ARRIBA: ISTOCK.COM, C\u00c9LULAS DE DISE\u00d1O<\/p>\n
La estabilidad gen\u00f3mica del SARS-CoV-2 que los cient\u00edficos esperaban inicialmente ha sido interrumpido por la aparici\u00f3n de diferentes variantes en el transcurso de la pandemia de COVID-19. El dominio N-terminal (NTD) de la prote\u00edna de pico del virus ha aparecido como una estructura potencialmente mutable; los cient\u00edficos han informado que tiene regiones propensas a la eliminaci\u00f3n que pueden permitir que el virus escape a la neutralizaci\u00f3n de anticuerpos. Seg\u00fan una preimpresi\u00f3n publicada en medRxiv<\/em> el 12 de junio, la prevalencia de estas eliminaciones aument\u00f3 durante los aumentos repentinos de casos de COVID-19 en todo el mundo. Los autores del estudio tambi\u00e9n informan la presencia de eliminaciones de NTD en muestras de SARS-CoV-2 de pacientes con COVID-19 que hab\u00edan sido infectados antes o que ya estaban completamente vacunados.<\/p>\n El equipo plantea la hip\u00f3tesis de que estas eliminaciones podr\u00edan ayudar a la virus para evadir la inmunidad, lo que podr\u00eda desempe\u00f1ar un papel en los aumentos repentinos y las infecciones por avance de vacunas. Las ideas de este manuscrito invitan a la reflexi\u00f3n, dice el vir\u00f3logo Kevin McCarthy de la Universidad de Pittsburgh, que no particip\u00f3 en este trabajo.<\/p>\n La comunidad de epidemiolog\u00eda ha centrado sus esfuerzos casi exclusivamente en la positividad de la PCR, principalmente en el seguimiento La transmisi\u00f3n de COVID-19 en tiempo real, pero los an\u00e1lisis de estos n\u00fameros apenas se han relacionado con datos gen\u00f3micos sobre variantes emergentes, dice Venky Soundararajan, director cient\u00edfico de la compa\u00f1\u00eda de inteligencia artificial nference y coautor del art\u00edculo. \u00c9l y sus colegas vieron la necesidad de integrar los datos epidemiol\u00f3gicos con el an\u00e1lisis gen\u00f3mico para determinar si ciertas mutaciones podr\u00edan estar asociadas con aumentos repentinos en los casos.<\/p>\n Los autores observaron una deleci\u00f3n de NTD que aument\u00f3 m\u00e1s de 13 veces de febrero a abril de 2021 en una variante emergente del SARS-CoV-2 en la India.<\/p>\n<\/blockquote>\n Primero analizaron 1,57 millones de secuencias del genoma del SARS-CoV-2 de 187 pa\u00edses o territorios para per\u00edodo de diciembre de 2019 a abril de 2021, obtenido de la base de datos de la Iniciativa mundial para compartir todos los datos sobre la influenza (GISAID). El an\u00e1lisis revel\u00f3 que en el transcurso de la pandemia surgieron 857 mutaciones de amino\u00e1cidos en la prote\u00edna espiga, cada una de las cuales estaba presente en al menos 100 secuencias. La mayor\u00eda de ellos (816) fueron sustituciones y 37 fueron eliminaciones.<\/p>\n Los autores preguntaron cu\u00e1les de esas mutaciones han aumentado en prevalencia durante intervalos de tres meses de aumento de la positividad de la prueba PCR en un pa\u00eds determinado. El equipo descubri\u00f3 que el 48,6 por ciento de las eliminaciones coincidieron con estos aumentos repentinos de casos de COVID-19, mientras que solo el 8,6 por ciento de las sustituciones cayeron en esta categor\u00eda. Las 18 deleciones asociadas a la oleada ocurrieron en el NTD de la prote\u00edna espiga, agrupadas en sitios a los que apuntan los anticuerpos neutralizantes. Seg\u00fan los autores, estas eliminaciones en SARS-CoV-2 podr\u00edan estar alimentando aumentos repentinos en todo el mundo.<\/p>\n El trabajo se alinea con un an\u00e1lisis de principios de este a\u00f1o de casi 150\u00a0000 secuencias de SARS-CoV-2 obtenidas de GISAID. base de datos, que revel\u00f3 cuatro sitios discretos dentro del NTD que tienen deleciones recurrentes en sitios antig\u00e9nicos. A ese estudio, dirigido por McCarthy, le siguieron trabajos estructurales y bioqu\u00edmicos que muestran que los anticuerpos neutralizantes humanos reconocen el NTD. La investigaci\u00f3n actual encontr\u00f3 que las eliminaciones de NTD ocurrieron principalmente dentro de seis regiones: las cuatro descritas anteriormente y dos recientemente informadas por el equipo de referencia.<\/p>\n Seg\u00fan Soundararajan, encontraron eliminaciones de NTD asociadas a aumentos repentinos en al menos 12 pa\u00edses de Asia, Am\u00e9rica del Sur, Europa y \u00c1frica. En la preimpresi\u00f3n, los autores se centran principalmente en los aumentos recientes en India y Chile. Observaron una eliminaci\u00f3n de NTD que aument\u00f3 m\u00e1s de 13 veces de febrero a abril de 2021 en una variante creciente de SARS-CoV-2 en India. En Chile, una deleci\u00f3n de NTD aument\u00f3 38 veces su prevalencia de enero a abril de 2021. Esta deleci\u00f3n es albergada por una de las dos principales variantes que circulan en el pa\u00eds que pertenece al linaje C.37.<\/p>\n Modelo propuesto en el preimpresi\u00f3n de las consecuencias de las eliminaciones en el NTD que afectan la uni\u00f3n de anticuerposAJ Venkatakrishnan, nference <\/p>\n Con respecto a la correlaci\u00f3n entre las eliminaciones y la positividad de la prueba, McCarthy dice que es dif\u00edcil saber si las mutaciones o los aumentos repentinos ocurrieron primero. Cuando tienes muchos casos propag\u00e1ndose, tambi\u00e9n tienes m\u00e1s replicaci\u00f3n viral, por lo que puedes tener m\u00e1s mutaciones, explica. Tambi\u00e9n advierte que el \u00e9nfasis de algunos pa\u00edses en la b\u00fasqueda de variantes espec\u00edficas puede sesgar el muestreo gen\u00f3mico en la base de datos. Por ejemplo, si un caso de COVID-19 tuviera contactos asociados con una variante de inter\u00e9s, es m\u00e1s probable que ese genoma viral sea secuenciado, explica. Las mutaciones en tales variantes podr\u00edan estar sobrerrepresentadas en la base de datos.<\/p>\n Theodora Hatziioannou, vir\u00f3loga de la Universidad Rockefeller de Nueva York que no particip\u00f3 en este trabajo, dice que es un estudio interesante, pero recomienda precauci\u00f3n al interpretar Los resultados. El aumento no depende solo del virus, dice, sino tambi\u00e9n de muchos otros factores, por ejemplo, el comportamiento humano.<\/p>\n Virologo Ricardo Soto Rifo de la Universidad de Chile que no particip\u00f3 en el estudio dice que destaca la relevancia de la NTD como un sitio antig\u00e9nico importante para la neutralizaci\u00f3n de anticuerpos. \u00c9l dice que la asociaci\u00f3n de las eliminaciones de NTD con aumentos repentinos en India y Chile requiere m\u00e1s investigaci\u00f3n, especialmente para comprender los efectos de estas mutaciones en las manifestaciones cl\u00ednicas de la enfermedad.<\/p>\n El equipo de referencia uni\u00f3 esfuerzos con Mayo Cl\u00ednica en Minnesota para explorar el papel potencial de las eliminaciones de NTD en pacientes con COVID-19 con inmunidad natural o inducida por vacunas. Analizaron los genomas virales de 53 pacientes, 20 con infecciones de avance de la vacuna y 33 con reinfecciones sospechosas. Observaron que 42 de estos pacientes ten\u00edan al menos una eliminaci\u00f3n en el NTD en comparaci\u00f3n con la secuencia de referencia de tipo salvaje de SARS-CoV-2, Wuhan-Hu-1, y 4 de ellos mostraban una extensi\u00f3n contigua de 39 amino\u00e1cidos eliminados. Los autores especulan que estos patrones de eliminaci\u00f3n podr\u00edan permitir que el virus evada la inmunidad adquirida.<\/p>\n Investigaciones recientes han demostrado que NTD induce una respuesta inmune, pero a\u00fan no sabemos qu\u00e9 significa eso para el avance de la vacuna, dice McCarthy. Creo que estudios como este son importantes para comenzar a juntar esas piezas para entender esto. \u00c9l dice que probablemente se necesitar\u00e1n miles de infecciones avanzadas y mucha m\u00e1s secuenciaci\u00f3n para determinar el significado completo de las mutaciones de NTD.<\/p>\n Soundararajan dice que m\u00e1s del 60 por ciento del total de genomas secuenciados de SARS-CoV- 2 son de EE. UU. o Reino Unido, una limitaci\u00f3n importante para comprender la evoluci\u00f3n del virus en todo el mundo. Este es un brote global, dice. Lo que est\u00e1 sucediendo en Chile [e] India es importante para los EE. UU., es importante para el Reino Unido. . . . Necesitamos invertir en la secuenciaci\u00f3n del genoma en diferentes partes del mundo, m\u00e1s all\u00e1 de nuestras fronteras, porque el mundo entero es una comunidad.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" ARRIBA: ISTOCK.COM, C\u00c9LULAS DE DISE\u00d1O La estabilidad gen\u00f3mica del SARS-CoV-2 que los cient\u00edficos esperaban inicialmente ha sido interrumpido por la aparici\u00f3n de diferentes variantes en el transcurso de la pandemia de COVID-19. El dominio N-terminal (NTD) de la prote\u00edna de pico del virus ha aparecido como una estructura potencialmente mutable; los cient\u00edficos han informado que tiene … Continuar leyendo \u00abSupresiones de prote\u00edna Spike vinculadas a aumentos repentinos de COVID-19: Preprint\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-37315","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/37315","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=37315"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/37315\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=37315"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=37315"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=37315"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}\n
Ver SARS-CoV-2 con eliminaciones gen\u00f3micas que escapan de un anticuerpo<\/h3>\n
Consecuencias cl\u00ednicas de las eliminaciones de NTD<\/h2>\n