{"id":37806,"date":"2022-09-01T08:41:38","date_gmt":"2022-09-01T13:41:38","guid":{"rendered":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/genoma-destacado-isopodo-gigante-bathynomus-jamesi\/"},"modified":"2022-09-01T08:41:38","modified_gmt":"2022-09-01T13:41:38","slug":"genoma-destacado-isopodo-gigante-bathynomus-jamesi","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/genoma-destacado-isopodo-gigante-bathynomus-jamesi\/","title":{"rendered":"Genoma destacado: is\u00f3podo gigante (Bathynomus jamesi)"},"content":{"rendered":"

ARRIBA: Un is\u00f3podo gigante estrechamente relacionado (Bathynomus giganteus<\/em>) en un acuario FLICKR\/cifraser1, CC BY 2.0 <\/p>\n

Como muchos animales de aguas profundas, los is\u00f3podos gigantes (g\u00e9nero Bathynomus<\/em>) parecen estar listos para protagonizar una pel\u00edcula de terror de serie B. Sin embargo, se han convertido en carism\u00e1ticos embajadores marinos en acuarios de todo el mundo; en algunos lugares, \u00a1incluso puedes acariciar a uno! Ahora, tambi\u00e9n est\u00e1n ayudando a los cient\u00edficos a comprender mejor c\u00f3mo las especies se adaptan a las profundidades oscuras, gracias a una secuencia gen\u00f3mica de alta calidad publicada el 13 de mayo en BMC Biology<\/em>.<\/p>\n

Las diversas formas y h\u00e1bitats de los is\u00f3podosFig. 1A de BMC Biol<\/em>, 20:113, 2022.<\/p>\n

El equipo de investigaci\u00f3n chino detr\u00e1s del nuevo ensamblaje escribe que los is\u00f3podos son excelentes para estudiar la adaptaci\u00f3n porque los representantes del grupo de las especies (se han identificado m\u00e1s de 10 000 especies) descrito hasta la fecha) se pueden encontrar en todo el mundo en h\u00e1bitats muy diversos, desde los bosques tropicales hasta el fondo del mar. De hecho, el lecho marino oce\u00e1nico se considera un h\u00e1bitat especialmente exigente, y cualquier organismo que viva all\u00ed debe hacer frente a temperaturas bajo cero, presiones intensas, oscuridad profunda y alimentos limitados. Los is\u00f3podos gigantes son uno de los invertebrados dominantes en este entorno, y sobreviven hurgando en las raras recompensas que caen desde arriba en forma de cad\u00e1veres que se hunden. Un genoma completo podr\u00eda permitir a los cient\u00edficos investigar la gen\u00e9tica subyacente a los rasgos que los ayudan a prosperar en las profundidades, incluidos sus cuerpos grandes, est\u00f3magos de gran tama\u00f1o y una notable capacidad de ayuno (un is\u00f3podo cautivo vivi\u00f3 durante cinco a\u00f1os sin comer).  <\/p>\n

Para secuenciar el genoma del is\u00f3podo gigante Bathynomus jamesi<\/em>, el equipo de novo reuni\u00f3 lecturas largas de Pacific Bio en lugar de utilizar cualquiera de los dos genomas de is\u00f3podos terrestres existentes como andamio. . Eso dio como resultado un genoma altamente contiguo de 5,24 Gb, casi 3,5 veces el tama\u00f1o del siguiente genoma de is\u00f3podo m\u00e1s grande que, seg\u00fan un conjunto de genes de crust\u00e1ceos esperados, estaba completo en un 95 por ciento.<\/p>\n

Un Bathynomus giganteus<\/em> un is\u00f3podo gigante se abre paso nadando hacia los corazones de la tripulaci\u00f3n del Okeanos Explorer. Oficina de Exploraci\u00f3n e Investigaci\u00f3n Oce\u00e1nica de la NOAA, Golfo de M\u00e9xico 2017<\/p>\n

En particular, aproximadamente el 90 % del genoma presentaba secuencias repetitivas, una proporci\u00f3n mucho mayor que la observada crust\u00e1ceos (que son t\u00edpicamente menos del 60 por ciento de secuencias repetitivas). Los autores especulan que la proliferaci\u00f3n repetida podr\u00eda ser la principal fuerza impulsora de la expansi\u00f3n del genoma de B. jamesi<\/em>, y que los elementos transponibles, que representan la gran mayor\u00eda de las secuencias repetitivas, probablemente tengan un profundo impacto en la plasticidad de todo el genoma.<\/p>\n

Consulte Adaptaci\u00f3n con un poco de ayuda de Jumping Genes<\/h3>\n

Los investigadores tambi\u00e9n detectaron la expansi\u00f3n de numerosas familias de genes, incluidas algunas asociadas con la se\u00f1alizaci\u00f3n de la tiroides y la insulina, que est\u00e1n vinculadas a la regulaci\u00f3n del crecimiento y al metabolismo de los l\u00edpidos. La expansi\u00f3n de estas familias de genes puede reflejar la evoluci\u00f3n adaptativa de B. jamesi<\/em> al entorno de las profundidades marinas, escriben.<\/p>\n

Los an\u00e1lisis realizados son solo el comienzo, los autores concluyen que los datos informados servir\u00e1n como un recurso valioso para comprender la evoluci\u00f3n del tama\u00f1o corporal y los mecanismos de adaptaci\u00f3n de organismos macrobent\u00f3nicos a ambientes de aguas profundas y proporcionan herramientas poderosas para estudios m\u00e1s amplios sobre la ecolog\u00eda, la biolog\u00eda evolutiva y la conservaci\u00f3n biol\u00f3gica de los is\u00f3podos.<\/p>\n

Subcampeones:<\/h2>\n

Platanthera<\/em> orqu\u00eddeas<\/h3>\n

Las plantas micoheter\u00f3trofas, a veces denominadas trampas de micorrizas, roban su sustento de los hongos, lo que les permite reducir o eliminar la fotos\u00edntesis por completo. Para dilucidar c\u00f3mo evolucion\u00f3 esta relaci\u00f3n parasitaria, los investigadores generaron ensamblajes de genomas de alta calidad para especies hermanas de orqu\u00eddeas: Platanthera zijinensis<\/em>, que es parcialmente micoheterotr\u00edfica, y P. guangdongensis<\/em>, que es totalmente micoheter\u00f3trofa. Los an\u00e1lisis de los datos publicados el 21 de abril en Nature Plants<\/em> sugieren que la micoheterotrofia est\u00e1 asociada con mayores tasas de sustituci\u00f3n en todo el genoma y numerosas p\u00e9rdidas de genes, incluidos muchos genes fotorreceptores. Combinados, los hallazgos sugieren que la evoluci\u00f3n de la micoheterotrofia completa en las orqu\u00eddeas puede ser una adaptaci\u00f3n para ocupar nichos biol\u00f3gicos espec\u00edficos sin luz, escriben los autores.<\/p>\n

Helecho arb\u00f3reo mono ara\u00f1a volador (Alsophila spinulosa<\/em>)<\/h3>\n

A pesar de ser el grupo m\u00e1s especioso de plantas terrestres sin flores, existen recursos gen\u00f3micos insignificantes para los helechos. Un ensamblaje a nivel cromos\u00f3mico del genoma de 6,23 Gb del helecho arb\u00f3reo mono ara\u00f1a volador, publicado el 9 de mayo en Nature Plants<\/em>, es solo el tercer genoma de helecho secuenciado hasta la fecha, y el primero para el orden Cyatheales. (helechos arborescentes). Los investigadores detr\u00e1s de la secuencia escriben que proporciona una referencia \u00fanica para inferir la historia de la diversidad gen\u00e9tica, la bios\u00edntesis de metabolitos secundarios y la evoluci\u00f3n de los helechos arborescentes para una mejor protecci\u00f3n y aplicaci\u00f3n de los helechos arborescentes en el futuro. De hecho, gracias a las comparaciones gen\u00f3micas con otras plantas, el equipo pudo sondear la historia evolutiva de las plantas, que puede haber incluido dos cuellos de botella gen\u00e9ticos, y comenzar a investigar c\u00f3mo construye los tejidos vasculares que sustentan su fisiolog\u00eda arborescente.<\/p>\n

Genome Spotlight es una columna mensual para <\/em>The Scientists Genetics & Bolet\u00edn de gen\u00f3mica que destaca las secuencias del genoma publicadas recientemente y los misterios de la vida que pueden revelar. <\/em><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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