Un equipo de investigadores de Gladstone, incluida Brbara Gonzlez Tern, que se muestra aqu\u00ed, desarroll\u00f3 un m\u00e9todo novedoso para identificar variantes gen\u00e9ticas que probablemente desempe\u00f1en un papel importante en la enfermedad card\u00edaca cong\u00e9nita , abriendo oportunidades para acelerar la investigaci\u00f3n de esta grave condici\u00f3n. Cr\u00e9dito: Michael Short\/Gladstone Institutes <\/p>\n
Casi el 1 por ciento de todos los ni\u00f1os nacen con una enfermedad card\u00edaca cong\u00e9nita, una variedad de problemas potencialmente mortales con la estructura y funci\u00f3n de sus corazones. Para la mayor\u00eda de los ni\u00f1os, se desconocen las causas precisas de estos defectos aterradores. <\/p>\n
Los culpables parecen ser versiones anormales, o variantes, de genes que est\u00e1n involucrados en la formaci\u00f3n del coraz\u00f3n en el \u00fatero. Pero a\u00fan queda mucho por aprender sobre exactamente qu\u00e9 genes contribuyen a la cardiopat\u00eda cong\u00e9nita y c\u00f3mo interact\u00faan entre s\u00ed.<\/p>\n
Ahora, seg\u00fan se informa en la revista cient\u00edfica Cell, los investigadores de Gladstone Institutes han desarrollado un m\u00e9todo novedoso para identificar variantes gen\u00e9ticas que probablemente desempe\u00f1en un papel importante en la cardiopat\u00eda cong\u00e9nita, lo que abre oportunidades para acelerar la investigaci\u00f3n de esta grave afecci\u00f3n. El estudio fue dirigido por el presidente e investigador s\u00e9nior de Gladstone, Deepak Srivastava, MD, y Katie Pollard, Ph.D., directora del Instituto Gladstone de ciencia de datos y biotecnolog\u00eda.<\/p>\n
La nueva estrategia, que combina t\u00e9cnicas de gen\u00e9tica, inform\u00e1tica La biolog\u00eda celular, la biolog\u00eda de c\u00e9lulas madre y la prote\u00f3mica tambi\u00e9n podr\u00edan aplicarse para estudiar muchas otras enfermedades con causas gen\u00e9ticas complejas.<\/p>\n
\u00abLos m\u00e9todos anteriores han generado largas listas de variantes detectadas en pacientes, pero muchas resultaron ser intrascendentes, por lo que un gran desaf\u00edo en el campo ha sido identificar qu\u00e9 variantes son las m\u00e1s importantes\u00bb, dice Srivastava, quien tambi\u00e9n es cardi\u00f3logo pedi\u00e1trico y profesor en el Departamento de Pediatr\u00eda de UC San Francisco (UCSF). \u00abNuestro enfoque identifica las variantes que tienen m\u00e1s probabilidades de estar involucradas en la enfermedad, lo que nos permite centrarnos en esas variantes, profundizar la comprensi\u00f3n de la biolog\u00eda subyacente de la enfermedad y, esperamos, avanzar m\u00e1s r\u00e1pidamente hacia nuevos tratamientos\u00bb.<\/p>\n
Aprovechando las interacciones entre prote\u00ednas<\/p>\n
En lugar de observar las variantes de forma aislada, la nueva estrategia considera las interacciones entre las prote\u00ednas para concentrarse en qu\u00e9 variantes podr\u00edan estar causando la enfermedad, en este caso, la cardiopat\u00eda cong\u00e9nita.<\/p>\n
Ya se sab\u00eda que las prote\u00ednas GATA4 y TBX5 eran necesarias para la formaci\u00f3n saludable del coraz\u00f3n humano y para colaborar con una red de prote\u00ednas adicionales para ayudar a desarrollar un coraz\u00f3n. Las mutaciones en las otras prote\u00ednas de la red podr\u00edan, en teor\u00eda, contribuir a la malformaci\u00f3n del coraz\u00f3n.<\/p>\n
Para identificar estos posibles genes culpables, los investigadores mapearon cuidadosamente toda la red de interacciones entre las prote\u00ednas GATA4 y TBX5 utilizando precursores c\u00e9lulas card\u00edacas cultivadas a partir de c\u00e9lulas madre pluripotentes inducidas por humanos. A continuaci\u00f3n, compararon esta red de 273 prote\u00ednas con datos de secuenciaci\u00f3n de ADN de m\u00e1s de 3000 ni\u00f1os con cardiopat\u00edas cong\u00e9nitas y sus padres, desarrollada por un consorcio financiado por los Institutos Nacionales de la Salud.<\/p>\n
Varias docenas de variantes en la secuenciaci\u00f3n de los ni\u00f1os los datos coincidieron con prote\u00ednas espec\u00edficas que tambi\u00e9n se encuentran en la red GATA4-TBX5, mucho m\u00e1s de lo esperado, lo que las se\u00f1ala como candidatas que pueden contribuir a la enfermedad card\u00edaca cong\u00e9nita.<\/p>\n
\u00abPrimero identificamos importantes redes de prote\u00ednas en los tipos de c\u00e9lulas afectadas en enfermedades card\u00edacas cong\u00e9nitas, y luego integr\u00f3 datos de secuenciaci\u00f3n de codificaci\u00f3n de prote\u00ednas a gran escala\u00bb, dice Brbara Gonzlez Tern, Ph.D., autora principal del estudio y becaria postdoctoral en el laboratorio de Srivastava. \u00abMuchos cient\u00edficos hab\u00edan especulado que este enfoque era posible, pero hasta donde sabemos, esta es la primera vez que se ha hecho, para cualquier enfermedad\u00bb.<\/p>\n
Nueva variante de alto rango descubierta<\/p>\n
Determinar si cada una de las variantes candidatas identificadas en la red GATA4-TBX5 realmente contribuye a la enfermedad card\u00edaca requerir\u00eda a\u00f1os de investigaci\u00f3n. Entonces, en cambio, para el paso final de su nuevo m\u00e9todo, Maureen Pittman, estudiante de posgrado de la UCSF en el laboratorio de Pollard, desarroll\u00f3 una herramienta computacional que clasifica a los candidatos seg\u00fan su probabilidad de contribuir a la enfermedad card\u00edaca cong\u00e9nita. Este algoritmo de clasificaci\u00f3n tiene en cuenta las caracter\u00edsticas de la variante, el gen afectado y el tipo de defecto card\u00edaco que se encuentra en los pacientes con la variante.<\/p>\n
\u00abDe las variantes de mayor clasificaci\u00f3n que identificamos con el algoritmo, algunas fueron en genes que ya se sabe que contribuyen a los defectos card\u00edacos cong\u00e9nitos\u00bb, dice Pittman. \u00abPero muchos nunca antes se hab\u00edan relacionado con el desarrollo del coraz\u00f3n, incluida una prote\u00edna llamada GLYR1, que est\u00e1 involucrada en activar y desactivar otros genes\u00bb.<\/p>\n
Experimentos adicionales en c\u00e9lulas y ratones indicaron que GLYR1 de hecho juega un papel central en la formaci\u00f3n del coraz\u00f3n, y una variante del paciente de GLYR1 interrumpe el desarrollo del coraz\u00f3n al dificultar su interacci\u00f3n con GATA4.<\/p>\n
\u00abLa identificaci\u00f3n de GLYR1 como un gen clave en el desarrollo del coraz\u00f3n abre un espacio biol\u00f3gico completamente nuevo para la comprensi\u00f3n c\u00f3mo funciona este sistema\u00bb, dice Srivastava. \u00abSeguiremos estudiando la biolog\u00eda de GLYR1 y esperamos que otros hagan un seguimiento de las otras variantes de puntuaci\u00f3n alta que encontramos\u00bb.<\/p>\n
Srivastava se\u00f1ala que el nuevo estudio se bas\u00f3 en gran medida no solo en t\u00e9cnicas computacionales desarrollado en Pollard Lab, sino tambi\u00e9n en t\u00e9cnicas de prote\u00f3mica del laboratorio de Nevan Krogan, Ph.D., investigador principal de Gladstone y director del Quantitative Biosciences Institute de UCSF.<\/p>\n
\u00abLa din\u00e1mica y el trabajo en equipo- los esfuerzos concentrados en Gladstone realmente hicieron esto posible\u00bb, dice Srivastava.<\/p>\n
Una nueva herramienta para estudiar enfermedades complejas<\/p>\n
Gracias a los avances en cirug\u00eda, millones de ni\u00f1os con defectos card\u00edacos ahora sobreviven hasta la edad adulta . Pero muchos contin\u00faan enfrentando problemas de por vida, como un mayor riesgo de insuficiencia card\u00edaca.<\/p>\n
\u00abUna mejor comprensi\u00f3n de la base gen\u00e9tica de la enfermedad card\u00edaca cong\u00e9nita podr\u00eda apuntar a nuevas estrategias para no solo bloquear el desarrollo de la enfermedad , que actualmente es muy desafiante, sino tambi\u00e9n para aliviar los problemas que persisten despu\u00e9s de la cirug\u00eda para mejorar la calidad y la duraci\u00f3n de la vida\u00bb, dice Gonzlez Tern.<\/p>\n
Los investigadores creen que el poder de su nuevo m\u00e9todo radica en su prometen ayudar a esclarecer c\u00f3mo las combinaciones de variantes, en lugar de las variantes individuales por s\u00ed solas, trabajan juntas para causar una cardiopat\u00eda cong\u00e9nita.<\/p>\n
\u00abRara vez esta enfermedad es causada por un solo gen; un paciente con la variante GLYR1, por ejemplo, podr\u00eda tal vez tengan variantes adicionales heredadas de sus padres que por s\u00ed mismas no fueron suficientes para causar la enfermedad, pero lo hacen junto con la variante GLYR1\u00bb, dice Pollard, quien tambi\u00e9n es profesor en UCSF e investigador de Chan Zuckerberg Biohub. \u00abNuestro nuevo enfoque podr\u00eda ayudar a identificar combinaciones espec\u00edficas de variantes que causan defectos card\u00edacos\u00bb.<\/p>\n
Este m\u00e9todo tambi\u00e9n podr\u00eda adaptarse para identificar combinaciones de variantes que pueden ser la base de otras enfermedades complejas. Por ejemplo, el equipo de Pollard ya est\u00e1 considerando aplicarlo a los trastornos del desarrollo neurol\u00f3gico, incluidos el autismo y la epilepsia.<\/p>\n
\u00abCon m\u00e1s y m\u00e1s datos de secuenciaci\u00f3n que se generan cada a\u00f1o de pacientes con enfermedades complejas, nuestro enfoque ayudar\u00e1 a guiar hacia d\u00f3nde para centrarse entre todas las variantes detectadas\u00bb, dice Srivastava. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
Un estudio revela redes de genes implicados en cardiopat\u00edas cong\u00e9nitas M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Barbara Gonzalez-Teran et al, Los interactomas de prote\u00ednas del factor de transcripci\u00f3n revelan determinantes gen\u00e9ticos en enfermedades card\u00edacas, Cell (2022) ). DOI: 10.1016\/j.cell.2022.01.021 Informaci\u00f3n de la revista:<\/strong> Cell <\/p>\n Proporcionado por los Institutos Gladstone Cita<\/strong>: Los investigadores desarrollan una estrategia s\u00f3lida para filtrar gen\u00e9tica a gran escala datos para comprender mejor los problemas card\u00edacos (2022, 18 de febrero) recuperado el 29 de agosto de 2022 de https:\/\/medicalxpress.com\/news\/2022-02-robust-strategy-sifting-large-scale-genetic.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor . Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Un equipo de investigadores de Gladstone, incluida Brbara Gonzlez Tern, que se muestra aqu\u00ed, desarroll\u00f3 un m\u00e9todo novedoso para identificar variantes gen\u00e9ticas que probablemente desempe\u00f1en un papel importante en la enfermedad card\u00edaca cong\u00e9nita , abriendo oportunidades para acelerar la investigaci\u00f3n de esta grave condici\u00f3n. Cr\u00e9dito: Michael Short\/Gladstone Institutes Casi el 1 por ciento de todos … Continuar leyendo \u00abLos investigadores desarrollan una estrategia s\u00f3lida para filtrar datos gen\u00e9ticos a gran escala para comprender mejor los problemas card\u00edacos\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-8141","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/8141","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=8141"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/8141\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=8141"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=8141"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=8141"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}