{"id":37545,"date":"2022-09-01T08:21:10","date_gmt":"2022-09-01T13:21:10","guid":{"rendered":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/genoma-destacado-grosella-espinosa-de-california-hormiphora-californensis\/"},"modified":"2022-09-01T08:21:10","modified_gmt":"2022-09-01T13:21:10","slug":"genoma-destacado-grosella-espinosa-de-california-hormiphora-californensis","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/genoma-destacado-grosella-espinosa-de-california-hormiphora-californensis\/","title":{"rendered":"Genoma destacado: grosella espinosa de California (Hormiphora californensis)"},"content":{"rendered":"

ARRIBA: Hormiphora californensis<\/em> DARRIN SCHULTZ 2021 MBARI <\/p>\n

Para los bi\u00f3logos, el debate por excelencia sobre qui\u00e9n vino primero es no pollo o huevo, sino bizcocho o cten\u00f3foro. La discusi\u00f3n sobre cu\u00e1l de estos grupos representa la rama m\u00e1s antigua del ancestro de todos los animales se ha prolongado durante m\u00e1s de una d\u00e9cada, con discusiones acaloradas provenientes de ambos lados. Ahora, un nuevo genoma de cten\u00f3foro a nivel de cromosoma publicado en el volumen de noviembre de G3 GenesGenomesGenetics<\/em> puede ofrecer la oportunidad de establecer de una vez por todas si Porifera o Ctenophora evolucionaron primero. Un m\u00e9todo que posiblemente podr\u00eda resolver la posici\u00f3n filogen\u00e9tica de los cten\u00f3foros y las esponjas es comparar cromosomas completos,  escribieron los investigadores en su art\u00edculo.<\/p>\n

Con su falta de tejidos y \u00f3rganos verdaderos o incluso de simetr\u00eda, las esponjas pueden parecer como la elecci\u00f3n obvia para el grupo de animales m\u00e1s antiguo. Pero a principios de la d\u00e9cada de 2010, un grupo vocal de investigadores armados con datos gen\u00f3micos comenz\u00f3 a argumentar que, a pesar de su aparente complejidad, los cten\u00f3foros (com\u00fanmente conocidos como medusas peine) son en realidad m\u00e1s antiguos. Los defensores de una topolog\u00eda de esponja primero aplaudieron, por supuesto, y el tira y afloja contin\u00faa hoy.<\/p>\n

Hormiphora californensis<\/em> es una de las especies criadas para investigaci\u00f3n y exhibici\u00f3n por parte de la personal del Acuario de la Bah\u00eda de Monterey.Darrin Schultz 2021 MBARI<\/p>\n

Una posible l\u00ednea de evidencia que no ha sido examinada es una comparaci\u00f3n filogen\u00f3mica de cromosomas completos. A\u00fan no se han realizado an\u00e1lisis cromos\u00f3micos porque los dos genomas de cten\u00f3foros publicados carec\u00edan de resoluci\u00f3n a nivel cromos\u00f3mico. De hecho, antes de este estudio, no estaba claro c\u00f3mo eran los cromosomas de los cten\u00f3foros; no hab\u00eda cariotipos publicados para ning\u00fan cten\u00f3foro. Entonces, antes de sumergirse en el genoma, el equipo de cient\u00edficos dirigido por el investigador del Instituto de Investigaci\u00f3n del Acuario de la Bah\u00eda de Monterey (MBARI, por sus siglas en ingl\u00e9s), Darrin Schultz, aprovech\u00f3 la capacidad del acuario para cultivar la grosella espinosa marina de California (Hormiphora californensis<\/em>) para generar el primer cariotipo del grupo. Result\u00f3 que el animal tiene 13 cromosomas emparejados, que es exactamente lo que se predijo para un cten\u00f3foro relacionado. lecturas finales. Pero para colocar el ADN en el contexto cromos\u00f3mico, el equipo recurri\u00f3 a la captura de conformaci\u00f3n de cromatina Hi-C. Hi-C proporciona informaci\u00f3n sobre la estructura de la cromatina porque antes de que se generen las secuencias, el ADN nativo se trata con formaldeh\u00eddo, lo que genera enlaces cruzados entre las piezas de cromatina que interact\u00faan. Cuando se digiere el ADN, estos enlaces cruzados inicialmente permanecen intactos, manteniendo juntos fragmentos de secuencia que interact\u00faan f\u00edsicamente (principalmente dentro de los cromosomas). Las secuencias adjuntas luego se fusionan entre s\u00ed, creando secuencias quim\u00e9ricas que mantienen el contexto espacial gen\u00f3mico de los cromosomas intactos. En el caso de H. californensis<\/em>, por ejemplo, un mapa de calor de las interacciones Hi-C recapitula los 13 cromosomas visualizados microsc\u00f3picamente.<\/p>\n

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Una de las herramientas m\u00e1s importantes en el ensamblaje del #genoma es el mapa Hi-C: un mapa de interacciones entre diferentes piezas de ADN en el espacio 3D. Aqu\u00ed, puedes ver las 13 unidades discretas que corresponden a las 13 cromosomas en el genoma de Hormiphora! https:\/\/t.co\/i3Q6a6YxE7 pic.twitter.com\/lWLN5BUsiB<\/p>\n

Darrin Schultz (@conchoecia) 22 de septiembre de 2021<\/p><\/blockquote>\n

El equipo tambi\u00e9n proporcion\u00f3 una anotaci\u00f3n inicial seleccionada manualmente para su nuevo genoma Esto revel\u00f3 miles de genes intr\u00f3nicos anidados: genes que existen dentro de los intrones de otros genes. De hecho, 484 estaban doblemente anidados. La investigaci\u00f3n sugiere que el anidamiento puede permitir un control de la transcripci\u00f3n m\u00e1s afinado y, por lo tanto, puede haber jugado un papel importante en la evoluci\u00f3n de la complejidad. De hecho, tal anidamiento de genes se observa en plantas y animales, incluso en humanos, los genes intr\u00f3nicos anidados est\u00e1n en gran parte ausentes de hongos y eucariotas unicelulares. Los autores se\u00f1alan que encontrar tantos de estos genes dentro de los genes en este cten\u00f3foro a la par con el grado de anidamiento observado en los primates puede sugerir que el mecanismo evolucion\u00f3 al principio de nuestro linaje.<\/p>\n

Si bien los investigadores no analizaron el cromosoma completo an\u00e1lisis filogen\u00f3micos de nivel para ver si el H. californensis<\/em> se suma al apoyo de una historia evolutiva del primer cten\u00f3foro, tales an\u00e1lisis ahora son posibles, ya que el a\u00f1o pasado se public\u00f3 un ensamblaje a nivel de cromosoma para una especie de esponja.<\/p>\n

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Subcampeones:<\/h2>\n

Cierre stilt de Jap\u00f3n (Microstegium vimineum<\/em>)<\/h3>\n

El stiltgrass japon\u00e9s lleva m\u00e1s de un siglo causando estragos en los ecosistemas nativos de el este de los EE.UU., sin embargo, la base biol\u00f3gica de su invasividad sigue siendo esquiva. Un ensamblaje del genoma de alta calidad a nivel cromos\u00f3mico para la especie, publicado en el volumen de noviembre de Genome Biology and Evolution<\/em>, proporciona informaci\u00f3n que podr\u00eda resultar valiosa tanto para los administradores de recursos como para los bot\u00e1nicos evolutivos.   <\/p>\n

Garbanzo (Cicer arietinum<\/em>)<\/h3>\n

Si bien el primer borrador del genoma del garbanzo se public\u00f3 hace ocho a\u00f1os, un esfuerzo masivo de secuenciaci\u00f3n de m\u00e1s de 3.000 variedades ha producido una novedad gen\u00f3mica diferente para la especie: un pangenoma. Como explica The New York Times<\/em> <\/em>, este cat\u00e1logo de variaci\u00f3n gen\u00e9tica intraespecies arroja luz sobre los or\u00edgenes y la historia de domesticaci\u00f3n de este importante cultivo, y puede ayudar a los cient\u00edficos agr\u00edcolas a mejorar o dise\u00f1ar nuevas variedades que son capaces de soportar cualquier cambio clim\u00e1tico que se les presente. <\/p>\n

Ver El Pangenoma: \u00bfEst\u00e1n muertos los genomas de referencia \u00fanica? Spotlight es una columna mensual de The Scientists Genetics & Bolet\u00edn sobre gen\u00f3mica que destaca secuencias gen\u00f3micas publicadas recientemente y los misterios de la vida que pueden revelar.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

ARRIBA: Hormiphora californensis DARRIN SCHULTZ 2021 MBARI Para los bi\u00f3logos, el debate por excelencia sobre qui\u00e9n vino primero es no pollo o huevo, sino bizcocho o cten\u00f3foro. La discusi\u00f3n sobre cu\u00e1l de estos grupos representa la rama m\u00e1s antigua del ancestro de todos los animales se ha prolongado durante m\u00e1s de una d\u00e9cada, con discusiones … Continuar leyendo \u00abGenoma destacado: grosella espinosa de California (Hormiphora californensis)\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-37545","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/37545","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=37545"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/37545\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=37545"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=37545"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=37545"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}