Cr\u00e9dito: Pixabay\/CC0 Dominio p\u00fablico <\/p>\n
Durante la pandemia del SARS-CoV-2, surgieron m\u00faltiples variantes nuevas y m\u00e1s transmisibles del virus. Comprender c\u00f3mo las mutaciones espec\u00edficas afectan la transmisi\u00f3n del SARS-CoV-2 podr\u00eda ayudarnos a comprender mejor la biolog\u00eda del virus y controlar los brotes. <\/p>\n
Sin embargo, esta es una tarea desafiante, dijo John Barton, profesor asistente de f\u00edsica y astronom\u00eda en la Universidad de California, Riverside, quien presenta los resultados de su investigaci\u00f3n titulada \u00abInferir los efectos de las mutaciones en el SARS-CoV- 2 Transmission From Genomic Surveillance Data\u00bb en la reuni\u00f3n de marzo de la American Physical Society. <\/p>\n
\u00abLos m\u00e9todos computacionales existentes para estudiar este problema tienden a ser dif\u00edciles de aplicar a grandes cantidades de datos o se basan en suposiciones muy restrictivas\u00bb, dijo Barton. \u00abLos experimentos tambi\u00e9n pueden proporcionar informaci\u00f3n excelente sobre c\u00f3mo las diferentes mutaciones afectan al virus, pero no se pueden usar para estudiar directamente la transmisi\u00f3n del SARS-CoV-2 en humanos\u00bb.<\/p>\n
Barton y sus colegas desarrollaron un nuevo m\u00e9todo computacional m\u00e9todo para resolver este problema aplicando t\u00e9cnicas de la f\u00edsica estad\u00edstica a modelos matem\u00e1ticos en epidemiolog\u00eda. Su m\u00e9todo les permite observar datos de vigilancia gen\u00f3mica, secuencias de SARS-CoV-2 recopiladas de individuos infectados a lo largo del tiempo y en muchas regiones del mundo, y encontrar los efectos de diferentes mutaciones en la transmisi\u00f3n del SARS-CoV-2 que explican mejor la historia evolutiva observada. del virus a lo largo de la pandemia. <\/p>\n
\u00abAlgunas caracter\u00edsticas novedosas de nuestro m\u00e9todo son que puede dar cuenta del viaje de personas infectadas entre regiones, lo que la mayor\u00eda de los otros modelos no pueden hacer, y que los m\u00e9todos basados en la f\u00edsica que usamos nos permiten escribir una expresi\u00f3n matem\u00e1tica exacta para los efectos de transmisi\u00f3n de diferentes mutaciones, en lugar de depender de simulaciones num\u00e9ricas para estimar estos par\u00e1metros\u00bb, dijo Barton.<\/p>\n
Despu\u00e9s de validar su m\u00e9todo en simulaciones, Barton y sus colegas lo aplicaron a m\u00e1s de 1,6 millones de secuencias de SARS-CoV-2 de la base de datos GISAID, que se recopilaron de 87 regiones geogr\u00e1ficas. <\/p>\n
\u00abGran parte de la investigaci\u00f3n se ha centrado en las mutaciones en la prote\u00edna espiga del SARS-CoV-2, y nuestro an\u00e1lisis respalda este \u00e9nfasis en la espiga como principal impulsor de la transmisi\u00f3n del SARS-CoV-2\u00bb, dijo Barton. \u00abAlrededor de la mitad de las mutaciones m\u00e1s impactantes que encontramos est\u00e1n en Spike, incluidas tres de las cuatro mutaciones principales. Sin embargo, tambi\u00e9n encontramos m\u00faltiples mutaciones fuera de Spike que parecen aumentar considerablemente la transmisi\u00f3n del virus. Algunas de estas pueden ser buenas objetivos para futuros experimentos para comprender c\u00f3mo las diferentes mutaciones afectan la funci\u00f3n del SARS-CoV-2\u00bb.<\/p>\n
Barton explic\u00f3 que su m\u00e9todo tambi\u00e9n es lo suficientemente sensible como para revelar beneficios en la transmisi\u00f3n del SARS-CoV-2 para mutaciones que se supon\u00edan previamente ser neutral Su equipo tambi\u00e9n puede detectar un aumento en la transmisi\u00f3n de nuevas variantes importantes, como alfa y delta, muy r\u00e1pidamente, dentro de una semana de su aparici\u00f3n en los datos regionales. El conjunto de datos que consider\u00f3 el equipo al escribir el art\u00edculo no inclu\u00eda secuencias de la variante omicron porque los datos solo se recopilaron hasta agosto de 2021. <\/p>\n
\u00abSin embargo, incluso sin observar ninguna secuencia omicron en los datos, ya estimar\u00edamos que omicron transmitir\u00eda m\u00e1s f\u00e1cilmente que Alpha solo en funci\u00f3n de las mutaciones que comparte con otras variantes del SARS-CoV-2\u00bb, dijo Barton. \u00abSi bien nos hemos centrado espec\u00edficamente en el SARS-CoV-2 en nuestro an\u00e1lisis, nuestro m\u00e9todo es muy general y podr\u00eda aplicarse para estudiar la transmisi\u00f3n de otros pat\u00f3genos, como la influenza\u00bb. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
La gen\u00e9tica de Omicron y los patrones de transmisi\u00f3n temprana caracterizaron M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Brian Lee et al, Inferir los efectos de las mutaciones en la transmisi\u00f3n del SARS-CoV-2 a partir de los datos de vigilancia gen\u00f3mica, (2022) . DOI: 10.1101\/2021.12.31.21268591 Proporcionado por la Universidad de California – Riverside Cita<\/strong>: Uso de la f\u00edsica para explicar los efectos de transmisi\u00f3n de diferentes mutaciones del SARS-CoV-2 (2022, 7 de febrero) recuperado el 29 de agosto de 2022 de https :\/\/medicalxpress.com\/news\/2022-02-physics-transmission-effects-sars-cov-mutations.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Cr\u00e9dito: Pixabay\/CC0 Dominio p\u00fablico Durante la pandemia del SARS-CoV-2, surgieron m\u00faltiples variantes nuevas y m\u00e1s transmisibles del virus. Comprender c\u00f3mo las mutaciones espec\u00edficas afectan la transmisi\u00f3n del SARS-CoV-2 podr\u00eda ayudarnos a comprender mejor la biolog\u00eda del virus y controlar los brotes. Sin embargo, esta es una tarea desafiante, dijo John Barton, profesor asistente de f\u00edsica … Continuar leyendo \u00abUso de la f\u00edsica para explicar los efectos de transmisi\u00f3n de diferentes mutaciones del SARS-CoV-2\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-8932","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/8932","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=8932"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/8932\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=8932"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=8932"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=8932"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}