{"id":37954,"date":"2022-09-01T08:53:14","date_gmt":"2022-09-01T13:53:14","guid":{"rendered":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/genoma-destacado-ediths-checkerspot-butterfly-euphydryas-editha\/"},"modified":"2022-09-01T08:53:14","modified_gmt":"2022-09-01T13:53:14","slug":"genoma-destacado-ediths-checkerspot-butterfly-euphydryas-editha","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/genoma-destacado-ediths-checkerspot-butterfly-euphydryas-editha\/","title":{"rendered":"Genoma destacado: Edith&rsquo;s Checkerspot Butterfly (Euphydryas editha)"},"content":{"rendered":"<p>ARRIBA: Una mariposa Ediths checkerspot ISTOCK.COM, KYEA MOFIRE <\/p>\n<p>Las mariposas Ediths checkerspot se encuentran en todo el oeste de Am\u00e9rica del Norte, pero no todos se ven o act\u00faan igual. Se han documentado docenas de formas espec\u00edficas de h\u00e1bitat o ecotipos de la especie, y cada uno est\u00e1 tan fuertemente adaptado a su entorno local que puede diferir notablemente de las poblaciones a solo 20 kil\u00f3metros de distancia.<\/p>\n<p>De hecho, d\u00e9cadas de laboratorio y los experimentos de campo sobre la adaptabilidad de las especies, incluido el trabajo que le vali\u00f3 al bi\u00f3logo de poblaciones de Stanford Paul Ehrlich el codiciado Premio Crafoord, indican que este peque\u00f1o lepid\u00f3ptero puede hacer cambios ecol\u00f3gicos importantes, como cambiar de especie de planta hu\u00e9sped, con notable rapidez. Esto los convierte en excelentes modelos para estudiar las consecuencias de la actividad antropog\u00e9nica, pero la falta de recursos gen\u00f3micos ha dificultado ese trabajo. Un genoma de alta calidad para la especie, ensamblado recientemente y publicado el 25 de julio en <em>Genome Biology and Evolution<\/em>, probablemente cambiar\u00e1 eso.<\/p>\n<p>Para construir el genoma de 0,6 Gb de la mariposa, el equipo emple\u00f3 la secuenciaci\u00f3n de lectura larga Oxford Nanopore junto con la captura de cromosomas Hi-C y el pulido de lectura corta Illumina. Eso dio como resultado un ensamblaje altamente contiguo que contiene el 97,5 por ciento de los genes de copia \u00fanica esperados seg\u00fan una base de datos de genomas de lepid\u00f3pteros publicados anteriormente. Los an\u00e1lisis de la secuencia revelaron 23\u00a0870 genes, 20\u00a0771 de los cuales los investigadores pudieron anotar funcionalmente.<\/p>\n<p>Una mancha de ajedrez de Taylor (<em>Euphydryas editha taylori<\/em>), una de las subespecies en peligro de extinci\u00f3n de <em>E. editha<\/em> ISTOCK.COM, JEFFGOULDEN<\/p>\n<p>Esta informaci\u00f3n finalmente permitir\u00e1 a los cient\u00edficos probar la base gen\u00e9tica de la versatilidad y adaptabilidad de esta mariposa. El <em>E. El genoma, la anotaci\u00f3n y las descripciones funcionales de editha ahora llenan un vac\u00edo que faltaba para uno de los principales sistemas de modelos ecol\u00f3gicos basados en el campo en Am\u00e9rica del Norte, escriben los autores del estudio en su art\u00edculo. Tambi\u00e9n deber\u00eda ayudar a los esfuerzos de conservaci\u00f3n de las subespecies de mariposas en peligro de extinci\u00f3n y de la especie en su conjunto, que investigaciones recientes sugieren que est\u00e1 en peligro debido al cambio clim\u00e1tico.<\/p>\n<h2>Finalistas:<\/h2>\n<h3>Nothothen calvo ( <em>Trematomus borchgrevinki<\/em>)<\/h3>\n<p>El notothen calvo no es un pez particularmente carism\u00e1tico. Y como una peque\u00f1a especie ant\u00e1rtica que generalmente se encuentra al acecho bajo el hielo, tampoco es buscada por los pescadores. Esta relativa oscuridad significaba que hab\u00eda una escasez de informaci\u00f3n gen\u00e9tica disponible para la especie y sus parientes cercanos y, por lo tanto, era un gran tema de prueba para comparar los m\u00e9todos de ensamblaje del genoma de novo. Entonces, para un art\u00edculo del 29 de julio en <em>G3 GenesGenomesGenetics<\/em>, los investigadores ensamblaron el genoma del pez usando tres t\u00e1cticas: puramente con lecturas cortas, con una combinaci\u00f3n de lecturas cortas y largas, y puramente con lecturas largas. Y si bien identificaron fuentes clave de error en los tres enfoques, el ensamblaje contig de lectura larga es la mejor opci\u00f3n actual, escriben los autores, ya que la calidad del ensamblaje resultante no tuvo comparaci\u00f3n con la de los otros m\u00e9todos.<\/p>\n<h3>Krait de muchas bandas (<em>Bungarus multicinctus<\/em>)<\/h3>\n<p>La krait de muchas bandas es una de las serpientes m\u00e1s venenosas de Asia, y es famosa por causar la muerte del amado curador de la Academia de Ciencias de California y el herpet\u00f3logo Joe Slowinski. En China, la serpiente es responsable de casi 1 de cada 10 mordeduras venenosas y tiene la tasa de letalidad m\u00e1s alta, matando hasta un tercio de las veces. Desarrollar mejores tratamientos requiere un conocimiento profundo del repertorio de toxinas de los animales, raz\u00f3n por la cual los investigadores de la Academia de Ciencias de China generaron un genoma de referencia de alta calidad para la especie. La asamblea, publicada el 12 de julio en <em>Cell Reports<\/em>, revel\u00f3 que la serpiente tiene un impresionante repertorio de 118 genes de toxinas de 17 familias. Nuestro <em>B. multicinctus<\/em> el ensamblaje a escala cromos\u00f3mica y los datos transcript\u00f3micos asociados proporcionan un recurso valioso para explorar el origen y la evoluci\u00f3n de los genes del veneno, lo que permite el descubrimiento de f\u00e1rmacos impulsados por el veneno, escriben los autores.<\/p>\n<p><em>Genoma Spotlight es una columna mensual de<\/em> The Scientist<em>s Genetics &amp; Bolet\u00edn de gen\u00f3mica que destaca secuencias gen\u00f3micas publicadas recientemente y los misterios de la vida que pueden revelar.<\/em><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>ARRIBA: Una mariposa Ediths checkerspot ISTOCK.COM, KYEA MOFIRE Las mariposas Ediths checkerspot se encuentran en todo el oeste de Am\u00e9rica del Norte, pero no todos se ven o act\u00faan igual. 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