ARRIBA: Un abul\u00f3n negro cerca de Marina, California INATURALIST.COM, ALLISONJGONG <\/p>\n
Abul\u00f3n negro (Haliotis cracherodii<\/em>) fueron una vez abundante en los h\u00e1bitats submareales de California, proporcionando prote\u00ednas y conchas lustrosas a los pueblos ind\u00edgenas que vivieron junto a ellos durante milenios. Las pesquer\u00edas comerciales de los EE. UU. se centraron inicialmente en los parientes de los moluscos herb\u00edvoros, pero luego de la disminuci\u00f3n de esos moluscos impulsada por la sobreexplotaci\u00f3n, en 1968 comenz\u00f3 una pesquer\u00eda comercial a gran escala para el abul\u00f3n negro, que a principios de la d\u00e9cada de 1970 estaba extrayendo cientos de toneladas m\u00e9tricas de los animales de la costa cada a\u00f1o. Luego, en las d\u00e9cadas de 1980 y 1990, cuando el abul\u00f3n negro ya estaba en declive, una devastadora enfermedad microbiana conocida como s\u00edndrome de marchitamiento mat\u00f3 a millones de ellos, acabando con m\u00e1s del 80 por ciento de la poblaci\u00f3n total. Esto llev\u00f3 a la Uni\u00f3n Internacional para la Conservaci\u00f3n de la Naturaleza (UICN) a designar a la especie como en peligro cr\u00edtico de extinci\u00f3n y desencaden\u00f3 una serie de protecciones federales.<\/p>\n En 2020, el Servicio Nacional de Pesca Marina de EE. UU. identific\u00f3 ocho acciones importantes necesarias para conservar y restaurar los animales, incluida la evaluaci\u00f3n de la estructura gen\u00e9tica y la diversidad de las poblaciones silvestres. Si bien se publicaron algunos estudios gen\u00e9ticos sobre el abul\u00f3n negro, la ausencia de recursos gen\u00f3micos obstaculiz\u00f3 una comprensi\u00f3n m\u00e1s profunda de la biolog\u00eda y la ecolog\u00eda de los animales. Por lo tanto, para ayudar en este trabajo y proporcionar nuevos conocimientos sobre estos caracoles en peligro cr\u00edtico de extinci\u00f3n, investigadores de la Universidad de California, Santa Cruz, construyeron un genoma de calidad de referencia para la especie.<\/p>\n La secuencia de 1,18 Gb, publicada el 14 de mayo en Journal of Heredity<\/em>, se ensambl\u00f3 usando una combinaci\u00f3n de lecturas largas Pacific Bio HiFi y cromatina Omni-C captura (que entrecruza el ADN antes de la secuenciaci\u00f3n para obtener informaci\u00f3n gen\u00f3mica 3D). Usando un conjunto de genes de referencia para los metazoos, los investigadores estiman que el genoma est\u00e1 completo en un 97,4 por ciento; con un conjunto de genes espec\u00edficos de moluscos, se estima que est\u00e1 completo en un 86 por ciento.<\/p>\n El abul\u00f3n negro alguna vez abund\u00f3 a lo largo de la costa de California, donde sus actividades de pastoreo desempe\u00f1aron un papel esencial en el ecosistema submareal. INATURALIST.COM, HKIBA<\/p>\n El genoma se suma a los cuatro genomas publicados anteriormente de otras especies de Haliotis<\/em> y es el primero de un abul\u00f3n en peligro cr\u00edtico, se\u00f1alan los autores, de hecho, de las bases de datos del NCBI m\u00e1s de 3200 animales genomas, se\u00f1alan que solo 75 provienen de moluscos a pesar de que Mollusca es el segundo filo animal m\u00e1s grande.<\/p>\n El genoma de referencia del abul\u00f3n negro ser\u00e1 un recurso esencial para comprender la historia evolutiva de esta especie, as\u00ed como para explorar sus niveles actuales de diversidad gen\u00e9tica y el establecimiento de planes futuros de gesti\u00f3n y restauraci\u00f3n, escribe el equipo en el art\u00edculo, y agrega que la secuencia deber\u00eda permitir a los cient\u00edficos responder preguntas clave sobre los animales, como si existen variaciones gen\u00f3micas asociadas con la resistencia o la susceptibilidad al marchitamiento. s\u00edndrome y si su estructura poblacional indica barreras ecol\u00f3gicas a la dispersi\u00f3n y asentamiento que necesitan ser superadas con acciones de manejo.<\/p>\n Algunas estimaciones sugieren que el ave marina m\u00e1s amenazada de Europa, la pardela balear, se extinguir\u00e1 en el pr\u00f3ximo medio siglo si los esfuerzos de conservaci\u00f3n no pueden revertir las fuertes disminuciones anuales de su poblaci\u00f3n. Los investigadores esperan que los esfuerzos de restauraci\u00f3n se vean favorecidos por un genoma de referencia de alta calidad (estimado en un 95,9 % completo) para la especie, publicado el 7 de mayo en Genome Biology and Evolution<\/em>. El equipo us\u00f3 la secuencia para reconstruir la historia demogr\u00e1fica de la especie, que incluye una fuerte ca\u00edda en el tama\u00f1o de la poblaci\u00f3n hace aproximadamente 150.000 a\u00f1os, coincidiendo con un per\u00edodo de niveles del mar muy bajos. Las futuras investigaciones en curso, utilizando un enfoque de gen\u00f3mica de poblaci\u00f3n m\u00e1s potente, permitir\u00e1n la reconstrucci\u00f3n de historias demogr\u00e1ficas m\u00e1s recientes de la especie y probar las hip\u00f3tesis basadas en f\u00f3siles de una p\u00e9rdida reciente de poblaci\u00f3n debido a la colonizaci\u00f3n humana de la isla, escriben los autores. <\/p>\n La avena cultivada ha sido un cereal b\u00e1sico en todo el mundo durante siglos, por lo que ha habido mucho inter\u00e9s en desarrollar gen\u00f3mica recursos para la especie. Desafortunadamente, el complejo genoma de las plantas contiene m\u00e1s de 80.000 genes, muchos m\u00e1s de los que tienen los humanos, dando dolores de cabeza a los genetistas. Finalmente, sin embargo, los investigadores publicaron un ensamblaje a escala cromos\u00f3mica bien anotado en Nature<\/em> el 18 de mayo. Los an\u00e1lisis que utilizaron el ensamblaje revelaron reorganizaciones gen\u00f3micas pasadas a gran escala que subyacen a la reproducci\u00f3n alterada entre cultivares. Gracias a la secuencia, las estrategias modernas de mejoramiento, como la edici\u00f3n del genoma y la pir\u00e1mide de genes, ahora se pueden aplicar m\u00e1s f\u00e1cilmente en la avena para desarrollar variedades que satisfagan la creciente demanda mundial de productos derivados de la avena, escriben los autores. En resumen, concluyen que este genoma de referencia de avena hexaploide completamente anotado sienta las bases para los avances en la mejora de la avena y la biolog\u00eda b\u00e1sica de la avena y para el proyecto pangenoma en curso. <\/p>\n Genome Spotlight<\/em> es una columna mensual para<\/em> The Scientists <\/em>Genetics & Genomics<\/em> bolet\u00edn informativo que destaca secuencias gen\u00f3micas publicadas recientemente y los misterios de la vida que pueden revelar. <\/em><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" ARRIBA: Un abul\u00f3n negro cerca de Marina, California INATURALIST.COM, ALLISONJGONG Abul\u00f3n negro (Haliotis cracherodii) fueron una vez abundante en los h\u00e1bitats submareales de California, proporcionando prote\u00ednas y conchas lustrosas a los pueblos ind\u00edgenas que vivieron junto a ellos durante milenios. Las pesquer\u00edas comerciales de los EE. 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Subcampeones :<\/h2>\n
Pardela balear (Puffinus mauretanicus<\/em>)<\/h3>\n
Avena cultivada (Avena sativa<\/em>)<\/h3>\n