ARRIBA: ISTOCK.COM, KATIV <\/p>\n
Dos de los an\u00e1lisis m\u00e1s grandes de secuencias de ADN de personas con autismo han descubierto genes relacionados con la afecci\u00f3n a trav\u00e9s de una gama de tipos de variantes. El trabajo, publicado hoy en dos estudios en Nature Genetics<\/em>, proporciona una imagen m\u00e1s completa de la arquitectura gen\u00e9tica de las condiciones y sugiere c\u00f3mo puede diferir de la de otras condiciones del neurodesarrollo.<\/p>\n Los cient\u00edficos suelen buscar variantes de novo en secuencias para detectar genes vinculados al autismo. Un enfoque que ha producido aproximadamente 100 genes. Pero las alteraciones en estos genes tienden a tener efectos globales en la cognici\u00f3n y la funci\u00f3n cerebral, y las personas que los portan a menudo representan solo una parte del espectro del autismo.<\/p>\n Creo que hemos estado sesgados en cuanto a los genes que hemos identificado, dice Wendy Chung, profesora de pediatr\u00eda y medicina en la Universidad de Columbia, quien codirigi\u00f3 uno de los estudios. Para comprender mejor la biolog\u00eda subyacente a la funci\u00f3n cerebral, el comportamiento y el autismo, los investigadores deben observar la variaci\u00f3n gen\u00e9tica en todo el espectro, dice.<\/p>\n Adem\u00e1s de las variantes de novo, existen otros tipos, como las variantes heredadas y las grandes duplicaciones o deleciones. de ADN conocidas como variantes del n\u00famero de copias (CNV) pueden contribuir al autismo. Pero los tama\u00f1os de muestra insuficientes han limitado la capacidad de los investigadores para detectar genes fuertemente ligados a la condici\u00f3n a trav\u00e9s de este tipo de alteraciones.<\/p>\n Los dos nuevos estudios provienen de colaboraciones internacionales que han acumulado una gran cantidad de datos gen\u00e9ticos. Un an\u00e1lisis considera tanto las variantes de novo como las heredadas para descubrir cinco nuevos genes vinculados al autismo, cuatro de los cuales est\u00e1n vinculados a una menor probabilidad de deterioro cognitivo que cinco genes vinculados al autismo bien establecidos. El otro estudio integra datos sobre cambios de una sola letra en el ADN, peque\u00f1as inserciones o deleciones llamadas indels y CNV para detectar 373 genes relacionados con el autismo y otras afecciones del neurodesarrollo, as\u00ed como 36 genes que muestran una mayor variaci\u00f3n en el autismo.<\/p>\n Juntos, los estudios ampl\u00edan la lista de genes ampliamente relacionados con el neurodesarrollo, que los investigadores pueden usar para desarrollar trabajos anteriores que tienen como objetivo descubrir c\u00f3mo los genes se relacionan con condiciones o rasgos espec\u00edficos, dice Varun Warrier, investigador postdoctoral en Simon Baron-Cohens. laboratorio de la Universidad de Cambridge en el Reino Unido, que no particip\u00f3 en la investigaci\u00f3n.<\/p>\n No sabemos muy bien con qu\u00e9 est\u00e1n realmente asociados estos genes, dice Warrier, pero el trabajo apunta hacia diferencias que pueden ayudar Los investigadores desentra\u00f1an la heterogeneidad entre las condiciones del neurodesarrollo.<\/p>\n Chung y sus colegas analizaron las secuencias gen\u00e9ticas de m\u00e1s de 42\u00a0607 personas con autismo y 79\u00a0670 de sus padres y hermanos. El equipo se bas\u00f3 en datos publicados anteriormente de tres proyectos: el Consorcio de Secuenciaci\u00f3n del Autismo, MSSNG y la Colecci\u00f3n Simons Simplex, as\u00ed como nuevas secuencias de 35.130 personas recopiladas a trav\u00e9s de un registro en l\u00ednea llamado SPARK. (Al igual que Spectrum<\/em>, Simons Simplex Collection y SPARK est\u00e1n financiados por la Iniciativa de Investigaci\u00f3n del Autismo de la Fundaci\u00f3n Simons, donde Chung tambi\u00e9n es director de investigaci\u00f3n cl\u00ednica).<\/p>\n Los investigadores utilizaron dos -Aproximaci\u00f3n por etapas: Primero se buscaron genes enriquecidos con alteraciones de novo. Tambi\u00e9n definieron 25 conjuntos de genes basados en evidencia gen\u00e9tica o funcional existente relevante para el autismo, como genes expresados en neuronas o aquellos predichos por herramientas de aprendizaje autom\u00e1tico que est\u00e1n vinculados a la condici\u00f3n. Luego identificaron genes que albergan variantes que las personas autistas heredan con m\u00e1s frecuencia de lo esperado por casualidad dentro de conjuntos de genes que est\u00e1n enriquecidos con variantes raras heredadas con p\u00e9rdida de funci\u00f3n.<\/p>\n En general, el autismo mostr\u00f3 v\u00ednculos con variantes de novo en 159 genes y variantes raras heredadas en otros 260 genes. Los genes conocidos relacionados con el autismo y el neurodesarrollo representan alrededor del 70 % de las probabilidades de autismo atribuidas a variantes de novo, encontr\u00f3 el equipo, mientras que estos genes explican menos del 20 % de la probabilidad conferida por variantes hereditarias raras.<\/p>\n Eso significa que es muy valioso identificar nuevos genes de riesgo a trav\u00e9s de variantes raras heredadas, dice Yufeng Shen, profesor asociado de biolog\u00eda de sistemas en la Universidad de Columbia, quien codirigi\u00f3 el trabajo.<\/p>\n Otra ronda de estudios estad\u00edsticos Las pruebas incorporaron 8,116 muestras adicionales de ni\u00f1os autistas y sus padres, nuevamente en busca de genes enriquecidos con variantes de novo o que albergan alteraciones que se heredan en exceso en el autismo entre 367 genes en cromosomas no sexuales. El an\u00e1lisis tambi\u00e9n compar\u00f3 las tasas de variantes de p\u00e9rdida de funci\u00f3n en 15\u00a0780 personas autistas y 236\u00a0000 controles de la poblaci\u00f3n.<\/p>\n El enfoque descubri\u00f3 60 genes fuertemente relacionados con el autismo, incluidos 5 nuevos: ITSN1<\/em>, SCAF1<\/em>, HNRNPUL2<\/em>, MARK2<\/em> y NAV3<\/em>. Los tres primeros genes de esta lista est\u00e1n vinculados al autismo a trav\u00e9s de m\u00faltiples tipos de variantes. NAV3<\/em>, sin embargo, est\u00e1 relacionado principalmente con la afecci\u00f3n a trav\u00e9s de variantes hereditarias raras, informan los investigadores.<\/p>\n Todos los genes nuevos, excepto MARK2 <\/em>, tienen una modesta efectos, encontraron los investigadores, y las personas autistas que portan variantes en ellos tienen menos probabilidades de tener deterioro cognitivo que las personas que albergan variantes en un conjunto de comparaci\u00f3n de cinco genes vinculados al autismo bien establecidos: CHD8<\/em>, SCN2A<\/em>, ADNP<\/em>, FOXP1<\/em> <\/em>y SHANK3<\/em>. Los genes con efectos modestos pueden estar m\u00e1s estrechamente relacionados con los rasgos centrales del autismo que con el desarrollo del cerebro, dicen los investigadores.<\/p>\n Aunque evaluar la cognici\u00f3n en personas con autismo puede ser un desaf\u00edo, el estudio es un paso para reflejar mejor la condiciona la complejidad, dice Thomas Bourgeron, profesor de gen\u00e9tica en el Instituto Pasteur de Par\u00eds, Francia, que no particip\u00f3 en la investigaci\u00f3n. Tener en cuenta el deterioro cognitivo proporciona m\u00e1s matices que simplemente comparar a las personas autistas con los controles. Es un poco m\u00e1s preciso, dice.<\/p>\n En el otro estudio, un equipo codirigido por Michael Talkowski, director del Centro de Medicina Gen\u00f3mica del Hospital General de Massachusetts en Boston, busc\u00f3 cambios de una sola letra en ADN y para indeles en secuencias de exoma de 63\u00a0237 personas, 20\u00a0627 de las cuales tienen autismo.<\/p>\n Tambi\u00e9n utilizaron un m\u00e9todo desarrollado hace varios a\u00f1os para detectar CNV en los datos de exoma extra\u00eddos de una variedad de repositorios, incluido el Autismo Sequencing Consortium, Simons Simplex Collection, iPSYCH y SPARK y calibraron el enfoque utilizando secuencias de genoma completo de 7165 personas.<\/p>\n En total, ese m\u00e9todo arroj\u00f3 17 774 CNV raras, heredadas y 662 de novo que abarcan tres o m\u00e1s exones . El equipo utiliz\u00f3 un marco estad\u00edstico llamado TADA para combinar la informaci\u00f3n sobre los CNV, los indeles y los cambios de ADN de una sola letra con una puntuaci\u00f3n que mide la tolerancia de los genes a las variantes que alteran su funci\u00f3n. Ese proceso revel\u00f3 72 genes asociados con el autismo, un aumento significativo con respecto a un estudio anterior que encontr\u00f3 32 genes vinculados a la afecci\u00f3n con el mismo nivel de significaci\u00f3n estad\u00edstica, informaron los investigadores.<\/p>\n Otro an\u00e1lisis que combin\u00f3 secuencias de personas con autismo y 91.605 personas del estudio Descifrando trastornos del desarrollo 31.058 de los cuales tienen una condici\u00f3n de desarrollo detect\u00f3 373 genes relacionados con el neurodesarrollo. Los genes identificados entre las personas con autismo y entre aquellos con otras condiciones de desarrollo se superpusieron, con 70 a 90 por ciento de los genes destacados en ambos grupos.<\/p>\n Evaluar la variaci\u00f3n entre 464 genes asociados con cualquiera de las condiciones a trav\u00e9s de mutaciones de novo que probablemente afectan La funci\u00f3n gen\u00e9tica revel\u00f3 36 genes que albergan m\u00e1s variaci\u00f3n entre las personas con autismo que en las personas con otras condiciones de desarrollo. Otros 82 genes se alteran m\u00e1s com\u00fanmente en personas con condiciones de desarrollo.<\/p>\n Estos resultados brindan una idea de algunos de los genes que podr\u00edan contribuir al autismo en comparaci\u00f3n con otras condiciones de desarrollo, dice Talkowski. La expresi\u00f3n de genes vinculados a otras condiciones de desarrollo se enriquece en los primeros tipos de c\u00e9lulas del neurodesarrollo, seg\u00fan un an\u00e1lisis de los datos de expresi\u00f3n g\u00e9nica de una sola c\u00e9lula del cerebro en desarrollo. Los genes predominantemente asociados con el autismo, por el contrario, se expresan en gran medida en las neuronas en maduraci\u00f3n.<\/p>\n Los hallazgos son interesantes, dice Warrier, pero los ni\u00f1os con otras afecciones del desarrollo pueden tener autismo no diagnosticado o coexistente, y viceversa. Estos no son compartimentos estancos, dice, y una mejor caracterizaci\u00f3n de las personas en cada grupo puede ayudar a vincular los genes con rasgos distintos, lo cual es un desaf\u00edo continuo en el campo.<\/p>\n Talkowski tambi\u00e9n se\u00f1ala que las dos condiciones son dif\u00edcil de desenredar. Los genes que est\u00e1n vinculados al autismo frente a otras condiciones del neurodesarrollo pueden cambiar a medida que contin\u00faa la investigaci\u00f3n, dice. No obstante, a medida que haya m\u00e1s datos disponibles, el estudio proporciona un marco para comprender mejor c\u00f3mo los genes y las clases de variantes contribuyen a diversas condiciones y rasgos del neurodesarrollo.<\/p>\n Este art\u00edculo se public\u00f3 originalmente en<\/em> Spectrum , el sitio l\u00edder en noticias de investigaci\u00f3n sobre el autismo.<\/em><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" ARRIBA: ISTOCK.COM, KATIV Dos de los an\u00e1lisis m\u00e1s grandes de secuencias de ADN de personas con autismo han descubierto genes relacionados con la afecci\u00f3n a trav\u00e9s de una gama de tipos de variantes. 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