Una micrograf\u00eda electr\u00f3nica de barrido coloreada del virus SARS-CoV-2. Cr\u00e9dito: NIAID <\/p>\n
Un equipo de investigadores del Instituto Robert Koch de Berl\u00edn y el Instituto Max Planck para la Ciencia de la Historia Humana presentan un m\u00e9todo novedoso para la estimaci\u00f3n r\u00e1pida de trayectorias de incidencia a partir de genomas de SARS-CoV-2 muestreados en serie y validan utilizando m\u00e9todos filodin\u00e1micos. <\/p>\n
Los recuentos diarios de nuevos casos de COVID-19 siguen siendo una base para evaluar el estado de la pandemia y son vitales para tomar decisiones informadas sobre intervenciones p\u00fablicas. Sin embargo, estos recuentos de casos se basan en resultados positivos de pruebas de diagn\u00f3stico y, por lo tanto, dependen en gran medida de la estrategia de prueba subyacente. Pero las estrategias de prueba difieren de una regi\u00f3n a otra y han cambiado dr\u00e1sticamente con el tiempo, lo que hace que su influencia precisa en la cantidad de nuevos diagn\u00f3sticos diarios sea dif\u00edcil de predecir. Por lo tanto, se necesitan estimaciones m\u00e1s s\u00f3lidas del n\u00famero de personas reci\u00e9n infectadas para la vigilancia de la pandemia.<\/p>\n
Para estimar mejor las nuevas tasas de infecci\u00f3n, los investigadores han desarrollado y probado un nuevo m\u00e9todo computacional que infiere perfiles temporales de incidencia viral puramente de secuencias gen\u00f3micas y sus fechas de muestreo. Debido a que el genoma viral subyace a un proceso de mutaci\u00f3n constante, los cambios en su secuencia a lo largo del tiempo tambi\u00e9n rastrean su propagaci\u00f3n a trav\u00e9s de la poblaci\u00f3n.<\/p>\n
\u00abLas mutaciones que surgen en los genomas virales dejan una se\u00f1al que nos permite conectar la gen\u00e9tica diversidad con el tama\u00f1o de la poblaci\u00f3n viral y, en este caso, tambi\u00e9n la incidencia\u00bb, dice Denise Khnert, coautora del estudio.<\/p>\n
Efecto de las intervenciones no farmac\u00e9uticas<\/p>\n
Al calcular piezas- Sabias estimaciones constantes del n\u00famero reproductivo efectivo entre cambios significativos en las intervenciones no farmac\u00e9uticas, el estudio destaca los efectos potenciales de las medidas p\u00fablicas en la propagaci\u00f3n de COVID-19.<\/p>\n
Las medidas de confinamiento adoptadas por muchos pa\u00edses europeos son un ejemplo revelador. En la primavera de 2020, despu\u00e9s de la implementaci\u00f3n de estrictas medidas de confinamiento en Europa, el n\u00famero reproductivo efectivo cay\u00f3 dr\u00e1sticamente a menos de 1. Cuando se levantaron estas medidas a principios del verano de 2020 en la mayor\u00eda de los pa\u00edses, el n\u00famero reproductivo efectivo aument\u00f3 a m\u00e1s de 1 .<\/p>\n
Fases de detecci\u00f3n insuficiente de casos<\/p>\n
El equipo realiz\u00f3 amplios an\u00e1lisis filodin\u00e1micos de \u00faltima generaci\u00f3n utilizando genomas de SARS-CoV-2 de cuatro regiones diferentes (Dinamarca, Escocia, Suiza y el estado australiano de Victoria) para validar el nuevo m\u00e9todo.<\/p>\n
\u00abAl comparar nuestros resultados con los n\u00fameros de casos notificados, pudimos detectar per\u00edodos de subregistro\u00bb, dice Ariane Weber, Ph.D. estudiante del grupo de investigaci\u00f3n y coautor del estudio. \u00abEstos incluyen la primera ola de infecciones en Escocia y Victoria, as\u00ed como peque\u00f1as olas epid\u00e9micas en Europa en el verano de 2020, que no son visibles en los recuentos de casos de diagn\u00f3stico\u00bb, agrega Weber.<\/p>\n
Caso relativo detecci\u00f3n<\/p>\n
Al usar el correlato de incidencia generado por el nuevo m\u00e9todo y los datos p\u00fablicos sobre las estrategias de prueba implementadas, los investigadores tambi\u00e9n pudieron calcular las tasas de detecci\u00f3n de casos a lo largo del tiempo. Estos sugieren que un aumento en la capacidad de prueba generalmente conduce a una mayor proporci\u00f3n de casos detectados. Sorprendentemente, sin embargo, la probabilidad de detecci\u00f3n disminuye cuando se relajan los criterios para la prueba. Esto proporciona una explicaci\u00f3n potencial para la subdetecci\u00f3n observada de casos en Europa en el verano de 2020, cuando se combinaron criterios de prueba m\u00e1s flexibles con capacidades de prueba sin cambios.<\/p>\n
El estudio se publica en Nature Communications. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
Los casos de COVID-19 en los Estados Unidos pueden estar sustancialmente subestimados M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> La estimaci\u00f3n r\u00e1pida de la incidencia a partir de los genomas del SARS-CoV-2 revela una disminuci\u00f3n de la detecci\u00f3n de casos en Europa durante el verano de 2020, Nature Communications, DOI: 10.1038\/s41467-021-26267-y Informaci\u00f3n de la revista:<\/strong> Nature Communications <\/p>\n Proporcionado por Max Planck Society Cita<\/strong>: Estimaci\u00f3n de incidencia de SARS-CoV- 2 genomas (2021, 14 de octubre) recuperado el 29 de agosto de 2022 de https:\/\/medicalxpress.com\/news\/2021-10-incidence-sars-cov-genomes.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Una micrograf\u00eda electr\u00f3nica de barrido coloreada del virus SARS-CoV-2. Cr\u00e9dito: NIAID Un equipo de investigadores del Instituto Robert Koch de Berl\u00edn y el Instituto Max Planck para la Ciencia de la Historia Humana presentan un m\u00e9todo novedoso para la estimaci\u00f3n r\u00e1pida de trayectorias de incidencia a partir de genomas de SARS-CoV-2 muestreados en serie y … Continuar leyendo \u00abEstimaci\u00f3n de la incidencia a partir de los genomas del SARS-CoV-2\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-693","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/693","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=693"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/693\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=693"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=693"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=693"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}