{"id":37585,"date":"2022-09-01T08:24:16","date_gmt":"2022-09-01T13:24:16","guid":{"rendered":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/genoma-destacado-junco-comun-phragmites-australis\/"},"modified":"2022-09-01T08:24:16","modified_gmt":"2022-09-01T13:24:16","slug":"genoma-destacado-junco-comun-phragmites-australis","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/genoma-destacado-junco-comun-phragmites-australis\/","title":{"rendered":"Genoma destacado: junco com\u00fan (Phragmites australis)"},"content":{"rendered":"

ARRIBA: Invasor Phragmites australis<\/em> en el Refugio Nacional de Vida Silvestre Alligator River de Carolina del Norte FLICKR.COM, NC HUMEDALES <\/p>\n

Llamando Phragmites australis<\/em> la ca\u00f1a com\u00fan realmente subestima su omnipresencia. La hierba de los humedales de hasta 6 metros de altura ha sido irritantemente omnipresente en Am\u00e9rica del Norte desde que se introdujo una subespecie europea en el siglo XIX y se extendi\u00f3 amplia y agresivamente. De hecho, la planta es tan tenaz en los h\u00e1bitats de humedales que ahoga el linaje nativo de Am\u00e9rica del Norte de la especie (a veces considerada una especie separada denominada P. americanus<\/em>), as\u00ed como muchas otras plantas nativas, lo que reduce la cantidad de flores. la riqueza de especies casi se triplic\u00f3 y expuls\u00f3 a los animales especializados de los pantanos, incluidas muchas especies amenazadas y en peligro de extinci\u00f3n.<\/p>\n

A pesar de d\u00e9cadas de investigaci\u00f3n, un misterio perdurable es por qu\u00e9 el linaje europeo es tan invasivo en Am\u00e9rica del Norte, cuando est\u00e1 cerca Los parientes han existido en el continente durante milenios sin apoderarse de los humedales. Los estudios gen\u00e9ticos han revelado pistas tentadoras, incluidos los niveles de ploid\u00eda en el linaje europeo que van desde 2 a 12x y m\u00e1s. Pero las investigaciones gen\u00e9ticas sobre la invasividad de los linajes europeos se han visto obstaculizadas por la falta de un ensamblaje de alta calidad para usar como referencia. Eso cambi\u00f3 el 28 de noviembre, con la publicaci\u00f3n de un genoma de referencia para la especie en Ecolog\u00eda Molecular<\/em>.<\/em><\/p>\n

Rociar Phragmites<\/em> invasivos en Nueva JerseyCHELSI BURNS, USFWS<\/p>\n

Los autores del art\u00edculo, dirigidos por Keith Clay de la Universidad de Tulane, construyeron el genoma a partir de lecturas largas producidas por la plataforma continua de secuenciaci\u00f3n en tiempo real de una sola mol\u00e9cula PacBio RSII. Los investigadores ensamblaron el genoma de 1,14 Gb a partir de m\u00e1s de 13.400 fragmentos de genoma sin espacios en los que se superpon\u00edan m\u00faltiples secuencias. Los modelos de anotaci\u00f3n estimaron que las plantas tienen casi 65 000 genes, aunque m\u00e1s de la mitad del genoma (~56,2 %) est\u00e1 compuesto por secuencias repetitivas, en su mayor\u00eda retrotransposones (~36,4 %).<\/p>\n

Comparaciones con otras plantas en la monocotiled\u00f3nea clado, que contiene decenas de miles de especies de plantas parecidas a las gram\u00edneas, revel\u00f3 que el g\u00e9nero Phragmites <\/em> experiment\u00f3 una duplicaci\u00f3n completa del genoma en alg\u00fan momento de su evoluci\u00f3n. Si bien muchos de los genes duplicados se perdieron, quedan al menos 14,000 y podr\u00edan desempe\u00f1ar un papel importante en la biolog\u00eda y ecolog\u00eda de las plantas. Seg\u00fan el art\u00edculo, muchos de estos genes son factores de transcripci\u00f3n que podr\u00edan proporcionar material gen\u00e9tico novedoso para que la selecci\u00f3n act\u00fae facilitando su potencial como especie invasora.<\/p>\n

El equipo tambi\u00e9n gener\u00f3 transcriptomas para individuos invasores y nativos y encontr\u00f3 sorprendentes diferencias en la expresi\u00f3n de genes basales, particularmente con respecto a los genes de respuesta al estr\u00e9s de las plantas: la abundancia de transcritos para los genes de respuesta al estr\u00e9s bi\u00f3tico fue mayor para el linaje invasivo. Eso puede llevar a que las plantas invasoras est\u00e9n preparadas para responder a los pat\u00f3genos y otros estresores bi\u00f3ticos, haci\u00e9ndolas m\u00e1s capaces de superar a sus parientes no preparados, particularmente en h\u00e1bitats perturbados.<\/p>\n

Quedan muchas preguntas, incluso si la ploid\u00eda juega un papel en la invasividad (el genoma ensamblado era funcionalmente diploide), y hasta qu\u00e9 punto las diferencias gen\u00e9ticas y gen\u00f3micas entre las ca\u00f1as nativas y las invasoras pueden informar las estrategias de manejo. Los autores escriben que el ensamblaje servir\u00e1 como una base gen\u00f3mica para el desarrollo de nuevos enfoques de gesti\u00f3n, se\u00f1alando que abre espec\u00edficamente la posibilidad de utilizar la interferencia de ARN (ARNi) para derribar el gen o los genes que le dan una ventaja al linaje invasivo. Tambi\u00e9n se\u00f1alan que se necesita m\u00e1s investigaci\u00f3n para identificar los objetivos de ARNi y probar cualquier tecnolog\u00eda de control desarrollada, particularmente cuando se trata de sus efectos en el linaje nativo de Phragmites<\/em>.  <\/p>\n

Subcampeones:<\/h2>\n

Big berry manzanita (Arctostaphylos glauca<\/em>)<\/h3>\n

Las manzanitas son arbustos ic\u00f3nicos end\u00e9micos del oeste de Am\u00e9rica del Norte que llenar nichos ecol\u00f3gicos fundamentales en el paisaje propenso a los incendios de sus pa\u00edses de origen. El primer genoma de manzanita, publicado a fines de noviembre en el Journal of Heredity<\/em>, ayudar\u00e1 a informar el monitoreo de la diversidad gen\u00e9tica para los grupos de muchas especies en peligro de extinci\u00f3n, escriben los autores del art\u00edculo, as\u00ed como a impulsar investigaciones m\u00e1s profundas sobre el Adaptaciones de las plantas e historia evolutiva.  <\/p>\n

Una ara\u00f1a hawaiana de mand\u00edbula larga (Tetragnatha kauaiensis<\/em>)<\/h3>\n

Existen pocos genomas de ara\u00f1a de alta calidad a pesar del tama\u00f1o de los grupos (m\u00e1s de 50.000 especies) y diversidad ecol\u00f3gica. Debido a esto, la gen\u00f3mica evolutiva de los animales de ocho patas permanece en gran parte inexplorada. La secuencia del genoma de una de las ara\u00f1as de mand\u00edbula larga de Haw\u00e1i, T.<\/em> kauaiensis<\/em>, publicada a fines de noviembre en Genome Biology and Evolution<\/em>, puede ayudar a explicar los muchos misterios dentro del ADN de la ara\u00f1a, incluidas las variaciones extremas en el tama\u00f1o del genoma entre especies, tal vez impulsadas por elementos transponibles o antiguas duplicaciones del genoma completo, escriben los autores del art\u00edculo.  <\/p>\n<\/p>\n

Genome Spotlight es una columna mensual para The Scientists Genetics & Bolet\u00edn sobre gen\u00f3mica que destaca secuencias gen\u00f3micas publicadas recientemente y los misterios de la vida que pueden revelar.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

ARRIBA: Invasor Phragmites australis en el Refugio Nacional de Vida Silvestre Alligator River de Carolina del Norte FLICKR.COM, NC HUMEDALES Llamando Phragmites australis la ca\u00f1a com\u00fan realmente subestima su omnipresencia. La hierba de los humedales de hasta 6 metros de altura ha sido irritantemente omnipresente en Am\u00e9rica del Norte desde que se introdujo una subespecie … Continuar leyendo \u00abGenoma destacado: junco com\u00fan (Phragmites australis)\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-37585","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/37585","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=37585"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/37585\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=37585"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=37585"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=37585"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}