Fig. 1: Programaci\u00f3n de una ruta de amplificaci\u00f3n isot\u00e9rmica de \u00e1cido nucleico como un gr\u00e1fico de reacci\u00f3n. Programaci\u00f3n de una v\u00eda de amplificaci\u00f3n isot\u00e9rmica de \u00e1cido nucleico como un gr\u00e1fico de reacci\u00f3n en el que el complejo de horquilla act\u00faa como iniciador y codifica dos sitios de cebado en la regi\u00f3n del bucle: (a) Un esquema para generar el mecanismo de estructura secundaria y el gr\u00e1fico de reacci\u00f3n a partir del motivo de horquilla funcional. amplificaci\u00f3n isot\u00e9rmica mediada. Las letras a\/s indican la complementariedad de la secuencia de \u00e1cido nucleico y los n\u00fameros representan fragmentos espec\u00edficos en la estructura de horquilla funcional (p. ej., 2a es complementario de 2s). Durante su amplificaci\u00f3n, el producto funcional de doble hebra con motivo de horquilla (caja azul) se desmonta (flechas s\u00f3lidas) para formar productos de hebras con sentido (tri\u00e1ngulo verde) y antisentido (cuadrado verde). La formaci\u00f3n de productos autoplegables expone los sitios de cebado, lo que conduce a la hibridaci\u00f3n de los cebadores y la extensi\u00f3n de la secuencia por la ADN polimerasa de desplazamiento de cadena (flechas discontinuas) para generar un amplic\u00f3n de doble cadena. El amplic\u00f3n se convierte entonces en el objetivo (o iniciador) de ciclos de amplificaci\u00f3n adicionales a trav\u00e9s de los circuitos S y A; b La cin\u00e9tica de reacci\u00f3n del mecanismo descrito en la Fig. 1a con diferentes longitudes de fragmento de bucle de 40 nt (cuadrados negros), 50 nt (disco rojo) y 60 nt (tri\u00e1ngulo azul). Los datos se presentan como valores medios; las barras de error son la desviaci\u00f3n est\u00e1ndar, N=3 experimentos independientes; c Secuenciaci\u00f3n del producto (3a+1s+2s+3s) donde los productos de amplificaci\u00f3n fueron digeridos (carril 1 en (d)), clonados y secuenciados, identific\u00e1ndose como repeticiones en t\u00e1ndem; d Electroforesis en gel de agarosa de los productos de amplificaci\u00f3n. Carril L: escalera de 50 pb; Calle 1: producto de amplificaci\u00f3n digerido por la enzima de restricci\u00f3n Xba I. Calle 2: producto de amplificaci\u00f3n (con iniciador); Carril 3: producto de amplificaci\u00f3n (sin iniciador). El gel es representativo de experimentos repetidos independientemente tres veces con resultados similares. Cr\u00e9dito: Nature Communications (2022). https:\/\/www.nature.com\/articles\/s41467-022-29101-1 <\/p>\n
El software que ayuda a acelerar el proceso de creaci\u00f3n de nuevas pruebas de diagn\u00f3stico podr\u00eda ayudar a combatir futuras pandemias, dicen sus desarrolladores. <\/p>\n
Un equipo de bioingenieros y qu\u00edmicos en Escocia y China ha desarrollado un sistema que sugiere nuevas v\u00edas de reacci\u00f3n para acelerar el dise\u00f1o y desarrollo de nuevos ensayos de diagn\u00f3stico.<\/p>\n
El sistema, que ahora est\u00e1 disponible gratuitamente para otros investigadores de todo el mundo para investigar, adaptar y utilizar, tambi\u00e9n se puede utilizar para identificar las primeras etapas de enfermedades no infecciosas como el c\u00e1ncer, lo que podr\u00eda ayudar a los pacientes a recibir un tratamiento m\u00e1s oportuno. <\/p>\n
En un nuevo art\u00edculo publicado hoy en la revista Nature Communications, investigadores de la Universidad de Glasgow en el Reino Unido y la Universidad Shanghai Jiao Tong en China describen c\u00f3mo desarrollaron y demostraron la eficacia de su sistema.<\/p>\n
Comenzaron desarrollando gr\u00e1ficos de reacci\u00f3n, representaciones de los procesos biomec\u00e1nicos que permiten pruebas de diagn\u00f3stico r\u00e1pido como la amplificaci\u00f3n de cebado cruzado (CPA) y la amplificaci\u00f3n de ADN mediada por bucle (LAMP). <\/p>\n
A diferencia de las pruebas de reacci\u00f3n en cadena de la polimerasa, o PCR, que requieren acceso a laboratorios sofisticados operados por personal capacitado, las pruebas isot\u00e9rmicas como LAMP pueden ofrecer resultados r\u00e1pidos y precisos al crear interacciones entre los productos qu\u00edmicos y las hebras de ADN contenidas en el paciente. muestras y entregar resultados r\u00e1pidos en el punto de atenci\u00f3n.<\/p>\n
Sin embargo, en muchos casos, esas pruebas r\u00e1pidas est\u00e1n dise\u00f1adas y desarrolladas para un prop\u00f3sito espec\u00edfico, lo que puede introducir una complejidad innecesaria y dificultar que una prueba sea f\u00e1cilmente adaptable para su uso en un diagn\u00f3stico diferente. <\/p>\n
Los investigadores desarrollaron un enfoque m\u00e1s generalizable para la creaci\u00f3n de nuevas pruebas, construyendo una herramienta de software capaz de convertir los gr\u00e1ficos de reacci\u00f3n en sugerencias sobre c\u00f3mo se podr\u00edan usar los cebadores y las reacciones qu\u00edmicas para crear los resultados de diagn\u00f3stico deseados. <\/p>\n
En el art\u00edculo, el equipo de investigaci\u00f3n describe c\u00f3mo probaron la eficacia del software us\u00e1ndolo para dise\u00f1ar cebadores y reacciones qu\u00edmicas para cuatro pruebas de diagn\u00f3stico diferentes, tres para enfermedades infecciosas y una para el c\u00e1ncer, una enfermedad no transmisible. <\/p>\n
Crearon con \u00e9xito una prueba multiplexada para una forma de VIH con altos niveles de variaciones de secuencia, una prueba altamente sensible para tuberculosis y un estudio para analizar muestras cl\u00ednicas de pacientes para detectar la presencia de hepatitis B. <\/p>\n
Tambi\u00e9n desarrollaron un ensayo para detectar secuencias cortas de miARN relevantes en el diagn\u00f3stico y pron\u00f3stico de c\u00e1nceres, incluidos el carcinoma oral de c\u00e9lulas escamosas, el c\u00e1ncer de mama y el glioma.<\/p>\n
Usaron sus ensayos de diagn\u00f3stico recientemente dise\u00f1ados para probar muestras derivadas de pacientes de laboratorios cl\u00ednicos en China. Luego, confirmaron sus resultados usando pruebas de PCR separadas. Probaron sus resultados con los diagn\u00f3sticos LAMP para las mismas enfermedades y descubrieron que sus resultados eran m\u00e1s espec\u00edficos y reproducibles que las pruebas LAMP. <\/p>\n
El profesor Jon Cooper, de la Escuela de Ingenier\u00eda James Watt de la Universidad de Glasgow, es el autor principal del art\u00edculo. El profesor Cooper dijo: \u00abHemos estado trabajando durante varios a\u00f1os en el desarrollo de pruebas isot\u00e9rmicas para enfermedades como la malaria y la hepatitis C para su uso en partes del mundo donde el acceso confiable a las pruebas de PCR es limitado. <\/p>\n
\u00abEn el transcurso de la construcci\u00f3n de esos sistemas de diagn\u00f3stico, qued\u00f3 claro que tambi\u00e9n est\u00e1bamos construyendo una comprensi\u00f3n de c\u00f3mo podr\u00edamos hacer un enfoque m\u00e1s generalizable para las pruebas de biomarcadores espec\u00edficos.<\/p>\n
\u00abNuestro sistema programable automatiza una gran cantidad de el trabajo inicial de prueba y error que se dedica al desarrollo de nuevas pruebas, y hemos demostrado que se puede utilizar para diagnosticar de manera confiable una muestra representativa \u00fatil de enfermedades transmisibles y no transmisibles. Es un descubrimiento emocionante y sugiere muchas aplicaciones potenciales en medicina\u00bb.<\/p>\n
Dr. Julien Reboud, coautor del art\u00edculo de la Universidad de Glasgow, agreg\u00f3: \u00abLa pandemia de COVID-19 le ha ense\u00f1ado al mundo lo vitalmente importante que es desarrollar r\u00e1pidamente diagn\u00f3sticos precisos, sensibles y espec\u00edficos para rastrear nuevas enfermedades y dirigir el tratamiento. .<\/p>\n
\u00abNuestro sistema programable ofrece una nueva ruta para respaldar ese tipo de desarrollo de diagn\u00f3stico r\u00e1pido. Estamos ansiosos por hacerlo lo m\u00e1s accesible posible para otros investigadores de todo el mundo, por lo que hemos hecho que todos nuestros gr\u00e1ficos y datos est\u00e9n disponibles gratuitamente en l\u00ednea. Esperamos que sea de utilidad real para investigadores y m\u00e9dicos en una amplia gama de aplicaciones, y esperamos ver las nuevas aplicaciones que encontrar\u00e1n para el sistema\u00bb.<\/p>\n
Dr. Gaolin Xu, un coautor del art\u00edculo con sede en la Universidad Jiao Tong de Shanghai, agreg\u00f3: \u00abDurante mi Ph.D. en el grupo del profesor Cooper, desarroll\u00e9 nuevas tecnolog\u00edas para la detecci\u00f3n de ADN. Siempre sent\u00ed que deber\u00eda haber una mejor manera de desarrollar nuevos dise\u00f1os de ensayos de diagn\u00f3stico. Cuando regres\u00e9 a China, continu\u00e9 la colaboraci\u00f3n con mis colegas en Escocia para desarrollar este nuevo y emocionante sistema de diagn\u00f3stico\u00bb.<\/p>\n
El art\u00edculo del equipo, titulado \u00abDise\u00f1o programable de ensayos de diagn\u00f3stico de \u00e1cido nucleico isot\u00e9rmico a trav\u00e9s de m\u00e9todos basados en abstracci\u00f3n Models\u00bb, se publica en Nature Communications. <\/p>\n
Explore m\u00e1s<\/p>\n
Una posible prueba casera de COVID-19 es tan buena como las pruebas de PCR de laboratorio, seg\u00fan datos precl\u00ednicos M\u00e1s informaci\u00f3n:<\/strong> Gaolian Xu et al, Dise\u00f1o programable de ensayos de diagn\u00f3stico de \u00e1cido nucleico isot\u00e9rmico mediante modelos basados en abstracci\u00f3n, Nature Communications (2022).DOI: 10.1038\/s41467-022-29101-1.www.nature.com\/articles\/s41467-022-29101 -1 Informaci\u00f3n de la revista:<\/strong> Nature Communications <\/p>\n Proporcionado por la Universidad de Glasgow Cita<\/strong>: Nuevo m\u00e9todo para desarrollar pruebas de diagn\u00f3stico podr\u00eda ayudar a abordar futuras pandemias (28 de marzo de 2022) recuperado 29 de agosto de 2022 de https:\/\/medicalxpress.com\/news\/2022-03-method-diagno stic-tackle-future-pandemics.html Este documento est\u00e1 sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigaci\u00f3n privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona \u00fanicamente con fines informativos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Fig. 1: Programaci\u00f3n de una ruta de amplificaci\u00f3n isot\u00e9rmica de \u00e1cido nucleico como un gr\u00e1fico de reacci\u00f3n. Programaci\u00f3n de una v\u00eda de amplificaci\u00f3n isot\u00e9rmica de \u00e1cido nucleico como un gr\u00e1fico de reacci\u00f3n en el que el complejo de horquilla act\u00faa como iniciador y codifica dos sitios de cebado en la regi\u00f3n del bucle: (a) Un … Continuar leyendo \u00abNuevo m\u00e9todo para desarrollar pruebas de diagn\u00f3stico podr\u00eda ayudar a abordar futuras pandemias\u00bb<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-9660","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-general"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/9660","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=9660"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/9660\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=9660"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=9660"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.biblia.work\/articulos-salud\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=9660"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}