos casos, dice el epidemi\u00f3logo e inmun\u00f3logo Michael Mina, director del laboratorio de patolog\u00eda y diagn\u00f3stico molecular del Hospital Brigham and Womens en Boston. Estas circunstancias est\u00e1n impulsando una carrera comercial para desarrollar nuevas pruebas de COVID-19 que se puedan implementar en hospitales y cl\u00ednicas para brindar respuestas de diagn\u00f3stico en poco tiempo.<\/p>\n
A nivel mundial, se han notificado casi 89\u00a0000 casos, m\u00e1s de 80\u00a0000 de estos en China junto con m\u00e1s de 3.000 muertes. El virus se ha encontrado en 64 pa\u00edses, seis de ellos solo el d\u00eda anterior.<\/p>\n
El genoma completo del nuevo coronavirus fue publicado el 10 de enero de este a\u00f1o, solo unas semanas despu\u00e9s de que la enfermedad se identificara por primera vez en Wuhan, China. Una semana despu\u00e9s, un grupo de investigadores dirigido por cient\u00edficos alemanes lanz\u00f3 el primer protocolo de diagn\u00f3stico para COVID-19 utilizando muestras de hisopos de la nariz y la garganta de un paciente; este protocolo basado en PCR ha sido seleccionado desde entonces por la Organizaci\u00f3n Mundial de la Salud (OMS).<\/p>\n
\nNo todos los pa\u00edses han adoptado el diagn\u00f3stico recomendado por la OMS, incluido EE. UU.<\/p>\n<\/blockquote>\n
El ensayo se desarroll\u00f3 inicialmente a partir de las similitudes gen\u00e9ticas entre el SARS-CoV-2 y su pariente cercano, el SARS, y luego se perfeccion\u00f3 utilizando los datos del genoma del SARS-CoV-2 para detectar genes virales exclusivos del virus reci\u00e9n descubierto. En particular, la prueba detecta la presencia del gen E<\/em> del SARS-CoV-2s, que codifica la envoltura que rodea la cubierta viral, y el gen de la enzima ARN polimerasa dependiente de ARN.<\/p>\n
Yvonne Doyle, directora m\u00e9dica y directora de protecci\u00f3n de la salud de Public Health England, le dice a The Scientist<\/em> en un correo electr\u00f3nico que una vez que un laboratorio recibe una muestra, se necesitan 2448 horas para obtenerla. un resultado. Al comentar sobre la precisi\u00f3n de las pruebas, dice que todos los resultados positivos hasta la fecha en el Reino Unido, un total de 36 hasta ahora, se han confirmado con la secuenciaci\u00f3n del genoma completo del virus aislado de muestras de pacientes y la sensibilidad anal\u00edtica de las pruebas en uso. es muy alto.<\/p>\n
Este enfoque tambi\u00e9n respalda las pruebas de laboratorio de COVID-19 en Australia, donde hasta ahora se han diagnosticado 27 casos, dice el vir\u00f3logo m\u00e9dico Dominic Dwyer, director de patolog\u00eda de salud p\u00fablica de NSW Health Pathology en Westmead. Hospital de S\u00eddney. Al final, decidimos tener un enfoque de detecci\u00f3n utilizando los cebadores de la OMS que se dirigen al llamado gen E<\/em> del coronavirus, dice. Si una prueba de detecci\u00f3n es positiva, hacemos algunas pruebas de confirmaci\u00f3n que seleccionan otros objetivos del genoma del virus.<\/p>\n
El laboratorio del Hospital Westmead tambi\u00e9n realiza una secuenciaci\u00f3n completa de cada muestra de virus para buscar posibles nuevas cepas de SARS-CoV-2 y ha compartido algunas de esas secuencias en la base de datos internacional Global Initiative on Sharing All Influenza Data (GISAID) para que otros investigadores las estudien. El personal tambi\u00e9n cultiva el virus y lo visualiza mediante microscop\u00eda electr\u00f3nica. Esa no es realmente una prueba de diagn\u00f3stico, pero te da cierta confirmaci\u00f3n de lo que est\u00e1s viendo en el laboratorio, dice Dwyer.<\/p>\n
Agrega que, hasta el momento, no hay indicios de resultados falsos positivos, porque cada prueba positiva tiene confirmado con secuenciaci\u00f3n del genoma completo, cultivo viral o microscop\u00eda electr\u00f3nica. En cuanto a los falsos negativos, a\u00f1ade, ser\u00eda dif\u00edcil saber si a alg\u00fan paciente infectado se le dio por error el visto bueno.<\/p>\n
No todos los pa\u00edses han adoptado el diagn\u00f3stico recomendado por la OMS. Los Centros para el Control y la Prevenci\u00f3n de Enfermedades (CDC) de EE. UU., por ejemplo, han desarrollado su propio ensayo que busca tres secuencias en el gen N<\/em>, que codifica la fosfoprote\u00edna de la nucleoc\u00e1pside que se encuentra en la cubierta del virus, tambi\u00e9n conocida como la c\u00e1pside. El ensayo tambi\u00e9n contiene cebadores para el gen de la ARN polimerasa dependiente de ARN<\/em>. Dwyer dice que los principios de las pruebas son los mismos; son solo los objetivos gen\u00e9ticos los que var\u00edan.<\/p>\n
Mina dice que no est\u00e1 claro por qu\u00e9 los CDC eligieron desarrollar un ensayo diferente al seleccionado por la OMS y adoptado por otros pa\u00edses. \u00bfEsto realmente se bas\u00f3 en el conocimiento superior que ten\u00edan los CDC, o fue m\u00e1s un esfuerzo por seguir nuestro propio camino y tener nuestras propias cosas y sentirnos bien por desarrollar nuestra propia prueba en los EE. UU. en comparaci\u00f3n con el resto del mundo? dice Mina, quien tambi\u00e9n es profesora asistente de epidemiolog\u00eda en la Escuela de Salud P\u00fablica de Harvard. El CDC se neg\u00f3 a responder a las preguntas de The Scientist<\/em>.<\/p>\n
\u00bfQui\u00e9n realiza las pruebas?<\/h2>\n
En el Reino Unido, las pruebas de COVID-19 las realiza un gama de laboratorios acreditados en todo el pa\u00eds. En los EE. UU., hasta hace poco, todas las pruebas de laboratorio para COVID-19 las realizaba exclusivamente el CDC. El tiempo de respuesta para un resultado ha sido de 2472 horas. Mina argumenta que permitir que los hospitales realicen sus propios diagn\u00f3sticos in situ podr\u00eda acelerar el proceso. Por ejemplo, los hospitales pueden generar resultados de gripe en una hora, dice Mina, m\u00e1s com\u00fanmente usando ensayos que detectan ant\u00edgenos virales. Gastamos mucho dinero en obtener pruebas de respuesta r\u00e1pida en el hospital para la gripe, por ejemplo, porque tenemos que saber c\u00f3mo clasificar a las personas.<\/p>\n
El d\u00eda o dos o tres que se tarda en contraer COVID-19 Los resultados han tenido ramificaciones log\u00edsticas para los hospitales, dice Mina. Si tenemos un paciente del que solo sospechamos que es positivo, aunque no sea positivo, la sola sospecha nos llevar\u00e1 a tener que buscarle una cama de aislamiento, dice.<\/p>\n
Ha habido una iniciativa de los CDC para enviar kits de prueba RT-PCR a los laboratorios de salud estatales, dice Molly Fleece, m\u00e9dica de enfermedades infecciosas de la Universidad de Alabama en Birmingham. Con suerte, m\u00e1s laboratorios en todo el pa\u00eds podr\u00e1n tener acceso a estos kits de prueba y analizar muestras en lugar de tener que enviar todas las muestras a los CDC para su an\u00e1lisis, dice.<\/p>\n
Sin embargo, eso El plan tuvo un problema recientemente cuando se descubri\u00f3 que uno de los reactivos de los kits de los CDC era defectuoso. La agencia ha anunciado que el reactivo ahora se est\u00e1 refabricando.<\/p>\n
Pruebas de SARS-CoV-2 en desarrollo<\/h2>\n
Ahora hay numerosas empresas que trabajan en kits de prueba comerciales en respuesta al creciente diagn\u00f3stico demandas de la epidemia. La mayor\u00eda est\u00e1 aplicando los mismos m\u00e9todos de PCR en tiempo real que ya est\u00e1n en uso, pero otros est\u00e1n adoptando un enfoque diferente. Por ejemplo, Mina y sus colegas est\u00e1n probando un diagn\u00f3stico en asociaci\u00f3n con Sherlock Biosciences, con sede en Cambridge, Massachusetts. Los investigadores est\u00e1n utilizando la tecnolog\u00eda CRISPR para etiquetar las secuencias objetivo del SARS-CoV-2 con una sonda fluorescente.<\/p>\n
\nA\u00fan no estaban en esa etapa de implementaci\u00f3n de las pruebas de serolog\u00eda o anticuerpos.<\/p>\n
Dominic Dwyer, NSW Health Pathology at Westmead Hospital<\/strong> <\/p><\/blockquote>\n
En muchos aspectos, es similar a la PCR en tiempo real, pero es m\u00e1s sensible y mucho m\u00e1s r\u00e1pida, dice Mina. Otro protocolo de diagn\u00f3stico basado en CRISPR desarrollado por investigadores del Instituto McGovern del MIT utiliza tiras de papel para detectar la presencia de un virus objetivo y afirma que el resultado tarda alrededor de una hora. Todav\u00eda no se ha probado en muestras de pacientes con COVID-19, y el instituto ha enfatizado que la prueba a\u00fan debe desarrollarse y validarse para uso cl\u00ednico, para COVID-19 o cualquier otra enfermedad viral. Mientras tanto, la empresa de biotecnolog\u00eda anglo-francesa Novacyte ha anunciado el lanzamiento de su kit de diagn\u00f3stico de PCR en tiempo real para COVID-19, que dice que entregar\u00e1 resultados en dos horas.<\/p>\n
Un enfoque de diagn\u00f3stico diferente ser\u00eda idear an\u00e1lisis de sangre para detectar anticuerpos contra el virus SARS-CoV-2, un desarrollo que, seg\u00fan Mina, ser\u00e1 un pr\u00f3ximo paso importante para monitorear la propagaci\u00f3n del virus. \u00bfPodr\u00edamos comenzar a tomar muestras de sangre de personas de todo el mundo y ver cu\u00e1ntas personas que no ten\u00edan s\u00edntomas o que ten\u00edan s\u00edntomas m\u00ednimos pudieron haber estado expuestas a esto? pregunta Mina.<\/p>\n
Dwyer dice que tales enfoques podr\u00edan ayudar a detectar cualquier falso negativo que se filtre a trav\u00e9s de los protocolos basados en PCR, pero a\u00fan no estaban en esa etapa de implementaci\u00f3n de las pruebas de serolog\u00eda o anticuerpos. Numerosos grupos est\u00e1n tratando de aislar anticuerpos, algunos con m\u00e1s \u00e9xito que otros. Investigadores de la Escuela de Medicina Duke-NUS en Singapur han utilizado pruebas de anticuerpos para demostrar un v\u00ednculo entre dos grupos separados de infecciones y en pacientes que hab\u00edan desaparecido de sus s\u00edntomas en el momento en que se les administr\u00f3 la prueba de anticuerpos. Mientras tanto, los investigadores en Taiw\u00e1n tambi\u00e9n est\u00e1n trabajando para identificar un anticuerpo contra el SARS-CoV-2 que podr\u00eda usarse para pruebas de diagn\u00f3stico, y dicen que dicha prueba podr\u00eda arrojar un resultado en cuesti\u00f3n de minutos en lugar de horas. <\/p>\n
Bianca Nogrady es una escritora cient\u00edfica independiente con sede en Sydney, Australia.<\/em><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
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