La farmacoprote\u00f3mica identifica los mecanismos de acci\u00f3n de los f\u00e1rmacos en las l\u00edneas celulares de LLA infantil. un UMAP de la distribuci\u00f3n de medicamentos con anotaciones de clase como una reducci\u00f3n bidimensional. Los f\u00e1rmacos se correlacionaron con datos de cuantificaci\u00f3n de prote\u00ednas basados en s\u00edmbolos gen\u00e9ticos basados en sDSS, y las puntuaciones de correlaci\u00f3n de Pearson de este an\u00e1lisis se utilizaron para generar el UMAP. Cada f\u00e1rmaco est\u00e1 anotado por su clase. b Reducci\u00f3n dimensional de UMAP de cada f\u00e1rmaco, calculada utilizando las correlaciones de Pearson entre sDSS y la abundancia de prote\u00ednas. Cada f\u00e1rmaco est\u00e1 anotado por una familia diana espec\u00edfica. c sDSS de la tacedalina (panel superior) y panobinostat (panel inferior) en las l\u00edneas celulares analizadas. Las l\u00edneas celulares de fusi\u00f3n TCF3-PBX1 resistentes a la trecedinalina se resaltan con c\u00edrculos rojos. La l\u00ednea discontinua roja indica el umbral seleccionado de sDSS=8. d Curvas de Tagg (temperatura de agregaci\u00f3n) derivadas de CETSA para HDAC1 en c\u00e9lulas KOPN-8 y RCH-ACV en presencia de DMSO y 20 M de tacedinalina despu\u00e9s de 3 h de incubaci\u00f3n. Todos los datos se normalizaron a la respuesta observada para cada condici\u00f3n de tratamiento a la temperatura de prueba m\u00e1s baja (panel superior). Dosis-respuesta CETSA de tacedinalina incubada durante 3 h a siete concentraciones diferentes que oscilan entre 100 M y 24 nM a 53 \u00b0C seg\u00fan datos de quimioluminiscencia sin procesar del an\u00e1lisis de transferencia Western para HDAC1 en l\u00edneas celulares KOPN-8 y RCH-ACV (panel inferior). Los datos se proporcionaron como dos puntos de datos individuales de dos experimentos independientes (n=2) para cada l\u00ednea celular. e Gr\u00e1ficas volc\u00e1nicas de sensibilidad diferencial a f\u00e1rmacos entre l\u00edneas celulares de ALL de linaje B y de linaje T. El l\u00edmite se estableci\u00f3 en el valor de p ajustado de la prueba t q0.02 y el sDSS medio delta entre las l\u00edneas celulares del linaje B y el linaje T se estableci\u00f3 en 5. Los f\u00e1rmacos seleccionados se anotan como c\u00edrculos azules. f La correlaci\u00f3n entre el sDSS para venetoclax en el DSRT y el nivel relativo de prote\u00edna de BCL2 (panel superior) y el sDSS para A-1155463 y el nivel relativo de prote\u00edna de BCL2L1 (panel inferior) para las 43 l\u00edneas celulares ALL analizadas. El eje x muestra el nivel relativo de prote\u00edna log2 de la prote\u00edna y el eje y muestra el sDSS para cada l\u00ednea celular respectiva (n = 43). En cada gr\u00e1fico se muestran el coeficiente de correlaci\u00f3n de Pearson (R) y los valores P de la distribuci\u00f3n t bilateral (P) para la comparaci\u00f3n. La l\u00ednea de tendencia de regresi\u00f3n lineal (negra) y su intervalo de confianza del 95 % (\u00e1rea gris sombreada) se muestran en el gr\u00e1fico. Los colores indican el subtipo citogen\u00e9tico de las l\u00edneas celulares. g Clasific\u00f3 OSU-03012 sDSS y correlaciones de prote\u00edna Pearson, destacando miembros del complejo de chaperonina que contiene TCP1, HSP90AB1 y prote\u00ednas que interact\u00faan con PDPK1 de la base de datos de la red STRING. h Gr\u00e1fico de dispersi\u00f3n de OSU-03012 sDSS y nivel relativo de prote\u00edna log2 de HSP90AB1 y TCP1 para cada una de las l\u00edneas celulares BCP-ALL (n=25). El eje x muestra el nivel relativo de prote\u00edna log2 de la prote\u00edna y el eje y muestra el sDSS para cada l\u00ednea celular respectiva (n = 25). En cada gr\u00e1fico se muestran el coeficiente de correlaci\u00f3n de Pearson (R) y los valores P de la distribuci\u00f3n t bilateral (P) para la comparaci\u00f3n. La l\u00ednea de tendencia de regresi\u00f3n lineal (negra) y su intervalo de confianza del 95 % (\u00e1rea gris sombreada) se muestran en el gr\u00e1fico. Los puntos est\u00e1n etiquetados por subtipo citogen\u00e9tico de cada l\u00ednea celular BCP-ALL representada. Cr\u00e9dito: Nature Communications (2022). DOI: 10.1038\/s41467-022-29224-5 <\/p>\n
Los investigadores del Departamento de Oncolog\u00eda-Patolog\u00eda han publicado un art\u00edculo en Nature Communications donde crearon un conjunto de datos de recursos de l\u00edneas celulares y una herramienta de an\u00e1lisis que podr\u00eda usarse para identificar los rasgos que hacen leucemias espec\u00edficas sensibles a nuevos tipos de terapias dirigidas. <\/p>\n
Los investigadores utilizaron l\u00edneas celulares de pacientes con leucemia linfobl\u00e1stica aguda (LLA) infantil con diferentes formas de la enfermedad y analizaron prote\u00ednas, ARN y sensibilidad a 528 medicamentos cl\u00ednicamente aprobados o en investigaci\u00f3n. La comparaci\u00f3n de l\u00edneas celulares que respondieron a los medicamentos de diferentes maneras podr\u00eda identificar los mecanismos de los medicamentos y los rasgos que hacen que las leucemias sean sensibles o resistentes a esas terapias. Para algunos medicamentos, los investigadores identificaron que podr\u00edan funcionar a trav\u00e9s de mecanismos secundarios fuera del objetivo. En un subtipo de LLA de mayor riesgo, que responde mal a la quimioterapia est\u00e1ndar, identificaron una sensibilidad inesperada a un tipo de f\u00e1rmaco de inmunoterapia, que aumenta la potencia de las se\u00f1ales moleculares que activan las c\u00e9lulas inmunitarias.<\/p>\n
La LLA es la m\u00e1s c\u00e1ncer infantil com\u00fan. La mayor\u00eda de los pacientes pueden ser tratados con quimioterapia y trasplante de c\u00e9lulas madre, pero el 1520 % responder\u00e1 mal, y este grupo de pacientes carece de opciones de tratamiento y tiene un alto riesgo de mortalidad. Adem\u00e1s, los tratamientos est\u00e1ndar actuales pueden tener una carga de salud a largo plazo para los ni\u00f1os que sobreviven al c\u00e1ncer. Existe la necesidad de identificar terapias que sean menos severas que los tratamientos est\u00e1ndar y que puedan ayudar a los pacientes que no responden a las opciones actuales. Los resultados de los investigadores proporcionan una base para explorar las diferencias biol\u00f3gicas y las nuevas terapias dirigidas a la LLA infantil, y sirven como un amplio recurso p\u00fablico que respaldar\u00e1 otros proyectos de investigaci\u00f3n.<\/p>\n
Los investigadores utilizaron un panel de 49 c\u00e9lulas de LLA infantil l\u00edneas y espectrometr\u00eda de masas adquirida basada en mediciones profundas de proteoma, secuenciaci\u00f3n de ARN, detecci\u00f3n de f\u00e1rmacos de alto rendimiento y an\u00e1lisis de genes de fusi\u00f3n. Crearon una plataforma basada en la web que permite al p\u00fablico explorar y analizar el conjunto de datos. Realizaron an\u00e1lisis que integraron estos tipos de datos y mejoraron la comprensi\u00f3n de las diferencias biol\u00f3gicas. Realizaron an\u00e1lisis para perfilar los mecanismos de f\u00e1rmacos efectivos en la pantalla. Realizaron experimentos de validaci\u00f3n para comprender en profundidad los mecanismos de los f\u00e1rmacos.<\/p>\n
\u00abVamos a validar a\u00fan m\u00e1s los resultados en el conjunto de datos con el mayor potencial de beneficio cl\u00ednico futuro\u00bb, dice Rozbeh Jafari, investigador principal del Departamento de Oncolog\u00eda. Patolog\u00eda y \u00faltimo autor del art\u00edculo. \u00abEsperamos expandir los subtipos representados de leucemia infantil en el conjunto de datos y explorar m\u00e1s caracterizaciones de nuestra sensibilidad a los medicamentos y los resultados del mecanismo biol\u00f3gico en muestras cl\u00ednicas y otros modelos. Tambi\u00e9n estamos interesados en desarrollar nuevos m\u00e9todos para comprender la actividad de los medicamentos y analizar e interpretar conjuntos de datos integrales similares que miden m\u00faltiples par\u00e1metros moleculares\u00bb. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
Anomal\u00eda gen\u00e9tica rara vinculada al 20 % de los casos de leucemia mieloide aguda infantil. l\u00edneas celulares de leucemia, Nature Communications (2022). DOI: 10.1038\/s41467-022-29224-5 Informaci\u00f3n de la revista:<\/strong> Nature Communications <\/p>\n Proporcionado por Karolinska Institutet Cita<\/strong>: Nueva herramienta explora diferencias biol\u00f3gicas y nuevas terapias dirigidas en leucemia linfobl\u00e1stica aguda infantil (30 de marzo de 2022) recuperado el 29 de agosto de 2022 de https:\/\/medicalxpress.com\/news\/2022-03-tool-explores-biological-differences-therapies.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" La farmacoprote\u00f3mica identifica los mecanismos de acci\u00f3n de los f\u00e1rmacos en las l\u00edneas celulares de LLA infantil. un UMAP de la distribuci\u00f3n de medicamentos con anotaciones de clase como una reducci\u00f3n bidimensional. Los f\u00e1rmacos se correlacionaron con datos de cuantificaci\u00f3n de prote\u00ednas basados en s\u00edmbolos gen\u00e9ticos basados en sDSS, y las puntuaciones de correlaci\u00f3n de … Continuar leyendo \u00abNueva herramienta explora las diferencias biol\u00f3gicas y nuevas terapias dirigidas en la leucemia linfobl\u00e1stica aguda infantil\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-9504","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/9504","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=9504"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/9504\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=9504"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=9504"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=9504"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}