ARRIBA: Tejido de pr\u00f3stata canceroso INSTITUTO NACIONAL DEL C\u00c1NCER, OTIS BRAWLEY <\/p>\n
En un estudio publicado el 10 de agosto en Nature<\/em>, los cient\u00edficos han trazado el paisaje gen\u00e9tico a trav\u00e9s de una pr\u00f3stata humana en alta resoluci\u00f3n y han descubierto c\u00f3mo los fragmentos de cromosomas adicionales o faltantes, conocidos como variaciones del n\u00famero de copias, que se cree que son exclusivos del c\u00e1ncer, a menudo est\u00e1n presentes en tejido aparentemente sano.<\/p>\n Esto fue sorprendente y completamente inesperado, dice el coautor del estudio Alastair Lamb, ur\u00f3logo del Departamento Nuffield de Ciencias Quir\u00fargicas de la Universidad de Oxford. Pensamos que este tipo de cambios defin\u00edan el c\u00e1ncer de pr\u00f3stata. Pero est\u00e1n presentes en [tejido] que es completamente benigno.<\/p>\n Lejos de ser una masa uniforme de c\u00e9lulas, los tumores consisten en un mosaico de tejidos malignos, benignos y sanos. Comprender c\u00f3mo las c\u00e9lulas normales se vuelven cancerosas requiere que los cient\u00edficos tracen los cambios gen\u00e9ticos dentro de este complejo ecosistema. En colaboraci\u00f3n con el investigador de tecnolog\u00eda gen\u00e9tica Joakim Lundeberg y colegas del KTH Royal Institute of Technology en Suecia, el equipo de Lambs utiliz\u00f3 una t\u00e9cnica llamada transcript\u00f3mica espacial para mapear las variaciones del n\u00famero de copias en ubicaciones precisas dentro de la pr\u00f3stata.<\/p>\n A diferencia de m\u00e9todos como la secuenciaci\u00f3n masiva de ADN, donde las c\u00e9lulas se separan y se pierde cualquier informaci\u00f3n sobre su ubicaci\u00f3n f\u00edsica, la transcript\u00f3mica espacial preserva la estructura 3D de las muestras al etiquetar gen\u00e9ticamente las mol\u00e9culas de ARN con datos de ubicaci\u00f3n antes de secuenciarlas, lo que permite que cada secuencia coincida con su original ubicaci\u00f3n dentro del \u00f3rgano. <\/p>\n Una pr\u00f3stata completa, extirpada de un paciente con c\u00e1ncer mediante prostatectom\u00eda, se cort\u00f3 horizontalmente en secciones de tejido y luego se dividi\u00f3 en bloques. El ARNm de bloques individuales se captur\u00f3 utilizando sondas codificadas espacialmente y se secuenci\u00f3. Esto permiti\u00f3 a los investigadores ver si las variaciones del n\u00famero de copias inferidas en el ADN (inferCNV) o los perfiles de expresi\u00f3n g\u00e9nica (transcript\u00f3mica) se mapean en \u00e1reas identificadas como cancerosas bajo el microscopio (patolog\u00eda de consenso). DE la Figura 1A Naturaleza<\/em> , <\/em>608:36067, 2022; CC BY 4.0<\/p>\n Esto implica colocar una secci\u00f3n de tejido en una superficie de vidrio que contiene una cuadr\u00edcula de puntos, cada uno de los cuales ancla cadenas cortas de nucle\u00f3tidos que contienen un c\u00f3digo de barras espacial y una cadena de residuos de timina que se unen al ARNm mol\u00e9culas. La muestra de tejido se permeabiliza justo antes de colocarla sobre el vidrio para que el ARNm se derrame fuera de las c\u00e9lulas, permiti\u00e9ndole adherirse a la rejilla, marcando as\u00ed cada mol\u00e9cula con su ubicaci\u00f3n dentro del tejido.<\/p>\n En el estudio, los investigadores quer\u00edan crear un mapa de variaciones en el n\u00famero de copias dentro de una pr\u00f3stata que se hab\u00eda extirpado quir\u00fargicamente de un paciente anciano, por lo que rastrearon secciones transversales de tejido en busca de transcripciones utilizando una cuadr\u00edcula que conten\u00eda 30,000 puntos. Cada punto, correspondiente a un \u00e1rea de solo diez c\u00e9lulas, captur\u00f3 alrededor de 3500 mol\u00e9culas de ARNm liberadas de las c\u00e9lulas m\u00e1s cercanas, lo que permiti\u00f3 al equipo mapear la expresi\u00f3n g\u00e9nica. Luego, utilizando un enfoque computacional, el equipo us\u00f3 el ARN que secuenciaron para predecir las variaciones del n\u00famero de copias en el ADN de las c\u00e9lulas e identific\u00f3 grupos de c\u00e9lulas o clones gen\u00e9ticamente id\u00e9nticos. Luego ensamblaron los clones en una jerarqu\u00eda filogen\u00e9tica para trazar c\u00f3mo la composici\u00f3n gen\u00e9tica de las c\u00e9lulas hab\u00eda cambiado con el tiempo. <\/p>\n Mientras tanto, el equipo visualiz\u00f3 el tejido intacto bajo un microscopio para anotar regiones de tejido canceroso y benigno seg\u00fan sobre morfolog\u00eda. La combinaci\u00f3n de los datos de im\u00e1genes con los perfiles gen\u00e9ticos espaciales revel\u00f3 una sorprendente cantidad de heterogeneidad dentro de un solo tumor, dice Lamb, con c\u00e9lulas tumorales de bajo grado (aquellas que se parecen m\u00e1s a las c\u00e9lulas sanas) ubicadas entre tumores de alto grado sanos y m\u00e1s avanzados. c\u00e9lulas. Como era de esperar, las c\u00e9lulas cancerosas conten\u00edan variaciones en el n\u00famero de copias en oncogenes como MYC<\/em> <\/em> y el gen supresor de tumores PTEN<\/em>. Sorprendentemente, sin embargo, los mismos cambios ocurrieron en el tejido sano cercano.<\/p>\n Las c\u00e9lulas con las caracter\u00edsticas gen\u00e9ticas del c\u00e1ncer de pr\u00f3stata abarcan los l\u00edmites patol\u00f3gicos: cada punto, que corresponde a una regi\u00f3n de solo diez c\u00e9lulas, se marc\u00f3 individualmente como benigno (azul), c\u00e1ncer de pr\u00f3stata precursor (verde), de bajo grado (rojo) o de alto grado (rojo oscuro) (izquierda). Las mismas regiones tambi\u00e9n se agruparon seg\u00fan su perfil gen\u00e9tico, y cada color representa grupos de c\u00e9lulas gen\u00e9ticamente id\u00e9nticas (derecha). Figuras 3C,D Naturaleza<\/em>, <\/em>608:36067, 2022; CC BY 4.0<\/p>\n Lo que es tan fant\u00e1stico aqu\u00ed es la instant\u00e1nea bidimensional. Vemos los eventos muy tempranos, los eventos intermedios y que el tumor se ha separado, dice Lundeberg. \u00c9l contrasta la t\u00e9cnica con el muestreo histol\u00f3gico, en el que un pat\u00f3logo identifica un tumor bajo el microscopio y lo disecciona usando un l\u00e1ser. Esto puede proporcionar una visi\u00f3n detallada del tumor, pero ignora el entorno celular que lo rodea, dice Lundeberg. Pero con la transcript\u00f3mica espacial, captura los eventos tempranos que no son evidentes cuando se mira bajo el microscopio.<\/p>\n Este tipo de enfoque de \u00f3rgano completo para la gen\u00e9tica del c\u00e1ncer es algo que Elana Fertig, investigadora del c\u00e1ncer en la Universidad Johns Hopkins. que no particip\u00f3 en el estudio, est\u00e1 particularmente entusiasmado. Creo que es incre\u00edble y eso es algo que necesitamos hacer cada vez m\u00e1s. Queremos asegurarnos de que no falten los marcadores moleculares de recurrencia que podr\u00edan no estar en la lesi\u00f3n predominante, dice.<\/p>\n Para investigar si ocurren patrones similares en otros tipos de c\u00e1ncer, Lundeberg y sus colegas repitieron el procedimiento usando secciones de tejido de c\u00e1ncer de piel, c\u00e1ncer de mama y glioblastoma. Como antes, encontraron alteraciones cromos\u00f3micas tanto en las c\u00e9lulas tumorales como en el tejido sano cercano.<\/p>\n Estos hallazgos sugieren que las variaciones en el n\u00famero de copias ocurren antes, no despu\u00e9s, de que las c\u00e9lulas benignas se transformen en tejido maligno, dice Francesca Ciccarelli, genetista del c\u00e1ncer. en Kings College London que no particip\u00f3 en el estudio. Las mismas observaciones de que las c\u00e9lulas aparentemente normales tienen [variaciones en el n\u00famero de copias] asociadas a tumores implican que no son suficientes para la transformaci\u00f3n, escribe en un correo electr\u00f3nico a The Scientist<\/em>.<\/p>\n Esto plantea la pregunta de qu\u00e9 eventos gen\u00e9ticos, si no estas variaciones en el n\u00famero de copias, impulsan la tumorig\u00e9nesis. Los cambios en el ADN no investigados en el estudio, como las modificaciones epigen\u00e9ticas, pueden desempe\u00f1ar un papel importante, sugiere Lamb. Tambi\u00e9n existe la posibilidad de se\u00f1alizaci\u00f3n [qu\u00edmica] entre los clones de c\u00e1ncer y el tejido del estroma circundante, a\u00f1ade. de tejido benigno puede dar lugar a un c\u00e1ncer letal, con implicaciones importantes para el diagn\u00f3stico precoz y la terapia dirigida. Eso es tan, tan poderoso, dice Lundeberg.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" ARRIBA: Tejido de pr\u00f3stata canceroso INSTITUTO NACIONAL DEL C\u00c1NCER, OTIS BRAWLEY En un estudio publicado el 10 de agosto en Nature, los cient\u00edficos han trazado el paisaje gen\u00e9tico a trav\u00e9s de una pr\u00f3stata humana en alta resoluci\u00f3n y han descubierto c\u00f3mo los fragmentos de cromosomas adicionales o faltantes, conocidos como variaciones del n\u00famero de copias, … Continuar leyendo \u00abMapa gen\u00e9tico 2D de las c\u00e9lulas de la pr\u00f3stata traza el crecimiento del c\u00e1ncer\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-37951","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/37951","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=37951"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/37951\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=37951"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=37951"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=37951"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}