Cr\u00e9dito: Pixabay\/CC0 Dominio p\u00fablico <\/p>\n
Investigadores del Instituto Broad del MIT y de la Universidad de Harvard y Princeton han desarrollado una tecnolog\u00eda basada en CRISPR que puede diferenciar r\u00e1pidamente entre omicron, delta y otras variantes de COVID-19, as\u00ed como otros virus respiratorios, incluida la gripe. El equipo utiliz\u00f3 el m\u00e9todo, conocido como mCARMEN, durante el comienzo de la oleada de omicron en diciembre de 2021 para obtener una visi\u00f3n provisional de la creciente prevalencia de la variante en Massachusetts. Con base en esos resultados, el Departamento de Salud P\u00fablica de Massachusetts (MDPH) comparti\u00f3 esta informaci\u00f3n con los hospitales del estado para ayudar a guiar las opciones de tratamiento para los pacientes con COVID-19. <\/p>\n
Para dise\u00f1ar mCARMEN, los investigadores adaptaron CARMEN, la tecnolog\u00eda de diagn\u00f3stico basada en CRISPR desarrollada en Broad en 2020, para que sea m\u00e1s r\u00e1pida, m\u00e1s sensible y m\u00e1s f\u00e1cil de implementar en laboratorios cl\u00ednicos y de vigilancia, con el objetivo de utilizar la plataforma optimizada. m\u00e1s ampliamente durante futuros brotes de SARS-CoV-2 u otros pat\u00f3genos.<\/p>\n
mCARMEN, un acr\u00f3nimo de \u00abmicrofluidic Combinatorial Arrayed Reactions for Multiplexed Evaluation of Nucleic acids\u00bb, se describe en Nature Medicine.<\/p>\n
\u00abLa pandemia de COVID-19 nos muestra que necesitamos m\u00e1s pruebas, con m\u00e1s frecuencia, especialmente al comienzo de una pandemia\u00bb, dijo el coautor principal Cameron Myhrvold, quien ayud\u00f3 a desarrollar CARMEN como investigadora posdoctoral en Broad y ahora es profesor asistente de biolog\u00eda molecular en la Universidad de Princeton. \u00abCOVID-19 nos muestra que seguir\u00e1n surgiendo virus desafiantes, por lo que debemos seguir busc\u00e1ndolos y encontrar mejores formas de hacerlo\u00bb.<\/p>\n
\u00abHa sido maravilloso trabajar en este gran proyecto de colaboraci\u00f3n \u201d, dijo la primera autora del estudio, Nicole Welch, estudiante de posgrado en el Programa de Virolog\u00eda de la Universidad de Harvard y en el laboratorio de Pardis Sabeti en el Broad. \u00abEstamos entusiasmados de que ya est\u00e9 marcando la diferencia en esta pandemia y esperamos ver su uso continuado para mejorar la salud p\u00fablica\u00bb.<\/p>\n
CARMEN V1<\/p>\n
Investigadores en los laboratorios de Sabeti y el miembro del n\u00facleo de Broad, Paul Blainey, desarrollaron por primera vez la plataforma CARMEN utilizando chips de microfluidos personalizados y mol\u00e9culas de ARN gu\u00eda basadas en CRISPR que pueden detectar secuencias espec\u00edficas en el material gen\u00e9tico de un pat\u00f3geno. En un estudio de 2020, demostraron que CARMEN pod\u00eda identificar un solo tipo de virus en m\u00e1s de 1000 muestras a la vez, o buscar m\u00e1s de 160 virus diferentes, incluido el virus COVID-19, en una peque\u00f1a cantidad de muestras.<\/p>\n
Sin embargo, la plataforma CARMEN original requiere equipo personalizado, implica un flujo de trabajo manual intensivo de 8 a 10 horas y ofrece un rendimiento m\u00e1s bajo que el que se necesita durante una pandemia. Para responder mejor a las amenazas para la salud p\u00fablica, como la aparici\u00f3n de nuevas variantes del SARS-CoV-2, los investigadores refinaron la tecnolog\u00eda en 2021 para hacerla m\u00e1s \u00fatil desde el punto de vista cl\u00ednico y permitirle detectar m\u00faltiples virus y variantes r\u00e1pidamente.<\/p>\n
El equipo adapt\u00f3 CARMEN para trabajar en la plataforma de instrumentaci\u00f3n y microfluidos Fluidigm disponible comercialmente, lo que facilita su ejecuci\u00f3n y reduce el tiempo de ejecuci\u00f3n a la mitad. Los investigadores tambi\u00e9n optimizaron el flujo de trabajo para una mayor sensibilidad, de modo que pueda detectar pat\u00f3genos en muestras con menos material gen\u00e9tico. Adem\u00e1s, al usar las enzimas Cas12 y Cas13 basadas en CRISPR en combinaci\u00f3n, mCARMEN no solo puede detectar la presencia de un virus, sino tambi\u00e9n medir la cantidad de virus en una muestra, informaci\u00f3n que puede indicar la capacidad de un paciente para infectar a otros o si un tratamiento es necesario. trabajando.<\/p>\n
Ver variantes<\/p>\n
En su \u00faltimo estudio, los cient\u00edficos demostraron que mCARMEN pod\u00eda distinguir entre 21 virus respiratorios humanos diferentes en muestras de pacientes, incluido el SARS-CoV-2, otros coronavirus, y cepas de influenza, funcionando tan bien como la tecnolog\u00eda CARMEN original. Trabajando con socios en el Hospital General de Massachusetts, demostraron a\u00fan m\u00e1s la capacidad de mCARMEN para detectar y distinguir entre una serie de virus respiratorios humanos en muestras de pacientes.<\/p>\n
Permitir que mCARMEN diagnostique pacientes y monitoree variantes emergentes de COVID-19 , los investigadores tambi\u00e9n desarrollaron una forma para que la plataforma rastree los cambios en el virus SARS-CoV-2. Idearon un \u00abpanel de identificaci\u00f3n de variantes\u00bb de ARN gu\u00eda basados en CRISPR que reconocen m\u00e1s de dos docenas de mutaciones en la prote\u00edna de punta del virus. Cada variante tiene un patr\u00f3n \u00fanico de estas mutaciones que puede servir como una \u00abhuella digital\u00bb para la variante en una muestra. Con este panel, el equipo demostr\u00f3 que mCARMEN puede buscar estas huellas dactilares y distinguir entre seis linajes variantes del SARS-CoV-2, incluidos delta y omicron, con tanta precisi\u00f3n como se puede hacer con la secuenciaci\u00f3n viral.<\/p>\n
Los investigadores decir que mCARMEN tambi\u00e9n puede ayudar a marcar nuevas variantes. Si aparece una huella dactilar mutacional viral desconocida en una muestra, puede indicar que puede estar surgiendo una nueva variante, lo que se puede confirmar con una secuenciaci\u00f3n viral m\u00e1s profunda.<\/p>\n
En asociaci\u00f3n con los Centros para Enfermedades de EE. UU. Control and Prevention y el MDPH, el Instituto Broad ha estado realizando secuenciaciones virales a gran escala para respaldar la vigilancia gen\u00f3mica de COVID-19 desde marzo de 2021. Con la aparici\u00f3n de la variante omicron a fines de 2021, el MDPH solicit\u00f3 que Broad use mCARMEN para analice espec\u00edmenes de COVID-19 de todo Massachusetts y proporcione un an\u00e1lisis preliminar m\u00e1s r\u00e1pido de la prevalencia de omicron para el conocimiento de la situaci\u00f3n de salud p\u00fablica. A fines de diciembre de 2021, Genomics Platform entreg\u00f3 un subconjunto de muestras positivas para COVID de su flujo de trabajo de vigilancia viral al equipo que desarrolla la plataforma mCARMEN.<\/p>\n
El equipo de mCARMEN us\u00f3 su plataforma para procesar casi 1000 muestras en un d\u00eda y generar r\u00e1pidamente una imagen de las variantes que circulan dentro del estado. Estimaron que omicron hab\u00eda sido la variante dominante de COVID-19 en Massachusetts desde mediados de diciembre. Adem\u00e1s de demostrar la capacidad de la plataforma para generar r\u00e1pidamente informaci\u00f3n a partir de una cantidad relativamente peque\u00f1a de muestras, el hallazgo tambi\u00e9n tuvo un impacto en tiempo real en la respuesta de COVID del estado. MDPH pudo comunicarse con los hospitales del \u00e1rea y aconsejarles que al usar anticuerpos monoclonales para tratar a pacientes con COVID-19, ahora deber\u00edan elegir los que se adapten mejor a omicron que a delta u otras variantes.<\/p>\n
\u00abCon la tecnolog\u00eda r\u00e1pida de mCARMEN tiempo de respuesta, podr\u00edamos ayudar a respaldar esa respuesta inmediata de salud p\u00fablica\u00bb, dijo Welch. \u00abEl brote de omicron muestra la necesidad de un diagn\u00f3stico que brinde m\u00e1s informaci\u00f3n que las pruebas est\u00e1ndar basadas en PCR, sin el costo o el tiempo requerido con la secuenciaci\u00f3n viral\u00bb.<\/p>\n
mCARMEN requerir\u00eda aprobaci\u00f3n regulatoria para usarse para diagnosticar pacientes . Por ahora, el equipo contin\u00faa utilizando la tecnolog\u00eda en colaboraci\u00f3n con colegas de Genomics Platform, CDC y MDPH para monitorear omicron y otras variantes de COVID-19. A medida que surgen nuevas variantes, pueden agregar f\u00e1cilmente nuevos paneles de mutaciones variantes al flujo de trabajo de mCARMEN, para saber qu\u00e9 est\u00e1 circulando y respaldar las respuestas de salud p\u00fablica.<\/p>\n
El equipo tambi\u00e9n est\u00e1 trabajando con los departamentos de salud p\u00fablica de todo el pa\u00eds y m\u00e1s all\u00e1. utilizar mCARMEN para la vigilancia del virus en esas regiones. Adem\u00e1s, est\u00e1n apoyando a investigadores colaboradores que est\u00e1n desarrollando nuevas aplicaciones de la plataforma m\u00e1s all\u00e1 de la pandemia de COVID-19, como detectar y discriminar infecciones bacterianas y monitorear la resistencia a los antibi\u00f3ticos.<\/p>\n
\u00abNuestra esperanza es difundir este mucho m\u00e1s ampliamente\u00bb, dijo la coautora principal Pardis Sabeti, miembro del instituto Broad, profesora de la Universidad de Harvard e investigadora del Instituto M\u00e9dico Howard Hughes. \u00abCon esta actualizaci\u00f3n de la plataforma CARMEN, podemos dise\u00f1ar paneles para una variedad de usos, lo que nos ayudar\u00e1 a prepararnos para la pr\u00f3xima amenaza de enfermedades infecciosas\u00bb. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
El estudio revisado por pares de EE. UU. sobre los resultados de los pacientes con Omicron revela diferencias significativas en el comportamiento de la infecci\u00f3n. M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Nicole L. Welch et al, Plataforma de microfluidos basada en CRISPR multiplexada para pruebas cl\u00ednicas de virus respiratorios e identificaci\u00f3n de variantes de SARS-CoV-2, Nature Medicine (2022). DOI: 10.1038\/s41591-022-01734-1 Informaci\u00f3n de la revista:<\/strong> Nature Medicine <\/p>\n Proporcionado por Broad Institute of MIT y Harvard Cita<\/strong>: Tecnolog\u00eda de diagn\u00f3stico basada en CRISPR r\u00e1pidamente detecta diferentes variantes de COVID y otros pat\u00f3genos (2022, 8 de febrero) recuperado el 29 de agosto de 2022 de https:\/\/medicalxpress.com\/news\/2022-02-crispr-based-diagnostic-technology-rapidly-covid.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Cr\u00e9dito: Pixabay\/CC0 Dominio p\u00fablico Investigadores del Instituto Broad del MIT y de la Universidad de Harvard y Princeton han desarrollado una tecnolog\u00eda basada en CRISPR que puede diferenciar r\u00e1pidamente entre omicron, delta y otras variantes de COVID-19, as\u00ed como otros virus respiratorios, incluida la gripe. El equipo utiliz\u00f3 el m\u00e9todo, conocido como mCARMEN, durante el … Continuar leyendo \u00abLa tecnolog\u00eda de diagn\u00f3stico basada en CRISPR detecta r\u00e1pidamente diferentes variantes de COVID y otros pat\u00f3genos\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-8841","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/8841","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=8841"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/8841\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=8841"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=8841"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=8841"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}