{"id":37712,"date":"2022-09-01T08:34:14","date_gmt":"2022-09-01T13:34:14","guid":{"rendered":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/genoma-destacado-rata-de-la-isla-de-navidad-rattus-macleari\/"},"modified":"2022-09-01T08:34:14","modified_gmt":"2022-09-01T13:34:14","slug":"genoma-destacado-rata-de-la-isla-de-navidad-rattus-macleari","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/genoma-destacado-rata-de-la-isla-de-navidad-rattus-macleari\/","title":{"rendered":"Genoma destacado: Rata de la Isla de Navidad (Rattus macleari)"},"content":{"rendered":"

ARRIBA: Una ilustraci\u00f3n cient\u00edfica temprana de una rata de la Isla de Navidad (originalmente llamada Mus macleari<\/em>) Joseph Smit; Proc Zool Soc Lond<\/em>, 1887 <\/p>\n

Las ratas alguna vez gobernaron la Isla de Navidad, una isla de 135 kil\u00f3metros cuadrados a unos 350 kil\u00f3metros al sur de Java en Indonesia. Mientras que las gorditas ratas bulldog (Rattus nativitatis<\/em>) vagaban por los suelos de los bosques de las islas, eran las ratas de la Isla de Navidad (Rattus macleari<\/em>), con su pelaje largo y espeso y sus orejas redondeadas, las que realmente ten\u00eda el funcionamiento del lugar. Seg\u00fan el paleont\u00f3logo brit\u00e1nico Charles William Andrews, quien escribi\u00f3 una monograf\u00eda sobre sus observaciones de la isla en 1897, enjambres de ellos aparecieron por todas partes tan pronto como se puso el sol. Sin embargo, el \u00faltimo avistamiento documentado de la especie ocurrir\u00eda apenas 18 a\u00f1os despu\u00e9s. En 1908, las ratas se extinguieron, probablemente v\u00edctimas de una enfermedad tra\u00edda a sus costas por ratas marrones polizones (Rattus rattus<\/em>).<\/p>\n

Estas p\u00e9rdidas alguna vez se consideraron irreversibles. Pero ahora, con tecnolog\u00edas gen\u00e9ticas en constante mejora, los investigadores est\u00e1n explorando la posibilidad de la extinci\u00f3n, lo que puede implicar resucitar una especie mediante la ingenier\u00eda del genoma de una especie viva para que coincida con sus parientes perdidos hace mucho tiempo. Lo reciente de la desaparici\u00f3n de las ratas de la Isla de Navidad, as\u00ed como su relaci\u00f3n gen\u00e9tica un tanto estrecha con las especies existentes, lo convierten en un excelente estudio de caso para la viabilidad de tales proyectos, escriben los investigadores en un art\u00edculo de Current Biology<\/em> del 9 de marzo. .  <\/p>\n

Ver CRISPR puede resultar \u00fatil en los esfuerzos de eliminaci\u00f3n de la extinci\u00f3n<\/h3>\n

El primer paso para editar el animal de vuelta a la vida es ensamblar una secuencia gen\u00f3mica de alta calidad. Entonces, el equipo obtuvo muestras de pieles de ratas de la Isla de Navidad, recolectadas originalmente entre 1900 y 1902, del Museo de Historia Natural de la Universidad de Oxford. Dada la edad de las muestras, el equipo emple\u00f3 la secuenciaci\u00f3n Illumina y BGISeq de lectura corta, que son ideales para el ADN degradado, y en lugar de ensamblar el genoma de novo, los investigadores asignaron las lecturas cortas que obtuvieron a la rata de Noruega ( Rattus norvegicus<\/em>) genoma. Los autores del art\u00edculo consideraron que las ratas de Noruega eran candidatas ideales para editar y resucitar a la rata de la Isla de Navidad porque son parientes cercanos de la especie extinta, con un tiempo de divergencia estimado de 2,6 millones de a\u00f1os, adem\u00e1s de que hay un genoma de referencia de excelente calidad para la especie.<\/p>\n

Al genoma construido le faltaban trozos considerables. Ten\u00eda una cobertura promedio de 60,81x, pero solo se asign\u00f3 al 95,15 por ciento de la secuencia de ratas de Noruega. Los investigadores estiman que a 2.500 de las ratas de Christmas Island les faltan aproximadamente 34.000 genes en el ensamblaje. La mala calidad del ADN, que result\u00f3 en que casi el 1 por ciento de las bases fueran ambiguas, as\u00ed como longitudes de lectura promedio muy cortas (casi la mitad ten\u00edan 50 pares de bases o menos) probablemente contribuyeron a la imposibilidad de mapear las secuencias, se\u00f1alan los autores, pero comparaciones adicionales entre especies de ratas vivas sugiri\u00f3 que la divergencia entre los dos genomas era un factor importante en las brechas aparentes. Aproximadamente una cuarta parte de la secuencia del genoma faltante probablemente consist\u00eda en genes, y los an\u00e1lisis de cobertura revelaron que los genes inmunes y olfativos ten\u00edan una cobertura particularmente baja. Los autores escriben que est\u00e1 claro que la distribuci\u00f3n no aleatoria de estos genes tendr\u00eda consecuencias para la biolog\u00eda resultante de los animales reconstruidos, lo que podr\u00eda impedir la reintroducci\u00f3n de la especie en su entorno original.<\/p>\n

El grado de ausencia El ADN sorprendi\u00f3 a los expertos en el campo, informa Science<\/em>. Douglas McCauley, un ecologista de la Universidad de California, Santa B\u00e1rbara, que no particip\u00f3 en el estudio, le dice al medio <\/em>que muestra cu\u00e1n maravillosamente cerca y, sin embargo, cu\u00e1n devastadoramente lejos est\u00e1n los investigadores de revivir animales extintos. especies. Podr\u00edamos hacer algo, pero parece claro que nunca ser\u00e1 una rata de la Isla de Navidad, se\u00f1ala. En cuyo caso, \u00bfcu\u00e1l es el punto?<\/p>\n

Ver The Booming Call of De-extinction<\/h3>\n

Sus posibles tecnolog\u00edas de mejora podr\u00edan conducir a genomas antiguos m\u00e1s completos y, por lo tanto, a un mayor \u00e9xito en la recreaci\u00f3n especies extintaspero a\u00fan as\u00ed, algunos expertos cuestionan si la de-extinci\u00f3n es un esfuerzo digno. Como ciencia, es impresionante, dice a Science News<\/em> el coautor Tom Gilbert, bi\u00f3logo evolutivo de la Universidad de Copenhague. Sin embargo, se pregunta si este es el mejor uso del dinero en un mundo en el que no podemos mantener con vida a nuestros rinocerontes.<\/p>\n

Subcampeones:<\/h2>\n

Neosho madtom (Noturus placidus<\/em>)<\/h3>\n

En las aguas de la cuenca del r\u00edo Arkansas vive un peque\u00f1o bagre \u00fanico conocido como Neosho madtom. Aproximadamente del tama\u00f1o del pulgar de una persona, estos diminutos peces fueron catalogados como amenazados en 1990 despu\u00e9s de que las actividades humanas destruyeran gran parte de su h\u00e1bitat ancestral. Pero los esfuerzos de conservaci\u00f3n se han visto obstaculizados por la falta de conocimiento sobre la gen\u00e9tica de la especie. Diez genomas completos publicados el 21 de febrero en G3 GenesGenomesGenetics<\/em> <\/em>podr\u00e1n cambiar eso. Los autores del estudio pudieron localizar polimorfismos de un solo nucle\u00f3tido entre los genomas, lo que revel\u00f3 poca diferenciaci\u00f3n de la poblaci\u00f3n a pesar de la separaci\u00f3n geogr\u00e1fica y proporcion\u00f3 las primeras estimaciones de la diversidad gen\u00e9tica de la especie. El trabajo ayudar\u00e1 a los esfuerzos de conservaci\u00f3n actuales y futuros, escriben los autores, y demuestra que el uso de la secuenciaci\u00f3n del genoma completo proporciona informaci\u00f3n detallada de la estructura y la demograf\u00eda de la poblaci\u00f3n utilizando solo un n\u00famero limitado de muestras raras y valiosas.<\/p>\n

Sud\u00e1frica trigo harinero (Triticum aestivum<\/em>) cultivar Kariega<\/h3>\n

La ingenier\u00eda gen\u00e9tica tiene el potencial de mejorar la agricultura aumentando los rendimientos, protegiendo los cultivos contra los pat\u00f3genos y ampliando las condiciones de crecimiento tolerables. Pero identificar y clonar genes clave para tales ganancias sigue siendo dif\u00edcil, ya que los genomas de las especies de cultivos, a menudo grandes y ricos en repeticiones, son dif\u00edciles de secuenciar. Los genomas de los trigos utilizados para la harina han resultado especialmente dif\u00edciles de dominar pero, en un art\u00edculo del 14 de marzo en Nature Genetics<\/em>, los investigadores informan sobre un ensamblaje de un cultivar sudafricano conocido por su resistencia a la enfermedad de la roya lineal f\u00fangica que es un orden de magnitud m\u00e1s contigua que las secuencias anteriores. El avance fue posible gracias a la secuenciaci\u00f3n de lectura larga y otras tecnolog\u00edas gen\u00e9ticas de vanguardia, escriben los autores, y el genoma de alta calidad les permiti\u00f3 identificar un alelo que posiblemente podr\u00eda usarse para conferir resistencia a otras variedades de trigo. Los hallazgos demuestran la viabilidad de generar ensamblajes de trigo a escala cromos\u00f3mica a partir de cualquier l\u00ednea de trigo para guiar los proyectos de clonaci\u00f3n de genes, concluyen los autores.<\/p>\n<\/p>\n

Genome Spotlight es una columna mensual para The Scientists ;Gen\u00e9tica &amperio; Bolet\u00edn sobre gen\u00f3mica que destaca secuencias gen\u00f3micas publicadas recientemente y los misterios de la vida que pueden revelar.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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