{"id":37757,"date":"2022-09-01T08:37:45","date_gmt":"2022-09-01T13:37:45","guid":{"rendered":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/genoma-destacado-cardenal-tubifer-siphamia-tubifer\/"},"modified":"2022-09-01T08:37:45","modified_gmt":"2022-09-01T13:37:45","slug":"genoma-destacado-cardenal-tubifer-siphamia-tubifer","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/genoma-destacado-cardenal-tubifer-siphamia-tubifer\/","title":{"rendered":"Genoma destacado: cardenal tubifer (Siphamia tubifer)"},"content":{"rendered":"

ARRIBA: Un cardenal tubifer (Siphamia tubifer<\/em>) en cautiverio en el Acuario Steinhart de la Academia de Ciencias de California Tim Wong, Academia de Ciencias de California <\/p>\n

Durante el d\u00eda, los cardenales tubifer (Siphamia tubifer<\/em>) se pueden encontrar saltando entre las espinas de los erizos en los arrecifes de los oc\u00e9anos \u00cdndico y Pac\u00edfico. Por la noche, se vuelven m\u00e1s audaces, quiz\u00e1s debido a su asociaci\u00f3n con la luminosa bacteria Photobacterium mandapamensis <\/em>. Gracias a los microbios, en la oscuridad, estos peces brillan suavemente con una luz que los cient\u00edficos sospechan que crea un sombreado que confunde a los depredadores.<\/p>\n

El pez cardenal tub\u00edfero se esconde entre las espinas de los erizos durante el d\u00eda, un comportamiento que ha llevado a algunos a llamarlo pez cardenal erizo de mar. Alison Gould, Academia de Ciencias de California<\/p>\n

Esta asociaci\u00f3n ha convertido a los peces y las bacterias en un modelo emergente de simbiosis entre microbios y vertebrados. Debido a que las bacterias se alojan en un \u00f3rgano que est\u00e1 conectado a los intestinos de los peces, el mutualismo comparte similitudes con las simbiosis del microbioma intestinal. La investigaci\u00f3n hasta la fecha se ha visto obstaculizada por la falta de recursos gen\u00f3micos para los peces, pero eso cambi\u00f3 el 29 de marzo con la publicaci\u00f3n de un ensamblaje del genoma a nivel cromos\u00f3mico para el cardenal en Genome Biology and Evolution<\/em>.<\/p <\/p>\n

Para armar el genoma de 23 cromosomas y 1,2 Gb del pez, la ecologista evolutiva de la Academia de Ciencias de California Alison Gould y sus colegas combinaron la secuenciaci\u00f3n de lectura larga PacBio HiFi con HiC, una tecnolog\u00eda que revela la estructura 3D del genoma al pegar juntas regiones de cromatina que est\u00e1n en estrecha proximidad f\u00edsica antes de la secuenciaci\u00f3n. El resultado fue un genoma nuclear de alta calidad con una puntuaci\u00f3n BUSCO del 99 por ciento, una medida que indica la integridad en funci\u00f3n de la medida en que un ensamblaje contiene genes de copia \u00fanica que se encuentran en especies relacionadas (en este caso, peces con aletas radiadas). El equipo tambi\u00e9n pudo secuenciar el genoma mitocondrial del pez de aproximadamente 18 kb.<\/p>\n

Las comparaciones iniciales con el \u00fanico otro genoma de pez cardenal secuenciado hasta la fecha, el Sphaeramia orbicularis<\/em> no bioluminiscente, y los de otros peces revelaron una fusi\u00f3n de cromosomas que ocurri\u00f3 en alg\u00fan momento antes de la divisi\u00f3n de los dos cardenales, as\u00ed como una superposici\u00f3n significativa en el posicionamiento de los genes en ambos cardenales a pesar de un estimado de 50 millones de a\u00f1os de divergencia entre las dos especies. Los autores se\u00f1alan que la divergencia temprana del cardenal tubifer plantea la posibilidad de que la simbiosis bioluminiscente desempe\u00f1\u00f3 un papel en la divergencia inicial y la especiaci\u00f3n de los anfitriones a partir de una hip\u00f3tesis de ancestro com\u00fan que podr\u00eda ser investigada por estudios futuros ahora que este ensamblaje ha permitido una investigaci\u00f3n m\u00e1s profunda sobre la simbiosis. -genes relacionados.<\/p>\n

Subcampeones:<\/h2>\n

Townsends menos gecko (Sphaerodactylus townsendi<\/em>)<\/h3>\n

La gran mayor\u00eda del conocimiento sobre la determinaci\u00f3n del sexo en los vertebrados proviene de aves y mam\u00edferos, cuyos sistemas de determinaci\u00f3n del sexo tienden a ser evolutivamente estables. En contraste, los reptiles escamosos y especialmente los geckos exhiben una amplia diversidad de sistemas de determinaci\u00f3n del sexo, incluidos los que se consideran cambios r\u00e1pidos de un sistema a otro en una escala de tiempo evolutiva. Para acelerar los conocimientos sobre la base gen\u00e9tica de tal flexibilidad, los investigadores publicaron el genoma del geco menor de Towsends el 1 de abril en Journal of Heredity<\/em>.<\/p>\n

Falso pez payaso (Amphiprion ocellaris<\/em>)<\/h3>\n

Los falsos peces payaso alcanzaron el estrellato internacional con la pel\u00edcula de Pixars de 2003 Buscando a Nemo<\/em>. Tambi\u00e9n han ido ganando popularidad en los c\u00edrculos cient\u00edficos, como un organismo modelo emergente para estudiar la evoluci\u00f3n, la ecolog\u00eda y la biolog\u00eda del desarrollo en los peces de arrecife. Un genoma de alta calidad para la especie, publicado el 30 de marzo en G3 GenesGenomesGenetics<\/em>, reforzar\u00e1 la investigaci\u00f3n que involucra a la especie y servir\u00e1 como un recurso valioso para comprender la ecolog\u00eda y la evoluci\u00f3n de los peces de arrecife, escriben los autores. <\/p>\n

Tigre de Tasmania (Thylacinus cynocephalus<\/em>)<\/h3>\n

El tigre de Tasmania, tambi\u00e9n conocido como tilacino, es uno de los ejemplos m\u00e1s famosos de extinci\u00f3n provocada por el hombre. . Si bien no es el primer ensamblaje del genoma de los amados marsupiales, el genoma publicado el 29 de marzo en  Genome Biology and Evolution<\/em> aprovecha la r\u00e1pida mejora de las tecnolog\u00edas de secuenciaci\u00f3n para generar el primer genoma a escala cromos\u00f3mica, que a pesar de basarse en El ADN es tan contiguo y completo como los genomas marsupiales existentes recientemente. Los estudios futuros de resecuenciaci\u00f3n del genoma completo, potenciados por este ensamblaje, tienen el potencial de proporcionar informaci\u00f3n a nivel de poblaci\u00f3n sobre la demograf\u00eda de las tilacinas y el nivel de carga gen\u00e9tica antes de su extinci\u00f3n, concluyen los autores.<\/p>\n<\/p>\n

Genome Spotlight es una columna mensual para The Scientists Genetics & Bolet\u00edn sobre gen\u00f3mica que destaca secuencias gen\u00f3micas publicadas recientemente y los misterios de la vida que pueden revelar.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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