ARRIBA: Una nueva prueba de la Universidad de Columbia analiza la saliva en busca de rastros gen\u00e9ticos del SARS-CoV-2 mediante LAMP. Las muestras que contienen ARN viral cambian de color de rojo a amarillo. CORTES\u00cdA DE ZEV WILLIAMS\/COLUMBIA UNIVERSITY<\/p>\n
Ante la continua falta de equipos de protecci\u00f3n y suministros para pruebas, los profesionales m\u00e9dicos han estado buscando alternativas para diagnosticar con precisi\u00f3n los casos. de la COVID-19, pandemia que ha causado m\u00e1s de 11 millones de casos y m\u00e1s de 530.000 muertes en todo el mundo. Los suministros de hisopos nasofar\u00edngeos fueron algunos de los primeros materiales de prueba que se agotaron a mediados de marzo, lo que provoc\u00f3 un giro hacia los hisopos nasales. M\u00e1s recientemente, las pruebas basadas en saliva se han presentado como una alternativa atractiva y de bajo costo.<\/p>\n
Las primeras pruebas de saliva ya se est\u00e1n vendiendo a los consumidores, y m\u00e1s personas est\u00e1n preparadas para solicitar la autorizaci\u00f3n de uso de emergencia de la US Food y Administraci\u00f3n de Drogas pronto. Si bien la saliva puede ser una muestra cruda para diagnosticar enfermedades mediante la PCR tradicional, se combina bien con una alternativa de PCR barata conocida como amplificaci\u00f3n isot\u00e9rmica mediada por bucle (LAMP), utilizada anteriormente para detectar brotes de zika y \u00e9bola en pa\u00edses de escasos recursos. Impulsados por una pandemia mundial, los investigadores de EE. UU. y el Reino Unido ahora est\u00e1n modificando LAMP y evaluando su utilidad como herramienta de diagn\u00f3stico para COVID-19.<\/p>\n
Al diversificar la posible elecci\u00f3n del ensayo, diversifica la cadena de suministro tambi\u00e9n, dice Robert Meagher, ingeniero qu\u00edmico de los Laboratorios Nacionales Sandia que desarrolla herramientas para diagnosticar enfermedades emergentes. Poner a disposici\u00f3n de los trabajadores de la salud opciones de prueba adicionales ayudar\u00e1 a mitigar los atrasos si un reactivo o material se agota. su muestra de saliva.<\/p>\n
Martin Burke, Universidad de Illinois<\/p><\/blockquote>\n
Las pruebas basadas en saliva tambi\u00e9n ofrecen una mejora con respecto al hisopo nasofar\u00edngeo est\u00e1ndar porque las personas pueden recolectar sus propias muestras con m\u00ednimas molestias, simplemente escupir en un tubo est\u00e9ril y env\u00edelo por correo a un laboratorio para su procesamiento. Y debido a una autorizaci\u00f3n de uso de emergencia otorgada a la Universidad de Rutgers en mayo, los pacientes ahora pueden realizar algunas pruebas en sus propios hogares, lo que permite guardar el personal y el equipo de protecci\u00f3n para cuando m\u00e1s se necesiten. Andrew Brooks, director de desarrollo de tecnolog\u00eda en RUCDR Infinite Biologics, el biorepositorio afiliado a Rutgers que desarroll\u00f3 la prueba, dice que el uso de pruebas en el hogar mitiga por completo el riesgo de contraer la enfermedad mientras se realiza la prueba y solo requiere guantes. <\/p>\n
Varias empresas est\u00e1n vendiendo kits de Rutgerss directamente a los consumidores a trav\u00e9s de pedidos en l\u00ednea, aunque todas las pruebas deben enviarse a su laboratorio en Nueva Jersey para su procesamiento. Los resultados positivos se informan a los funcionarios de salud locales y se aconseja a las personas sobre c\u00f3mo responder.<\/p>\n
Tanto las universidades como los m\u00e9dicos ahora planean incorporar muestras basadas en saliva en su flujo de trabajo para diagnosticar COVID-19. El gobierno del Reino Unido se asoci\u00f3 recientemente con la empresa de diagn\u00f3stico molecular Optigene para desarrollar un estudio piloto en el que participaron m\u00e1s de 14\u00a0000 personas para probar la eficacia de su prueba de saliva. En los EE. UU., la Universidad de Chicago utilizar\u00e1 pruebas de saliva para limpiar a los pacientes antes de las cirug\u00edas electivas en su hospital durante los pr\u00f3ximos a\u00f1os, le dice a The Scientist<\/em> Evgeny Izumchenko, un onc\u00f3logo de UChicago que ayud\u00f3 a desarrollar la prueba de la universidad. >.<\/p>\n En otra aplicaci\u00f3n de evaluaci\u00f3n, el qu\u00edmico de la Universidad de Illinois, Martin Burke, present\u00f3 planes para usar una nueva prueba dise\u00f1ada por \u00e9l y sus colegas en m\u00e1s de 50,000 estudiantes cuando regresen al campus en el oto\u00f1o. Imaginamos que esto ser\u00e1 solo parte de su orientaci\u00f3n, dijo Burke durante un seminario web el 16 de junio. As\u00ed que obtienes la informaci\u00f3n de tu vivienda, tu tarjeta de comedor, tu tarjeta de identificaci\u00f3n y tambi\u00e9n env\u00edas tu muestra de saliva.<\/p>\n A pesar de la facilidad de muestreo, la saliva no est\u00e1 exenta de desaf\u00edos. Para la PCR, el ARN del virus primero debe transcribirse de forma inversa en ADN, y la saliva contiene enzimas que mastican los \u00e1cidos nucleicos e inhibidores que interfieren con el proceso de amplificaci\u00f3n del ADN utilizado para detectar el virus. Como resultado, la saliva a menudo debe purificarse antes de que se pueda amplificar el ADN. Es una especie de dogma. . . que tiene que comenzar con ADN o ARN absolutamente puro, dice Meagher.<\/p>\n Si bien la PCR de transcripci\u00f3n inversa cuantitativa sigue siendo el m\u00e9todo m\u00e1s utilizado para diagnosticar COVID-19 independientemente de c\u00f3mo se recolecta la muestra, muchos de los cuellos de botella en la tuber\u00eda se derivan del alto costo y la baja escalabilidad del enfoque, dice Meagher. Un \u00fanico termociclador de sobremesa, la m\u00e1quina que controla los cambios de temperatura durante la PCR, suele costar unos 25\u00a0000\u00a0$ y normalmente solo puede procesar entre 96 y 384 muestras a la vez.<\/p>\n Para hacer frente a estos desaf\u00edos, un equipo de Investigadores de la Universidad de Columbia modificaron recientemente un protocolo LAMP utilizado por su cl\u00ednica de fertilidad para identificar anomal\u00edas en el n\u00famero de cromosomas en embriones humanos. En lugar de contar los cromosomas, la herramienta ahora detecta la presencia de ARN del SARS-CoV-2 en la saliva en tan solo media hora, cambiando el color de la muestra de rojo a amarillo cuando el virus est\u00e1 presente.<\/p>\n Para la pandemia de COVID-19, realmente se sinti\u00f3 que el gran desaf\u00edo es tratar de llevar la prueba a donde se necesita, dice Zev Williams, un endocrin\u00f3logo reproductivo que ayud\u00f3 a desarrollar la prueba. Las pruebas perfectamente precisas que tardan d\u00edas en arrojar resultados y solo se pueden administrar a un peque\u00f1o n\u00famero de pacientes no son suficientes para abordar el problema.<\/p>\n La nueva prueba del equipo es una de varias que utilizan LAMP. A diferencia de la PCR, que crea nuevas copias de ADN a trav\u00e9s de cambios c\u00edclicos de temperatura, las reacciones LAMP tienen lugar a una temperatura constante de 63 \u00b0C, lo que elimina la necesidad de maquinaria compleja. Los productos qu\u00edmicos utilizados en la reacci\u00f3n tambi\u00e9n son m\u00e1s robustos contra las enzimas y los inhibidores de la saliva, lo que elimina la necesidad de purificar cada muestra.<\/p>\n Si esta prueba est\u00e1 disponible. . . muchos de nosotros lo adquiriremos y probaremos. Si funciona como dicen, podr\u00eda ser una adici\u00f3n maravillosa.<\/p>\n Alan Wells, Universidad de Pittsburgh<\/p><\/blockquote>\n Muy pronto, [LAMP] fue reconocido como algo que tendr\u00eda aplicaciones para la detecci\u00f3n de pat\u00f3genos. , dice Meagher, quien us\u00f3 LAMP para estudiar el zika y el \u00e9bola. Tiene el potencial para un tipo de an\u00e1lisis de muestra en respuesta muy simplificado, que es mucho m\u00e1s dif\u00edcil de lograr con PCR.<\/p>\n LAMP se ha implementado tradicionalmente en pa\u00edses de escasos recursos porque requiere menos energ\u00eda y equipo que PCR. Pero bajo la pandemia actual, el mundo entero se ha vuelto algo limitado en recursos, y Meagher enfatiza que LAMP puede ser igual de \u00fatil para diagnosticar enfermedades emergentes en naciones del primer mundo como los EE. UU. Durante el brote de zika en Florida en 2016, las pruebas de diagn\u00f3stico a veces pod\u00edan tardar hasta ocho semanas en procesarse, dice Meagher, y una t\u00e9cnica como LAMP tambi\u00e9n habr\u00eda marcado una gran diferencia en los Estados Unidos.<\/p>\n Un informe que detalla el ensayo LAMP modificado de Williams, publicado el 16 de junio en el servidor de preimpresi\u00f3n medRxiv<\/em>, describe un LAMP de alto rendimiento con 1000 veces la sensibilidad de un LAMP est\u00e1ndar ensayo, capaz de detectar una sola copia del virus SARS-CoV-2 en tan solo un microlitro de saliva. En comparaci\u00f3n con otros m\u00e9todos, como la PCR cuantitativa de RT, dice Williams, el nuevo ensayo LAMP a veces puede ser incluso m\u00e1s sensible.<\/p>\n Williams prev\u00e9 que su prueba se utilice para realizar evaluaciones masivas en aeropuertos, oficinas y escuelas. para identificar incluso a pacientes asintom\u00e1ticos con una carga viral baja. No es la persona que est\u00e1 enferma y en el hospital la que necesita tratamiento, subraya. Necesitamos tratar a la persona que est\u00e1 bien y que viaja en el metro y lo transmite. Actualmente, el equipo est\u00e1 solicitando una autorizaci\u00f3n de uso de emergencia.<\/p>\n Alan Wells, director m\u00e9dico de los Laboratorios Cl\u00ednicos UPMC de la Universidad de Pittsburgh, expres\u00f3 su escepticismo de que cualquier ensayo LAMP pueda ser tan sensible como la PCR tradicional. Si bien podr\u00edan ser tan sensibles en teor\u00eda, en la pr\u00e1ctica todav\u00eda tengo que verlo, dice Wells a The Scientist<\/em>, y agrega que los ensayos LAMP son inherentemente menos eficientes para amplificar el ADN que la PCR. Si esta prueba est\u00e1 disponible. . . muchos de nosotros lo adquiriremos y probaremos. Si funciona como dicen, podr\u00eda ser una adici\u00f3n maravillosa.<\/p>\n Si bien el art\u00edculo de Williams a\u00fan no se ha sometido a una revisi\u00f3n por pares, est\u00e1 lejos de ser la \u00fanica investigaci\u00f3n que sugiere que LAMP puede ser tan sensible como la PCR. m\u00e9todos. Varios proyectos ya han comenzado a procesar muestras utilizando LAMP. El estudio piloto en Inglaterra, por ejemplo, utiliza su propio protocolo LAMP, y los investigadores de Beaumont Health, el sistema de salud m\u00e1s grande de Michigan, tambi\u00e9n han anunciado una nueva prueba LAMP para procesar muestras de saliva. <\/p>\n Nunca hab\u00eda sentido tanto estr\u00e9s o presi\u00f3n en mi vida, dice Brooks, y agrega que con frecuencia ha trabajado 22 horas al d\u00eda en los \u00faltimos cuatro meses para llevar su prueba de saliva al mercado. Todos lo hemos llevado a otro nivel debido a su importancia. Espero que nunca volvamos a ver algo as\u00ed en nuestra vida.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" ARRIBA: Una nueva prueba de la Universidad de Columbia analiza la saliva en busca de rastros gen\u00e9ticos del SARS-CoV-2 mediante LAMP. Las muestras que contienen ARN viral cambian de color de rojo a amarillo. 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